Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000488462
- Subject:
- NM_172688.3
- Aligned Length:
- 1737
- Identities:
- 1593
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGTCTACAGCCTCTGCCGCCTCCTCCTCCTCCTCGTCTTCGGCCGGTGAGATGATCGAAGCCCCTTCCCAGGT 74
|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct 1 ATGTCGACAGCCTCCGCCGCCTCGTCCTCCTCCTCGTCTTCTGCCAGTGAGATGATCGAAGCGCCGTCGCAGGT 74
Query 75 CCTCAACTTTGAAGAGATCGACTACAAGGAGATCGAGGTGGAAGAGGTTGTTGGAAGAGGAGCCTTTGGAGTTG 148
|||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|
Sbjct 75 CCTGAACTTCGAAGAGATCGACTACAAGGAGATCGAGGTGGAAGAGGTTGTCGGAAGAGGAGCTTTTGGAGTAG 148
Query 149 TTTGCAAAGCTAAGTGGAGAGCAAAAGATGTTGCTATTAAACAAATAGAAAGTGAATCTGAGAGGAAAGCGTTT 222
|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.
Sbjct 149 TTTGCAAAGCTAAGTGGAGAGCAAAAGATGTCGCTATTAAACAGATAGAAAGTGAGTCTGAGAGGAAGGCTTTC 222
Query 223 ATTGTAGAGCTTCGGCAGTTATCCCGTGTGAACCATCCTAATATTGTAAAGCTTTATGGAGCCTGCTTGAATCC 296
|||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||.|.||||||||||||.|||||||
Sbjct 223 ATTGTGGAGCTCCGGCAGTTGTCACGTGTGAACCATCCTAACATTGTCAAGTTGTATGGAGCCTGCCTGAATCC 296
Query 297 AGTGTGTCTTGTGATGGAATATGCTGAAGGGGGCTCTTTATATAATGTGCTGCATGGTGCTGAACCATTGCCAT 370
|||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 297 AGTATGTCTTGTGATGGAATATGCAGAGGGGGGCTCATTGTATAATGTGCTGCATGGTGCTGAACCATTGCCTT 370
Query 371 ATTATACTGCTGCCCACGCAATGAGTTGGTGTTTACAGTGTTCCCAAGGAGTGGCTTATCTTCACAGCATGCAA 444
|.||.||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.
Sbjct 371 ACTACACTGCTGCTCATGCCATGAGCTGGTGTTTACAGTGTTCCCAAGGAGTGGCTTACCTGCACAGCATGCAG 444
Query 445 CCCAAAGCGCTAATTCACAGGGACCTGAAACCACCAAACTTACTGCTGGTTGCAGGGGGGACAGTTCTAAAAAT 518
|||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 445 CCCAAAGCGCTGATTCACAGGGACCTCAAGCCTCCAAACTTGCTGCTGGTTGCAGGAGGGACAGTTCTAAAAAT 518
Query 519 TTGTGATTTTGGTACAGCCTGTGACATTCAGACACACATGACCAATAACAAGGGGAGTGCTGCTTGGATGGCAC 592
.||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 519 CTGCGATTTTGGTACAGCTTGTGACATCCAAACACACATGACCAATAATAAAGGGAGTGCTGCTTGGATGGCGC 592
Query 593 CTGAAGTTTTTGAAGGTAGTAATTACAGTGAAAAATGTGACGTCTTCAGCTGGGGTATTATTCTTTGGGAAGTG 666
|||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 593 CTGAAGTATTTGAAGGTAGCAATTACAGTGAAAAGTGTGATGTCTTCAGCTGGGGTATTATCCTCTGGGAAGTG 666
Query 667 ATAACGCGTCGGAAACCCTTTGATGAGATTGGTGGCCCAGCTTTCCGAATCATGTGGGCTGTTCATAATGGTAC 740
|||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 667 ATAACACGCCGGAAACCCTTCGATGAGATCGGTGGCCCAGCTTTCAGAATCATGTGGGCTGTTCATAATGGCAC 740
Query 741 TCGACCACCACTGATAAAAAATTTACCTAAGCCCATTGAGAGCCTGATGACTCGTTGTTGGTCTAAAGATCCTT 814
|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.|||||||||||.||.||.|
Sbjct 741 TCGACCACCACTGATCAAAAATTTACCTAAGCCCATTGAGAGCTTGATGACACGCTGTTGGTCTAAGGACCCAT 814
Query 815 CCCAGCGCCCTTCAATGGAGGAAATTGTGAAAATAATGACTCACTTGATGCGGTACTTTCCAGGAGCAGATGAG 888
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 815 CTCAGCGCCCTTCAATGGAGGAAATTGTGAAAATAATGACTCACTTGATGCGGTACTTCCCAGGAGCGGATGAG 888
Query 889 CCATTACAGTATCCTTGTCAGTATTCAGATGAAGGACAGAGCAACTCTGCCACCAGTACAGGCTCATTCATGGA 962
||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 889 CCGTTACAGTATCCTTGTCAGTACTCTGATGAAGGGCAGAGCAACTCAGCCACCAGCACAGGCTCATTCATGGA 962
Query 963 CATTGCTTCTACAAATACGAGTAACAAAAGTGACACTAATATGGAGCAAGTTCCTGCCACAAATGATACTATTA 1036
||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 963 CATTGCTTCTACAAATACCAGTAATAAAAGTGACACAAATATGGAACAGGTTCCTGCCACAAACGACACTATTA 1036
Query 1037 AGCGCTTAGAATCAAAATTGTTGAAAAATCAGGCAAAGCAACAGAGTGAATCTGGACGTTTAAGCTTGGGAGCC 1110
|.|||||.||.||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||..|.||||||||||||
Sbjct 1037 AACGCTTGGAGTCAAAACTTTTGAAAAACCAGGCAAAGCAACAGAGTGAATCTGGACGCCTGAGCTTGGGAGCC 1110
Query 1111 TCCCGTGGGAGCAGTGTGGAGAGCTTGCCCCCAACCTCTGAGGGCAAGAGGATGAGTGCTGACATGTCTGAAAT 1184
||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TCTCGTGGGAGCAGTGTGGAGAGCTTGCCCCCCACTTCCGAGGGCAAGAGGATGAGTGCTGACATGTCTGAAAT 1184
Query 1185 AGAAGCTAGGATCGCCGCAACCACAGGCAACGGACAGCCAAGACGTAGATCCATCCAAGACTTGACTGTAACTG 1258
||||||.|||||||..||.||..||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1185 AGAAGCCAGGATCGTGGCGACTGCAGGTAACGGGCAACCAAGGCGTAGATCCATCCAAGACTTGACTGTTACTG 1258
Query 1259 GAACAGAACCTGGTCAGGTGAGCAGTAGGTCATCCAGTCCCAGTGTCAGAATGATTACTACCTCAGGACCAACC 1332
|.|||||||||||||||||||||||..||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GGACAGAACCTGGTCAGGTGAGCAGCCGGTCATCCAGCCCTAGTGTCAGAATGATCACTACCTCAGGACCAACC 1332
Query 1333 TCAGAAAAGCCAACTCGAAGTCATCCATGGACCCCTGATGATTCCACAGATACCAATGGATCAGATAACTCCAT 1406
|||||.||||||.||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1333 TCAGAGAAGCCAGCTCGCAGTCACCCGTGGACCCCTGATGATTCCACAGATACCAATGGCTCAGATAACTCCAT 1406
Query 1407 CCCAATGGCTTATCTTACACTGGATCACCAACTACAGCCTCTAGCACCGTGCCCAAACTCCAAAGAATCTATGG 1480
|||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1407 CCCAATGGCGTATCTTACACTGGATCACCAGCTACAGCCTCTAGCGCCGTGCCCAAACTCCAAAGAATCCATGG 1480
Query 1481 CAGTGTTTGAACAGCATTGTAAAATGGCACAAGAATATATGAAAGTTCAAACAGAAATTGCATTGTTATTACAG 1554
|||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||.|||||
Sbjct 1481 CAGTGTTCGAACAACATTGTAAAATGGCACAGGAGTATATGAAAGTTCAAACCGAAATCGCATTGTTACTACAG 1554
Query 1555 AGAAAGCAAGAACTAGTTGCAGAACTGGACCAGGATGAAAAGGACCAGCAAAATACATCTCGCCTGGTACAGGA 1628
||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1555 AGAAAGCAAGAACTAGTTGCAGAATTGGACCAGGATGAAAAGGACCAGCAAAATACATCTCGTCTGGTACAGGA 1628
Query 1629 ACATAAAAAGCTTTTAGATGAAAACAAAAGCCTTTCTACTTACTACCAGCAATGCAAAAAACAACTAGAGGTCA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 ACATAAAAAGCTTTTAGATGAAAACAAAAGCCTTTCTACTTATTACCAGCAATGCAAAAAACAACTAGAGGTCA 1702
Query 1703 TCAGAAGTCAGCAGCAGAAACGACAAGGCACTTCA 1737
|||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TCAGAAGCCAACAGCAGAAACGACAAGGCACTTCA 1737