Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488479
• Subject: NM_015292.2
• Aligned Length: 3312
• Identities: 3312
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGAGCGATCTCCAGGAGAGGGCCCCAGCCCCAGCCCCATGGACCAGCCCTCTGCTCCCTCCGACCCCACTGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGCGATCTCCAGGAGAGGGCCCCAGCCCCAGCCCCATGGACCAGCCCTCTGCTCCCTCCGACCCCACTGA  74

Query   75  CCAGCCCCCCGCTGCTCACGCAAAGCCAGACCCAGGTTCTGGGGGCCAACCTGCTGGCCCTGGCGCGGCGGGTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCAGCCCCCCGCTGCTCACGCAAAGCCAGACCCAGGTTCTGGGGGCCAACCTGCTGGCCCTGGCGCGGCGGGTG  148

Query  149  AGGCCCTGGCGGTGCTGACTTCATTCGGGAGGCGGTTGCTGGTGCTGATACCTGTGTATTTGGCCGGGGCAGTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGCCCTGGCGGTGCTGACTTCATTCGGGAGGCGGTTGCTGGTGCTGATACCTGTGTATTTGGCCGGGGCAGTG  222

Query  223  GGACTCAGCGTGGGTTTCGTGCTCTTCGGCCTCGCCCTCTACCTGGGCTGGCGCCGGGTCCGCGACGAGAAAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGACTCAGCGTGGGTTTCGTGCTCTTCGGCCTCGCCCTCTACCTGGGCTGGCGCCGGGTCCGCGACGAGAAAGA  296

Query  297  ACGGAGCCTTCGAGCAGCGAGGCAGCTACTGGACGACGAGGAGCAGCTCACTGCGAAAACTCTCTATATGAGTC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACGGAGCCTTCGAGCAGCGAGGCAGCTACTGGACGACGAGGAGCAGCTCACTGCGAAAACTCTCTATATGAGTC  370

Query  371  ATCGAGAGCTACCTGCCTGGGTCAGCTTCCCAGACGTGGAAAAGGCTGAATGGCTCAATAAGATTGTGGCCCAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATCGAGAGCTACCTGCCTGGGTCAGCTTCCCAGACGTGGAAAAGGCTGAATGGCTCAATAAGATTGTGGCCCAG  444

Query  445  GTCTGGCCCTTCCTGGGCCAGTATATGGAGAAGCTTCTGGCTGAAACTGTGGCTCCGGCTGTTAGGGGATCTAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTCTGGCCCTTCCTGGGCCAGTATATGGAGAAGCTTCTGGCTGAAACTGTGGCTCCGGCTGTTAGGGGATCTAA  518

Query  519  CCCCCATCTGCAAACATTTACATTTACACGAGTGGAACTGGGTGAAAAGCCATTGCGCATCATTGGAGTCAAGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCCCCATCTGCAAACATTTACATTTACACGAGTGGAACTGGGTGAAAAGCCATTGCGCATCATTGGAGTCAAGG  592

Query  593  TTCACCCAGGTCAGAGAAAAGAGCAGATCCTGCTGGACTTGAACATCAGCTATGTAGGTGATGTGCAGATTGAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTCACCCAGGTCAGAGAAAAGAGCAGATCCTGCTGGACTTGAACATCAGCTATGTAGGTGATGTGCAGATTGAT  666

Query  667  GTGGAAGTGAAGAAATATTTTTGCAAAGCAGGAGTCAAGGGCATGCAGCTACATGGCGTTTTGCGGGTGATACT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTGGAAGTGAAGAAATATTTTTGCAAAGCAGGAGTCAAGGGCATGCAGCTACATGGCGTTTTGCGGGTGATACT  740

Query  741  GGAGCCACTCATTGGGGACCTTCCCTTCGTGGGGGCTGTGTCAATGTTCTTCATCCGACGCCCGACCCTAGACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGAGCCACTCATTGGGGACCTTCCCTTCGTGGGGGCTGTGTCAATGTTCTTCATCCGACGCCCGACCCTAGACA  814

Query  815  TCAACTGGACAGGGATGACCAACCTGCTGGATATCCCAGGACTTAGCTCACTCTCTGACACCATGATCATGGAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCAACTGGACAGGGATGACCAACCTGCTGGATATCCCAGGACTTAGCTCACTCTCTGACACCATGATCATGGAC  888

Query  889  TCCATTGCTGCCTTCCTCGTGTTGCCCAACCGATTACTGGTGCCCCTTGTGCCTGACCTTCAAGATGTGGCTCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCCATTGCTGCCTTCCTCGTGTTGCCCAACCGATTACTGGTGCCCCTTGTGCCTGACCTTCAAGATGTGGCTCA  962

Query  963  GTTGCGTTCCCCTCTGCCCAGGGGCATTATTCGAATTCACCTGCTGGCTGCTCGAGGGCTGAGTTCCAAGGACA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GTTGCGTTCCCCTCTGCCCAGGGGCATTATTCGAATTCACCTGCTGGCTGCTCGAGGGCTGAGTTCCAAGGACA  1036

Query 1037  AATATGTGAAGGGCCTGATTGAGGGCAAGTCAGACCCATATGCACTTGTGCGTTTGGGTACCCAGACATTCTGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AATATGTGAAGGGCCTGATTGAGGGCAAGTCAGACCCATATGCACTTGTGCGTTTGGGTACCCAGACATTCTGC  1110

Query 1111  AGTCGTGTCATTGATGAAGAACTCAACCCACAGTGGGGAGAGACTTATGAGGTGATGGTACACGAGGTCCCAGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGTCGTGTCATTGATGAAGAACTCAACCCACAGTGGGGAGAGACTTATGAGGTGATGGTACACGAGGTCCCAGG  1184

Query 1185  GCAGGAGATTGAAGTGGAGGTGTTCGACAAGGATCCAGATAAAGATGACTTTCTGGGCAGAATGAAGCTGGATG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCAGGAGATTGAAGTGGAGGTGTTCGACAAGGATCCAGATAAAGATGACTTTCTGGGCAGAATGAAGCTGGATG  1258

Query 1259  TAGGGAAGGTGTTACAGGCTAGCGTTCTGGATGATTGGTTCCCTCTACAAGGTGGGCAAGGCCAAGTTCACTTG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TAGGGAAGGTGTTACAGGCTAGCGTTCTGGATGATTGGTTCCCTCTACAAGGTGGGCAAGGCCAAGTTCACTTG  1332

Query 1333  AGGCTAGAATGGCTGTCACTTTTGTCAGATGCAGAGAAACTGGAGCAGGTTCTACAGTGGAATTGGGGAGTCTC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AGGCTAGAATGGCTGTCACTTTTGTCAGATGCAGAGAAACTGGAGCAGGTTCTACAGTGGAATTGGGGAGTCTC  1406

Query 1407  CTCTCGACCAGATCCCCCGTCAGCTGCCATCTTAGTTGTCTACCTGGATCGGGCCCAGGATCTTCCTCTGAAGA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CTCTCGACCAGATCCCCCGTCAGCTGCCATCTTAGTTGTCTACCTGGATCGGGCCCAGGATCTTCCTCTGAAGA  1480

Query 1481  AGGGGAACAAGGAACCCAACCCTATGGTACAACTGTCAATTCAGGATGTGACTCAGGAGAGCAAGGCTGTCTAC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGGGGAACAAGGAACCCAACCCTATGGTACAACTGTCAATTCAGGATGTGACTCAGGAGAGCAAGGCTGTCTAC  1554

Query 1555  AGTACCAACTGCCCAGTGTGGGAGGAAGCGTTCCGGTTCTTCCTACAAGACCCTCAAAGCCAGGAGCTCGATGT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AGTACCAACTGCCCAGTGTGGGAGGAAGCGTTCCGGTTCTTCCTACAAGACCCTCAAAGCCAGGAGCTCGATGT  1628

Query 1629  GCAAGTGAAGGATGATTCCAGGGCCCTGACTTTAGGAGCACTGACGCTGCCTCTGGCCCGCCTGCTGACTGCCC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GCAAGTGAAGGATGATTCCAGGGCCCTGACTTTAGGAGCACTGACGCTGCCTCTGGCCCGCCTGCTGACTGCCC  1702

Query 1703  CAGAACTCATCCTGGACCAGTGGTTCCAGCTCAGCAGCTCTGGTCCAAACTCCAGACTCTATATGAAACTAGTC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CAGAACTCATCCTGGACCAGTGGTTCCAGCTCAGCAGCTCTGGTCCAAACTCCAGACTCTATATGAAACTAGTC  1776

Query 1777  ATGAGGATCCTGTACTTGGATTCATCAGAAATATGCTTCCCCACGGTGCCTGGTTGTCCTGGTGCTTGGGACGT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  ATGAGGATCCTGTACTTGGATTCATCAGAAATATGCTTCCCCACGGTGCCTGGTTGTCCTGGTGCTTGGGACGT  1850

Query 1851  GGACAGTGAGAATCCCCAGAGAGGCAGCAGTGTGGATGCCCCACCTCGACCCTGTCACACGACTCCTGATAGCC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GGACAGTGAGAATCCCCAGAGAGGCAGCAGTGTGGATGCCCCACCTCGACCCTGTCACACGACTCCTGATAGCC  1924

Query 1925  AGTTTGGGACTGAGCATGTGCTTCGGATCCATGTATTAGAGGCCCAGGACCTGATTGCCAAAGACCGTTTCTTG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AGTTTGGGACTGAGCATGTGCTTCGGATCCATGTATTAGAGGCCCAGGACCTGATTGCCAAAGACCGTTTCTTG  1998

Query 1999  GGGGGACTGGTGAAGGGCAAGTCAGACCCCTATGTCAAACTAAAGTTGGCAGGACGAAGCTTCCGGAGCCATGT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GGGGGACTGGTGAAGGGCAAGTCAGACCCCTATGTCAAACTAAAGTTGGCAGGACGAAGCTTCCGGAGCCATGT  2072

Query 2073  TGTTCGGGAAGATCTCAATCCCCGCTGGAATGAGGTTTTTGAGGTGATCGTCACATCAGTTCCAGGCCAAGAGC  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TGTTCGGGAAGATCTCAATCCCCGCTGGAATGAGGTTTTTGAGGTGATCGTCACATCAGTTCCAGGCCAAGAGC  2146

Query 2147  TAGAGGTTGAAGTCTTTGACAAGGACTTGGACAAGGATGATTTTCTGGGCAGGTGTAAAGTGCGTCTCACCACA  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TAGAGGTTGAAGTCTTTGACAAGGACTTGGACAAGGATGATTTTCTGGGCAGGTGTAAAGTGCGTCTCACCACA  2220

Query 2221  GTCTTAAACAGTGGCTTCCTTGATGAGTGGCTGACCCTGGAGGATGTCCCATCTGGCCGCCTGCACTTGCGCCT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GTCTTAAACAGTGGCTTCCTTGATGAGTGGCTGACCCTGGAGGATGTCCCATCTGGCCGCCTGCACTTGCGCCT  2294

Query 2295  GGAGCGTCTCACCCCCCGTCCCACTGCTGCTGAGTTAGAGGAGGTGCTGCAGGTGAATAGTTTGATCCAGACTC  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GGAGCGTCTCACCCCCCGTCCCACTGCTGCTGAGTTAGAGGAGGTGCTGCAGGTGAATAGTTTGATCCAGACTC  2368

Query 2369  AGAAGAGTGCGGAGCTGGCTGCGGCCCTGCTATCCATCTATATGGAGCGGGCAGAGGACCTCCCGCTGCGAAAA  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  AGAAGAGTGCGGAGCTGGCTGCGGCCCTGCTATCCATCTATATGGAGCGGGCAGAGGACCTCCCGCTGCGAAAA  2442

Query 2443  GGCACCAAGCACCTCAGCCCTTATGCTACTCTCACTGTGGGAGATAGTTCTCATAAAACCAAGACTATTTCGCA  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  GGCACCAAGCACCTCAGCCCTTATGCTACTCTCACTGTGGGAGATAGTTCTCATAAAACCAAGACTATTTCGCA  2516

Query 2517  AACTTCAGCCCCTGTCTGGGATGAGAGTGCCTCCTTTCTCATCAGGAAACCACACACTGAGAGCCTAGAGTTGC  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  AACTTCAGCCCCTGTCTGGGATGAGAGTGCCTCCTTTCTCATCAGGAAACCACACACTGAGAGCCTAGAGTTGC  2590

Query 2591  AGGTTCGGGGTGAGGGCACTGGCGTGCTGGGCTCATTATCCCTGCCCCTCTCAGAGCTCCTCGTGGCTGACCAG  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  AGGTTCGGGGTGAGGGCACTGGCGTGCTGGGCTCATTATCCCTGCCCCTCTCAGAGCTCCTCGTGGCTGACCAG  2664

Query 2665  CTCTGCTTGGACCGCTGGTTTACACTCAGCAGTGGTCAGGGGCAGGTGCTACTGAGAGCACAGCTAGGGATCCT  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  CTCTGCTTGGACCGCTGGTTTACACTCAGCAGTGGTCAGGGGCAGGTGCTACTGAGAGCACAGCTAGGGATCCT  2738

Query 2739  GGTGTCCCAGCACTCGGGAGTGGAAGCTCATAGCCACAGCTACAGCCACAGCTCCTCATCGCTGAGTGAAGAAC  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  GGTGTCCCAGCACTCGGGAGTGGAAGCTCATAGCCACAGCTACAGCCACAGCTCCTCATCGCTGAGTGAAGAAC  2812

Query 2813  CAGAGCTCTCGGGGGGACCCCCTCACATCACCTCCTCAGCCCCAGAGCTCCGGCAGCGCCTAACACATGTTGAC  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  CAGAGCTCTCGGGGGGACCCCCTCACATCACCTCCTCAGCCCCAGAGCTCCGGCAGCGCCTAACACATGTTGAC  2886

Query 2887  AGTCCCCTTGAGGCTCCAGCCGGGCCTCTGGGCCAGGTGAAACTGACTCTGTGGTACTACAGTGAAGAACGAAA  2960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  AGTCCCCTTGAGGCTCCAGCCGGGCCTCTGGGCCAGGTGAAACTGACTCTGTGGTACTACAGTGAAGAACGAAA  2960

Query 2961  GCTGGTCAGCATTGTTCATGGTTGCCGGTCCCTTCGACAGAATGGACGTGATCCTCCTGATCCCTATGTGTCAC  3034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  GCTGGTCAGCATTGTTCATGGTTGCCGGTCCCTTCGACAGAATGGACGTGATCCTCCTGATCCCTATGTGTCAC  3034

Query 3035  TGTTGCTACTGCCAGACAAGAACCGAGGCACCAAGAGGAGGACCTCACAGAAGAAGAGGACCCTGAGTCCTGAA  3108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  TGTTGCTACTGCCAGACAAGAACCGAGGCACCAAGAGGAGGACCTCACAGAAGAAGAGGACCCTGAGTCCTGAA  3108

Query 3109  TTTAATGAACGGTTTGAGTGGGAACTCCCCCTGGATGAGGCCCAGAGACGAAAGCTGGATGTCTCTGTCAAGTC  3182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  TTTAATGAACGGTTTGAGTGGGAACTCCCCCTGGATGAGGCCCAGAGACGAAAGCTGGATGTCTCTGTCAAGTC  3182

Query 3183  TAATTCCTCCTTCATGTCAAGAGAGCGTGAGCTGCTGGGGAAGGTGCAGCTGGACCTAGCTGAGACAGACCTTT  3256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  TAATTCCTCCTTCATGTCAAGAGAGCGTGAGCTGCTGGGGAAGGTGCAGCTGGACCTAGCTGAGACAGACCTTT  3256

Query 3257  CCCAGGGTGTAGCCCGGTGGTATGACCTGATGGACAACAAGGACAAGGGCAGCTCC  3312
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257  CCCAGGGTGTAGCCCGGTGGTATGACCTGATGGACAACAAGGACAAGGGCAGCTCC  3312