Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488486
• Subject: NM_001174053.1
• Aligned Length: 1755
• Identities: 1387
• Gaps: 249

Alignment

Query    1  ATGGCCACCACGGTGACCTGCACCCGCTTCACCGACGAGTACCAGCTCTACGAGGATATTGGCAAGGGGGCTTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCACCACGGTGACCTGCACCCGTTTCACCGACGAGTACCAGCTATACGAGGATATTGGCAAGGGGGCTTT  74

Query   75  CTCTGTGGTCCGACGCTGTGTCAAGCTCTGCACCGGCCATGAGTATGCAGCCAAGATCATCAACACCAAGAAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct   75  CTCTGTGGTCCGACGCTGTGTCAAGCTCTGTACCGGCCATGAGTATGCAGCCAAGATCATTAATACCAAGAAGC  148

Query  149  TGTCAGCCAGAGATCACCAGAAGCTGGAGAGAGAGGCTCGGATCTGCCGCCTTCTGAAGCATTCCAACATCGTG  222
            ||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.
Sbjct  149  TGTCGGCCAGAGATCACCAGAAACTGGAGAGAGAAGCTCGGATCTGCCGCCTGCTGAAGCATTCCAACATTGTA  222

Query  223  CGTCTCCACGACAGCATCTCCGAGGAGGGCTTCCACTACCTGGTCTTCGATCTGGTCACTGGTGGGGAGCTCTT  296
            ||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGCCTCCATGACAGCATCTCTGAAGAGGGCTTCCACTACCTGGTCTTCGATCTGGTCACTGGTGGGGAGCTCTT  296

Query  297  TGAAGACATTGTGGCGAGAGAGTACTACAGCGAGGCTGATGCCAGTCACTGTATCCAGCAGATCCTGGAGGCCG  370
            |||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct  297  TGAAGACATCGTGGCAAGAGAGTACTACAGTGAAGCTGATGCCAGTCACTGCATCCAGCAGATCCTGGAAGCTG  370

Query  371  TTCTCCATTGTCACCAAATGGGGGTCGTCCACAGAGACCTCAAGCCGGAGAACCTGCTTCTGGCCAGCAAGTGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  371  TTCTCCATTGTCACCAAATGGGGGTCGTCCACAGAGACCTCAAGCCTGAGAACCTGCTTCTGGCCAGCAAATGC  444

Query  445  AAAGGGGCTGCAGTGAAGCTGGCAGACTTCGGCCTAGCTATCGAGGTGCAGGGGGACCAGCAGGCATGGTTTGG  518
            |||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAAGGCGCCGCAGTGAAGCTGGCAGACTTCGGCCTGGCCATCGAGGTTCAGGGAGACCAGCAGGCATGGTTTGG  518

Query  519  TTTCGCTGGCACACCAGGCTACCTGTCCCCTGAGGTCCTTCGCAAAGAGGCGTATGGCAAGCCTGTGGACATCT  592
            .||.||.||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  519  ATTTGCGGGAACGCCAGGCTACCTGTCTCCCGAGGTCCTTCGGAAGGAGGCCTACGGCAAACCTGTGGACATCT  592

Query  593  GGGCATGTGGGGTGATCCTGTACATCCTGCTCGTGGGCTACCCACCCTTCTGGGACGAGGACCAGCACAAGCTG  666
            ||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  593  GGGCATGTGGGGTGATCCTGTATATCCTGCTGGTGGGCTACCCACCTTTCTGGGATGAGGACCAACACAAGCTG  666

Query  667  TACCAGCAGATCAAGGCTGGTGCCTATGACTTCCCGTCCCCTGAGTGGGACACCGTCACTCCTGAAGCCAAAAA  740
            ||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  667  TACCAGCAGATCAAGGCTGGGGCGTATGATTTCCCATCCCCTGAGTGGGACACCGTTACTCCTGAAGCCAAAAA  740

Query  741  CCTCATCAACCAGATGCTGACCATCAACCCTGCCAAGCGCATCACAGCCCATGAGGCCCTGAAGCACCCGTGGG  814
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  741  CCTCATCAACCAGATGCTGACCATCAACCCTGCCAAGCGCATCACGGCCCATGAGGCCCTGAAGCACCCATGGG  814

Query  815  TCTGCCAACGCTCCACGGTAGCATCCATGATGCACAGACAGGAGACTGTGGAGTGTCTGAAAAAGTTCAATGCC  888
            ||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct  815  TCTGCCAACGTTCCACCGTGGCCTCTATGATGCACAGACAGGAGACTGTGGAATGTCTGAAGAAGTTCAATGCA  888

Query  889  AGGAGAAAGCTCAAGGGAGCCATCCTCACCACCATGCTGGCCACACGGAATTTCTCAGTGGGCAGACAGACCAC  962
            |||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||                  
Sbjct  889  AGGAGGAAGCTCAAGGGAGCCATCCTCACCACTATGCTGGCCACACGGAATTTCTC------------------  944

Query  963  CGCTCCGGCCACAATGTCCACCGCGGCCTCCGGCACCACCATGGGGCTGGTGGAACAAGCCAAGAGTTTACTCA  1036
                                                                     |||||||||||||||||
Sbjct  945  ---------------------------------------------------------AGCCAAGAGTTTACTCA  961

Query 1037  ACAAGAAAGCAGATGGAGTCAAGCCCCAGACGAATAGCACCAAAAACAGTGCAGCCGCCACCAGCCCCAAAGGG  1110
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||..|.|||..|||||||||||||||.
Sbjct  962  ACAAGAAAGCAGATGGAGTCAAGCCCCAGACAAACAGCACCAAAAACAGCTCGGCCATCACCAGCCCCAAAGGA  1035

Query 1111  ACGCTTCCTCCTGCCGCCCTGGAGCCTCAAACCACCGTCATCCATAACCCAGTGGACGGGATTAAGGAGTCTTC  1184
            .|.||.||||||||.|||||                                             |||.|||||
Sbjct 1036  TCTCTCCCTCCTGCTGCCCT---------------------------------------------GGAATCTTC  1064

Query 1185  TGACAGTGCCAATACCACCATAGAGGATGAAGACGCTAAAG---------------------------------  1225
            .|||||..||||.||.|||||||||||||||||.||.||||                                 
Sbjct 1065  CGACAGCACCAACACAACCATAGAGGATGAAGATGCCAAAGCCCCCAGGATCTCTGACATCCTCAACTCAGTGA  1138

Query 1226  --------------------------------------------------------------------------  1225
                                                                                      
Sbjct 1139  GGCGGGGCTCAGGGACCCCAGAAGCTGAGGGCCTCCCACCAGTGGGCCCCCCACCCTGCCCATCTCCGACTCTC  1212

Query 1226  ----------------------CCCGGAAGCAGGAGATCATTAAGACCACGGAGCAGCTCATCGAGGCCGTCAA  1277
                                  |||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1213  CCTGGCCCCTTGCCCACCCCATCCCGGAAGCAGGAAATCATCAAGACCACAGAGCAGCTCATTGAGGCCGTCAA  1286

Query 1278  CAACGGTGACTTTGAGGCCTACGCGAAAATCTGTGACCCAGGGCTGACCTCGTTTGAGCCTGAAGCACTGGGCA  1351
            |||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1287  CAATGGGGACTTTGAGGCCTATGCGAAAATCTGTGACCCAGGCCTGACCTCATTTGAGCCTGAAGCTCTGGGCA  1360

Query 1352  ACCTGGTTGAAGGGATGGACTTCCACAGATTCTACTTCGAGAACCTGCTGGCCAAGAACAGCAAGCCGATCCAC  1425
            |||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1361  ACCTGGTCGAAGGGATGGATTTCCACAGATTCTACTTTGAGAACCTGCTGGCCAAGAACAGCAAGCCGATCCAC  1434

Query 1426  ACGACCATCCTGAACCCACACGTGCACGTCATTGGAGAGGATGCCGCCTGCATCGCTTACATCCGGCTCACGCA  1499
            ||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||
Sbjct 1435  ACCACCATCCTGAACCCGCACGTGCACGTCATTGGCGAGGATGCGGCATGCATCGCCTACATCCGCCTCACACA  1508

Query 1500  GTACATTGACGGGCAGGGCCGGCCCCGCACCAGCCAGTCTGAGGAGACCCGCGTGTGGCACCGCCGCGACGGCA  1573
            ||||||.||.||.||||||.|.|||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1509  GTACATCGATGGCCAGGGCAGACCCCGTACCAGCCAGTCCGAAGAGACCCGTGTGTGGCACCGCCGCGACGGCA  1582

Query 1574  AGTGGCAGAACGTGCACTTCCACTGCTCGGGCGCGCCTGTGGCCCCGCTGCAG  1626
            ||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1583  AGTGGCAGAATGTACATTTCCACTGCTCGGGCGCTCCAGTGGCCCCGCTGCAG  1635