Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488486
• Subject: NM_001174054.1
• Aligned Length: 1659
• Identities: 1433
• Gaps: 105

Alignment

Query    1  ATGGCCACCACGGTGACCTGCACCCGCTTCACCGACGAGTACCAGCTCTACGAGGATATTGGCAAGGGGGCTTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCACCACGGTGACCTGCACCCGTTTCACCGACGAGTACCAGCTATACGAGGATATTGGCAAGGGGGCTTT  74

Query   75  CTCTGTGGTCCGACGCTGTGTCAAGCTCTGCACCGGCCATGAGTATGCAGCCAAGATCATCAACACCAAGAAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct   75  CTCTGTGGTCCGACGCTGTGTCAAGCTCTGTACCGGCCATGAGTATGCAGCCAAGATCATTAATACCAAGAAGC  148

Query  149  TGTCAGCCAGAGATCACCAGAAGCTGGAGAGAGAGGCTCGGATCTGCCGCCTTCTGAAGCATTCCAACATCGTG  222
            ||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.
Sbjct  149  TGTCGGCCAGAGATCACCAGAAACTGGAGAGAGAAGCTCGGATCTGCCGCCTGCTGAAGCATTCCAACATTGTA  222

Query  223  CGTCTCCACGACAGCATCTCCGAGGAGGGCTTCCACTACCTGGTCTTCGATCTGGTCACTGGTGGGGAGCTCTT  296
            ||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGCCTCCATGACAGCATCTCTGAAGAGGGCTTCCACTACCTGGTCTTCGATCTGGTCACTGGTGGGGAGCTCTT  296

Query  297  TGAAGACATTGTGGCGAGAGAGTACTACAGCGAGGCTGATGCCAGTCACTGTATCCAGCAGATCCTGGAGGCCG  370
            |||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct  297  TGAAGACATCGTGGCAAGAGAGTACTACAGTGAAGCTGATGCCAGTCACTGCATCCAGCAGATCCTGGAAGCTG  370

Query  371  TTCTCCATTGTCACCAAATGGGGGTCGTCCACAGAGACCTCAAGCCGGAGAACCTGCTTCTGGCCAGCAAGTGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  371  TTCTCCATTGTCACCAAATGGGGGTCGTCCACAGAGACCTCAAGCCTGAGAACCTGCTTCTGGCCAGCAAATGC  444

Query  445  AAAGGGGCTGCAGTGAAGCTGGCAGACTTCGGCCTAGCTATCGAGGTGCAGGGGGACCAGCAGGCATGGTTTGG  518
            |||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAAGGCGCCGCAGTGAAGCTGGCAGACTTCGGCCTGGCCATCGAGGTTCAGGGAGACCAGCAGGCATGGTTTGG  518

Query  519  TTTCGCTGGCACACCAGGCTACCTGTCCCCTGAGGTCCTTCGCAAAGAGGCGTATGGCAAGCCTGTGGACATCT  592
            .||.||.||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  519  ATTTGCGGGAACGCCAGGCTACCTGTCTCCCGAGGTCCTTCGGAAGGAGGCCTACGGCAAACCTGTGGACATCT  592

Query  593  GGGCATGT---------------------------------GGGGTGATCCTGTACATCCTGCTCGTGGGCTAC  633
            ||||||||                                 ||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  593  GGGCATGTGGCCATTATGTTTGTCTGCCTGTGCTCATTATAGGGGTGATCCTGTATATCCTGCTGGTGGGCTAC  666

Query  634  CCACCCTTCTGGGACGAGGACCAGCACAAGCTGTACCAGCAGATCAAGGCTGGTGCCTATGACTTCCCGTCCCC  707
            |||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||
Sbjct  667  CCACCTTTCTGGGATGAGGACCAACACAAGCTGTACCAGCAGATCAAGGCTGGGGCGTATGATTTCCCATCCCC  740

Query  708  TGAGTGGGACACCGTCACTCCTGAAGCCAAAAACCTCATCAACCAGATGCTGACCATCAACCCTGCCAAGCGCA  781
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGAGTGGGACACCGTTACTCCTGAAGCCAAAAACCTCATCAACCAGATGCTGACCATCAACCCTGCCAAGCGCA  814

Query  782  TCACAGCCCATGAGGCCCTGAAGCACCCGTGGGTCTGCCAACGCTCCACGGTAGCATCCATGATGCACAGACAG  855
            ||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct  815  TCACGGCCCATGAGGCCCTGAAGCACCCATGGGTCTGCCAACGTTCCACCGTGGCCTCTATGATGCACAGACAG  888

Query  856  GAGACTGTGGAGTGTCTGAAAAAGTTCAATGCCAGGAGAAAGCTCAAGGGAGCCATCCTCACCACCATGCTGGC  929
            |||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  889  GAGACTGTGGAATGTCTGAAGAAGTTCAATGCAAGGAGGAAGCTCAAGGGAGCCATCCTCACCACTATGCTGGC  962

Query  930  CACACGGAATTTCTCAGTGGGCAGACAGACCACCGCTCCGGCCACAATGTCCACCGCGGCCTCCGGCACCACCA  1003
            |||||||||||||||||                                                         
Sbjct  963  CACACGGAATTTCTCAG---------------------------------------------------------  979

Query 1004  TGGGGCTGGTGGAACAAGCCAAGAGTTTACTCAACAAGAAAGCAGATGGAGTCAAGCCCCAGACGAATAGCACC  1077
                           .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  980  ---------------CAGCCAAGAGTTTACTCAACAAGAAAGCAGATGGAGTCAAGCCCCAGACAAACAGCACC  1038

Query 1078  AAAAACAGTGCAGCCGCCACCAGCCCCAAAGGGACGCTTCCTCCTGCCGCCCTGGAGCCTCAAACCACCGTCAT  1151
            ||||||||..|.|||..|||||||||||||||..|.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1039  AAAAACAGCTCGGCCATCACCAGCCCCAAAGGATCTCTCCCTCCTGCTGCCCTGGAGCCTCAAACCACCGTTAT  1112

Query 1152  CCATAACCCAGTGGACGGGATTAAGGAGTCTTCTGACAGTGCCAATACCACCATAGAGGATGAAGACGCTAAAG  1225
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||..||||.||.|||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1113  CCATAACCCAGTGGACGGGATTAAGGAATCTTCCGACAGCACCAACACAACCATAGAGGATGAAGATGCCAAAG  1186

Query 1226  CCCGGAAGCAGGAGATCATTAAGACCACGGAGCAGCTCATCGAGGCCGTCAACAACGGTGACTTTGAGGCCTAC  1299
            |||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.
Sbjct 1187  CCCGGAAGCAGGAAATCATCAAGACCACAGAGCAGCTCATTGAGGCCGTCAACAATGGGGACTTTGAGGCCTAT  1260

Query 1300  GCGAAAATCTGTGACCCAGGGCTGACCTCGTTTGAGCCTGAAGCACTGGGCAACCTGGTTGAAGGGATGGACTT  1373
            ||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1261  GCGAAAATCTGTGACCCAGGCCTGACCTCATTTGAGCCTGAAGCTCTGGGCAACCTGGTCGAAGGGATGGATTT  1334

Query 1374  CCACAGATTCTACTTCGAGAACCTGCTGGCCAAGAACAGCAAGCCGATCCACACGACCATCCTGAACCCACACG  1447
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1335  CCACAGATTCTACTTTGAGAACCTGCTGGCCAAGAACAGCAAGCCGATCCACACCACCATCCTGAACCCGCACG  1408

Query 1448  TGCACGTCATTGGAGAGGATGCCGCCTGCATCGCTTACATCCGGCTCACGCAGTACATTGACGGGCAGGGCCGG  1521
            |||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||.||||||.|.
Sbjct 1409  TGCACGTCATTGGCGAGGATGCGGCATGCATCGCCTACATCCGCCTCACACAGTACATCGATGGCCAGGGCAGA  1482

Query 1522  CCCCGCACCAGCCAGTCTGAGGAGACCCGCGTGTGGCACCGCCGCGACGGCAAGTGGCAGAACGTGCACTTCCA  1595
            |||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct 1483  CCCCGTACCAGCCAGTCCGAAGAGACCCGTGTGTGGCACCGCCGCGACGGCAAGTGGCAGAATGTACATTTCCA  1556

Query 1596  CTGCTCGGGCGCGCCTGTGGCCCCGCTGCAG  1626
            ||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1557  CTGCTCGGGCGCTCCAGTGGCCCCGCTGCAG  1587