Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000488486
- Subject:
- NM_001220.5
- Aligned Length:
- 1998
- Identities:
- 1626
- Gaps:
- 372
Alignment
Query 1 ATGGCCACCACGGTGACCTGCACCCGCTTCACCGACGAGTACCAGCTCTACGAGGATATTGGCAAGGGGGCTTT 74
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Sbjct 1 ATGGCCACCACGGTGACCTGCACCCGCTTCACCGACGAGTACCAGCTCTACGAGGATATTGGCAAGGGGGCTTT 74
Query 75 CTCTGTGGTCCGACGCTGTGTCAAGCTCTGCACCGGCCATGAGTATGCAGCCAAGATCATCAACACCAAGAAGC 148
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Sbjct 75 CTCTGTGGTCCGACGCTGTGTCAAGCTCTGCACCGGCCATGAGTATGCAGCCAAGATCATCAACACCAAGAAGC 148
Query 149 TGTCAGCCAGAGATCACCAGAAGCTGGAGAGAGAGGCTCGGATCTGCCGCCTTCTGAAGCATTCCAACATCGTG 222
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Sbjct 149 TGTCAGCCAGAGATCACCAGAAGCTGGAGAGAGAGGCTCGGATCTGCCGCCTTCTGAAGCATTCCAACATCGTG 222
Query 223 CGTCTCCACGACAGCATCTCCGAGGAGGGCTTCCACTACCTGGTCTTCGATCTGGTCACTGGTGGGGAGCTCTT 296
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Sbjct 223 CGTCTCCACGACAGCATCTCCGAGGAGGGCTTCCACTACCTGGTCTTCGATCTGGTCACTGGTGGGGAGCTCTT 296
Query 297 TGAAGACATTGTGGCGAGAGAGTACTACAGCGAGGCTGATGCCAGTCACTGTATCCAGCAGATCCTGGAGGCCG 370
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Sbjct 297 TGAAGACATTGTGGCGAGAGAGTACTACAGCGAGGCTGATGCCAGTCACTGTATCCAGCAGATCCTGGAGGCCG 370
Query 371 TTCTCCATTGTCACCAAATGGGGGTCGTCCACAGAGACCTCAAGCCGGAGAACCTGCTTCTGGCCAGCAAGTGC 444
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Sbjct 371 TTCTCCATTGTCACCAAATGGGGGTCGTCCACAGAGACCTCAAGCCGGAGAACCTGCTTCTGGCCAGCAAGTGC 444
Query 445 AAAGGGGCTGCAGTGAAGCTGGCAGACTTCGGCCTAGCTATCGAGGTGCAGGGGGACCAGCAGGCATGGTTTGG 518
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Sbjct 445 AAAGGGGCTGCAGTGAAGCTGGCAGACTTCGGCCTAGCTATCGAGGTGCAGGGGGACCAGCAGGCATGGTTTGG 518
Query 519 TTTCGCTGGCACACCAGGCTACCTGTCCCCTGAGGTCCTTCGCAAAGAGGCGTATGGCAAGCCTGTGGACATCT 592
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Sbjct 519 TTTCGCTGGCACACCAGGCTACCTGTCCCCTGAGGTCCTTCGCAAAGAGGCGTATGGCAAGCCTGTGGACATCT 592
Query 593 GGGCATGTGGGGTGATCCTGTACATCCTGCTCGTGGGCTACCCACCCTTCTGGGACGAGGACCAGCACAAGCTG 666
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Sbjct 593 GGGCATGTGGGGTGATCCTGTACATCCTGCTCGTGGGCTACCCACCCTTCTGGGACGAGGACCAGCACAAGCTG 666
Query 667 TACCAGCAGATCAAGGCTGGTGCCTATGACTTCCCGTCCCCTGAGTGGGACACCGTCACTCCTGAAGCCAAAAA 740
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Sbjct 667 TACCAGCAGATCAAGGCTGGTGCCTATGACTTCCCGTCCCCTGAGTGGGACACCGTCACTCCTGAAGCCAAAAA 740
Query 741 CCTCATCAACCAGATGCTGACCATCAACCCTGCCAAGCGCATCACAGCCCATGAGGCCCTGAAGCACCCGTGGG 814
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Sbjct 741 CCTCATCAACCAGATGCTGACCATCAACCCTGCCAAGCGCATCACAGCCCATGAGGCCCTGAAGCACCCGTGGG 814
Query 815 TCTGCCAACGCTCCACGGTAGCATCCATGATGCACAGACAGGAGACTGTGGAGTGTCTGAAAAAGTTCAATGCC 888
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Sbjct 815 TCTGCCAACGCTCCACGGTAGCATCCATGATGCACAGACAGGAGACTGTGGAGTGTCTGAAAAAGTTCAATGCC 888
Query 889 AGGAGAAAGCTCAAGGGAGCCATCCTCACCACCATGCTGGCCACACGGAATTTCTCAGTGGGCAGACAGACCAC 962
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Sbjct 889 AGGAGAAAGCTCAAGGGAGCCATCCTCACCACCATGCTGGCCACACGGAATTTCTCAGTGGGCAGACAGACCAC 962
Query 963 CGCTCCGGCCACAATGTCCACCGCGGCCTCCGGCACCACCATGGGGCTGGTGGAACAAGCCAAGAGTTTACTCA 1036
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Sbjct 963 CGCTCCGGCCACAATGTCCACCGCGGCCTCCGGCACCACCATGGGGCTGGTGGAACAAGCCAAGAGTTTACTCA 1036
Query 1037 ACAAGAAAGCAGATGGAGTCAAGCCCCAGACGAATAGCACCAAAAACAGTGCAGCCGCCACCAGCCCCAAAGGG 1110
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Sbjct 1037 ACAAGAAAGCAGATGGAGTCAAGCCCCAGACGAATAGCACCAAAAACAGTGCAGCCGCCACCAGCCCCAAAGGG 1110
Query 1111 ACGCTTCCTCCTGCCGCCCTGGAGCCTCAAACCACCGTCATCCATAACCCAGTGGACGGGATTAAGGAGTCTTC 1184
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Sbjct 1111 ACGCTTCCTCCTGCCGCCCTGGAGCCTCAAACCACCGTCATCCATAACCCAGTGGACGGGATTAAGGAGTCTTC 1184
Query 1185 TGACAGTGCCAATACCACCATAGAGGATGAAGACGCTAAAG--------------------------------- 1225
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Sbjct 1185 TGACAGTGCCAATACCACCATAGAGGATGAAGACGCTAAAGCCCCCAGGGTCCCCGACATCCTGAGCTCAGTGA 1258
Query 1226 -------------------------------------------------------------------------- 1225
Sbjct 1259 GGAGGGGCTCGGGAGCCCCAGAAGCCGAGGGGCCCCTGCCCTGCCCATCTCCGGCTCCCTTTAGCCCCCTGCCA 1332
Query 1226 -------------------------------------------------------------------------- 1225
Sbjct 1333 GCCCCATCCCCCAGGATCTCTGACATCCTGAACTCTGTGAGAAGGGGTTCAGGAACCCCAGAAGCCGAGGGCCC 1406
Query 1226 -------------------------------------------------------------------------- 1225
Sbjct 1407 CCTCTCAGCGGGGCCCCCGCCCTGCCTGTCTCCGGCTCTCCTAGGCCCCCTGTCCTCCCCGTCCCCCAGGATCT 1480
Query 1226 -------------------------------------------------------------------------- 1225
Sbjct 1481 CTGACATCCTGAACTCTGTGAGGAGGGGCTCAGGGACCCCAGAAGCCGAGGGCCCCTCGCCAGTGGGGCCCCCG 1554
Query 1226 -------------------------------------------CCCGGAAGCAGGAGATCATTAAGACCACGGA 1256
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Sbjct 1555 CCCTGCCCATCTCCGACTATCCCTGGCCCCCTGCCCACCCCATCCCGGAAGCAGGAGATCATTAAGACCACGGA 1628
Query 1257 GCAGCTCATCGAGGCCGTCAACAACGGTGACTTTGAGGCCTACGCGAAAATCTGTGACCCAGGGCTGACCTCGT 1330
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Sbjct 1629 GCAGCTCATCGAGGCCGTCAACAACGGTGACTTTGAGGCCTACGCGAAAATCTGTGACCCAGGGCTGACCTCGT 1702
Query 1331 TTGAGCCTGAAGCACTGGGCAACCTGGTTGAAGGGATGGACTTCCACAGATTCTACTTCGAGAACCTGCTGGCC 1404
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Sbjct 1703 TTGAGCCTGAAGCACTGGGCAACCTGGTTGAAGGGATGGACTTCCACAGATTCTACTTCGAGAACCTGCTGGCC 1776
Query 1405 AAGAACAGCAAGCCGATCCACACGACCATCCTGAACCCACACGTGCACGTCATTGGAGAGGATGCCGCCTGCAT 1478
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Sbjct 1777 AAGAACAGCAAGCCGATCCACACGACCATCCTGAACCCACACGTGCACGTCATTGGAGAGGATGCCGCCTGCAT 1850
Query 1479 CGCTTACATCCGGCTCACGCAGTACATTGACGGGCAGGGCCGGCCCCGCACCAGCCAGTCTGAGGAGACCCGCG 1552
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Sbjct 1851 CGCTTACATCCGGCTCACGCAGTACATTGACGGGCAGGGCCGGCCCCGCACCAGCCAGTCTGAGGAGACCCGCG 1924
Query 1553 TGTGGCACCGCCGCGACGGCAAGTGGCAGAACGTGCACTTCCACTGCTCGGGCGCGCCTGTGGCCCCGCTGCAG 1626
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Sbjct 1925 TGTGGCACCGCCGCGACGGCAAGTGGCAGAACGTGCACTTCCACTGCTCGGGCGCGCCTGTGGCCCCGCTGCAG 1998