Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488486
• Subject: XM_005249864.3
• Aligned Length: 1626
• Identities: 1481
• Gaps: 144

Alignment

Query    1  ATGGCCACCACGGTGACCTGCACCCGCTTCACCGACGAGTACCAGCTCTACGAGGATATTGGCAAGGGGGCTTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCACCACGGTGACCTGCACCCGCTTCACCGACGAGTACCAGCTCTACGAGGATATTGGCAAGGGGGCTTT  74

Query   75  CTCTGTGGTCCGACGCTGTGTCAAGCTCTGCACCGGCCATGAGTATGCAGCCAAGATCATCAACACCAAGAAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCTGTGGTCCGACGCTGTGTCAAGCTCTGCACCGGCCATGAGTATGCAGCCAAGATCATCAACACCAAGAAGC  148

Query  149  TGTCAGCCAGAGATCACCAGAAGCTGGAGAGAGAGGCTCGGATCTGCCGCCTTCTGAAGCATTCCAACATCGTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGTCAGCCAGAGATCACCAGAAGCTGGAGAGAGAGGCTCGGATCTGCCGCCTTCTGAAGCATTCCAACATCGTG  222

Query  223  CGTCTCCACGACAGCATCTCCGAGGAGGGCTTCCACTACCTGGTCTTCGATCTGGTCACTGGTGGGGAGCTCTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGTCTCCACGACAGCATCTCCGAGGAGGGCTTCCACTACCTGGTCTTCGATCTGGTCACTGGTGGGGAGCTCTT  296

Query  297  TGAAGACATTGTGGCGAGAGAGTACTACAGCGAGGCTGATGCCAGTCACTGTATCCAGCAGATCCTGGAGGCCG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGAAGACATTGTGGCGAGAGAGTACTACAGCGAGGCTGATGCCAGTCACTGTATCCAGCAGATCCTGGAGGCCG  370

Query  371  TTCTCCATTGTCACCAAATGGGGGTCGTCCACAGAGACCTCAAGCCGGAGAACCTGCTTCTGGCCAGCAAGTGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTCTCCATTGTCACCAAATGGGGGTCGTCCACAGAGACCTCAAGCCGGAGAACCTGCTTCTGGCCAGCAAGTGC  444

Query  445  AAAGGGGCTGCAGTGAAGCTGGCAGACTTCGGCCTAGCTATCGAGGTGCAGGGGGACCAGCAGGCATGGTTTGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAAGGGGCTGCAGTGAAGCTGGCAGACTTCGGCCTAGCTATCGAGGTGCAGGGGGACCAGCAGGCATGGTTTGG  518

Query  519  TTTCGCTGGCACACCAGGCTACCTGTCCCCTGAGGTCCTTCGCAAAGAGGCGTATGGCAAGCCTGTGGACATCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TTTCGCTGGCACACCAGGCTACCTGTCCCCTGAGGTCCTTCGCAAAGAGGCGTATGGCAAGCCTGTGGACATCT  592

Query  593  GGGCATGTGGGGTGATCCTGTACATCCTGCTCGTGGGCTACCCACCCTTCTGGGACGAGGACCAGCACAAGCTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGGCATGTGGGGTGATCCTGTACATCCTGCTCGTGGGCTACCCACCCTTCTGGGACGAGGACCAGCACAAGCTG  666

Query  667  TACCAGCAGATCAAGGCTGGTGCCTATGACTTCCCGTCCCCTGAGTGGGACACCGTCACTCCTGAAGCCAAAAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TACCAGCAGATCAAGGCTGGTGCCTATGACTTCCCGTCCCCTGAGTGGGACACCGTCACTCCTGAAGCCAAAAA  740

Query  741  CCTCATCAACCAGATGCTGACCATCAACCCTGCCAAGCGCATCACAGCCCATGAGGCCCTGAAGCACCCGTGGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCTCATCAACCAGATGCTGACCATCAACCCTGCCAAGCGCATCACAGCCCATGAGGCCCTGAAGCACCCGTGGG  814

Query  815  TCTGCCAACGCTCCACGGTAGCATCCATGATGCACAGACAGGAGACTGTGGAGTGTCTGAAAAAGTTCAATGCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCTGCCAACGCTCCACGGTAGCATCCATGATGCACAGACAGGAGACTGTGGAGTGTCTGAAAAAGTTCAATGCC  888

Query  889  AGGAGAAAGCTCAAGGGAGCCATCCTCACCACCATGCTGGCCACACGGAATTTCTCAGTGGGCAGACAGACCAC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
Sbjct  889  AGGAGAAAGCTCAAGGGAGCCATCCTCACCACCATGCTGGCCACACGGAATTTCTCAG----------------  946

Query  963  CGCTCCGGCCACAATGTCCACCGCGGCCTCCGGCACCACCATGGGGCTGGTGGAACAAGCCAAGAGTTTACTCA  1036
                                                                    .|||||||||||||||||
Sbjct  947  --------------------------------------------------------CAGCCAAGAGTTTACTCA  964

Query 1037  ACAAGAAAGCAGATGGAGTCAAGCCCCAGACGAATAGCACCAAAAACAGTGCAGCCGCCACCAGCCCCAAAGGG  1110
            ||||||||||||||||||||||                                                    
Sbjct  965  ACAAGAAAGCAGATGGAGTCAA----------------------------------------------------  986

Query 1111  ACGCTTCCTCCTGCCGCCCTGGAGCCTCAAACCACCGTCATCCATAACCCAGTGGACGGGATTAAGGAGTCTTC  1184
                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  987  --------------------GGAGCCTCAAACCACCGTCATCCATAACCCAGTGGACGGGATTAAGGAGTCTTC  1040

Query 1185  TGACAGTGCCAATACCACCATAGAGGATGAAGACGCTAAAGCCCGGAAGCAGGAGATCATTAAGACCACGGAGC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1041  TGACAGTGCCAATACCACCATAGAGGATGAAGACGCTAAAGCCCGGAAGCAGGAGATCATTAAGACCACGGAGC  1114

Query 1259  AGCTCATCGAGGCCGTCAACAACGGTGACTTTGAGGCCTACGCGAAAATCTGTGACCCAGGGCTGACCTCGTTT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1115  AGCTCATCGAGGCCGTCAACAACGGTGACTTTGAGGCCTACGCGAAAATCTGTGACCCAGGGCTGACCTCGTTT  1188

Query 1333  GAGCCTGAAGCACTGGGCAACCTGGTTGAAGGGATGGACTTCCACAGATTCTACTTCGAGAACCTGCTGGCCAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1189  GAGCCTGAAGCACTGGGCAACCTGGTTGAAGGGATGGACTTCCACAGATTCTACTTCGAGAACCTGCTGGCCAA  1262

Query 1407  GAACAGCAAGCCGATCCACACGACCATCCTGAACCCACACGTGCACGTCATTGGAGAGGATGCCGCCTGCATCG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1263  GAACAGCAAGCCGATCCACACGACCATCCTGAACCCACACGTGCACGTCATTGGAGAGGATGCCGCCTGCATCG  1336

Query 1481  CTTACATCCGGCTCACGCAGTACATTGACGGGCAGGGCCGGCCCCGCACCAGCCAGTCTGAGGAGACCCGCGTG  1554
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Sbjct 1337  CTTACATCCGGCTCACGCAGTACATTGACGGGCAGGGCCGGCCCCGCACCAGCCAGTCTGAGGAGACCCGCGTG  1410

Query 1555  TGGCACCGCCGCGACGGCAAGTGGCAGAACGTGCACTTCCACTGCTCGGGCGCGCCTGTGGCCCCGCTGCAG  1626
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Sbjct 1411  TGGCACCGCCGCGACGGCAAGTGGCAGAACGTGCACTTCCACTGCTCGGGCGCGCCTGTGGCCCCGCTGCAG  1482