Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488486
• Subject: XM_017012661.1
• Aligned Length: 1971
• Identities: 1611
• Gaps: 348

Alignment

Query    1  ATGGCCACCACGGTGACCTGCACCCGCTTCACCGACGAGTACCAGCTCTACGAGGATATTGGCAAGGGGGCTTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCACCACGGTGACCTGCACCCGCTTCACCGACGAGTACCAGCTCTACGAGGATATTGGCAAGGGGGCTTT  74

Query   75  CTCTGTGGTCCGACGCTGTGTCAAGCTCTGCACCGGCCATGAGTATGCAGCCAAGATCATCAACACCAAGAAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCTGTGGTCCGACGCTGTGTCAAGCTCTGCACCGGCCATGAGTATGCAGCCAAGATCATCAACACCAAGAAGC  148

Query  149  TGTCAGCCAGAGATCACCAGAAGCTGGAGAGAGAGGCTCGGATCTGCCGCCTTCTGAAGCATTCCAACATCGTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGTCAGCCAGAGATCACCAGAAGCTGGAGAGAGAGGCTCGGATCTGCCGCCTTCTGAAGCATTCCAACATCGTG  222

Query  223  CGTCTCCACGACAGCATCTCCGAGGAGGGCTTCCACTACCTGGTCTTCGATCTGGTCACTGGTGGGGAGCTCTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGTCTCCACGACAGCATCTCCGAGGAGGGCTTCCACTACCTGGTCTTCGATCTGGTCACTGGTGGGGAGCTCTT  296

Query  297  TGAAGACATTGTGGCGAGAGAGTACTACAGCGAGGCTGATGCCAGTCACTGTATCCAGCAGATCCTGGAGGCCG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGAAGACATTGTGGCGAGAGAGTACTACAGCGAGGCTGATGCCAGTCACTGTATCCAGCAGATCCTGGAGGCCG  370

Query  371  TTCTCCATTGTCACCAAATGGGGGTCGTCCACAGAGACCTCAAGCCGGAGAACCTGCTTCTGGCCAGCAAGTGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTCTCCATTGTCACCAAATGGGGGTCGTCCACAGAGACCTCAAGCCGGAGAACCTGCTTCTGGCCAGCAAGTGC  444

Query  445  AAAGGGGCTGCAGTGAAGCTGGCAGACTTCGGCCTAGCTATCGAGGTGCAGGGGGACCAGCAGGCATGGTTTGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAAGGGGCTGCAGTGAAGCTGGCAGACTTCGGCCTAGCTATCGAGGTGCAGGGGGACCAGCAGGCATGGTTTGG  518

Query  519  TTTCGCTGGCACACCAGGCTACCTGTCCCCTGAGGTCCTTCGCAAAGAGGCGTATGGCAAGCCTGTGGACATCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TTTCGCTGGCACACCAGGCTACCTGTCCCCTGAGGTCCTTCGCAAAGAGGCGTATGGCAAGCCTGTGGACATCT  592

Query  593  GGGCATGTGGGGTGATCCTGTACATCCTGCTCGTGGGCTACCCACCCTTCTGGGACGAGGACCAGCACAAGCTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGGCATGTGGGGTGATCCTGTACATCCTGCTCGTGGGCTACCCACCCTTCTGGGACGAGGACCAGCACAAGCTG  666

Query  667  TACCAGCAGATCAAGGCTGGTGCCTATGACTTCCCGTCCCCTGAGTGGGACACCGTCACTCCTGAAGCCAAAAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TACCAGCAGATCAAGGCTGGTGCCTATGACTTCCCGTCCCCTGAGTGGGACACCGTCACTCCTGAAGCCAAAAA  740

Query  741  CCTCATCAACCAGATGCTGACCATCAACCCTGCCAAGCGCATCACAGCCCATGAGGCCCTGAAGCACCCGTGGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCTCATCAACCAGATGCTGACCATCAACCCTGCCAAGCGCATCACAGCCCATGAGGCCCTGAAGCACCCGTGGG  814

Query  815  TCTGCCAACGCTCCACGGTAGCATCCATGATGCACAGACAGGAGACTGTGGAGTGTCTGAAAAAGTTCAATGCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCTGCCAACGCTCCACGGTAGCATCCATGATGCACAGACAGGAGACTGTGGAGTGTCTGAAAAAGTTCAATGCC  888

Query  889  AGGAGAAAGCTCAAGGGAGCCATCCTCACCACCATGCTGGCCACACGGAATTTCTCAGTGGGCAGACAGACCAC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGGAGAAAGCTCAAGGGAGCCATCCTCACCACCATGCTGGCCACACGGAATTTCTCAGTGGGCAGACAGACCAC  962

Query  963  CGCTCCGGCCACAATGTCCACCGCGGCCTCCGGCACCACCATGGGGCTGGTGGAACAAGCCAAGAGTTTACTCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CGCTCCGGCCACAATGTCCACCGCGGCCTCCGGCACCACCATGGGGCTGGTGGAACAAGCCAAGAGTTTACTCA  1036

Query 1037  ACAAGAAAGCAGATGGAGTCAAGCCCCAGACGAATAGCACCAAAAACAGTGCAGCCGCCACCAGCCCCAAAGGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACAAGAAAGCAGATGGAGTCAAGCCCCAGACGAATAGCACCAAAAACAGTGCAGCCGCCACCAGCCCCAAAGGG  1110

Query 1111  ACGCTTCCTCCTGCCGCCCTGGAGCCT-----------CAA-ACCACC--------------------------  1146
            ||||||||||||||||||||||||.||           ||| ||||||                          
Sbjct 1111  ACGCTTCCTCCTGCCGCCCTGGAGTCTTCTGACAGTGCCAATACCACCATAGAGGATGAAGACGCTAAAGCCCC  1184

Query 1147  ----------GTCATCCATAACCCAGTG-GACGGGATTAAGGA-------------------------------  1178
                      |.|||||..|||.|.||| ||.|||.||.||||                               
Sbjct 1185  CAGGATCTCTGACATCCTGAACTCTGTGAGAAGGGGTTCAGGAACCCCAGAAGCCGAGGGCCCCCTCTCAGCGG  1258

Query 1179  ----------------GTCT------------------------------------------TCTGACA-----  1189
                            ||||                                          |||||||     
Sbjct 1259  GGCCCCCGCCCTGCCTGTCTCCGGCTCTCCTAGGCCCCCTGTCCTCCCCGTCCCCCAGGATCTCTGACATCCTG  1332

Query 1190  -----------------------------------------------------------------GTGCCAAT-  1197
                                                                             .||||.|| 
Sbjct 1333  AACTCTGTGAGGAGGGGCTCAGGGACCCCAGAAGCCGAGGGCCCCTCGCCAGTGGGGCCCCCGCCCTGCCCATC  1406

Query 1198  -------------------------ACCACCATAGA-GGATGA-------------------------------  1214
                                     ||| ||||.|| ||||||                               
Sbjct 1407  TCCGACTATCCCTGGCCCCCTGCCCACC-CCATGGATGGATGACATCCCAGGGCTGCTGCCACCCCCACCTGTG  1479

Query 1215  ---AGAC-------------------------------------------------------------------  1218
               ||||                                                                   
Sbjct 1480  GGGAGACACCAGACTGGGGGTGGTGTGGAGATACTCTTAGAGAAGAGGCTGCTGGGCCACGGGCTCGGCATGGC  1553

Query 1219  ---------GCTAAAGCCCGGAAGCAGGAGATCATTAAGACCACGGAGCAGCTCATCGAGGCCGTCAACAACGG  1283
                     |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554  AGGGCAGTGGCT--AGCCCGGAAGCAGGAGATCATTAAGACCACGGAGCAGCTCATCGAGGCCGTCAACAACGG  1625

Query 1284  TGACTTTGAGGCCTACGCGAAAATCTGTGACCCAGGGCTGACCTCGTTTGAGCCTGAAGCACTGGGCAACCTGG  1357
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626  TGACTTTGAGGCCTACGCGAAAATCTGTGACCCAGGGCTGACCTCGTTTGAGCCTGAAGCACTGGGCAACCTGG  1699

Query 1358  TTGAAGGGATGGACTTCCACAGATTCTACTTCGAGAACCTGCTGGCCAAGAACAGCAAGCCGATCCACACGACC  1431
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1700  TTGAAGGGATGGACTTCCACAGATTCTACTTCGAGAACCTGCTGGCCAAGAACAGCAAGCCGATCCACACGACC  1773

Query 1432  ATCCTGAACCCACACGTGCACGTCATTGGAGAGGATGCCGCCTGCATCGCTTACATCCGGCTCACGCAGTACAT  1505
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Sbjct 1774  ATCCTGAACCCACACGTGCACGTCATTGGAGAGGATGCCGCCTGCATCGCTTACATCCGGCTCACGCAGTACAT  1847

Query 1506  TGACGGGCAGGGCCGGCCCCGCACCAGCCAGTCTGAGGAGACCCGCGTGTGGCACCGCCGCGACGGCAAGTGGC  1579
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Sbjct 1848  TGACGGGCAGGGCCGGCCCCGCACCAGCCAGTCTGAGGAGACCCGCGTGTGGCACCGCCGCGACGGCAAGTGGC  1921

Query 1580  AGAACGTGCACTTCCACTGCTCGGGCGCGCCTGTGGCCCCGCTGCAG  1626
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Sbjct 1922  AGAACGTGCACTTCCACTGCTCGGGCGCGCCTGTGGCCCCGCTGCAG  1968