Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488486
• Subject: XM_017314238.1
• Aligned Length: 1998
• Identities: 1431
• Gaps: 447

Alignment

Query    1  ATGGCCACCACGGTGACCTGCACCCGCTTCACCGACGAGTACCAGCTCTACGAGGATATTGGCAAGGGGGCTTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCACCACGGTGACCTGCACCCGTTTCACCGACGAGTACCAGCTATACGAGGATATTGGCAAGGGGGCTTT  74

Query   75  CTCTGTGGTCCGACGCTGTGTCAAGCTCTGCACCGGCCATGAGTATGCAGCCAAGATCATCAACACCAAGAAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct   75  CTCTGTGGTCCGACGCTGTGTCAAGCTCTGTACCGGCCATGAGTATGCAGCCAAGATCATTAATACCAAGAAGC  148

Query  149  TGTCAGCCAGAGATCACCAGAAGCTGGAGAGAGAGGCTCGGATCTGCCGCCTTCTGAAGCATTCCAACATCGTG  222
            ||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.
Sbjct  149  TGTCGGCCAGAGATCACCAGAAACTGGAGAGAGAAGCTCGGATCTGCCGCCTGCTGAAGCATTCCAACATTGTA  222

Query  223  CGTCTCCACGACAGCATCTCCGAGGAGGGCTTCCACTACCTGGTCTTCGATCTGGTCACTGGTGGGGAGCTCTT  296
            ||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGCCTCCATGACAGCATCTCTGAAGAGGGCTTCCACTACCTGGTCTTCGATCTGGTCACTGGTGGGGAGCTCTT  296

Query  297  TGAAGACATTGTGGCGAGAGAGTACTACAGCGAGGCTGATGCCAGTCACTGTATCCAGCAGATCCTGGAGGCCG  370
            |||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct  297  TGAAGACATCGTGGCAAGAGAGTACTACAGTGAAGCTGATGCCAGTCACTGCATCCAGCAGATCCTGGAAGCTG  370

Query  371  TTCTCCATTGTCACCAAATGGGGGTCGTCCACAGAGACCTCAAGCCGGAGAACCTGCTTCTGGCCAGCAAGTGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  371  TTCTCCATTGTCACCAAATGGGGGTCGTCCACAGAGACCTCAAGCCTGAGAACCTGCTTCTGGCCAGCAAATGC  444

Query  445  AAAGGGGCTGCAGTGAAGCTGGCAGACTTCGGCCTAGCTATCGAGGTGCAGGGGGACCAGCAGGCATGGTTTGG  518
            |||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAAGGCGCCGCAGTGAAGCTGGCAGACTTCGGCCTGGCCATCGAGGTTCAGGGAGACCAGCAGGCATGGTTTGG  518

Query  519  TTTCGCTGGCACACCAGGCTACCTGTCCCCTGAGGTCCTTCGCAAAGAGGCGTATGGCAAGCCTGTGGACATCT  592
            .||.||.||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  519  ATTTGCGGGAACGCCAGGCTACCTGTCTCCCGAGGTCCTTCGGAAGGAGGCCTACGGCAAACCTGTGGACATCT  592

Query  593  GGGCATGTGGGGTGATCCTGTACATCCTGCTCGTGGGCTACCCACCCTTCTGGGACGAGGACCAGCACAAGCTG  666
            ||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  593  GGGCATGTGGGGTGATCCTGTATATCCTGCTGGTGGGCTACCCACCTTTCTGGGATGAGGACCAACACAAGCTG  666

Query  667  TACCAGCAGATCAAGGCTGGTGCCTATGACTTCCCGTCCCCTGAGTGGGACACCGTCACTCCTGAAGCCAAAAA  740
            ||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  667  TACCAGCAGATCAAGGCTGGGGCGTATGATTTCCCATCCCCTGAGTGGGACACCGTTACTCCTGAAGCCAAAAA  740

Query  741  CCTCATCAACCAGATGCTGACCATCAACCCTGCCAAGCGCATCACAGCCCATGAGGCCCTGAAGCACCCGTGGG  814
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  741  CCTCATCAACCAGATGCTGACCATCAACCCTGCCAAGCGCATCACGGCCCATGAGGCCCTGAAGCACCCATGGG  814

Query  815  TCTGCCAACGCTCCACGGTAGCATCCATGATGCACAGACAGGAGACTGTGGAGTGTCTGAAAAAGTTCAATGCC  888
            ||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct  815  TCTGCCAACGTTCCACCGTGGCCTCTATGATGCACAGACAGGAGACTGTGGAATGTCTGAAGAAGTTCAATGCA  888

Query  889  AGGAGAAAGCTCAAGGGAGCCATCCTCACCACCATGCTGGCCACACGGAATTTCTCAGTGGGCAGACAGACCAC  962
            |||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||                  
Sbjct  889  AGGAGGAAGCTCAAGGGAGCCATCCTCACCACTATGCTGGCCACACGGAATTTCTC------------------  944

Query  963  CGCTCCGGCCACAATGTCCACCGCGGCCTCCGGCACCACCATGGGGCTGGTGGAACAAGCCAAGAGTTTACTCA  1036
                                                                     |||||||||||||||||
Sbjct  945  ---------------------------------------------------------AGCCAAGAGTTTACTCA  961

Query 1037  ACAAGAAAGCAGATGGAGTCAAGCCCCAGACGAATAGCACCAAAAACAGTGCAGCCGCCACCAGCCCCAAAGGG  1110
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||..|.|||..|||||||||||||||.
Sbjct  962  ACAAGAAAGCAGATGGAGTCAAGCCCCAGACAAACAGCACCAAAAACAGCTCGGCCATCACCAGCCCCAAAGGA  1035

Query 1111  ACGCTTCCTCCTGCCGCCCTGGAGCCTCAAACCACCGTCATCCATAACCCAGTGGACGGGATTAAGGAGTCTTC  1184
            .|.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1036  TCTCTCCCTCCTGCTGCCCTGGAGCCTCAAACCACCGTTATCCATAACCCAGTGGACGGGATTAAGGAATCTTC  1109

Query 1185  TGACAGTGCCAATACCACCATAGAGGATGAAGACGCTAAAG---------------------------------  1225
            .|||||..||||.||.|||||||||||||||||.||.||||                                 
Sbjct 1110  CGACAGCACCAACACAACCATAGAGGATGAAGATGCCAAAGCCCCCAGGGTCCCTGATGTCCTGAGCTTGGTGA  1183

Query 1226  --------------------------------------------------------------------------  1225
                                                                                      
Sbjct 1184  GGAGGGCCTCAGGAGCCCCCGAAGCCGAGGGCCCCCTCTCCTGCCAATCTCCAGTTCCCATTAGCCCCCTTCCA  1257

Query 1226  --------------------------------------------------------------------------  1225
                                                                                      
Sbjct 1258  ACCCCGTCCCCCAGGATCTCTGACATCCTGAACTCAGTGAGAAGGGGCTGTGGAACCCCAGAAGCCGAGGGACC  1331

Query 1226  --------------------------------------------------------------------------  1225
                                                                                      
Sbjct 1332  CCTATCAGTGGGGCCCCCACCCTGCTTGTCTCCGGGTCTCCTAGGCCCCCTGCCCACCCCGTCCCCCAGGATCT  1405

Query 1226  --------------------------------------------------------------------------  1225
                                                                                      
Sbjct 1406  CTGACATCCTCAACTCAGTGAGGCGGGGCTCAGGGACCCCAGAAGCTGAGGGCCTCCCACCAGTGGGCCCCCCA  1479

Query 1226  -------------------------------------------CCCGGAAGCAGGAGATCATTAAGACCACGGA  1256
                                                       |||||||||||||.|||||.||||||||.||
Sbjct 1480  CCCTGCCCATCTCCGACTCTCCCTGGCCCCTTGCCCACCCCATCCCGGAAGCAGGAAATCATCAAGACCACAGA  1553

Query 1257  GCAGCTCATCGAGGCCGTCAACAACGGTGACTTTGAGGCCTACGCGAAAATCTGTGACCCAGGGCTGACCTCGT  1330
            |||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 1554  GCAGCTCATTGAGGCCGTCAACAATGGGGACTTTGAGGCCTATGCGAAAATCTGTGACCCAGGCCTGACCTCAT  1627

Query 1331  TTGAGCCTGAAGCACTGGGCAACCTGGTTGAAGGGATGGACTTCCACAGATTCTACTTCGAGAACCTGCTGGCC  1404
            |||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1628  TTGAGCCTGAAGCTCTGGGCAACCTGGTCGAAGGGATGGATTTCCACAGATTCTACTTTGAGAACCTGCTGGCC  1701

Query 1405  AAGAACAGCAAGCCGATCCACACGACCATCCTGAACCCACACGTGCACGTCATTGGAGAGGATGCCGCCTGCAT  1478
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||
Sbjct 1702  AAGAACAGCAAGCCGATCCACACCACCATCCTGAACCCGCACGTGCACGTCATTGGCGAGGATGCGGCATGCAT  1775

Query 1479  CGCTTACATCCGGCTCACGCAGTACATTGACGGGCAGGGCCGGCCCCGCACCAGCCAGTCTGAGGAGACCCGCG  1552
            |||.||||||||.|||||.||||||||.||.||.||||||.|.|||||.|||||||||||.||.||||||||.|
Sbjct 1776  CGCCTACATCCGCCTCACACAGTACATCGATGGCCAGGGCAGACCCCGTACCAGCCAGTCCGAAGAGACCCGTG  1849

Query 1553  TGTGGCACCGCCGCGACGGCAAGTGGCAGAACGTGCACTTCCACTGCTCGGGCGCGCCTGTGGCCCCGCTGCAG  1626
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1850  TGTGGCACCGCCGCGACGGCAAGTGGCAGAATGTACATTTCCACTGCTCGGGCGCTCCAGTGGCCCCGCTGCAG  1923