Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000488486
- Subject:
- XM_017314239.1
- Aligned Length:
- 1629
- Identities:
- 1506
- Gaps:
- 3
Alignment
Query 1 ATGGCCACCACGGTGACCTGCACCCGCTTCACCGACGAGTACCAGCTCTACGAGGATATTGGCAAGGGGGCTTT 74
||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCCACCACGGTGACCTGCACCCGTTTCACCGACGAGTACCAGCTATACGAGGATATTGGCAAGGGGGCTTT 74
Query 75 CTCTGTGGTCCGACGCTGTGTCAAGCTCTGCACCGGCCATGAGTATGCAGCCAAGATCATCAACACCAAGAAGC 148
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 75 CTCTGTGGTCCGACGCTGTGTCAAGCTCTGTACCGGCCATGAGTATGCAGCCAAGATCATTAATACCAAGAAGC 148
Query 149 TGTCAGCCAGAGATCACCAGAAGCTGGAGAGAGAGGCTCGGATCTGCCGCCTTCTGAAGCATTCCAACATCGTG 222
||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.
Sbjct 149 TGTCGGCCAGAGATCACCAGAAACTGGAGAGAGAAGCTCGGATCTGCCGCCTGCTGAAGCATTCCAACATTGTA 222
Query 223 CGTCTCCACGACAGCATCTCCGAGGAGGGCTTCCACTACCTGGTCTTCGATCTGGTCACTGGTGGGGAGCTCTT 296
||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CGCCTCCATGACAGCATCTCTGAAGAGGGCTTCCACTACCTGGTCTTCGATCTGGTCACTGGTGGGGAGCTCTT 296
Query 297 TGAAGACATTGTGGCGAGAGAGTACTACAGCGAGGCTGATGCCAGTCACTGTATCCAGCAGATCCTGGAGGCCG 370
|||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct 297 TGAAGACATCGTGGCAAGAGAGTACTACAGTGAAGCTGATGCCAGTCACTGCATCCAGCAGATCCTGGAAGCTG 370
Query 371 TTCTCCATTGTCACCAAATGGGGGTCGTCCACAGAGACCTCAAGCCGGAGAACCTGCTTCTGGCCAGCAAGTGC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 371 TTCTCCATTGTCACCAAATGGGGGTCGTCCACAGAGACCTCAAGCCTGAGAACCTGCTTCTGGCCAGCAAATGC 444
Query 445 AAAGGGGCTGCAGTGAAGCTGGCAGACTTCGGCCTAGCTATCGAGGTGCAGGGGGACCAGCAGGCATGGTTTGG 518
|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AAAGGCGCCGCAGTGAAGCTGGCAGACTTCGGCCTGGCCATCGAGGTTCAGGGAGACCAGCAGGCATGGTTTGG 518
Query 519 TTTCGCTGGCACACCAGGCTACCTGTCCCCTGAGGTCCTTCGCAAAGAGGCGTATGGCAAGCCTGTGGACATCT 592
.||.||.||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 519 ATTTGCGGGAACGCCAGGCTACCTGTCTCCCGAGGTCCTTCGGAAGGAGGCCTACGGCAAACCTGTGGACATCT 592
Query 593 GGGCATGTGGGGTGATCCTGTACATCCTGCTCGTGGGCTACCCACCCTTCTGGGACGAGGACCAGCACAAGCTG 666
||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 593 GGGCATGTGGGGTGATCCTGTATATCCTGCTGGTGGGCTACCCACCTTTCTGGGATGAGGACCAACACAAGCTG 666
Query 667 TACCAGCAGATCAAGGCTGGTGCCTATGACTTCCCGTCCCCTGAGTGGGACACCGTCACTCCTGAAGCCAAAAA 740
||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 667 TACCAGCAGATCAAGGCTGGGGCGTATGATTTCCCATCCCCTGAGTGGGACACCGTTACTCCTGAAGCCAAAAA 740
Query 741 CCTCATCAACCAGATGCTGACCATCAACCCTGCCAAGCGCATCACAGCCCATGAGGCCCTGAAGCACCCGTGGG 814
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 741 CCTCATCAACCAGATGCTGACCATCAACCCTGCCAAGCGCATCACGGCCCATGAGGCCCTGAAGCACCCATGGG 814
Query 815 TCTGCCAACGCTCCACGGTAGCATCCATGATGCACAGACAGGAGACTGTGGAGTGTCTGAAAAAGTTCAATGCC 888
||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct 815 TCTGCCAACGTTCCACCGTGGCCTCTATGATGCACAGACAGGAGACTGTGGAATGTCTGAAGAAGTTCAATGCA 888
Query 889 AGGAGAAAGCTCAAGGGAGCCATCCTCACCACCATGCTGGCCACACGGAATTTCTCAGTGGGCAGACAGACCAC 962
|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AGGAGGAAGCTCAAGGGAGCCATCCTCACCACTATGCTGGCCACACGGAATTTCTCAGTGGGCAGACAGACCAC 962
Query 963 CGCTCCGGCCACAATGTCCACCGCGGCCTCCGGCACCACCATGGGGCTGGTGGAACA---AGCCAAGAGTTTAC 1033
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 963 CGCTCCGGCCACAATGTCCACCGCGGCCTCCGGCACCACCATGGGGCTGGTGGAACAAGCAGCCAAGAGTTTAC 1036
Query 1034 TCAACAAGAAAGCAGATGGAGTCAAGCCCCAGACGAATAGCACCAAAAACAGTGCAGCCGCCACCAGCCCCAAA 1107
||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||..|.|||..|||||||||||||
Sbjct 1037 TCAACAAGAAAGCAGATGGAGTCAAGCCCCAGACAAACAGCACCAAAAACAGCTCGGCCATCACCAGCCCCAAA 1110
Query 1108 GGGACGCTTCCTCCTGCCGCCCTGGAGCCTCAAACCACCGTCATCCATAACCCAGTGGACGGGATTAAGGAGTC 1181
||..|.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1111 GGATCTCTCCCTCCTGCTGCCCTGGAGCCTCAAACCACCGTTATCCATAACCCAGTGGACGGGATTAAGGAATC 1184
Query 1182 TTCTGACAGTGCCAATACCACCATAGAGGATGAAGACGCTAAAGCCCGGAAGCAGGAGATCATTAAGACCACGG 1255
|||.|||||..||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.|
Sbjct 1185 TTCCGACAGCACCAACACAACCATAGAGGATGAAGATGCCAAAGCCCGGAAGCAGGAAATCATCAAGACCACAG 1258
Query 1256 AGCAGCTCATCGAGGCCGTCAACAACGGTGACTTTGAGGCCTACGCGAAAATCTGTGACCCAGGGCTGACCTCG 1329
||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1259 AGCAGCTCATTGAGGCCGTCAACAATGGGGACTTTGAGGCCTATGCGAAAATCTGTGACCCAGGCCTGACCTCA 1332
Query 1330 TTTGAGCCTGAAGCACTGGGCAACCTGGTTGAAGGGATGGACTTCCACAGATTCTACTTCGAGAACCTGCTGGC 1403
||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1333 TTTGAGCCTGAAGCTCTGGGCAACCTGGTCGAAGGGATGGATTTCCACAGATTCTACTTTGAGAACCTGCTGGC 1406
Query 1404 CAAGAACAGCAAGCCGATCCACACGACCATCCTGAACCCACACGTGCACGTCATTGGAGAGGATGCCGCCTGCA 1477
||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||
Sbjct 1407 CAAGAACAGCAAGCCGATCCACACCACCATCCTGAACCCGCACGTGCACGTCATTGGCGAGGATGCGGCATGCA 1480
Query 1478 TCGCTTACATCCGGCTCACGCAGTACATTGACGGGCAGGGCCGGCCCCGCACCAGCCAGTCTGAGGAGACCCGC 1551
||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||.||||||.|.|||||.|||||||||||.||.||||||||.
Sbjct 1481 TCGCCTACATCCGCCTCACACAGTACATCGATGGCCAGGGCAGACCCCGTACCAGCCAGTCCGAAGAGACCCGT 1554
Query 1552 GTGTGGCACCGCCGCGACGGCAAGTGGCAGAACGTGCACTTCCACTGCTCGGGCGCGCCTGTGGCCCCGCTGCA 1625
||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1555 GTGTGGCACCGCCGCGACGGCAAGTGGCAGAATGTACATTTCCACTGCTCGGGCGCTCCAGTGGCCCCGCTGCA 1628
Query 1626 G 1626
|
Sbjct 1629 G 1629