Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488550
• Subject: NM_001204747.2
• Aligned Length: 3445
• Identities: 3439
• Gaps: 4

Alignment

Query    1  ATGGACATTCGGAAATTCTTTGGAGTAATACCAAGTGGAAAGAAACTTGTAAGTGAAACAGTAAAGAAGAATGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACATTCGGAAATTCTTTGGAGTAATACCAAGTGGAAAGAAACTTGTAAGTGAAACAGTAAAGAAGAATGA  74

Query   75  GAAAACAAAGTCTGATGAAGAAACTTTAAAAGCAAAGAAAGGAATAAAGGAAATCAAGGTAAATAGCTCCCGTA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAAAACAAAGTCTGATGAAGAAACTTTAAAAGCAAAGAAAGGAATAAAGGAAATCAAGGTAAATAGCTCCCGTA  148

Query  149  AAGAGGATGACTTCAAACAAAAGCAACCAAGCAAGAAAAAGAGGATCATCTATGATTCAGATTCAGAGTCAGAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAGAGGATGACTTCAAACAAAAGCAACCAAGCAAGAAAAAGAGGATCATCTATGATTCAGATTCAGAGTCAGAG  222

Query  223  GAGACGTTGCAGGTAAAAAATGCCAAAAAGCCACCAGAAAAACTGCCAGTATCTTCTAAACCTGGTAAAATTTC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAGACGTTGCAGGTAAAAAATGCCAAAAAGCCACCAGAAAAACTGCCAGTATCTTCTAAACCTGGTAAAATTTC  296

Query  297  ACGGCAGGATCCTGTTACATACATTTCAGAAACAGATGAAGAAGATGACTTTATGTGTAAGAAGGCGGCCTCTA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACGGCAGGATCCTGTTACATACATTTCAGAAACAGATGAAGAAGATGACTTTATGTGTAAGAAGGCGGCCTCTA  370

Query  371  AATCAAAAGAGAATGGAAGATCTACAAATAGTCATCTTGGAACATCAAACATGAAAAAGAATGAAGAAAACACT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AATCAAAAGAGAATGGAAGATCTACAAATAGTCATCTTGGAACATCAAACATGAAAAAGAATGAAGAAAACACT  444

Query  445  AAGACCAAGAATAAGCCTTTATCACCAATAAAACTTACACCCACATCAGTACTTGATTATTTTGGAACTGGAAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGACCAAGAATAAGCCTTTATCACCAATAAAACTTACACCCACATCAGTACTTGATTATTTTGGAACTGGAAG  518

Query  519  TGTCCAAAGATCTAATAAGAAGATGGTGGCAAGCAAAAGAAAAGAGCTTTCACAAAATACAGATGAGTCTGGAT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGTCCAAAGATCTAATAAGAAGATGGTGGCAAGCAAAAGAAAAGAGCTTTCACAAAATACAGATGAGTCTGGAT  592

Query  593  TAAATGATGAAGCCATCGCCAAGCAATTACAGCTTGATGAAGATGCGGAGCTGGAGAGGCAGTTGCATGAAGAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TAAATGATGAAGCCATCGCCAAGCAATTACAGCTTGATGAAGATGCGGAGCTGGAGAGGCAGTTGCATGAAGAT  666

Query  667  GAAGAGTTTGCCAGAACATTAGCCATGTTGGATGAAGAACCCAAGACCAAAAAGGCTCGAAAGGACACAGAAGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAAGAGTTTGCCAGAACATTAGCCATGTTGGATGAAGAACCCAAGACCAAAAAGGCTCGAAAGGACACAGAAGC  740

Query  741  GGGAGAAACGTTTTCATCTGTCCAAGCCAATTTAAGTAAAGCAGAAAAACATAAATATCCTCATAAAGTAAAAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGGAGAAACGTTTTCATCTGTCCAAGCCAATTTAAGTAAAGCAGAAAAACATAAATATCCTCATAAAGTAAAAA  814

Query  815  CAGCACAAGTTTCAGATGAAAGAAAGAGCTACAGTCCTAGGAAGCAAAGTAAATATGAAAGTTCAAAAGAATCT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CAGCACAAGTTTCAGATGAAAGAAAGAGCTACAGTCCTAGGAAGCAAAGTAAATATGAAAGTTCAAAAGAATCT  888

Query  889  CAGCAACATTCCAAGTCATCAGCTGACAAAATAGGAGAAGTCTCTTCTCCCAAGGCCAGTTCTAAGCTGGCAAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CAGCAACATTCCAAGTCATCAGCTGACAAAATAGGAGAAGTCTCTTCTCCCAAGGCCAGTTCTAAGCTGGCAAT  962

Query  963  TATGAAAAGAAAAGAAGAGAGCTCTTATAAAGAAATAGAGCCTGTGGCCTCAAAAAGAAAAGAAAATGCCATTA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TATGAAAAGAAAAGAAGAGAGCTCTTATAAAGAAATAGAGCCTGTGGCCTCAAAAAGAAAAGAAAATGCCATTA  1036

Query 1037  AATTGAAAGGAGAGACAAAAACTCCTAAGAAAACCAAAAGTTCTCCAGCTAAAAAAGAGTCTGTAAGTCCTGAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AATTGAAAGGAGAGACAAAAACTCCTAAGAAAACCAAAAGTTCTCCAGCTAAAAAAGAGTCTGTAAGTCCTGAA  1110

Query 1111  GATTCTGAAAAGAAACGCACTAATTATCAAGCTTATCGAAGCTACTTAAATCGAGAAGGTCCCAAGGCTCTGGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GATTCTGAAAAGAAACGCACTAATTATCAAGCTTATCGAAGCTACTTAAATCGAGAAGGTCCCAAGGCTCTGGG  1184

Query 1185  CTCCAAAGAAATACCAAAGGGAGCTGAAAATTGCTTGGAAGGCCTTATATTTGTAATCACAGGCGTGCTGGAGT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTCCAAAGAAATACCAAAGGGAGCTGAAAATTGCTTGGAAGGCCTTATATTTGTAATCACAGGCGTGCTGGAGT  1258

Query 1259  CTATTGAACGAGATGAGGCCAAGTCTCTAATTGAACGTTATGGGGGAAAAGTAACAGGAAATGTCAGCAAGAAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTATTGAACGAGATGAGGCCAAGTCTCTAATTGAACGTTATGGGGGAAAAGTAACAGGAAATGTCAGCAAGAAA  1332

Query 1333  ACAAATTATCTTGTCATGGGTCGTGATAGTGGACAGTCCAAGAGTGATAAGGCCGCAGCCTTGGGGACAAAAAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ACAAATTATCTTGTCATGGGTCGTGATAGTGGACAGTCCAAGAGTGATAAGGCCGCAGCCTTGGGGACAAAAAT  1406

Query 1407  TATTGATGAAGATGGCCTGTTGAATCTGATTCGGACTATGCCAGGCAAGAAATCCAAGTATGAAATAGCAGTTG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TATTGATGAAGATGGCCTGTTGAATCTGATTCGGACTATGCCAGGCAAGAAATCCAAGTATGAAATAGCAGTTG  1480

Query 1481  AAACTGAGATGAAGAAAGAGTCCAAACTGGAGAGAACACCCCAAAAAAATGTCCAAGGAAAAAGAAAAATTAGT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AAACTGAGATGAAGAAAGAGTCCAAACTGGAGAGAACACCCCAAAAAAATGTCCAAGGAAAAAGAAAAATTAGT  1554

Query 1555  CCATCTAAAAAGGAATCAGAATCTAAAAAGAGCAGGCCGACTTCCAAAAGGGACAGTTTGGCAAAGACAATAAA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CCATCTAAAAAGGAATCAGAATCTAAAAAGAGCAGGCCGACTTCCAAAAGGGACAGTTTGGCAAAGACAATAAA  1628

Query 1629  AAAGGAAACAGATGTGTTTTGGAAAAGCCTGGATTTCAAGGAGCAGGTGGCTGAGGAGACAAGTGGTGACAGCA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AAAGGAAACAGATGTGTTTTGGAAAAGCCTGGATTTCAAGGAGCAGGTGGCTGAGGAGACAAGTGGTGACAGCA  1702

Query 1703  AGGCTAGGAATTTGGCTGATGACAGCAGTGAAAACAAAGTGGAAAATTTGCTCTGGGTGGATAAATATAAGCCA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AGGCTAGGAATTTGGCTGATGACAGCAGTGAAAACAAAGTGGAAAATTTGCTCTGGGTGGATAAATATAAGCCA  1776

Query 1777  ACCTCGCTCAAGACCATAATTGGACAGCAAGGTGACCAGAGCTGTGCCAACAAACTCCTACGCTGGCTCCGAAA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  ACCTCGCTCAAGACCATAATTGGACAGCAAGGTGACCAGAGCTGTGCCAACAAACTCCTACGCTGGCTCCGAAA  1850

Query 1851  CTGGCAAAAGAGTTCTTCCGAAGATAAAAAACAC---GCAAAGTTTGGTAAATTTTCCGGCAAAGATGATGGCT  1921
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CTGGCAAAAGAGTTCTTCCGAAGATAAAAAACACGCAGCAAAGTTTGGTAAATTTTCCGGCAAAGATGATGGCT  1924

Query 1922  CTAGTTTTAAAGCAGCGTTGCTGTCAGGCCCTCCTGGTGTTGGCAAAACCACCACAGCTTCCCTGGTGTGTCAG  1995
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CTAGTTTTAAAGCAGCGTTGCTGTCAGGCCCTCCTGGTGTTGGCAAAACCACCACAGCTTCCCTGGTGTGTCAG  1998

Query 1996  GAGTTGGGATACAGCTACGTGGAACTGAATGCAAGTGACACCCGGAGTAAGAGCAGTTTGAAGGCGATTGTTGC  2069
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GAGTTGGGATACAGCTACGTGGAACTGAATGCAAGTGACACCCGGAGTAAGAGCAGTTTGAAGGCGATTGTTGC  2072

Query 2070  TGAGTCACTGAACAATACCAGCATCAAAGGCTTTTATTCAAATGGAGCAGCCTCTTCAGTAAGCACGAAACATG  2143
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TGAGTCACTGAACAATACCAGCATCAAAGGCTTTTATTCAAATGGAGCAGCCTCTTCAGTAAGCACGAAACATG  2146

Query 2144  CTCTCATCATGGATGAAGTAGATGGCATGGCAGGCAATGAGGATAGGGGAGGAATTCAGGAATTAATTGGCCTG  2217
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CTCTCATCATGGATGAAGTAGATGGCATGGCAGGCAATGAGGATAGGGGAGGAATTCAGGAATTAATTGGCCTG  2220

Query 2218  ATAAAACATACTAAAATTCCCATTATTTGTATGTGCAATGATAGAAATCATCCCAAGATTCGCTCTCTGGTTCA  2291
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  ATAAAACATACTAAAATTCCCATTATTTGTATGTGCAATGATAGAAATCATCCCAAGATTCGCTCTCTGGTTCA  2294

Query 2292  TTATTGTTTTGATCTTCGTTTTCAAAGACCTCGGGTTGAACAGATTAAGGGTGCTATGATGTCTATTGCATTTA  2365
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  TTATTGTTTTGATCTTCGTTTTCAAAGACCTCGGGTTGAACAGATTAAGGGTGCTATGATGTCTATTGCATTTA  2368

Query 2366  AAGAAGGTTTAAAGATTCCCCCTCCAGCTATGAATGAAATAATTTTGGGAGCCAATCAAGATATCAGACAGGTT  2439
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  AAGAAGGTTTAAAGATTCCCCCTCCAGCTATGAATGAAATAATTTTGGGAGCCAATCAAGATATCAGACAGGTT  2442

Query 2440  TTACATAATCTGAGTATGTGGTGTGCACGAAGTAAAGCATTAACCTATGACCAGGCCAAAGCTGATTCTCACAG  2513
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  TTACATAATCTGAGTATGTGGTGTGCACGAAGTAAAGCATTAACCTATGACCAGGCCAAAGCTGATTCTCACAG  2516

Query 2514  AGCCAAAAAGGATATCAAAATGGGCCCGTTTGATGTTGCCCGGAAAGTGTTTGCAGCTGGAGAGGAGACTGCTC  2587
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  AGCCAAAAAGGATATCAAAATGGGCCCATTTGATGTTGCCCGGAAAGTGTTTGCAGCTGGAGAGGAGACTGCTC  2590

Query 2588  ACATGTCACTTGTGGACAAGTCAGATCTCTTTTTTCATGATTATTCAATAGCACCCCTCTTCGTCCAGGAAAAT  2661
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  ACATGTCACTTGTGGACAAGTCAGATCTCTTTTTTCATGATTATTCAATAGCACCCCTCTTCGTCCAGGAAAAT  2664

Query 2662  TACATACACGTGAAGCCTGTAGCAGCAGGGGGTGACATGAAAAAGCACCTGATGCTTTTAAGCAGAGCAGCAGA  2735
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  TACATACACGTGAAGCCTGTAGCAGCAGGGGGTGACATGAAAAAGCACCTGATGCTTTTAAGCAGAGCAGCAGA  2738

Query 2736  CAGCATATGCGATGGTGACCTAGTGGACAGCCAGATCCGGAGTAAGCAAAACTGGAGTCTTCTGCCTGCGCAGG  2809
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  CAGCATATGCGATGGTGACCTAGTGGACAGCCAGATCCGGAGTAAGCAAAACTGGAGTCTTCTGCCTGCGCAGG  2812

Query 2810  CCATTTATGCCAGTGTTCTTCCTGGAGAGTTGATGAGGGGGTACATGACCCAGTTTCCCACCTTCCCAAGCTGG  2883
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  CCATTTATGCCAGTGTTCTTCCTGGAGAGTTGATGAGGGGGTACATGACCCAGTTTCCCACCTTCCCAAGCTGG  2886

Query 2884  CTGGGGAAGCACTCGTCTACAGGCAAACATGATCGTATTGTTCAGGACCTGGCCTTGCATATGAGTCTCAGAAC  2957
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  CTGGGGAAGCACTCGTCTACAGGCAAACATGATCGTATTGTTCAGGACCTGGCCTTGCATATGAGTCTCAGAAC  2960

Query 2958  TTACTCCAGCAAAAGGACTGTAAACATGGATTATCTGTCGCTTCTAAGGGATGCACTTGTACAGCCCTTGACCT  3031
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  TTACTCCAGCAAAAGGACTGTAAACATGGATTATCTGTCGCTTCTAAGGGATGCACTTGTACAGCCCTTGACCT  3034

Query 3032  CACAAGGAGTAGACGGAGTACAGGATGTTGTTGCACTTATGGACACATATTATTTGATGAAAGAAGACTTTGAG  3105
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  CACAAGGAGTAGACGGAGTACAGGATGTTGTTGCACTTATGGACACATATTATTTGATGAAAGAAGACTTTGAG  3108

Query 3106  AATATCATGGAAATCAGCAGCTGGGGCGGCAAACCTAGTCCCTTTTCAAAGCTGGATCCCAAGGTGAAAGCAGC  3179
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  AATATCATGGAAATCAGCAGCTGGGGTGGCAAACCTAGTCCCTTTTCAAAGCTGGATCCCAAGGTGAAAGCAGC  3182

Query 3180  CTTCACAAGAGCTTACAATAAGGAAGCCCACCTTACTCCATACTCACTTCAAGCTATAAAGGCATCTAGACACA  3253
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  CTTCACAAGAGCTTACAATAAGGAAGCCCACCTTACTCCATACTCACTTCAAGCTATAAAGGCATCTAGACACA  3256

Query 3254  GCACAAGCCCATCCCTGGATTCGGAATACAATGAAGAATTAAATGAAGATGACTCTCAATCTGATGAGAAAGAC  3327
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257  GCACAAGCCCATCCCTGGATTCGGAATACAATGAAGAATTAAATGAAGATGACTCTCAATCTGATGAGAAAGAC  3330

Query 3328  CAAGATGCTATAGAAACTGATGCCATGATCAAGAAAAAGACAAAATCTTCAAAGCCTTCAAAACCAGAAAAAGA  3401
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331  CAAGATGCTATAGAAACTGATGCCATGATCAAGAAAAAGACAAAATCTTCAAAGCCTTCAAAACCAGAAAAAGA  3404

Query 3402  TAAGGAGCCCAGAAAAGGAAAAGGAAAAAGTTCGAAGAAAG  3442
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct 3405  TAAGGAGCCCAGAAAAGGAAAAGGAAAAAGTTCGAAGAAA-  3444