Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000488554
- Subject:
- XM_017313219.1
- Aligned Length:
- 1569
- Identities:
- 1052
- Gaps:
- 411
Alignment
Query 1 ATGGAGTCAGCTCCGGCAGCCCCCGACCCCGCCGCCAGCGAGCCAGGCAGCAGCGGCGCGGACGCGGCCGCCGG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CTCCAGGGAGACCCCGCTGAACCAGGAATCCGCCCGCAAGAGCGAGCCGCCTGCCCCGGTGCGCAGACAGAGCT 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 ATTCCAGCACCAGCAGAGGTATCTCAGTAACGAAGAAGACACATACATCTCAAATTGAAATTATTCCATGCAAG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 ATCTGTGGAGACAAATCATCAGGAATCCATTATGGTGTCATTACATGTGAAGGCTGCAAGGGCTTTTTCAGGAG 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 AAGTCAGCAAAGCAATGCCACCTACTCCTGTCCTCGTCAGAAGAACTGTTTGATTGATCGAACCAGTAGAAACC 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 GCTGCCAACACTGTCGATTACAGAAATGCCTTGCCGTAGGGATGTCTCGAGATGCTGTAAAATTTGGCCGAATG 444
|||||||||||||||||.||.|||||.||.|||
Sbjct 1 -----------------------------------------ATGTCTCGAGATGCTGTCAAGTTTGGTCGGATG 33
Query 445 TCAAAAAAGCAGAGAGACAGCTTGTATGCAGAAGTACAGAAACACCGGATGCAGCAGCAGCAGCGCGACCACCA 518
||.||.||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 34 TCCAAGAAGCAGAGAGACAGCTTGTACGCCGAGGTGCAGAAGCACCGGATGCAGCAGCAGCAGCGAGACCACCA 107
Query 519 GCAGCAGCCTGGAGAGGCTGAGCCGCTGACGCCCACCTACAACATCTCGGCCAACGGGCTGACGGAACTTCACG 592
||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|
Sbjct 108 GCAGCAGCCTGGGGAGGCGGAGCCGCTGACGCCCACCTACAACATCTCAGCCAATGGGCTGACGGAACTGCATG 181
Query 593 ACGACCTCAGTAACTACATTGACGGGCACACCCCTGAGGGGAGTAAGGCAGACTCCGCCGTCAGCAGCTTCTAC 666
|.||||||||.|.|||.||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 182 ATGACCTCAGCACCTATATGGATGGGCACACCCCCGAGGGCAGCAAGGCCGACTCAGCCGTCAGCAGCTTCTAC 255
Query 667 CTGGACATACAGCCTTCCCCAGACCAGTCAGGTCTTGATATCAATGGAATCAAACCAGAACCAATATGTGACTA 740
||||||||.|||||.||||||||||||||.||..|.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 256 CTGGACATCCAGCCCTCCCCAGACCAGTCGGGATTGGACATCAATGGGATCAAACCCGAACCCATATGTGACTA 329
Query 741 CACACCAGCATCAGGCTTCTTTCCCTACTGTTCGTTCACCAACGGCGAGACTTCCCCAACTGTGTCCATGGCAG 814
||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 330 CACACCAGCATCTGGCTTCTTCCCCTACTGTTCCTTCACCAACGGAGAGACTTCCCCAACCGTGTCCATGGCAG 403
Query 815 AATTAGAACACCTTGCACAGAATATATCTAAATCGCATCTGGAAACCTGCCAATACTTGAGAGAAGAGCTCCAG 888
||.|||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||.|.||||||||||||
Sbjct 404 AACTAGAACACCTTGCCCAGAACATATCCAAATCCCACCTGGAAACCTGCCAGTACTTGCGGGAAGAGCTCCAG 477
Query 889 CAGATAACGTGGCAGACCTTTTTACAGGAAGAAATTGAGAACTATCAAAACAAGCAGCGGGAGGTGATGTGGCA 962
||||||||||||||||||||..|.|||||.||.|||||.|||||.||.|||||||||.|.||||||||||||||
Sbjct 478 CAGATAACGTGGCAGACCTTCCTGCAGGAGGAGATTGAAAACTACCAGAACAAGCAGAGAGAGGTGATGTGGCA 551
Query 963 ATTGTGTGCCATCAAAATTACAGAAGCTATACAGTATGTGGTGGAGTTTGCCAAACGCATTGATGGATTTATGG 1036
..|||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 552 GCTGTGTGCCATCAAGATTACAGAAGCTATCCAGTATGTGGTGGAGTTTGCCAAACGCATTGATGGATTTATGG 625
Query 1037 AACTGTGTCAAAATGATCAAATTGTGCTTCTAAAAGCAGGTTCTCTAGAGGTGGTGTTTATCAGAATGTGCCGT 1110
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 626 AGCTGTGTCAAAATGATCAAATTGTGCTTCTAAAAGCAGGCTCGCTAGAGGTGGTGTTTATTAGGATGTGCCGT 699
Query 1111 GCCTTTGACTCTCAGAACAACACCGTGTACTTTGATGGGAAGTATGCCAGCCCCGACGTCTTCAAATCCTTAGG 1184
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||.||||
Sbjct 700 GCCTTTGACTCTCAGAACAACACCGTGTACTTTGACGGGAAGTATGCGAGCCCCGATGTCTTCAAGTCCCTAGG 773
Query 1185 TTGTGAAGACTTTATTAGCTTTGTGTTTGAATTTGGAAAGAGTTTATGTTCTATGCACCTGACTGAAGATGAAA 1258
||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 774 TTGTGAAGACTTCATCAGCTTTGTGTTTGAATTTGGGAAGAGTTTGTGTTCTATGCACCTGACCGAAGACGAAA 847
Query 1259 TTGCATTATTTTCTGCATTTGTACTGATGTCAGCAGATCGCTCATGGCTGCAAGAAAAGGTAAAAATTGAAAAA 1332
|.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.
Sbjct 848 TCGCGTTATTTTCTGCATTCGTACTGATGTCAGCGGATCGCTCGTGGCTTCAGGAAAAGGTAAAAATAGAAAAG 921
Query 1333 CTGCAACAGAAAATTCAGCTAGCTCTTCAACACGTCCTACAGAAGAATCACCGAGAAGATGGAATACTAACAAA 1406
||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 922 CTGCAACAGAAAATTCAGCTGGCCCTTCAGCACGTCCTACAGAAGAACCACCGAGAAGATGGAATTCTAACCAA 995
Query 1407 GTTAATATGCAAGGTGTCTACATTAAGAGCCTTATGTGGACGACATACAGAAAAGCTAATGGCATTTAAAGCAA 1480
|.|||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 996 GCTAATATGCAAGGTGTCTACGTTAAGAGCCCTATGTGGACGACATACGGAAAAGCTAATGGCATTTAAAGCAA 1069
Query 1481 TATACCCAGACATTGTGCGACTTCATTTTCCTCCATTATACAAGGAGTTGTTCACTTCAGAATTTGAGCCAGCA 1554
||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1070 TATACCCAGACATTGTGCGACTCCATTTTCCTCCATTATACAAGGAATTGTTCACTTCAGAATTTGAGCCAGCC 1143
Query 1555 ATGCAAATTGATGGG 1569
||||||||.||||||
Sbjct 1144 ATGCAAATCGATGGG 1158