Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000488599
- Subject:
- XM_011528913.1
- Aligned Length:
- 2621
- Identities:
- 2609
- Gaps:
- 11
Alignment
Query 1 ATGGGCCCCCCGAGCCTCGTGCTGTGCTTGCTGTCCGCAACTGTGTTCTCCCTGCTGGGTGGAAGCTCGGCCTT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGCCCCCCGAGCCTCGTGCTGTGCTTGCTGTCCGCAACTGTGTTCTCCCTGCTGGGTGGAAGCTCGGCCTT 74
Query 75 CCTGTCGCACCACCGCCTGAAAGGCAGGTTTCAGAGGGACCGCAGGAACATCCGCCCCAACATCATCCTGGTGC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCTGTCGCACCACCGCCTGAAAGGCAGGTTTCAGAGGGACCGCAGGAACATCCGCCCCAACATCATCCTGGTGC 148
Query 149 TGACGGACGACCAGGATGTGGAGCTGGGTTCCATGCAGGTGATGAACAAGACCCGGCGCATCATGGAGCAGGGC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGACGGACGACCAGGATGTGGAGCTGGGTTCCATGCAGGTGATGAACAAGACCCGGCGCATCATGGAGCAGGGC 222
Query 223 GGGGCGCACTTCATCAACGCCTTCGTGACCACACCCATGTGCTGCCCCTCACGCTCCTCCATCCTCACCGGCAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 223 GGGGCGCACTTCATCAACGCCTTCGTGACCACACCCATGTGCTGCCCCTCACGCTCCTCCATCCTCACTGGCAA 296
Query 297 GTACGTCCACAACCACAACACCTACACCAACAATGAGAACTGCTCCTCGCCCTCCTGGCAGGCACAGCACGAGA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GTACGTCCACAACCACAACACCTACACCAACAATGAGAACTGCTCCTCGCCCTCCTGGCAGGCACAGCACGAGA 370
Query 371 GCCGCACCTTTGCCGTGTACCTCAATAGCACTGGCTACCGGACAGCTTTCTTCGGGAAGTATCTTAATGAATAC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GCCGCACCTTTGCCGTGTACCTCAATAGCACTGGCTACCGGACAGCTTTCTTCGGGAAGTATCTTAATGAATAC 444
Query 445 AACGGCTCCTACGTGCCACCCGGCTGGAAGGAGTGGGTCGGACTCCTTAAAAACTCCCGCTTTTATAACTACAC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AACGGCTCCTACGTGCCACCCGGCTGGAAGGAGTGGGTCGGACTCCTTAAAAACTCCCGCTTTTATAACTACAC 518
Query 519 GCTGTGTCGGAACGGGGTGAAAGAGAAGCACGGCTCCGACTACTCCAAGGATTACCTCACAGACCTCATCACCA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GCTGTGTCGGAACGGGGTGAAAGAGAAGCACGGCTCCGACTACTCCAAGGATTACCTCACAGACCTCATCACCA 592
Query 593 ATGACAGCGTGAGCTTCTTCCGCACGTCCAAGAAGATGTACCCGCACAGGCCAGTCCTCATGGTCATCAGCCAT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ATGACAGCGTGAGCTTCTTCCGCACGTCCAAGAAGATGTACCCGCACAGGCCAGTCCTCATGGTCATCAGCCAT 666
Query 667 GCAGCCCCCCACGGCCCTGAGGATTCAGCCCCACAATATTCACGCCTCTTCCCAAACGCATCTCAGCACATCAC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GCAGCCCCCCACGGCCCTGAGGATTCAGCCCCACAATATTCACGCCTCTTCCCAAACGCATCTCAGCACATCAC 740
Query 741 GCCGAGCTACAACTACGCGCCCAACCCGGACAAACACTGGATCATGCGCTACACGGGGCCCATGAAGCCCATCC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GCCGAGCTACAACTACGCGCCCAACCCGGACAAACACTGGATCATGCGCTACACGGGGCCCATGAAGCCCATCC 814
Query 815 ACATGGAATTCACCAACATGCTCCAGCGGAAGCGCTTGCAGACCCTCATGTCGGTGGACGACTCCATGGAGACG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ACATGGAATTCACCAACATGCTCCAGCGGAAGCGCTTGCAGACCCTCATGTCGGTGGACGACTCCATGGAGACG 888
Query 889 ATTTACAACATGCTGGTTGAGACGGGCGAGCTGGACAACACGTACATCGTATACACCGCCGACCACGGTTACCA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ATTTACAACATGCTGGTTGAGACGGGCGAGCTGGACAACACGTACATCGTATACACCGCCGACCACGGTTACCA 962
Query 963 CATCGGCCAGTTTGGCCTGGTGAAAGGGAAATCCATGCCATATGAGTTTGACATCAGGGTCCCGTTCTACGTGA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CATCGGCCAGTTTGGCCTGGTGAAAGGGAAATCCATGCCATATGAGTTTGACATCAGGGTCCCGTTCTACGTGA 1036
Query 1037 GGGGCCCCAACGTGGAAGCCGGCTGTCTGAATCCCCACATCGTCCTCAACATTGACCTGGCCCCCACCATCCTG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GGGGCCCCAACGTGGAAGCCGGCTGTCTGAATCCCCACATCGTCCTCAACATTGACCTGGCCCCCACCATCCTG 1110
Query 1111 GACATTGCAGGCCTGGACATACCTGCGGATATGGACGGGAAATCCATCCTCAAGCTGCTGGACACGGAGCGGCC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GACATTGCAGGCCTGGACATACCTGCGGATATGGACGGGAAATCCATCCTCAAGCTGCTGGACACGGAGCGGCC 1184
Query 1185 GGTGAATCGGTTTCACTTGAAAAAGAAGATGAGGGTCTGGCGGGACTCCTTCTTGGTGGAGAGAGGCAAGCTGC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GGTGAATCGGTTTCACTTGAAAAAGAAGATGAGGGTCTGGCGGGACTCCTTCTTGGTGGAGAGAGGCAAGCTGC 1258
Query 1259 TACACAAGAGAGACAATGACAAGGTGGACGCCCAGGAGGAGAACTTTCTGCCCAAGTACCAGCGTGTGAAGGAC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TACACAAGAGAGACAATGACAAGGTGGACGCCCAGGAGGAGAACTTTCTGCCCAAGTACCAGCGTGTGAAGGAC 1332
Query 1333 CTGTGTCAGCGTGCTGAGTACCAGACGGCGTGTGAGCAGCTGGGACAGAAGTGGCAGTGTGTGGAGGACGCCAC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CTGTGTCAGCGTGCTGAGTACCAGACGGCGTGTGAGCAGCTGGGACAGAAGTGGCAGTGTGTGGAGGACGCCAC 1406
Query 1407 GGGGAAGCTGAAGCTGCATAAGTGCAAGGGCCCCATGCGGCTGGGCGGCAGCAGAGCCCTCTCCAACCTCGTGC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GGGGAAGCTGAAGCTGCATAAGTGCAAGGGCCCCATGCGGCTGGGCGGCAGCAGAGCCCTCTCCAACCTCGTGC 1480
Query 1481 CCAAGTACTACGGGCAGGGCAGCGAGGCCTGCACCTGTGACAGCGGGGACTACAAGCTCAGCCTGGCCGGACGC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CCAAGTACTACGGGCAGGGCAGCGAGGCCTGCACCTGTGACAGCGGGGACTACAAGCTCAGCCTGGCCGGACGC 1554
Query 1555 CGGAAAAAACTCTTCAAGAAGAAGTACAAGGCCAGCTATGTCCGCAGTCGCTCCATCCGCTCAGTGGCCATCGA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CGGAAAAAACTCTTCAAGAAGAAGTACAAGGCCAGCTATGTCCGCAGTCGCTCCATCCGCTCAGTGGCCATCGA 1628
Query 1629 GGTGGACGGCAGGGTGTACCACGTAGGCCTGGGTGATGCCGCCCAGCCCCGAAACCTCACCAAGCGGCACTGGC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GGTGGACGGCAGGGTGTACCACGTAGGCCTGGGTGATGCCGCCCAGCCCCGAAACCTCACCAAGCGGCACTGGC 1702
Query 1703 CAGGGGCCCCTGAGGACCAAGATGACAAGGATGGTGGGGACTTCAGTGGCACTGGAGGCCTTCCCGACTACTCA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CAGGGGCCCCTGAGGACCAAGATGACAAGGATGGTGGGGACTTCAGTGGCACTGGAGGCCTTCCCGACTACTCA 1776
Query 1777 GCCGCCAACCCCATTAAAGTGACACATC---GGTGCTACATCCTAGAGAACGACACAGTCCAGTGTGACCTGGA 1847
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GCCGCCAACCCCATTAAAGTGACACATCGCAGGTGCTACATCCTAGAGAACGACACAGTCCAGTGTGACCTGGA 1850
Query 1848 CCTGTACAAGTCCCTGCAGGCCTGGAAAGACCACAAGCTGCACATCGACCACGAGATTGAAACCCTGCAGAACA 1921
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CCTGTACAAGTCCCTGCAGGCCTGGAAAGACCACAAGCTGCACATCGACCACGAGATTGAAACCCTGCAGAACA 1924
Query 1922 AAATTAAGAACCTGAGGGAAGTCCGAGGTCACCTGAAGAAAAAGCGGCCAGAAGAATGTGACTGTCACAAAATC 1995
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 AAATTAAGAACCTGAGGGAAGTCCGAGGTCACCTGAAGAAAAAGCGGCCAGAAGAATGTGACTGTCACAAAATC 1998
Query 1996 AGCTACCACACCCAGCACAAAGGCCGCCTCAAGCACAGAGGCTCCAGTCTGCATCCTTTCAGGAAGGGCCTGCA 2069
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 AGCTACCACACCCAGCACAAAGGCCGCCTCAAGCACAGAGGCTCCAGTCTGCATCCTTTCAGGAAGGGCCTGCA 2072
Query 2070 AGAGAAGGACAAGGTGTGGCTGTTGCGGGAGCAGAAGCGCAAGAAGAAACTCCGCAAGCTGCTCAAGCGCCTGC 2143
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 AGAGAAGGACAAGGTGTGGCTGTTGCGGGAGCAGAAGCGCAAGAAGAAACTCCGCAAGCTGCTCAAGCGCCTGC 2146
Query 2144 AGAACAACGACACGTGCAGCATGCCAGGCCTCACGTGCTTCACCCACGACAACCAGCACTGGCAGACGGCGCCT 2217
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 AGAACAACGACACGTGCAGCATGCCAGGCCTCACGTGCTTCACCCACGACAACCAGCACTGGCAGACGGCGCCT 2220
Query 2218 TTCTGGACACTGGGGCCTTTCTGTGCCTGCACCAGCGCCAACAATAACACGTACTGGTGCATGAGGACCATCAA 2291
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 TTCTGGACACTGGGGCCTTTCTGTGCCTGCACCAGCGCCAACAATAACACGTACTGGTGCATGAGGACCATCAA 2294
Query 2292 TGAGACTCACAATTTCCTCTTCTGTGAATTTGCAACTGGCTTCCTAGAGTACTTTGATCTCAACACAGACCCCT 2365
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 TGAGACTCACAATTTCCTCTTCTGTGAATTTGCAACTGGCTTCCTAGAGTACTTTGATCTCAACACAGACCCCT 2368
Query 2366 ACCAGCTGATGAATGCAGTGAACACACTGGACAGGGATGTCCTCAACCAGCTACACGTACAGCTCATGGAGCTG 2439
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 ACCAGCTGATGAATGCAGTGAACACACTGGACAGGGATGTCCTCAACCAGCTACACGTACAGCTCATGGAGCTG 2442
Query 2440 AGGAGCTGCAAGGGTTACAAGCAGTGTAACCCCCGGACTCGAAACATGGACCTGGGACTTAAAGATGGAGGAAG 2513
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 AGGAGCTGCAAGGGTTACAAGCAGTGTAACCCCCGGACTCGAAACATGGACCTGGGACTTAAAGATGGAGGAAG 2516
Query 2514 CTATGAGCAATACAGGCAGTTTCAGCGTCGAAAGTGGCCAGAAATGAAGAGACCTTCTTCCAAATCACTGGGAC 2587
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 CTATGAGCAATACAGGCAGTTTCAGCGTCGAAAGTGGCCAGAAATGAAGAGACCTTCTTCCAAATCACTGGGAC 2590
Query 2588 AACTGTGGGAAGGCTGGGAAGGTTAAAAGCT 2618
|||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 AACTGTGGGAAGGCTGGGAAGGT-------- 2613