Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000488612
- Subject:
- XM_011539542.2
- Aligned Length:
- 3666
- Identities:
- 2597
- Gaps:
- 1068
Alignment
Query 1 ATGGAGGCGGCGCGCACGGAGCGCCCCGCAGGCAGGCCGGGGGCGCCGCTTGTCCGGACGGGGCTCCTACTCTT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GTCGACGTGGGTCCTGGCCGGCGCCGAGATCACTTGGGACGCGACAGGCGGTCCCGGACGCCCGGCGGCCCCGG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CTTCGCGGCCACCGGCGTTGTCTCCACTCTCGCCGCGGGCAGTGGCCAGCCAGTGGCCGGAGGAGCTGGCGTCG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GCGCGGAGAGCCGCCGTGCTGGGGCGCCGGGCCGGACCAGAGCTGCTGCCCCAGCAGGGCGGCGGCAGAGGCGG 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 TGAGATGCAGGTGGAAGCCGGAGGGACATCACCGGCAGGCGAGCGGCGGGGCCGGGGCATCCCAGCTCCTGCCA 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 AGCTTGGCGGCGCGAGGAGGAGTCGCCGGGCGCAGCCCCCAATCACCCAGGAACGCGGGGACGCCTGGGCCACT 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 GCTCCGGCCGATGGTTCCAGAGGAAGCCGTCCCCTTGCTAAGGGTTCCCGGGAGGAGGTGAAGGCGCCGCGGGC 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 TGGGGGGTCGGCGGCTGAAGACCTCCGGCTGCCCAGCACCTCCTTCGCGCTGACCGGGGACTCGGCCCACAACC 592
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 593 AAGCCATGGTGCACTGGTCGGGACACAACAGCAGCGTCATACTTATCCTGACGAAGCTGTATGACTTCAACCTG 666
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 667 GGCAGCGTGACTGAGAGTTCACTATGGAGGTCGACAGATTATGGCACCACCTATGAAAAGCTGAATGACAAAGT 740
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 741 GGGTTTGAAGACTGTCCTCAGTTACCTCTATGTCAATCCAACCAACAAAAGGAAGATTATGCTTCTCAGTGATC 814
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 815 CTGAGATGGAGAGCAGCATATTGATCAGCTCAGACGAAGGGGCGACCTATCAGAAGTATCGGCTCACCTTCTAT 888
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 889 ATCCAGAGCCTGCTCTTTCATCCCAAGCAAGAGGACTGGGTGCTGGCCTACAGTTTGGATCAAAAGCTCTACAG 962
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 963 CTCCATGGACTTTGGAAGACGGTGGCAACTCATGCATGAACGCATCACACCCAACAGGTTTTATTGGTCGGTGG 1036
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 1037 CCGGATTGGATAAGGAGGCGGACCTGGTGCACATGGAGGTGCGGACCACGGATGGATATGCTCACTACCTCACC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 --------------------------------ATGGAGGTGCGGACCACGGATGGATATGCTCACTACCTCACC 42
Query 1111 TGCAGGATCCAGGAATGTGCCGAGACAACTAGAAGTGGGCCTTTTGCCCGCTCCATTGACATCAGTTCCCTGGT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 43 TGCAGGATCCAGGAATGTGCCGAGACAACTAGAAGTGGGCCTTTTGCCCGCTCCATTGACATCAGTTCCCTGGT 116
Query 1185 TGTCCAGGATGAATATATCTTCATTCAGGTAACAACTAGTGGAAGAGCCAGCTACTACGTGTCTTATCGAAGAG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 117 TGTCCAGGATGAATATATCTTCATTCAGGTAACAACTAGTGGAAGAGCCAGCTACTACGTGTCTTATCGAAGAG 190
Query 1259 AGGCCTTTGCTCAGATAAAGCTGCCTAAGTACTCGTTGCCAAAGGACATGCACATCATCAGTACAGACGAGAAC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 191 AGGCCTTTGCTCAGATAAAGCTGCCTAAGTACTCGTTGCCAAAGGACATGCACATCATCAGTACAGACGAGAAC 264
Query 1333 CAAGTATTTGCTGCGGTCCAAGAATGGAACCAGAATGACACGTACAACCTCTACATCTCAGACACGCGTGGGAT 1406
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 265 CAAGTATTTGCTGCGGTCCAAGAATGGAACCAGAACGACACGTACAACCTCTACATCTCAGACACGCGTGGGAT 338
Query 1407 TTACTTCACTCTGGCCATGGAGAACATCAAGAGCAGCAGAGGTCTAATGGGGAACATCATTATTGAATTGTATG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 339 TTACTTCACTCTGGCCATGGAGAACATCAAGAGCAGCAGAGGTCTAATGGGGAACATCATTATTGAATTGTATG 412
Query 1481 AGGTAGCAGGTATCAAAGGGATATTTCTGGCAAACAAGAAGGTGGACGACCAGGTGAAGACATACATCACTTAC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 413 AGGTAGCAGGTATCAAAGGGATATTTCTGGCAAACAAGAAGGTGGACGACCAGGTGAAGACATACATCACTTAC 486
Query 1555 AACAAAGGCAGGGATTGGCGCCTGCTGCAAGCTCCGGATGTGGACCTGAGAGGAAGCCCAGTGCACTGCCTGCT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 487 AACAAAGGCAGGGATTGGCGCCTGCTGCAAGCTCCGGATGTGGACCTGAGAGGAAGCCCAGTGCACTGCCTGCT 560
Query 1629 GCCCTTCTGTTCCTTACATCTGCACCTGCAACTCTCTGAAAATCCATATTCCTCAGGAAGAATCTCTAGCAAGG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 561 GCCCTTCTGTTCCTTACATCTGCACCTGCAACTCTCTGAAAATCCATATTCCTCAGGAAGAATCTCTAGCAAGG 634
Query 1703 AGACAGCCCCAGGACTTGTGGTGGCTACAGGCAACATTGGCCCGGAGCTCTCATATACTGATATTGGTGTGTTC 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 635 AGACAGCCCCAGGACTTGTGGTGGCTACAGGCAACATTGGCCCGGAGCTCTCATATACTGATATTGGTGTGTTC 708
Query 1777 ATCTCCTCCGATGGGGGCAACACATGGAGACAGATCTTTGATGAAGAGTACAATGTCTGGTTCCTAGACTGGGG 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 709 ATCTCCTCCGATGGGGGCAACACATGGAGACAGATCTTTGATGAAGAGTACAATGTCTGGTTCCTAGACTGGGG 782
Query 1851 TGGTGCCCTCGTGGCCATGAAACACACACCTCTGCCAGTCAGGCATTTGTGGGTGAGTTTTGATGAGGGCCACT 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 783 TGGTGCCCTCGTGGCCATGAAACACACACCTCTGCCAGTCAGGCATTTGTGGGTGAGTTTTGATGAGGGCCACT 856
Query 1925 CTTGGGACAAGTATGGTTTCACTTCGGTTCCTCTCTTTGTTGACGGGGCTCTGGTGGAGGCAGGAATGGAGACC 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 857 CTTGGGACAAGTATGGTTTCACTTCGGTTCCTCTCTTTGTTGACGGGGCTCTGGTGGAGGCAGGAATGGAGACC 930
Query 1999 CACATCATGACAGTTTTTGGCCACTTCAGCCTCCGCTCCGAATGGCAATTGGTGAAAGTGGACTACAAATCTAT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 931 CACATCATGACAGTTTTTGGCCACTTCAGCCTCCGCTCCGAATGGCAATTGGTGAAAGTGGACTACAAATCTAT 1004
Query 2073 CTTCAGCCGGCATTGCACCAAGGAGGACTATCAGACCTGGCACCTGCTCAATCAGGGAGAGCCTTGTGTCATGG 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1005 CTTCAGCCGGCATTGCACCAAGGAGGACTATCAGACCTGGCACCTGCTCAATCAGGGAGAGCCTTGTGTCATGG 1078
Query 2147 GAGAAAGGAAAATATTCAAGAAACGTAAGCCAGGAGCTCAGTGTGCCCTGGGCCGAGACCACTCAGGATCAGTG 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1079 GAGAAAGGAAAATATTCAAGAAACGTAAGCCAGGAGCTCAGTGTGCCCTGGGCCGAGACCACTCAGGATCAGTG 1152
Query 2221 GTCTCAGAACCCTGTGTCTGTGCCAATTGGGACTTCGAGTGTGACTATGGGTATGAGAGACATGGGGAGAGCCA 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1153 GTCTCAGAACCCTGTGTCTGTGCCAATTGGGACTTCGAGTGTGACTATGGGTATGAGAGACATGGGGAGAGCCA 1226
Query 2295 GTGTGTCCCAGCTTTCTGGTACAATCCAGCATCCCCATCAAAGGACTGCAGCCTTGGTCAAAGCTACCTTAACA 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1227 GTGTGTCCCAGCTTTCTGGTACAATCCAGCATCCCCATCAAAGGACTGCAGCCTTGGTCAAAGCTACCTTAACA 1300
Query 2369 GCACTGGGTATCGGCGGATTGTGTCCAACAACTGCACAGATGGGCTAAGGGAGAAGTACACCGCCAAGGCCCAG 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1301 GCACTGGGTATCGGCGGATTGTGTCCAACAACTGCACAGATGGGCTAAGGGAGAAGTACACCGCCAAGGCCCAG 1374
Query 2443 ATGTGCCCTGGAAAAGCCCCTCGGGGCCTCCATGTGGTGACGACCGATGGGCGGCTGGTGGCAGAGCAGGGGCA 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1375 ATGTGCCCTGGAAAAGCCCCTCGGGGCCTCCATGTGGTGACGACCGATGGGCGGCTGGTGGCAGAGCAGGGGCA 1448
Query 2517 CAATGCAACTTTCATCATCCTCATGGAGGAGGGTGATCTACAAAGGACAAACATCCAGCTTGACTTTGGGGATG 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1449 CAATGCAACTTTCATCATCCTCATGGAGGAGGGTGATCTACAAAGGACAAACATCCAGCTTGACTTTGGGGATG 1522
Query 2591 GGATTGCTGTGTCCTACGCAAACTTCAGCCCCATCGAGGACGGCATCAAGCACGTGTATAAGAGTGCGGGGATC 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1523 GGATTGCTGTGTCCTACGCAAACTTCAGCCCCATCGAGGACGGCATCAAGCACGTGTATAAGAGTGCGGGGATC 1596
Query 2665 TTCCAGGTGACAGCCTATGCAGAGAACAACCTTGGCTCAGACACAGCTGTCCTCTTCCTGCATGTGGTTTGTCC 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1597 TTCCAGGTGACAGCCTATGCAGAGAACAACCTTGGCTCAGACACAGCTGTCCTCTTCCTGCATGTGGTTTGTCC 1670
Query 2739 TGTGGAGCATGTTCATCTCCGAGTTCCATTTGTTGCCATAAGAAATAAGGAGGTCAACATCAGTGCAGTCGTGT 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1671 TGTGGAGCATGTTCATCTCCGAGTTCCATTTGTTGCCATAAGAAATAAGGAGGTCAACATCAGTGCAGTCGTGT 1744
Query 2813 GGCCCAGTCAACTGGGGACCCTTACCTATTTCTGGTGGTTCGGCAATAGCACAAAGCCTCTCATCACTTTGGAC 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1745 GGCCCAGTCAACTGGGGACCCTTACCTATTTCTGGTGGTTCGGCAATAGCACAAAGCCTCTCATCACTTTGGAC 1818
Query 2887 AGCAGCATTTCCTTCACATTCCTTGCAGAAGGAACCGACACCATCACAGTCCAGGTGGCTGCTGGGAATGCCCT 2960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1819 AGCAGCATTTCCTTCACATTCCTTGCAGAAGGAACCGACACCATCACAGTCCAGGTGGCTGCTGGGAATGCCCT 1892
Query 2961 CATCCAGGACACAAAAGAGATTGCAGTTCATGAATATTTCCAGTCCCAGCTTTTATCATTCTCTCCTAATCTGG 3034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1893 CATCCAGGACACAAAAGAGATTGCAGTTCATGAATATTTCCAGTCCCAGCTTTTATCATTCTCTCCTAATCTGG 1966
Query 3035 ATTACCACAATCCTGACATTCCTGAGTGGAGAAAAGATATTGGCAATGTCATCAAGCGAGCTCTGGTTAAAGTA 3108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1967 ATTACCACAATCCTGACATTCCTGAGTGGAGAAAAGATATTGGCAATGTCATCAAGCGAGCTCTGGTTAAAGTA 2040
Query 3109 ACCAGTGTCCCAGAGGACCAGATCCTCATTGCCGTGTTTCCTGGTCTCCCCACTTCAGCAGAGCTTTTCATTCT 3182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2041 ACCAGTGTCCCAGAGGACCAGATCCTCATTGCCGTGTTTCCTGGTCTCCCCACTTCAGCAGAGCTTTTCATTCT 2114
Query 3183 TCCACCCAAGAACCTGACAGAGAGGAGGAAAGGCAATGAAGGGGACCTGGAACAAATTGTAGAAACACTGTTTA 3256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2115 TCCACCCAAGAACCTGACAGAGAGGAGGAAAGGCAATGAAGGGGACCTGGAACAAATTGTAGAAACACTGTTTA 2188
Query 3257 ATGCTCTCAACCAAAATTTGGTCCAGTTTGAGCTGAAGCCGGGGGTACAAGTCATTGTGTATGTCACACAGCTG 3330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2189 ATGCTCTCAACCAAAATTTGGTCCAGTTTGAGCTGAAGCCGGGGGTACAAGTCATTGTGTATGTCACACAGCTG 2262
Query 3331 ACGTTAGCTCCATTGGTGGACTCCAGTGCTGGGCACAGCAGCTCAGCCATGCTTATGCTATTATCAGTGGTATT 3404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2263 ACGTTAGCTCCATTGGTGGACTCCAGTGCTGGGCACAGCAGCTCAGCCATGCTTATGCTATTATCAGTGGTATT 2336
Query 3405 TGTTGGCCTGGCTGTGTTTTTGATCTACAAGTTTAAAAGGAAAATCCCTTGGATTAACATCTATGCTCAAGTCC 3478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2337 TGTTGGCCTGGCTGTGTTTTTGATCTACAAGTTTAAAAGGAAAATCCCTTGGATTAACATCTATGCTCAAGTCC 2410
Query 3479 AACACGACAAGGAGCAGGAGATGATTGGGTCAGTGAGCCAAAGTGAAAACGCCCCCAAAATCACACTCAGTGAC 3552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2411 AACACGACAAGGAGCAGGAGATGATTGGGTCAGTGAGCCAAAGTGAAAACGCCCCCAAAATCACACTCAGTGAC 2484
Query 3553 TTTACGGAGCCTGAGGAGCTGCTGGACAAAGAGCTGGACACGCGGGTCATAGGAGGCATTGCCACTATTGCAAA 3626
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2485 TTTACGGAGCCTGAGGAGCTGCTGGACAAAGAGCTGGACACGCGGGTCATAGGAGGCATTGCCACTATTGCAAA 2558
Query 3627 CAGCGAAAGCACAAAGGAGATCCCCAACTGCACTAGTGTT 3666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2559 CAGCGAAAGCACAAAGGAGATCCCCAACTGCACTAGTGTT 2598
