Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000488616
- Subject:
- XM_011516927.2
- Aligned Length:
- 1717
- Identities:
- 1527
- Gaps:
- 164
Alignment
Query 1 ATGTGCACCGTAG---TGGACCCTCGCATTGT-----CCGGAGATACCTACTCAGGCGGCAGCTCGGGC----- 61
||| ||..|| .|||| ||..|| |.|.|||.||| |.||||| ||||
Sbjct 1 ATG----CCAGAGGCTGGGAC-----CAGGGTGGGGGCAGAAGAGACC-------GTGGCAG---GGGCTAGAT 55
Query 62 -----AGG-------GGGCCTATGGCATTGTGTGGAAGGCAGTGGACCGGAGGACTGGTGAGGTCGTGGCCATC 123
||| .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 56 TCTGGAGGAATCTGAAGGCCTATGGCATTGTGTGGAAGGCAGTGGACCGGAGGACTGGTGAGGTCGTGGCCATC 129
Query 124 AAGAAAATCTTTGATGCTTTTAGGGATAAGACAGATGCCCAGAGAACATTCCGGGAAATCACGCTCCTCCAGGA 197
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 130 AAGAAAATCTTTGATGCTTTTAGGGATAAGACAGATGCCCAGAGAACATTCCGGGAAATCACGCTCCTCCAGGA 203
Query 198 GTTTGGGGACCATCCCAACATCATCAGCCTCCTTGACGTGATCCGGGCAGAGAACGACAGGGACATTTACCTGG 271
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 204 GTTTGGGGACCATCCCAACATCATCAGCCTCCTTGACGTGATCCGGGCAGAGAACGACAGGGACATTTACCTGG 277
Query 272 TGTTTGAGTTTATGGACACTGACCTGAACGCAGTCATCCGGAAGGGCGGCCTGCTGCAGGACGTCCACGTGCGC 345
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 278 TGTTTGAGTTTATGGACACTGACCTGAACGCAGTCATCCGGAAGGGCGGCCTGCTGCAGGACGTCCACGTGCGC 351
Query 346 TCCATCTTCTACCAGCTCCTGCGGGCCACCCGGTTCCTCCACTCGGGGCACGTTGTGCACCGGGACCAGAAGCC 419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 352 TCCATCTTCTACCAGCTCCTGCGGGCCACCCGGTTCCTCCACTCGGGGCACGTTGTGCACCGGGACCAGAAGCC 425
Query 420 GTCCAATGTGCTCCTGGATGCCAACTGCACAGTGAAGCTGTGTGACTTTGGCCTGGCCCGCTCCCTGGGCGACC 493
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 426 GTCCAATGTGCTCCTGGATGCCAACTGCACAGTGAAGCTGTGTGACTTTGGCCTGGCCCGCTCCCTGGGCGACC 499
Query 494 TCCCCGAGGGGCCTGAGGACCAGGCCGTGACAGAGTACGTGGCCACACGCTGGTACCGAGCACCGGAGGTGCTG 567
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 500 TCCCCGAGGGGCCTGAGGACCAGGCCGTGACAGAGTACGTGGCCACACGCTGGTACCGAGCACCGGAGGTGCTG 573
Query 568 CTCTCTTCGCACCGATACACCCTTGGGGTGGACATGTGGAGTCTGGGCTGTATCCTGGGGGAGATGCTGCGGGG 641
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 574 CTCTCTTCGCACCGATACACCCTTGGGGTGGACATGTGGAGTCTGGGCTGTATCCTGGGGGAGATGCTGCGGGG 647
Query 642 GAGACCCCTGTTCCCCGGCACGTCCACCCTCCACCAGCTGGAGCTGATCCTGGAGACCATCCCACCGCCATCTG 715
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 648 GAGACCCCTGTTCCCCGGCACGTCCACCCTCCACCAGCTGGAGCTGATCCTGGAGACCATCCCACCGCCATCTG 721
Query 716 AGGAGGACCTCCTGGCTCTCGGCTCAGGCTGCCGTGCCTCTGTGCTGCACCAGCTGGGGTCCCGGCCACGACAG 789
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 722 AGGAGGACCTCCTGGCTCTCGGCTCAGGCTGCCGTGCCTCTGTGCTGCACCAGCTGGGGTCCCGGCCACGACAG 795
Query 790 ACGCTGGATGCCCTCCTACCGCCAGACACCTCCCCAGAGGCCTTGGACCTCCTTAGGCGACTCCTGGTGTTCGC 863
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 796 ACGCTGGATGCCCTCCTACCGCCAGACACCTCCCCAGAGGCCTTGGACCTCCTTAGGCGACTCCTGGTGTTCGC 869
Query 864 CCCGGACAAGCGGTTAAGCGCGACCCAGGCACTGCAGCACCCCTACGTGCAGAGGTTCCACTGCCCCAGCGACG 937
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 870 CCCGGACAAGCGGTTAAGCGCGACCCAGGCACTGCAGCACCCCTACGTGCAGAGGTTCCACTGCCCCAGCGACG 943
Query 938 AGTGGGCACGAGAGGCAGATGTGCGGCCCCGGGCACACGAAGGGGTCCAGCTCTCTGTGCCTGAGTACCGCAGC 1011
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 944 AGTGGGCACGAGAGGCAGATGTGCGGCCCCGGGCACACGAAGGGGTCCAGCTCTCTGTGCCTGAGTACCGCAGC 1017
Query 1012 CGCGTCTATCAGATGATCCTGGAGTGTGGAGGCAGCAGCGGCACCTCGAGAGAGAAGGGCCCGGAGGGTGTCTC 1085
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1018 CGCGTCTATCAGATGATCCTGGAGTGTGGAGGCAGCAGCGGCACCTCGAGAGAGAAGGGCCCGGAGGGTGTCTC 1091
Query 1086 CCCAAGCCAGGCACACCTGCACAAACCCAGAGCCGACCCTCAGCTGCCTTCTAGGACACCTGTGCAGGGTCCCA 1159
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1092 CCCAAGCCAGGCACACCTGCACAAACCCAGAGCCGACCCTCAGCTGCCTTCTAGGACACCTGTGCAGGGTCCCA 1165
Query 1160 GACCCAGGCCCCAGAGCAGCCCAGGCCATGACCCTGCCGAGCACGAGTCCCCCCGTGCAGCCAAGAACGTTCCC 1233
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1166 GACCCAGGCCCCAGAGCAGCCCAGGCCATGACCCTGCCGAGCACGAGTCCCCCCGTGCAGCCAAGAACGTTCCC 1239
Query 1234 AGGCAGAACTCCGCTCCCCTGCTCCAAACTGCTCTCCTAGGGAATGGGGAAAGGCCCCCTGGGGCGAAGGAAGC 1307
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1240 AGGCAGAACTCCGCTCCCCTGCTCCAAACTGCTCTCCTAGGGAATGGGGAAAGGCCCCCTGGGGCGAAGGAAGC 1313
Query 1308 GCCCCCCTTGACACTCTCGCTGGTGAAGCCAAGCGGGAGGGGAGCTGCGCCCTCCCTGACCTCCCAGGCTGCGG 1381
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1314 GCCCCCCTTGACACTCTCGCTGGTGAAGCCAAGCGGGAGGGGAGCTGCGCCCTCCCTGACCTCCCAGGCTGCGG 1387
Query 1382 CTCAGGTGGCCAACCAGGCCCTGATCCGGGGTGACTGGAACCGGGGCGGTGGGGTGAGGGTGGCCAGCGTACAA 1455
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1388 CTCAGGTGGCCAACCAGGCCCTGATCCGGGGTGACTGGAACCGGGGCGGTGGGGTGAGGGTGGCCAGCGTACAA 1461
Query 1456 CAGGT--------------------CCCTCCCCGGCTTCCTCCGGAGG----------------CCCGGCCCGG 1493
||||| ||.||||| .|.|||||| ||| |||.|
Sbjct 1462 CAGGTAAGCCCGGCCCAGTCTGCCCCCGTCCCC-TCATCCTCC-----TTTCCCCTTTCCCCTTCCC--CCCTG 1527
Query 1494 CCGGAGGATGTTCAGCACCTCTGCCTT--GCAGGGTGCCCAGGGGGGTG------------CCAGGGCTTT--- 1550
| |.||| |||| |||| .||.|.|.|||| .|| |||| ||
Sbjct 1528 C-------TTTTC----CCTC--CCTTCCCCATGCTTCCCA-----TTGCCCCTCCAATGTCCAG----TTCAA 1579
Query 1551 -GCT-TGGAGGCTACTCCCAA-GCCTACGGGACTGTCTGCCACTCGGCACTGGGCCACCTGCCC-CTGCTGGAG 1620
.|| |.|||| || |.||| |||| ||.||| ||||| |||| ||| |||.|
Sbjct 1580 ATCTCTCGAGG--AC-CTCAAGGCCT-------------CCCCTC--CACTG---CACC--CCCTCTGAT---- 1626
Query 1621 GGGCACC---ATGTG 1632
|||.|| |||
Sbjct 1627 -GGCCCCTTTATG-- 1638