Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000488623
- Subject:
- NM_001007792.1
- Aligned Length:
- 2463
- Identities:
- 2241
- Gaps:
- 198
Alignment
Query 1 ATGTCGGGTGAGGCCTGGCAGCTGCAGCTGGGAGCGCACAGACGGCTGCCCCGCCTGAGCGAGGCGGGCGCCGC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CGCGATGCTGCGAGGCGGACGGCGCGGGCAGCTTGGCTGGCACAGCTGGGCTGCGGGGCCGGGCAGCCTGCTGG 148
.||..|| .|||.||| ||
Sbjct 1 --------------------------------------------------ATGAAGG---AGGCCGCC--CT-- 17
Query 149 CTTGGCTGATACTGGCATCTGCGGGCGCCGCACCCT-----GCCCCGATGCCTGCTGCCCCCACGG----CTCC 213
|||||||..| ||||||| .||||||| |.|| |||| .|||
Sbjct 18 ---------------CATCTGCCTG----GCACCCTCTGTACCCCCGAT-CTTG--------ACGGTGAAGTCC 63
Query 214 TCGGGACTGCGATGCACCCGGGATGGGGCC--CTGGATAGCCTCCACCACCTGCCCGGCGCAGAGAACCTGACT 285
| ||||| .|.||||| |.||.||.| ||.||| |.|||.|||.| |||.|| .|
Sbjct 64 T-GGGAC-ACCATGCA-----GTTGCGGGCTGCTAGAT---------------CTCGGTGCACA-AACTTG-TT 113
Query 286 G--AGC--TCTACATCGAGAACCAGCAGCATCTGCAGCATCTGGAGCTCCGTGATCTGAGGGGCCTGGGGGAGC 355
| ||| .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 114 GGCAGCAAGCTACATCGAGAACCAGCAGCATCTGCAGCATCTGGAGCTCCGTGATCTGAGGGGCCTGGGGGAGC 187
Query 356 TGAGAAACCTCACCATCGTGAAGAGTGGTCTCCGTTTCGTGGCGCCAGATGCCTTCCATTTCACTCCTCGGCTC 429
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 188 TGAGAAACCTCACCATCGTGAAGAGTGGTCTCCGTTTCGTGGCGCCAGATGCCTTCCATTTCACTCCTCGGCTC 261
Query 430 AGTCGCCTGAATCTCTCCTTCAACGCTCTGGAGTCTCTCTCCTGGAAAACTGTGCAGGGCCTCTCCTTACAGGA 503
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 262 AGTCGCCTGAATCTCTCCTTCAACGCTCTGGAGTCTCTCTCCTGGAAAACTGTGCAGGGCCTCTCCTTACAGGA 335
Query 504 ACTGGTCCTGTCGGGGAACCCTCTGCACTGTTCTTGTGCCCTGCGCTGGCTACAGCGCTGGGAGGAGGAGGGAC 577
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 336 ACTGGTCCTGTCGGGGAACCCTCTGCACTGTTCTTGTGCCCTGCGCTGGCTACAGCGCTGGGAGGAGGAGGGAC 409
Query 578 TGGGCGGAGTGCCTGAACAGAAGCTGCAGTGTCATGGGCAAGGGCCCCTGGCCCACATGCCCAATGCCAGCTGT 651
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 410 TGGGCGGAGTGCCTGAACAGAAGCTGCAGTGTCATGGGCAAGGGCCCCTGGCCCACATGCCCAATGCCAGCTGT 483
Query 652 GGTGTGCCCACGCTGAAGGTCCAGGTGCCCAATGCCTCGGTGGATGTGGGGGACGACGTGCTGCTGCGGTGCCA 725
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 484 GGTGTGCCCACGCTGAAGGTCCAGGTGCCCAATGCCTCGGTGGATGTGGGGGACGACGTGCTGCTGCGGTGCCA 557
Query 726 GGTGGAGGGGCGGGGCCTGGAGCAGGCCGGCTGGATCCTCACAGAGCTGGAGCAGTCAGCCACGGTGATGAAAT 799
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 558 GGTGGAGGGGCGGGGCCTGGAGCAGGCCGGCTGGATCCTCACAGAGCTGGAGCAGTCAGCCACGGTGATGAAAT 631
Query 800 CTGGGGGTCTGCCATCCCTGGGGCTGACCCTGGCCAATGTCACCAGTGACCTCAACAGGAAGAACTTGACGTGC 873
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 632 CTGGGGGTCTGCCATCCCTGGGGCTGACCCTGGCCAATGTCACCAGTGACCTCAACAGGAAGAACGTGACGTGC 705
Query 874 TGGGCAGAGAACGATGTGGGCCGGGCAGAGGTCTCTGTTCAGGTCAACGTCTCCTTCCCGGCCAGTGTGCAGCT 947
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 706 TGGGCAGAGAACGATGTGGGCCGGGCAGAGGTCTCTGTTCAGGTCAACGTCTCCTTCCCGGCCAGTGTGCAGCT 779
Query 948 GCACACGGCGGTGGAGATGCACCACTGGTGCATCCCCTTCTCTGTGGATGGGCAGCCGGCACCGTCTCTGCGCT 1021
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 GCACACGGCGGTGGAGATGCACCACTGGTGCATCCCCTTCTCTGTGGATGGGCAGCCGGCACCGTCTCTGCGCT 853
Query 1022 GGCTCTTCAATGGCTCCGTGCTCAATGAGACCAGCTTCATCTTCACTGAGTTCCTGGAGCCGGCAGCCAATGAG 1095
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 854 GGCTCTTCAATGGCTCCGTGCTCAATGAGACCAGCTTCATCTTCACTGAGTTCCTGGAGCCGGCAGCCAATGAG 927
Query 1096 ACCGTGCGGCACGGGTGTCTGCGCCTCAACCAGCCCACCCACGTCAACAACGGCAACTACACGCTGCTGGCTGC 1169
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 928 ACCGTGCGGCACGGGTGTCTGCGCCTCAACCAGCCCACCCACGTCAACAACGGCAACTACACGCTGCTGGCTGC 1001
Query 1170 CAACCCCTTCGGCCAGGCCTCCGCCTCCATCATGGCTGCCTTCATGGACAACCCTTTCGAGTTCAACCCCGAGG 1243
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1002 CAACCCCTTCGGCCAGGCCTCCGCCTCCATCATGGCTGCCTTCATGGACAACCCTTTCGAGTTCAACCCCGAGG 1075
Query 1244 ACCCCATCCCTGACACTAACAGCACATCTGGAGACCCGGTGGAGAAGAAGGACGAAACACCTTTTGGGGTCTCG 1317
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1076 ACCCCATCCCTGACACTAACAGCACATCTGGAGACCCGGTGGAGAAGAAGGACGAAACACCTTTTGGGGTCTCG 1149
Query 1318 GTGGCTGTGGGCCTGGCCGTCTTTGCCTGCCTCTTCCTTTCTACGCTGCTCCTTGTGCTCAACAAATGTGGACG 1391
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1150 GTGGCTGTGGGCCTGGCCGTCTTTGCCTGCCTCTTCCTTTCTACGCTGCTCCTTGTGCTCAACAAATGTGGACG 1223
Query 1392 GAGAAACAAGTTTGGGATCAACCGCCCGGCTGTGCTGGCTCCAGAGGATGGGCTGGCCATGTCCCTGCATTTCA 1465
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1224 GAGAAACAAGTTTGGGATCAACCGCCCGGCTGTGCTGGCTCCAGAGGATGGGCTGGCCATGTCCCTGCATTTCA 1297
Query 1466 TGACATTGGGTGGCAGCTCCCTGTCCCCCACCGAGGGCAAAGGCTCTGGGCTCCAAGGCCACATCATCGAGAAC 1539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1298 TGACATTGGGTGGCAGCTCCCTGTCCCCCACCGAGGGCAAAGGCTCTGGGCTCCAAGGCCACATCATCGAGAAC 1371
Query 1540 CCACAATACTTCAGTGATGCCTGTGTTCACCACATCAAGCGCCGGGACATCGTGCTCAAGTGGGAGCTGGGGGA 1613
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1372 CCACAATACTTCAGTGATGCCTGTGTTCACCACATCAAGCGCCGGGACATCGTGCTCAAGTGGGAGCTGGGGGA 1445
Query 1614 GGGCGCCTTTGGGAAGGTCTTCCTTGCTGAGTGCCACAACCTCCTGCCTGAGCAGGACAAGATGCTGGTGGCTG 1687
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1446 GGGCGCCTTTGGGAAGGTCTTCCTTGCTGAGTGCCACAACCTCCTGCCTGAGCAGGACAAGATGCTGGTGGCTG 1519
Query 1688 TCAAGGCACTGAAGGAGGCGTCCGAGAGTGCTCGGCAGGACTTCCAACGTGAGGCTGAGCTGCTCACCATGCTG 1761
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1520 TCAAGGCACTGAAGGAGGCGTCCGAGAGTGCTCGGCAGGACTTCCAGCGTGAGGCTGAGCTGCTCACCATGCTG 1593
Query 1762 CAGCACCAGCACATCGTGCGCTTCTTCGGCGTCTGCACCGAGGGCCGCCCCCTGCTCATGGTCTTTGAGTATAT 1835
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1594 CAGCACCAGCACATCGTGCGCTTCTTCGGCGTCTGCACCGAGGGCCGCCCCCTGCTCATGGTCTTTGAGTATAT 1667
Query 1836 GCGGCACGGGGACCTCAACCGCTTCCTCCGATCCCATGGACCTGATGCCAAGCTGCTGGCTGGTGGGGAGGATG 1909
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1668 GCGGCACGGGGACCTCAACCGCTTCCTCCGATCCCATGGACCTGATGCCAAGCTGCTGGCTGGTGGGGAGGATG 1741
Query 1910 TGGCTCCAGGCCCCCTGGGTCTGGGGCAGCTGCTGGCCGTGGCTAGCCAGGTCGCTGCGGGGATGGTGTACCTG 1983
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1742 TGGCTCCAGGCCCCCTGGGTCTGGGGCAGCTGCTGGCCGTGGCTAGCCAGGTCGCTGCGGGGATGGTGTACCTG 1815
Query 1984 GCGGGTCTGCATTTTGTGCACCGGGACCTGGCCACACGCAACTGTCTAGTGGGCCAGGGACTGGTGGTCAAGAT 2057
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1816 GCGGGTCTGCATTTTGTGCACCGGGACCTGGCCACACGCAACTGTCTAGTGGGCCAGGGACTGGTGGTCAAGAT 1889
Query 2058 TGGTGATTTTGGCATGAGCAGGGATATCTACAGCACCGACTATTACCGTGTGGGAGGCCGCACCATGCTGCCCA 2131
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1890 TGGTGATTTTGGCATGAGCAGGGATATCTACAGCACCGACTATTACCGTGTGGGAGGCCGCACCATGCTGCCCA 1963
Query 2132 TTCGCTGGATGCCGCCCGAGAGCATCCTGTACCGTAAGTTCACCACCGAGAGCGACGTGTGGAGCTTCGGCGTG 2205
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1964 TTCGCTGGATGCCGCCCGAGAGCATCCTGTACCGTAAGTTCACCACCGAGAGCGACGTGTGGAGCTTCGGCGTG 2037
Query 2206 GTGCTCTGGGAGATCTTCACCTACGGCAAGCAGCCCTGGTACCAGCTCTCCAACACGGAGGCAATCGACTGCAT 2279
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2038 GTGCTCTGGGAGATCTTCACCTACGGCAAGCAGCCCTGGTACCAGCTCTCCAACACGGAGGCAATCGACTGCAT 2111
Query 2280 CACGCAGGGACGTGAGTTGGAGCGGCCACGTGCCTGCCCACCAGAGGTCTACGCCATCATGCGGGGCTGCTGGC 2353
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2112 CACGCAGGGACGTGAGTTGGAGCGGCCACGTGCCTGCCCACCAGAGGTCTACGCCATCATGCGGGGCTGCTGGC 2185
Query 2354 AGCGGGAGCCCCAGCAACGCCACAGCATCAAGGATGTGCACGCCCGGCTGCAAGCCCTGGCCCAGGCACCTCCT 2427
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2186 AGCGGGAGCCCCAGCAACGCCACAGCATCAAGGATGTGCACGCCCGGCTGCAAGCCCTGGCCCAGGCACCTCCT 2259
Query 2428 GTCTACCTGGATGTCCTGGGC 2448
|||||||||||||||||||||
Sbjct 2260 GTCTACCTGGATGTCCTGGGC 2280