Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000488632
- Subject:
- XM_006522139.3
- Aligned Length:
- 3308
- Identities:
- 3004
- Gaps:
- 52
Alignment
Query 1 ATGAACCACCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGAAAGCGGGCGAGCAGCAG--TTGAGCGAGCCCGAGGACATGGAG 72
|..||.|| ||.|..||| |||.||.|
Sbjct 1 ------------------------------ATGGCTGG-GAACTACAGGCTTGGGCAA---------------- 27
Query 73 ATGGAAGCGGGAGATACAGATGACCCACCAAGAATTACTCAGAACCCTGTGATCAATGGGAATGTGGCCCTGAG 146
|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||..|||||||
Sbjct 28 ---GAAGCTGGAGATACAGATGACCCACCAAGAATTACTCAGAACCCTGTCATCAATGGGAATGTAACCCTGAG 98
Query 147 TGATGGACACAACACCGCGGAGGAGGACATGGAGGATGACACCAGTTGGCGCTCCGAGGCAACCTTTCAGTTCA 220
||||||.||||.||.|||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 99 TGATGGGCACAGCAACGCAGAAGAGGACATGGAGGATGACACCAGTTGGCGCTCCGAGGCAACCTTTCAGTTCA 172
Query 221 CTGTGGAGCGCTTCAGCAGACTGAGTGAGTCGGTCCTTAGCCCTCCGTGTTTTGTGCGAAATCTGCCATGGAAG 294
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 173 CTGTCGAGCGCTTCAGCAGACTGAGTGAGTCGGTCCTTAGCCCTCCGTGTTTTGTGCGAAATCTGCCATGGAAG 246
Query 295 ATTATGGTGATGCCACGCTTTTATCCAGACAGACCACACCAAAAAAGCGTAGGATTCTTTCTCCAGTGCAATGC 368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 247 ATTATGGTGATGCCACGCTTTTATCCAGACAGACCACACCAAAAAAGCGTAGGATTCTTTCTCCAGTGCAATGC 320
Query 369 TGAATCTGATTCCACGTCATGGTCTTGCCATGCACAAGCAGTGCTGAAGATAATAAATTACAGAGATGATGAAA 442
|||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 321 TGAATCTGACTCCACGTCGTGGTCCTGCCACGCACAAGCAGTGCTGAAGATAATAAATTACAGGGATGATGACA 394
Query 443 AGTCGTTCAGTCGTCGTATTAGTCATTTGTTCTTCCATAAAGAAAATGATTGGGGATTTTCCAATTTTATGGCC 516
|.||.|||||.||.||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||.||.||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct 395 AATCATTCAGCCGGCGAATCAGCCACTTGTTCTTCCACAAGGAAAACGACTGGGGATTCTCTAATTTCATGGCC 468
Query 517 TGGAGTGAAGTGACCGATCCTGAGAAAGGATTTATAGATGATGACAAAGTTACCTTTGAAGTCTTTGTACAGGC 590
||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 469 TGGAGTGAAGTGACTGATCCTGAGAAAGGATTCATCGATGATGACAAAGTCACCTTTGAAGTTTTTGTACAGGC 542
Query 591 GGATGCTCCCCATGGAGTTGCGTGGGATTCAAAGAAGCACACAGGCTACGTCGGCTTAAAGAATCAGGGAGCGA 664
.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 543 AGATGCTCCCCATGGAGTTGCGTGGGACTCAAAGAAGCATACTGGCTATGTCGGCTTAAAGAATCAGGGAGCAA 616
Query 665 CTTGTTACATGAACAGCCTGCTACAGACGTTATTTTTCACGAATCAGCTACGAAAGGCTGTGTACATGATGCCA 738
|.|||||||||||.|||.||||.|||||.||.||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 617 CGTGTTACATGAATAGCTTGCTGCAGACCTTGTTTTTCACAAATCAGTTACGAAAGGCTGTGTACATGATGCCA 690
Query 739 ACCGAGGGGGATGATTCGTCTAAAAGCGTCCCTTTAGCATTACAAAGAGTGTTCTATGAATTACAGCATAGTGA 812
||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 691 ACAGAGGGCGATGATTCATCTAAAAGCGTCCCTTTAGCATTACAAAGAGTGTTCTATGAATTACAGCACAGCGA 764
Query 813 TAAACCTGTAGGAACAAAAAAGTTAACAAAGTCATTTGGGTGGGAAACTTTAGATAGCTTCATGCAACATGATG 886
|||.||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 765 TAAGCCCGTAGGAACAAAAAAGCTCACAAAGTCATTTGGGTGGGAAACTTTAGATAGCTTCATGCAACACGATG 838
Query 887 TTCAGGAGCTTTGTCGAGTGTTGCTCGATAATGTGGAAAATAAGATGAAAGGCACCTGTGTAGAGGGCACCATA 960
||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 839 TTCAAGAGCTTTGTCGAGTGTTGCTTGATAATGTGGAAAATAAGATGAAAGGCACCTGTGTAGAGGGCACCATT 912
Query 961 CCCAAATTATTCCGCGGCAAAATGGTGTCCTATATCCAGTGTAAAGAAGTAGACTATCGGTCTGATAGAAGAGA 1034
||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||
Sbjct 913 CCAAAGTTATTCCGAGGCAAAATGGTGTCCTATATTCAGTGCAAAGACGTAGACTACCGTTCTGATAGGAGAGA 986
Query 1035 AGATTATTATGATATCCAGCTAAGTATCAAAGGAAAGAAAAATATATTTGAATCATTTGTGGATTATGTGGCAG 1108
|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 987 AGATTATTATGATATCCAGCTAAGTATAAAAGGAAAGAAAAACATATTTGAATCATTTGTGGATTATGTGGCAG 1060
Query 1109 TAGAACAGCTCGATGGGGACAATAAATACGACGCTGGGGAACATGGCTTACAGGAAGCAGAGAAAGGTGTGAAA 1182
|||||||.||.||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||.|.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1061 TAGAACAACTAGACGGTGACAATAAATACGATGCTGGGGAGCATGGCCTGCAGGAGGCAGAGAAAGGTGTGAAA 1134
Query 1183 TTCCTAACATTGCCACCAGTGTTACATCTACAACTGATGAGATTTATGTATGACCCTCAGACGGACCAAAATAT 1256
||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1135 TTCCTAACATTGCCCCCAGTGTTACACCTGCAACTTATGAGGTTCATGTATGACCCTCAGACGGACCAAAACAT 1208
Query 1257 CAAGATCAATGATAGGTTTGAATTCCCAGAGCAGTTACCACTTGATGAATTTTTGCAAAAAACAGATCCTAAGG 1330
||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1209 CAAGATCAATGACAGGTTTGAGTTTCCAGAACAGTTACCACTTGATGAATTTTTGCAAAAAACAGACCCTAAGG 1282
Query 1331 ACCCTGCAAATTATATTCTTCATGCAGTCCTGGTTCATAGTGGAGATAATCATGGTGGACATTATGTGGTTTAT 1404
|||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1283 ACCCTGCAAATTATATTCTCCATGCAGTCTTGGTTCACAGTGGAGATAATCATGGTGGACATTACGTGGTTTAC 1356
Query 1405 CTAAACCCCAAAGGGGATGGCAAATGGTGTAAATTTGATGACGACGTGGTGTCAAGGTGTACTAAAGAGGAAGC 1478
||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1357 CTAAACCCCAAAGGGGATGGCAAATGGTGTAAGTTCGATGATGACGTGGTATCCAGGTGTACTAAAGAAGAAGC 1430
Query 1479 AATTGAGCACAATTATGGGGGTCACGATGACGACCTGTCTGTTCGACACTGCACTAATGCTTACATGTTAGTCT 1552
.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|
Sbjct 1431 CATTGAGCACAATTATGGGGGTCATGATGATGATCTGTCTGTTCGACACTGCACAAATGCCTATATGTTAGTGT 1504
Query 1553 ACATCAGGGAATCAAAACTGAGTGAAGTTTTACAGGCGGTCACCGACCATGATATTCCTCAGCAGTTGGTGGAG 1626
||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1505 ACATCAGGGAATCAAAGCTAAGTGAAGTGTTACAAGCTGTCACCGACCATGATATTCCTCAGCAGTTGGTGGAA 1578
Query 1627 CGATTACAAGAAGAGAAAAGGATCGAGGCTCAGAAGCGGAAGGAGCGGCAGGAAGCCCATCTCTATATGCAAGT 1700
|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1579 CGATTGCAAGAAGAGAAAAGGATCGAGGCTCAGAAGCGGAAGGAGCGGCAGGAAGCCCATCTCTACATGCAAGT 1652
Query 1701 GCAGATAGTCGCAGAGGACCAGTTTTGTGGCCACCAAGGGAATGACATGTACGATGAAGAAAAAGTGAAATACA 1774
|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||..||||
Sbjct 1653 GCAGATAGTTGCAGAGGACCAGTTTTGTGGCCACCAAGGAAATGACATGTACGACGAGGAGAAAGTGAGGTACA 1726
Query 1775 CTGTGTTCAAAGTATTGAAGAACTCCTCGCTTGCTGAGTTTGTTCAGAGCCTCTCTCAGACCATGGGATTTCCA 1848
||||||||||.||..|||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1727 CTGTGTTCAAGGTTCTGAAGAACTCCTCCCTGGCCGAGTTTGTTCAGAGCCTCTCCCAGACCATGGGGTTTCCA 1800
Query 1849 CAAGATCAAATTCGATTGTGGCCCATGCAAGCAAGGAGTAATGGAACAAAACGACCAGCAATGTTAGATAATGA 1922
||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1801 CAAGATCAGATTCGATTATGGCCTATGCAAGCAAGAAGTAATGGAACAAAGCGGCCTGCAATGTTAGATAATGA 1874
Query 1923 AGCCGACGGCAATAAAACAATGATTGAGCTCAGTGATAATGAAAACCCTTGGACAATATTCCTGGAAACAGTTG 1996
|||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1875 AGCTGACGGCAATAAAACAATGATTGAACTGAGTGATAATGAAAACCCTTGGACAATATTCCTGGAAACAGTTG 1948
Query 1997 ATCCCGAGCTGGCTGCTAGTGGAGCGACCTTACCCAAGTTTGATAAAGATCATGATGTAATGTTATTTTTGAAG 2070
||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1949 ATCCTGAGCTGGCTGCTAGTGGAGCAACATTGCCCAAGTTTGATAAAGATCATGATGTAATGTTATTTTTGAAG 2022
Query 2071 ATGTATGATCCCAAAACGCGGAGCTTGAATTACTGTGGGCATATCTACACACCAATATCCTGTAAAATACGTGA 2144
|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 2023 ATGTATGATCCTAAAACCCGGAGCTTGAATTACTGTGGACATATCTACACACCCATATCCTGTAAAATACGTGA 2096
Query 2145 CTTGCTCCCAGTTATGTGTGACAGAGCAGGATTTATTCAAGATACTAGCCTTATCCTCTATGAGGAAGTTAAAC 2218
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2097 CTTGCTCCCGGTTATGTGTGACAGAGCAGGATTTATCCAGGATACTAGCCTTATCCTCTATGAGGAAGTTAAGC 2170
Query 2219 CGAATTTAACAGAGAGAATTCAGGACTATGACGTGTCTCTTGATAAAGCCCTTGATGAACTAATGGATGGTGAC 2292
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 2171 CGAATTTAACAGAGAGAATTCAGGACTATGATGTGTCTCTTGATAAAGCCCTTGATGAGCTGATGGATGGTGAC 2244
Query 2293 ATCATAGTATTTCAGAAGGATGACCCTGAAAATGATAACAGTGAATTACCCACCGCAAAGGAGTATTTCCGAGA 2366
||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||..|.|||||.||.||.|||||||||.||||
Sbjct 2245 ATCATAGTGTTTCAGAAGGATGACCCAGAAAACGATAACAGTGAGCTGCCCACTGCTAAAGAGTATTTCAGAGA 2318
Query 2367 TCTCTACCACCGCGTTGATGTCATTTTCTGTGATAAAACAATCCCTAATGATCCTGGATTTGTGGTTACGTTAT 2440
||||||||||||.||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.||||
Sbjct 2319 TCTCTACCACCGGGTCGACGTCATCTTCTGTGACAAAACGATCCCCAATGACCCTGGATTTGTGGTCACATTAT 2392
Query 2441 CAAATAGAATGAATTATTTTCAGGTTGCAAAGACAGTTGCACAGAGGCTCAACACAGATCCAATGTTGCTGCAG 2514
|||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||.||||||||
Sbjct 2393 CAAATAGGATGAACTATTTTCAGGTTGCAAAGACAGTTGCACAGAGGCTCAACACAGACCCCATGCTGCTGCAG 2466
Query 2515 TTTTTCAAGTCTCAAGGTTATAGGGATGGCCCAGGTAATCCTCTTAGACATAATTATGAAGGTACTTTAAGAGA 2588
||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 2467 TTTTTCAAGTCTCAAGGTTATAGGGACGGCCCCGGTAATCCTCTTAGGCATAATTACGAAGGTACTTTAAGAGA 2540
Query 2589 TCTTCTACAGTTCTTCAAGCCTAGACAACCTAAGAAACTTTACTATCAGCAGCTTAAGATGAAAATCACAGACT 2662
|||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 2541 TCTTCTACAATTCTTCAAGCCAAGACAACCTAAGAAACTTTACTATCAGCAACTTAAGATGAAAATCACAGACT 2614
Query 2663 TTGAGAACAGGCGAAGTTTTAAATGTATATGGTTAAACAGCCAATTTAGGGAAGAGGAAATAACACTATATCCA 2736
|||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 2615 TTGAGAACAGGAGAAGTTTTAAGTGTATATGGTTAAACAGCCAATTTAGGGAAGAGGAAATAACACTATACCCA 2688
Query 2737 GACAAGCATGGGTGTGTCCGGGACCTGTTAGAAGAATGTAAAAAGGCCGTGGAGCTTGGGGAGAAAGCATCAGG 2810
|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 2689 GACAAGCATGGCTGTGTCCGGGACCTGTTAGAAGAATGTAAAAAAGCCGTGGAGCTCGGTGACAAAGCATCAGG 2762
Query 2811 GAAACTTAGGCTGCTAGAAATTGTAAGCTACAAAATCATTGGTGTTCATCAAGAAGATGAACTATTAGAATGTT 2884
||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2763 GAGACTTAGGCTGCTAGAAATTGTGAGCTACAAAATTATTGGTGTGCATCAAGAAGATGAACTATTAGAATGCT 2836
Query 2885 TATCTCCTGCAACGAGCCGGACGTTTCGAATAGAGGAAATCCCTTTGGACCAGGTGGACATAGACAAAGAGAAT 2958
||||||||||||||||.|||||.|||.|||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.||.
Sbjct 2837 TATCTCCTGCAACGAGTCGGACTTTTAGAATAGAGGAAATACCTTTGGACCAGGTAGACATAGATAAGGAAAAC 2910
Query 2959 GAGATGCTTGTCACAGTGGCGCATTTCCACAAAGAGGTCTTCGGAACGTTCGGAATCCCGTTTTTGCTGAGGAT 3032
||||||||..||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||
Sbjct 2911 GAGATGCTAATCACAGTGGCACATTTCCACAAAGAGGTGTTTGGGACGTTTGGAATTCCATTTTTGCTAAGGAT 2984
Query 3033 ACACCAGGGCGAGCATTTTCGAGAAGTGATGAAGCGAATCCAGAGCCTGCTGGACATCCAGGAGAAGGAGTTTG 3106
|||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2985 ACACCAGGGTGAGCATTTCCGAGAGGTGATGAAGCGGATACAGAGCCTGCTGGACATCCAGGAGAAGGAGTTTG 3058
Query 3107 AGAAGTTTAAATTTGCAATTGTAATGATGGGCCGACACCAGTACATAAATGAAGACGAGTATGAAGTAAATTTG 3180
|.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 3059 AAAAGTTTAAATTTGCAATTGTCATGATGGGCCGGCACCAGTACATCAATGAAGATGAGTATGAAGTAAATTTG 3132
Query 3181 AAAGACTTTGAGCCACAGCCCGGTAATATGTCTCATCCTCGGCCTTGGCTAGGGCTCGACCACTTCAACAAAGC 3254
||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 3133 AAGGACTTTGAGCCACAACCTGGTAACATGTCTCATCCTCGGCCTTGGCTAGGGCTTGACCACTTCAACAAAGC 3206
Query 3255 CCCAAAGAGGAGTCGCTACACTTACCTTGAAAAGGCCATTAAAATCCATAAC 3306
|||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 3207 CCCAAAGAGGAGTCGCTACACTTACCTAGAAAAGGCAATTAAAATCCACAAC 3258