Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000488648
- Subject:
- NM_001323324.2
- Aligned Length:
- 1399
- Identities:
- 920
- Gaps:
- 248
Alignment
Query 1 ATGAGCCTCCATTTCTTATACTACTGCAGTGAACCAACATTGGATGTGAAAATTGCCTTTTGTCAGGGATTCGA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TAAACAAGTGGATGTGTCATATATTGCCAAACATTACAACATGAGCAAAAGCAAAGTTGACAACCAGTTCTACA 148
|||||||.||||||...|||||||.|.||.||.|
Sbjct 1 ----------------------------------------ATGAGCAGAAGCAAGCGTGACAACAATTTTTATA 34
Query 149 GTGTGGAAGTGGGAGACTCAACCTTCACAGTTCTCAAGCGCTACCAGAATCTAAAGCCTATTGGCTCTGGGGCT 222
||||.||..|.|||||.||.||.||||||||.||.||.||.||.||||||.||||.|||||.|||||.||.|||
Sbjct 35 GTGTAGAGATTGGAGATTCTACATTCACAGTCCTGAAACGATATCAGAATTTAAAACCTATAGGCTCAGGAGCT 108
Query 223 CAGGGCATAGTTTGTGCCGCGTATGATGCTGTCCTTGACAGAAATGTGGCCATTAAGAAGCTCAGCAGACCCTT 296
||.||.|||||.||.||.||.||||||||..|.|||||.||||||||.||.||.||||||||.|||.||||.||
Sbjct 109 CAAGGAATAGTATGCGCAGCTTATGATGCCATTCTTGAAAGAAATGTTGCAATCAAGAAGCTAAGCCGACCATT 182
Query 297 TCAGAACCAAACACATGCCAAGAGAGCGTACCGGGAGCTGGTCCTCATGAAGTGTGTGAACCATAAAAACATTA 370
||||||.||.||.|||||||||.|.||.|||.|.|||||.||.||.|||||.|||||.||.||.|||||.||.|
Sbjct 183 TCAGAATCAGACTCATGCCAAGCGGGCCTACAGAGAGCTAGTTCTTATGAAATGTGTTAATCACAAAAATATAA 256
Query 371 TTAGTTTATTAAATGTCTTCACACCCCAGAAAACGCTGGAGGAGTTCCAAGATGTTTACTTAGTAATGGAACTG 444
||.|..|.||.|||||.||||||||.||||||.|.||.||.||.||.||||||||||||.||||.|||||.||.
Sbjct 257 TTGGCCTTTTGAATGTTTTCACACCACAGAAATCCCTAGAAGAATTTCAAGATGTTTACATAGTCATGGAGCTC 330
Query 445 ATGGATGCCAA-CTTATGTCAAGTGATTCAGATGGAATTAGACCATGAGCGAATGTCTTACCTGCTGTACCAAA 517
||||||||.|| ||| ||.|||||||||||||||||..||||.|||||..|||||||.|||||.||.||.||.|
Sbjct 331 ATGGATGCAAATCTT-TGCCAAGTGATTCAGATGGAGCTAGATCATGAAAGAATGTCCTACCTTCTCTATCAGA 403
Query 518 TGTTGTGTGGCATTAAGCACCTCCATTCTGCTGGAATTATTCACAGGGATTTAAAACCAAGTAACATTGTAGTC 591
||.|||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||..||||.|||||.||.|||||.||.|||||.
Sbjct 404 TGCTGTGTGGAATCAAGCACCTTCATTCTGCTGGAATTATTCATCGGGACTTAAAGCCCAGTAATATAGTAGTA 477
Query 592 AAGTCTGATTGCACATTGAAAATCCTGGACTTTGGACTGGCCAGGACAGCAGGCACAAGCTTCATGATGACTCC 665
||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||.||
Sbjct 478 AAATCTGATTGCACTTTGAAGATTCTTGACTTCGGTCTGGCCAGGACTGCAGGAACGAGTTTTATGATGACGCC 551
Query 666 ATATGTGGTGACACGTTATTACAGAGCCCCTGAGGTCATCCTGGGGATGGGCTACAAGGAGAACGTGGATATAT 739
.|||||.|||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||.|||
Sbjct 552 TTATGTAGTGACTCGCTACTACAGAGCACCCGAGGTCATCCTTGGCATGGGCTACAAGGAAAACGTGGATTTAT 625
Query 740 GGTCTGTGGGATGCATTATGGGAGAAATGGTTCGCCACAAAATCCTCTTTCCAGGAAGGGACTATATTGACCAG 813
||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 626 GGTCTGTGGGGTGCATTATGGGAGAAATGGTTTGCCACAAAATCCTCTTTCCAGGAAGGGACTATATTGATCAG 699
Query 814 TGGAATAAGGTAATTGAACAACTAGGAACACCATGTCCAGAATTCATGAAGAAATTGCAACCCACAGTAAGAAA 887
||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||.||||||||.|.
Sbjct 700 TGGAATAAAGTTATTGAACAGCTTGGAACACCATGTCCTGAATTCATGAAGAAACTGCAACCAACAGTAAGGAC 773
Query 888 CTATGTGGAGAATCGGCCCAAGTATGCGGGACTCACCTTCCCCAAACTCTTCCCAGATTCCCTCTTCCCAGCGG 961
.||.||.||.||..|.||.||.|||||.|||...|.|||....|||||||||||.|||..|||.||||||||.|
Sbjct 774 TTACGTTGAAAACAGACCTAAATATGCTGGATATAGCTTTGAGAAACTCTTCCCTGATGTCCTTTTCCCAGCTG 847
Query 962 ACTCCGAGCACAATAAACTCAAAGCCAGCCAAGCCAGGGACTTGTTGTCAAAGATGCTAGTGATTGACCCAGCA 1035
||||.||.|||||.|||||.||||||||.||.||.|||||.|||||.||.||.|||||.||.||.||..||.|.
Sbjct 848 ACTCAGAACACAACAAACTTAAAGCCAGTCAGGCAAGGGATTTGTTATCCAAAATGCTGGTAATAGATGCATCT 921
Query 1036 AAAAGAATATCAGTGGACGACGCCTTACAGCATCCCTACATCAACGTCTGGTATGACCCAGCCGAAGTGGAGGC 1109
|||||.||.||.||.||.||.||..|.||.||.||.||||||||.|||||||||||.||..|.||||..||.||
Sbjct 922 AAAAGGATCTCTGTAGATGAAGCTCTCCAACACCCGTACATCAATGTCTGGTATGATCCTTCTGAAGCAGAAGC 995
Query 1110 GCCTCCACCTCAGATATATGACAAGCAGTTGGATGAAAGAGAACACACAATTGAAGAATGGAAAGAACTTATCT 1183
.||.|||||..||||...||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||.|.||.|
Sbjct 996 TCCACCACCAAAGATCCCTGACAAGCAGTTAGATGAAAGGGAACACACAATAGAAGAGTGGAAAGAATTGATAT 1069
Query 1184 ACAAGGAAGTAATGAATTCAGAAGAAAAGACTAAAAATGGTGTAGTAAAAGGACAGCCTTCTCCTTCAGCACAG 1257
|.||||||||.|||.|.|..||.||.|..||.||.|||||.||..||...||.|||||.|||||||.|||||||
Sbjct 1070 ATAAGGAAGTTATGGACTTGGAGGAGAGAACCAAGAATGGAGTTATACGGGGGCAGCCCTCTCCTTTAGCACAG 1143
Query 1258 GTGCAGCAGTGAACAGCAGTGAGAGTCTCCCTCCATCCTCGTCTGTCAATGACATCTCCTCCATGTCCACCGAC 1331
|||||||||
Sbjct 1144 GTGCAGCAG----------------------------------------------------------------- 1152
Query 1332 CAGACCCTGGCATCTGACACTGACAGCAGCCTGGAAGCCTCGGCAGGACCCCTGGGTTGTTGCAGGG 1398
Sbjct 1153 ------------------------------------------------------------------- 1152