Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488675
• Subject: NM_013523.3
• Aligned Length: 2088
• Identities: 1801
• Gaps: 15

Alignment

Query    1  ATGGCCCTGCTCCTGGTCTCTTTGCTGGCATTCCTGAGCTTGGGCTCAGGATGTCATCATCGGATCTGTCACTG  74
            ||||||.|||||||||||||.||||||||||||.||.|||.|||.||.|||||||||||..||.|.|||||.||
Sbjct    1  ATGGCCTTGCTCCTGGTCTCCTTGCTGGCATTCTTGGGCTCGGGATCTGGATGTCATCACTGGCTGTGTCATTG  74

Query   75  CTCTAACAGGGTTTTTCTCTGCCAAGAGAGCAAGGTGACAGAGATTCCTTCTGACCTCCCGAGGAATGCCATTG  148
            ||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||..|.||||||||..||||.|||||||
Sbjct   75  CTCTAACAGGGTCTTCCTCTGCCAAGATAGCAAGGTGACCGAGATTCCGCCCGACCTCCCCCGGAACGCCATTG  148

Query  149  AACTGAGGTTTGTCCTCACCAAGCTTCGAGTCATCCAAAAAGGTGCATTTTCAGGATTTGGGGACCTGGAGAAA  222
            |||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|.||||||..|||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AACTGAGATTTGTGCTCACCAAGCTTCGAGTCATTCCAAAAGGATCATTTTCTGGATTTGGGGACCTGGAGAAA  222

Query  223  ATAGAGATCTCTCAGAATGATGTCTTGGAGGTGATAGAGGCAGATGTGTTCTCCAACCTTCCCAAATTACATGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||
Sbjct  223  ATAGAGATCTCTCAGAATGATGTCTTGGAGGTAATAGAGGCAGATGTGTTCTCCAACCTACCCAACTTGCATGA  296

Query  297  AATTAGAATTGAAAAGGCCAACAACCTGCTCTACATCAACCCTGAGGCCTTCCAGAACCTTCCCAACCTTCAAT  370
            ||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||..||.|.||
Sbjct  297  AATTAGGATTGAAAAGGCTAACAATCTGCTGTACATCAACCCTGAGGCCTTCCAGAATCTTCCCAGTCTCCGAT  370

Query  371  ATCTGTTAATATCCAACACAGGTATTAAGCACCTTCCAGATGTTCACAAGATTCATTCTCTCCAAAAAGTTTTA  444
            ||||||||||||||||||||||.|||||.|||.|.||||...||||||||||.||.|||||||||||.||||||
Sbjct  371  ATCTGTTAATATCCAACACAGGCATTAAACACTTGCCAGCCTTTCACAAGATCCAGTCTCTCCAAAAGGTTTTA  444

Query  445  CTTGACATTCAAGATAACATAAACATCCACACAATTGAAAGAAATTCTTTCGTGGGGCTGAGCTTTGAAAGTGT  518
            .|.||||||||||||||||||||||||||||..||||..||.||.||.|||.||||.|||||||||||||||||
Sbjct  445  TTAGACATTCAAGATAACATAAACATCCACATCATTGCCAGGAACTCCTTCATGGGACTGAGCTTTGAAAGTGT  518

Query  519  GATTCTATGGCTGAATAAGAATGGGATTCAAGAAATACACAACTGTGCATTCAATGGAACCCAACTAGATGAGC  592
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|
Sbjct  519  AATTCTATGGCTGAATAAGAATGGGATTCAAGAAATACACAACTGTGCATTCAACGGAACCCAGCTAGATGAAC  592

Query  593  TGAATCTAAGCGATAATAATAATTTAGAAGAATTGCCTAATGATGTTTTCCACGGAGCCTCTGGACCAGTCATT  666
            ||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||.||||||.||
Sbjct  593  TGAATCTAAGCGATAACAATAATTTGGAAGAATTGCCTGATGATGTTTTCCAGGGAGCCTCTGGGCCAGTCGTT  666

Query  667  CTAGATATTTCAAGAACAAGGATCCATTCCCTGCCTAGCTATGGCTTAGAAAATCTTAAGAAGCTGAGGGCCAG  740
            .||||.||.|||||.||||.|.||.||||||||||.|.|.||||||||||||||||.||||||.||||||||||
Sbjct  667  TTAGACATCTCAAGGACAAAGGTCTATTCCCTGCCCAACCATGGCTTAGAAAATCTGAAGAAGTTGAGGGCCAG  740

Query  741  GTCGACTTACAACTTAAAAAAGCTGCCTACTCTGGAAAAGCTTGTCGCCCTCATGGAAGCCAGCCTCACCTATC  814
            |||.||.|||..|||.||||||||.||||.|||.||.|||.|||||...|||||.||.||||||||.|||||.|
Sbjct  741  GTCAACATACCGCTTGAAAAAGCTCCCTAGTCTAGACAAGTTTGTCATGCTCATTGAGGCCAGCCTTACCTACC  814

Query  815  CCAGCCATTGCTGTGCCTTTGCAAACTGGAGACGGCAAATCTCTGAGCTTCATCCAATTTGCAACAAATCTATT  888
            ||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  815  CCAGTCACTGCTGTGCCTTTGCAAACTGGAGGCGGCAAACCTCTGAACTTCATCCAATTTGCAACAAGTCTATT  888

Query  889  TTAAGGCAAGAAGTTGATTATATGACTCAGGCTAGGGGTCAGAGATCCTCTCTGGCAGAAGACAATGAGTCCAG  962
            |.|||||||||..|||||.|||||||||||.||.|||.|||||||..||||||.|.|||.|   ||||..||||
Sbjct  889  TCAAGGCAAGATATTGATGATATGACTCAGCCTGGGGATCAGAGAGTCTCTCTCGTAGATG---ATGAACCCAG  959

Query  963  CTACAGCAGAGGATTTGACATGACGTACACTGAGTTTGACTATGACTTATGCAATGAAGTGGTTGACGTGACCT  1036
            .||..|.|.|||||.|||||||..|||.|.|||.||||||||||||||||||||||||.|.|||||.|||||||
Sbjct  960  TTATGGAAAAGGATCTGACATGTTGTATAGTGAATTTGACTATGACTTATGCAATGAATTTGTTGATGTGACCT  1033

Query 1037  GCTCCCCTAAGCCAGATGCATTCAACCCATGTGAAGATATCATGGGGTACAACATCCTCAGAGTCCTGATATGG  1110
            ||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1034  GCTCGCCAAAGCCAGATGCATTTAATCCATGTGAAGACATCATGGGGTACAACATCCTCAGAGTCTTGATATGG  1107

Query 1111  TTTATCAGCATCCTGGCCATCACTGGGAACATCATAGTGCTAGTGATCCTAACTACCAGCCAATATAAACTCAC  1184
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||.|||.||||.||.||.||||||||.||||||||
Sbjct 1108  TTTATCAGCATCCTGGCCATCACTGGGAACACCACAGTGCTGGTGGTCCTGACCACAAGCCAATACAAACTCAC  1181

Query 1185  AGTCCCCAGGTTCCTTATGTGCAACCTGGCCTTTGCTGATCTCTGCATTGGAATCTACCTGCTGCTCATTGCAT  1258
            .||.|||.|||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||.||||.||.||.||.|
Sbjct 1182  TGTGCCCCGGTTCCTTATGTGTAACCTCGCCTTTGCTGATCTTTGCATTGGGATCTACTTGCTACTTATAGCCT  1255

Query 1259  CAGTTGATATCCATACCAAGAGCCAATATCACAACTATGCCATTGACTGGCAAACTGGGGCAGGCTGTGATGCT  1332
            ||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.
Sbjct 1256  CAGTTGATATCCATACTAAGAGCCAGTACCACAATTACGCCATTGACTGGCAAACAGGAGCAGGCTGCGATGCC  1329

Query 1333  GCTGGCTTTTTCACTGTCTTTGCCAGTGAGCTGTCAGTCTACACTCTGACAGCTATCACCTTGGAAAGATGGCA  1406
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||..||.||||.||.|||.|.|||||||||||
Sbjct 1330  GCTGGCTTTTTCACTGTCTTTGCCAGTGAACTGTCAGTCTACACATTGGCAGCCATAACCCTAGAAAGATGGCA  1403

Query 1407  TACCATCACGCATGCCATGCAGCTGGACTGCAAGGTGCAGCTCCGCCATGCTGCCAGTGTCATGGTGATGGGCT  1480
            |||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||.|||||||||||||..||||||||.||||||
Sbjct 1404  TACCATCACACATGCCATGCAACTGGAATGCAAGGTACAGCTCTGCCATGCTGCCAGCATCATGGTGCTGGGCT  1477

Query 1481  GGATTTTTGCTTTTGCAGCTGCCCTCTTTCCCATCTTTGGCATCAGCAGCTACATGAAGGTGAGCATCTGCCTG  1554
            ||...|||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1478  GGGCCTTTGCCTTTGCGGCTGCTCTCTTCCCCATCTTTGGCATCAGTAGCTACATGAAAGTGAGCATCTGCCTG  1551

Query 1555  CCCATGGATATTGACAGCCCTTTGTCACAGCTGTATGTCATGTCCCTCCTTGTGCTCAATGTCCTGGCCTTTGT  1628
            |||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||.|||||||.||.|||||.|.||||||||||||
Sbjct 1552  CCCATGGATATCGACAGCCCTTTGTCGCAGCTGTATGTTATGGCCCTCCTCGTACTCAACGCCCTGGCCTTTGT  1625

Query 1629  GGTCATCTGTGGCTGCTATATCCACATCTACCTCACAGTGCGGAACCCCAACATCGTGTCCTCCTCTAGTGACA  1702
            ||||||||||||.|||||.|.|||||||||||||||||||.||||.||.|||||.||||||||.||.||.||||
Sbjct 1626  GGTCATCTGTGGTTGCTACACCCACATCTACCTCACAGTGAGGAATCCTAACATTGTGTCCTCGTCAAGAGACA  1699

Query 1703  CCAGGATCGCCAAGCGCATGGCCATGCTCATCTTCACTGACTTCCTCTGCATGGCACCCATTTCTTTCTTTGCC  1776
            |||.|||.||||||||||||||||..|||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||..|||||||||
Sbjct 1700  CCAAGATTGCCAAGCGCATGGCCACACTCATCTTCACGGACTTTCTCTGCATGGCCCCAATTTTATTCTTTGCC  1773

Query 1777  ATTTCTGCCTCCCTCAAGGTGCCCCTCATCACTGTGTCCAAAGCAAAGATTCTGCTGGTTCTGTTTCACCCCAT  1850
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||||||||..|||||||
Sbjct 1774  ATTTCCGCCTCCCTCAAGGTGCCCCTCATCACTGTGTCCAAGGCCAAGATCCTCCTAGTTCTGTTCTACCCCAT  1847

Query 1851  CAACTCCTGTGCCAACCCCTTCCTCTATGCCATCTTTACCAAAAACTTTCGCAGAGATTTCTTCATTCTGCTGA  1924
            |||.||.||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||||||.|.|||.|||
Sbjct 1848  CAATTCTTGTGCCAATCCTTTCCTCTATGCCATTTTCACCAAGAACTTCCGCAGGGACTTCTTCGTCCTGATGA  1921

Query 1925  GCAAGTGTGGCTGCTATGAAATGCAAGCCCAAATTTATAGGACAGAAACTTCATCCACTGTCCACAACACCCA-  1997
            ||||||.||||||.|||||..||||||||||.|||||.|.|||||||||.|||||.|.|..|||||||..||| 
Sbjct 1922  GCAAGTTTGGCTGTTATGAGGTGCAAGCCCAGATTTACAAGACAGAAACCTCATCTATTACCCACAACTTCCAC  1995

Query 1998  TCC--AAGGAATGGCCACTGCTCTTCAGCTCCCAGAGTCACCAGTGGTTCCACTTACATACTTGTCCCTCTAAG  2069
            |||  ||.||||   |.|||.||.||.||||||||||||||||.|      |.||||.|.|||||||||||||.
Sbjct 1996  TCCAGAAAGAAT---CCCTGTTCCTCGGCTCCCAGAGTCACCAAT------AGTTACGTGCTTGTCCCTCTAAA  2060

Query 2070  TCATTTAGCCCAAAAC  2085
            |||||.||.|||.|||
Sbjct 2061  TCATTCAGTCCAGAAC  2076