Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488694
• Subject: NM_001311161.1
• Aligned Length: 1109
• Identities: 965
• Gaps: 15

Alignment

Query    1  ATGGCGTACTCCACAGTGCAGAGAGTCGCTCTGGCTTCTGGGCTTGTCCTGGCTCTGTCGCTGCTGCTGCCCAA  74
            ||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.||||||||..|||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGTACTCCACGGTGCAGAGAGTGGCGCTGGCCTCGGGGCTCGTCCTGGCCGTGTCGCTGCTGCTGCCCAA  74

Query   75  GGCCTTCCTGTCCCGCGGGAAGCGGCAGGAGCCGCCGCCGACACCTGAAGGAAAATTGGGCCGATTTCCACCTA  148
            |||||||.||||.|||||||||||.|.|||||||||||||...||.|||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct   75  GGCCTTCTTGTCTCGCGGGAAGCGACCGGAGCCGCCGCCGGGCCCGGAAGGAAAATTGGACCGATTTCCACCTA  148

Query  149  TGATGCATCATCACCAGGCACACTCAGATGGCCAGACTCCTGGGGCTCGTTTCCAGAGGTCTCACCTTGCCGAG  222
            ||||||||||.|||..|||||.|||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  149  TGATGCATCACCACTCGGCACCCTCAGATGGTCAGACACCAGGGGCTCGTTTCCAGAGGTCTCACCTTGCAGAG  222

Query  223  GCATTTGCAAAGGCCAAAGGATCAGGTGGAGGTGCTGGAGGAGGAGGTAGTGGAAGAGGTCTGATGGGGCAGAT  296
            ||.||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  223  GCCTTTGCAAAGGCCAAGGGAGCAGGTGGAGGTGCTGGAGGAGGGGGTAGTGGAAGAGGACTGATGGGCCAGAT  296

Query  297  TATTCCAATCTACGGTTTTGGGATTTTTTTATATATACTGTACATTCTATTTAAGCTCTCAAAGGGGAAAACAA  370
            .|||||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||   ||
Sbjct  297  CATTCCAATCTATGGCTTTGGGATCTTTTTGTACATACTGTACATTTTGTTTAAGCTTTCAAAGGGGAA---AA  367

Query  371  CTGCAGAGGATGGGAAATGCTATACTGCCATGCCTGGAAACACCCACAGGAAAATTACCAGTTTTGAGCTTGCT  444
            |||||||||||.||||.||||..||||||...|||||||||.||||||||||.|||||||..||||||||||.|
Sbjct  368  CTGCAGAGGATCGGAACTGCTCCACTGCCCCACCTGGAAACGCCCACAGGAAGATTACCAACTTTGAGCTTGTT  441

Query  445  CAACTGCAAGAAAAACTGAAGGAGACAGAAGCAGCCATGGAAAAATTATTCAACAGAGTGGGACCTAATGGTGA  518
            |||||.|||||||||||.||.||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  442  CAACTACAAGAAAAACTAAAAGAGACAGAAGAAGCCATGGAAAAATTAATCAACAGAGTTGGACCTAATGGTGA  515

Query  519  GAGAGCACAGACTGTGACTTCTGACCAAGAGAAACGGTTGCTACATCAGCTCCGAGAAATCACCAGGGTCATGA  592
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  516  GAGAGCACAGGCTGTGACTTCTGACCAAGAGAAACGATTACTGCATCAGCTCCGAGAAATCACCAGGGTCATGA  589

Query  593  AAGAAGGAAAATTCATTGACAGATTTTCTCCAGAGAAAGAAGCTGAGGAGGCCCCTTACATGGAGGACTGGGAA  666
            |||||||.||.|||||.||||.|   |||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct  590  AAGAAGGCAAGTTCATCGACACA---TCTCCAGAGAAGGAAGCTGAGGAAGCCCCATACATGGAGGACTGGGAA  660

Query  667  GGTTACCCTGAAGAGACTTACCCAATTTATGACCTTTCAGACTGTATCAAGCGTAGGCAAGAAACAATCTTGGT  740
            ||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||..||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  661  GGTTACCCAGAAGAGACTTATCCAATATATGACCTTTCGGATGGTATCAAGCGTAGGCAAGAAACAATCCTGGT  734

Query  741  GGATTACCCTGACCCAAAAGAACTTTTCTGCTGAAGAAATAGCTGAAAGAATGGGAATGATAGAAGAGGAAGAA  814
            ||||||||||||||.||||||.| ..||||||||||||||.||||||..|||||||..||||||||||||||.|
Sbjct  735  GGATTACCCTGACCTAAAAGAGC-CCTCTGCTGAAGAAATTGCTGAACAAATGGGAGAGATAGAAGAGGAAGGA  807

Query  815  TCAGATCATTTGGGTTGGGAAAGTCTGCCCACTGACCCCAGAGCCCAGGAAGATAATTCTGTTACCTCGTGTGA  888
            |||||.|.||||.|.|||||...|.|||||||||||||..||||||||.||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct  808  TCAGAGCGTTTGAGCTGGGATCATTTGCCCACTGACCCTGGAGCCCAGAAAGATAATTCTGTTGCCCCGTGTGA  881

Query  889  TCCAAAGCCAGAAACATGTTCCTGCTGTTTTCATGAAGACGAGGATCCTGCTGTCTTGGCAGAGAATGCTGGAT  962
            |||.||.||||||.||||.|||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  882  TCCCAAACCAGAATCATGCTCCTGCTGTGTTCATGAAGAGGAGGATCCTGCTGTCTTGGCAGAGAATGCTGGTT  955

Query  963  TCAGTGCAGATAGCTACCCTGAGCAAGAGGAAACCACCAAAGAAGAGTGGTCCCAAGACTTTAAAGATGAAGGG  1036
            |||||||||||.|||||..|||||||||||||.|||||||.|||.|.|.|.||||.|||||||.|.||||||||
Sbjct  956  TCAGTGCAGATGGCTACAGTGAGCAAGAGGAAGCCACCAAGGAAAACTTGCCCCAGGACTTTACAAATGAAGGG  1029

Query 1037  TTGGGCATCAGCACCGATAAAGCATATACA----GGCAGCATGCTGAGGAAGCGTAACCCCCAGGGTTTAGAG  1105
            .||||..|||||||.|||||.||    |||    ||..|.|||.||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 1030  CTGGGAGTCAGCACTGATAATGC----ACACGTGGGTGGTATGTTGAGGAAGCGCAACCCCCAGGGTTTTGAG  1098