Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488694
• Subject: XM_006718317.4
• Aligned Length: 1192
• Identities: 1102
• Gaps: 88

Alignment

Query    1  ATGGCGTACTCCACAGTGCAGAGAGTCGCTCTGGCTTCTGGGCTTGTCCTGGCTCTGTCGCTGCTGCTGCCCAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGTACTCCACAGTGCAGAGAGTCGCTCTGGCTTCTGGGCTTGTCCTGGCTCTGTCGCTGCTGCTGCCCAA  74

Query   75  GGCCTTCCTGTCCCGCGGGAAGCGGCAGGAGCCGCCGCCGACACCTGAAGGAAAATTGGGCCGATTTCCACCTA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCCTTCCTGTCCCGCGGGAAGCGGCAGGAGCCGCCGCCGACACCTGAAGGAAAATTGGGCCGATTTCCACCTA  148

Query  149  TGATGCATCATCACCAGGCACACTCAGATGGCCAGACTCCTGGGGCTCGTTTCCAGAGGTCTCACCTTGCCGAG  222
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGATGCATCATCACCAGGCACCCTCAGATGGCCAGACTCCTGGGGCTCGTTTCCAGAGGTCTCACCTTGCCGAG  222

Query  223  GCATTTGCAAAGGCCAAAGGATCAGGTGGAGGTGCTGGAGGAGGAGGTAGTGGAAGAGGTCTGATGGGGCAGAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCATTTGCAAAGGCCAAAGGATCAGGTGGAGGTGCTGGAGGAGGAGGTAGTGGAAGAGGTCTGATGGGGCAGAT  296

Query  297  TATTCCAATCTACGGTTTTGGGATTTTTTTATATATACTGTACATTCTATTTAAGCTCTCAAAGGGGAAAACAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TATTCCAATCTACGGTTTTGGGATTTTTTTATATATACTGTACATTCTATTTAAGCTCTCAAAGGGGAAAACAA  370

Query  371  CTGCAGAGGATGGGAAATGCTATACTGCCATGCCTGGAAACACCCACAGGAAAATTACCAGTTTTGAGCTTGCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTGCAGAGGATGGGAAATGCTATACTGCCATGCCTGGAAACACCCACAGGAAAATTACCAGTTTTGAGCTTGCT  444

Query  445  CAACTGCAAGAAAAACTGAAGGAGACAGAAGCAGCCATGGAAAAATTATTCAACAGAGTGGGACCTAATGGTGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAACTGCAAGAAAAACTGAAGGAGACAGAAGCAGCCATGGAAAAATTAATCAACAGAGTGGGACCTAATGGTGA  518

Query  519  G-------------------------------------------------------------------------  519
            |                                                                         
Sbjct  519  GAGTACCCAGACAGACCATAGTGATGTTTACGTCCATTGCCTAGGAGTATTTACCACTAAATGGTTGGATTGTC  592

Query  520  --------------AGAGCACAGACTGTGACTTCTGACCAAGAGAAACGGTTGCTACATCAGCTCCGAGAAATC  579
                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGATATTTCTAAGCAGAGCACAGACTGTGACTTCTGACCAAGAGAAACGGTTGCTACATCAGCTCCGAGAAATC  666

Query  580  ACCAGGGTCATGAAAGAAGGAAAATTCATTGACAGATTTTCTCCAGAGAAAGAAGCTGAGGAGGCCCCTTACAT  653
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACCAGGGTCATGAAAGAAGGAAAATTCATTGACAGATTTTCTCCAGAGAAAGAAGCTGAGGAGGCCCCTTACAT  740

Query  654  GGAGGACTGGGAAGGTTACCCTGAAGAGACTTACCCAATTTATGACCTTTCAGACTGTATCAAGCGTAGGCAAG  727
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGAGGACTGGGAAGGTTACCCTGAAGAGACTTACCCAATTTATGACCTTTCAGACTGTATCAAGCGTAGGCAAG  814

Query  728  AAACAATCTTGGTGGATTACCCTGACCCAAAAGAACTTTTCTGCTGAAGAAATAGCTGAAAGAATGGGAATGAT  801
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAACAATCTTGGTGGATTACCCTGACCCAAAAGAAC-TTTCTGCTGAAGAAATAGCTGAAAGAATGGGAATGAT  887

Query  802  AGAAGAGGAAGAATCAGATCATTTGGGTTGGGAAAGTCTGCCCACTGACCCCAGAGCCCAGGAAGATAATTCTG  875
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  AGAAGAGGAAGAATCAGATCATTTGGGTTGGGAAAGTCTGCCCACTGACCCCAGAGCCCAGGAAGATAATTCTG  961

Query  876  TTACCTCGTGTGATCCAAAGCCAGAAACATGTTCCTGCTGTTTTCATGAAGACGAGGATCCTGCTGTCTTGGCA  949
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  TTACCTCGTGTGATCCAAAGCCAGAAACATGTTCCTGCTGTTTTCATGAAGACGAGGATCCTGCTGTCTTGGCA  1035

Query  950  GAGAATGCTGGATTCAGTGCAGATAGCTACCCTGAGCAAGAGGAAACCACCAAAGAAGAGTGGTCCCAAGACTT  1023
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  GAGAATGCTGGATTCAGTGCAGATAGCTACCCTGAGCAAGAGGAAACCACCAAAGAAGAGTGGTCCCAAGACTT  1109

Query 1024  TAAAGATGAAGGGTTGGGCATCAGCACCGATAAAGCATATACAGGCAGCATGCTGAGGAAGCGTAACCCCCAGG  1097
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110  TAAAGATGAAGGGTTGGGCATCAGCACCGATAAAGCATATACAGGCAGCATGCTGAGGAAGCGTAACCCCCAGG  1183

Query 1098  GTTTAGAG  1105
            ||||||||
Sbjct 1184  GTTTAGAG  1191