Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488697
• Subject: NM_010838.4
• Aligned Length: 1330
• Identities: 965
• Gaps: 221

Alignment

Query    1  ATGGCTGAGCCCCGCCAGGAGTTCGAAGTGATGGAAGATCACGCTGGGACGTACGGGTTGGGGGACAGGAAAGA  74
            ||||||||.||.|||||||||||.||....||||||||.||.|||||                        |||
Sbjct    1  ATGGCTGACCCTCGCCAGGAGTTTGACACAATGGAAGACCATGCTGG------------------------AGA  50

Query   75  TCAGGGGGGCTACACCATGCACCAAGACCAAGAGGGTGACACGGACGCTGGCCTGAAAGAATCTCCCCTGCAGA  148
            |         |||||..|||.||||||||||||.||.||||.||||..||||.|.||                 
Sbjct   51  T---------TACACTCTGCTCCAAGACCAAGAAGGAGACATGGACCATGGCTTAAA-----------------  98

Query  149  CCCCCACTGAGGACGGATCTGAGGAACCGGGCTCTGAAACCTCTGATGCTAAGAGCACTCCAACAGCGGAAGAT  222
                                                                                      
Sbjct   99  --------------------------------------------------------------------------  98

Query  223  GTGACAGCACCCTTAGTGGATGAGGGAGCTCCCGGCAAGCAGGCTGCCGCGCAGCCCCACACGGAGATCCCAGA  296
                                                                                      
Sbjct   99  --------------------------------------------------------------------------  98

Query  297  AGGAACCACAGCTGAAGAAGCAGGCATTGGAGACACCCCCAGCCTGGAAGACGAAGCTGCTGGTCACGTGACCC  370
                     |||.||||||||||||||.|||||||||||.|.||.|||.|||.||||.|||||.||.|||||.|
Sbjct   99  ---------AGCCGAAGAAGCAGGCATCGGAGACACCCCGAACCAGGAGGACCAAGCCGCTGGGCATGTGACTC  163

Query  371  AAGCTCGCATGGTCAGTAAAAGCAAAGACGGGACTGGAAGCGATGACAAAAAAGCCAAGGGGGCTGATGGTAAA  444
            |||||||..|||.|      |||||||||.||||.||||..||.||.||.|||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  164  AAGCTCGTGTGGCC------AGCAAAGACAGGACAGGAAATGACGAGAAGAAAGCCAAGGGCGCTGATGGCAAA  231

Query  445  A------CGAAGATCGCCACACCGCGGGGAGCAGCCCCTCCAGGCCAGAAGGGCCAGGCCAACGCCACCAGGAT  512
            |      ||||||||||||||||.||||||||||||.||||.|.||||||||||..|.||||||||||||||||
Sbjct  232  ACCGGGGCGAAGATCGCCACACCTCGGGGAGCAGCCTCTCCGGCCCAGAAGGGCACGTCCAACGCCACCAGGAT  305

Query  513  TCCAGCAAAAACCCCGCCC-GCTCCAAAGACACCACCCAGCTCTGGTGAACCTCCAAAATCAGGGGATCGCAGC  585
            .||.||.||.|||.||||| || ||.|||||.||.||..|.||.||||||||.||||||||.||.||.||.|||
Sbjct  306  CCCGGCCAAGACCACGCCCAGC-CCTAAGACTCCTCCAGGGTCAGGTGAACCACCAAAATCCGGAGAACGAAGC  378

Query  586  GGCTACAGCAGCCCCGGCTCCCCAGGCACTCCCGGCAGCCGCTCCCGCACCCCGTCCCTTCCAACCCCACCCAC  659
            ||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||
Sbjct  379  GGCTACAGCAGCCCCGGCTCTCCCGGAACGCCTGGCAGTCGCTCGCGCACCCCATCCCTACCAACACCGCCCAC  452

Query  660  CCGGGAGCCCAAGAAGGTGGCAGTGGTCCGTACTCCACCCAAGTCGCCGTCTTCCGCCAAGAGCCGCCTGCAGA  733
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||..|....||||||||||||||||
Sbjct  453  CCGGGAGCCCAAGAAGGTGGCAGTGGTCCGCACTCCCCCTAAGTCACCATCAGCTAGTAAGAGCCGCCTGCAGA  526

Query  734  CAGCCCCCGTGCCCATGCCAGACCTGAAGAATGTCAAGTCCAAGATCGGCTCCACTGAGAACCTGAAGCACCAG  807
            |.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||.|||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  527  CTGCCCCTGTGCCCATGCCAGACCTAAAGAATGTCAGGTCGAAGATTGGCTCTACTGAGAACCTGAAGCACCAG  600

Query  808  CCGGGAGGCGGGAAGGTGCAGATAATTAATAAGAAGCTGGATCTTAGCAACGTCCAGTCCAAGTGTGGCTCAAA  881
            ||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  601  CCAGGAGGTGGCAAGGTGCAGATAATTAATAAGAAGCTGGATCTTAGCAACGTCCAGTCCAAGTGTGGCTCGAA  674

Query  882  GGATAATATCAAACACGTCCTGGGAGGCGGCAGTGTGCAAATAGTCTACAAACCAGTTGACCTGAGCAAGGTGA  955
            ||||||||||||||||||||.|||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||
Sbjct  675  GGATAATATCAAACACGTCCCGGGTGGAGGCAGTGTGCAAATAGTCTACAAGCCGGTGGACCTGAGCAAAGTGA  748

Query  956  CCTCCAAGTGTGGCTCATTAGGCAACATCCATCATAAACCAGGAGGTGGCCAGGTGGAAGTAAAATCTGAGAAG  1029
            ||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  749  CCTCCAAGTGTGGCTCGTTAGGGAACATCCATCACAAGCCAGGAGGTGGCCAGGTGGAAGTAAAATCAGAGAAG  822

Query 1030  CTTGACTTCAAGGACAGAGTCCAGTCGAAGATTGGGTCCCTGGACAATATCACCCACGTCCCTGGCGGAGGAAA  1103
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||.||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct  823  CTGGACTTCAAGGACAGAGTCCAGTCGAAGATTGGCTCCTTGGATAATATCACCCACGTCCCTGGAGGAGGGAA  896

Query 1104  TAAAAAGATTGAAACCCACAAGCTGACCTTCCGCGAGAACGCCAAAGCCAAGACAGACCACGGGGCGGAGATCG  1177
            |||.|||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|
Sbjct  897  TAAGAAGATTGAAACCCACAAGCTGACCTTCAGGGAGAATGCCAAAGCCAAGACAGACCATGGAGCAGAAATTG  970

Query 1178  TGTACAAGTCGCCAGTGGTGTCTGGGGACACGTCTCCACGGCATCTCAGCAATGTCTCCTCCACCGGCAGCATC  1251
            ||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct  971  TGTATAAGTCACCCGTGGTGTCTGGGGACACATCTCCACGGCACCTCAGCAATGTGTCTTCCACGGGCAGCATC  1044

Query 1252  GACATGGTAGACTCGCCCCAGCTCGCCACGCTAGCTGACGAGGTGTCTGCCTCCCTGGCCAAGCAGGGTTTG  1323
            ||||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||.||||||||.|||.|||||||||||||||||
Sbjct 1045  GACATGGTGGACTCACCACAGCTTGCCACACTAGCCGATGAAGTGTCTGCTTCCTTGGCCAAGCAGGGTTTG  1116