Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000488701
- Subject:
- XM_005257552.5
- Aligned Length:
- 1460
- Identities:
- 1319
- Gaps:
- 100
Alignment
Query 1 ---------------ATG------GCCAG-----CA-------ACAGC-----AGCTCC----TGCCCGACACC 32
||| |||.| || ||||| ||||.| ||.| |||||
Sbjct 1 ATGATGTCACAGACAATGACACAAGCCGGTGTCTCATTCCGACACAGCGTCCGAGCTGCACAATGTC--ACACC 72
Query 33 TGGGGGC--------GGGCACCTCAATGGGTACCCGGTGCCTCCCTACGCCTTCT--------TCTTCCCCCCT 90
.|||.|| .|||.||.| |..|||||| ||||||||||.|| ||| ||.|.|
Sbjct 73 CGGGTGCCAAACACTTGGCCCCGC----GCGACCCGG-----CCCTACGCCTCCTGCCGCCGCTCT--CCGCGT 135
Query 91 ATGCTG----GGTGGAC----TCTCCCCGCCAGGCGCTCTGACCACTCTCCAGCACC-------AGCT-TCCAG 148
.|.|.| |||||.| ||..||.|.|||| |..||| .|...|.|||.|| .||| .|.||
Sbjct 136 CTCCGGGGGAGGTGGCCCGGTTCGGCCGGGCAGG-GGGCTG---GCGGGCGAGCCCCGCGGGCGGGCTGGCGAG 205
Query 149 TTAGTGGATATAGCACACCATCCCCAGCCACCATTGAGACCCAGAGCAGCAGTTCTGAAGAGATAGTGCCCAGC 222
...|| |||.| ||....||| |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 206 CGGGT-GATGT-------CACGGGCAG-CGCCATTGAGACCCAGAGCAGCAGTTCTGAAGAGATAGTGCCCAGC 270
Query 223 CCTCCCTCGCCACCCCCTCTACCCCGCATCTACAAGCCTTGCTTTGTCTGTCAGGACAAGTCCTCAGGCTACCA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 271 CCTCCCTCGCCACCCCCTCTACCCCGCATCTACAAGCCTTGCTTTGTCTGTCAGGACAAGTCCTCAGGCTACCA 344
Query 297 CTATGGGGTCAGCGCCTGTGAGGGCTGCAAGGGCTTCTTCCGCCGCAGCATCCAGAAGAACATGGTGTACACGT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 345 CTATGGGGTCAGCGCCTGTGAGGGCTGCAAGGGCTTCTTCCGCCGCAGCATCCAGAAGAACATGGTGTACACGT 418
Query 371 GTCACCGGGACAAGAACTGCATCATCAACAAGGTGACCCGGAACCGCTGCCAGTACTGCCGACTGCAGAAGTGC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 419 GTCACCGGGACAAGAACTGCATCATCAACAAGGTGACCCGGAACCGCTGCCAGTACTGCCGACTGCAGAAGTGC 492
Query 445 TTTGAAGTGGGCATGTCCAAGGAGTCTGTGAGAAACGACCGAAACAAGAAGAAGAAGGAGGTGCCCAAGCCCGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 493 TTTGAAGTGGGCATGTCCAAGGAGTCTGTGAGAAACGACCGAAACAAGAAGAAGAAGGAGGTGCCCAAGCCCGA 566
Query 519 GTGCTCTGAGAGCTACACGCTGACGCCGGAGGTGGGGGAGCTCATTGAGAAGGTGCGCAAAGCGCACCAGGAAA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 567 GTGCTCTGAGAGCTACACGCTGACGCCGGAGGTGGGGGAGCTCATTGAGAAGGTGCGCAAAGCGCACCAGGAAA 640
Query 593 CCTTCCCTGCCCTCTGCCAGCTGGGCAAATACACTACGAACAACAGCTCAGAACAACGTGTCTCTCTGGACATT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 641 CCTTCCCTGCCCTCTGCCAGCTGGGCAAATACACTACGAACAACAGCTCAGAACAACGTGTCTCTCTGGACATT 714
Query 667 GACCTCTGGGACAAGTTCAGTGAACTCTCCACCAAGTGCATCATTAAGACTGTGGAGTTCGCCAAGCAGCTGCC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 715 GACCTCTGGGACAAGTTCAGTGAACTCTCCACCAAGTGCATCATTAAGACTGTGGAGTTCGCCAAGCAGCTGCC 788
Query 741 CGGCTTCACCACCCTCACCATCGCCGACCAGATCACCCTCCTCAAGGCTGCCTGCCTGGACATCCTGATCCTGC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 789 CGGCTTCACCACCCTCACCATCGCCGACCAGATCACCCTCCTCAAGGCTGCCTGCCTGGACATCCTGATCCTGC 862
Query 815 GGATCTGCACGCGGTACACGCCCGAGCAGGACACCATGACCTTCTCGGACGGGCTGACCCTGAACCGGACCCAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 863 GGATCTGCACGCGGTACACGCCCGAGCAGGACACCATGACCTTCTCGGACGGGCTGACCCTGAACCGGACCCAG 936
Query 889 ATGCACAACGCTGGCTTCGGCCCCCTCACCGACCTGGTCTTTGCCTTCGCCAACCAGCTGCTGCCCCTGGAGAT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 937 ATGCACAACGCTGGCTTCGGCCCCCTCACCGACCTGGTCTTTGCCTTCGCCAACCAGCTGCTGCCCCTGGAGAT 1010
Query 963 GGATGATGCGGAGACGGGGCTGCTCAGCGCCATCTGCCTCATCTGCGGAGACCGCCAGGACCTGGAGCAGCCGG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1011 GGATGATGCGGAGACGGGGCTGCTCAGCGCCATCTGCCTCATCTGCGGAGACCGCCAGGACCTGGAGCAGCCGG 1084
Query 1037 ACCGGGTGGACATGCTGCAGGAGCCGCTGCTGGAGGCGCTAAAGGTCTACGTGCGGAAGCGGAGGCCCAGCCGC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1085 ACCGGGTGGACATGCTGCAGGAGCCGCTGCTGGAGGCGCTAAAGGTCTACGTGCGGAAGCGGAGGCCCAGCCGC 1158
Query 1111 CCCCACATGTTCCCCAAGATGCTAATGAAGATTACTGACCTGCGAAGCATCAGCGCCAAGGGGGCTGAGCGGGT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1159 CCCCACATGTTCCCCAAGATGCTAATGAAGATTACTGACCTGCGAAGCATCAGCGCCAAGGGGGCTGAGCGGGT 1232
Query 1185 GATCACGCTGAAGATGGAGATCCCGGGCTCCATGCCGCCTCTCATCCAGGAAATGTTGGAGAACTCAGAGGGCC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1233 GATCACGCTGAAGATGGAGATCCCGGGCTCCATGCCGCCTCTCATCCAGGAAATGTTGGAGAACTCAGAGGGCC 1306
Query 1259 TGGACACTCTGAGCGGACAGCCGGGGGGTGGGGGGCGGGACGGGGGTGGCCTGGCCCCCCCGCCAGGCAGCTGT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1307 TGGACACTCTGAGCGGACAGCCGGGGGGTGGGGGGCGGGACGGGGGTGGCCTGGCCCCCCCGCCAGGCAGCTGT 1380
Query 1333 AGCCCCAGCCTCAGCCCCAGCTCCAACAGAAGCAGCCCGGCCACCCACTCCCCG 1386
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1381 AGCCCCAGCCTCAGCCCCAGCTCCAACAGAAGCAGCCCGGCCACCCACTCCCCG 1434