Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488713
• Subject: NM_001079908.2
• Aligned Length: 2467
• Identities: 2206
• Gaps: 14

Alignment

Query    1  ATGTGGAGCTGGAAGTGCCTCCTCTTCTGGGCTGTGCTGGTCACAGCCACACTCTGCACCGCTAGGCCGTCCCC  74
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||..||||
Sbjct    1  ATGTGGGGCTGGAAGTGCCTCCTCTTCTGGGCTGTGCTGGTCACAGCCACTCTCTGCACTGCCAGGCCAGCCCC  74

Query   75  GACCTTGCCTGAACAAGCCCAGCCCTGGGGAGCCCCTGTGGAAGTGGAGTCCTTCCTGGTCCACCCCGGTGACC  148
            .|||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||..|||||||||||||.||.||||
Sbjct   75  AACCTTGCCTGAACAAGCTCAGCCCTGGGGAGTCCCTGTGGAAGTGGAGTCTCTCCTGGTCCACCCTGGCGACC  148

Query  149  TGCTGCAGCTTCGCTGTCGGCTGCGGGACGATGTGCAGAGCATCAACTGGCTGCGGGACGGGGTGCAGCTGGCG  222
            ||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|
Sbjct  149  TGCTACAGCTTCGCTGTCGGCTTCGCGATGATGTGCAGAGCATCAACTGGCTGCGGGATGGGGTGCAGCTGGTG  222

Query  223  GAAAGCAACCGCACCCGCATCACAGGGGAGGAGGTGGAGGTGCAGGACTCCGTGCCCGCAGACTCCGGCCTCTA  296
            ||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|.|||||.|||||.||||||||
Sbjct  223  GAGAGCAACCGTACCCGCATCACAGGGGAGGAGGTGGAGGTGCGGGACTCCATCCCCGCTGACTCTGGCCTCTA  296

Query  297  TGCTTGCGTAACCAGCAGCCCCTCGGGCAGTGACACCACCTACTTCTCCGTCAATGTTTCAGATGCTCTCCCCT  370
            .||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|
Sbjct  297  CGCTTGCGTGACCAGCAGCCCCTCTGGCAGCGATACCACCTACTTCTCCGTCAATGTCTCAGATGCACTCCCAT  370

Query  371  CCTCGGAGGATGATGATGATGATGATGACTCCTCTTCAGAGGAGAAAGAAACAGATAACACCAAACCAAACCGT  444
            |||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||   
Sbjct  371  CCTCGGAAGATGATGACGACGACGATGACTCCTCCTCGGAGGAGAAAGAGACGGACAACACCAAACCAAAC---  441

Query  445  ATGCCCGTAGCTCCATATTGGACATCCCCAGAAAAGATGGAAAAGAAATTGCATGCAGTGCCGGCTGCCAAGAC  518
               ||.||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.||||||.|||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  442  ---CCTGTAGCTCCCTACTGGACATCCCCAGAGAAAATGGAGAAGAAACTGCATGCGGTGCCCGCTGCCAAGAC  512

Query  519  AGTGAAGTTCAAATGCCCTTCCAGTGGGACCCCAAACCCCACACTGCGCTGGTTGAAAAATGGCAAAGAATTCA  592
            .|||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct  513  GGTGAAGTTCAAGTGCCCGTCGAGTGGGACACCCAACCCCACTCTGCGCTGGTTGAAAAATGGCAAAGAGTTTA  586

Query  593  AACCTGACCACAGAATTGGAGGCTACAAGGTCCGTTATGCCACCTGGAGCATCATAATGGACTCTGTGGTGCCC  666
            |.|||||||||.|||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct  587  AGCCTGACCACCGAATTGGAGGCTACAAGGTTCGCTATGCCACCTGGAGCATCATAATGGATTCTGTGGTGCCT  660

Query  667  TCTGACAAGGGCAACTACACCTGCATTGTGGAGAATGAGTACGGCAGCATCAACCACACATACCAGCTGGATGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct  661  TCTGACAAGGGCAACTACACCTGCATCGTGGAGAATGAGTATGGGAGCATCAACCACACCTACCAGCTTGACGT  734

Query  741  CGTGGAGCGGTCCCCTCACCGGCCCATCCTGCAAGCAGGGTTGCCCGCCAACAAAACAGTGGCCCTGGGTAGCA  814
            ||||||.||.||.||.|||||.||||||||.||.||||||.||||.||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct  735  CGTGGAACGATCTCCGCACCGACCCATCCTTCAGGCAGGGCTGCCTGCCAACAAGACAGTGGCCCTGGGCAGCA  808

Query  815  ACGTGGAGTTCATGTGTAAGGTGTACAGTGACCCGCAGCCGCACATCCAGTGGCTAAAGCACATCGAGGTGAAT  888
            |.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  809  ATGTGGAGTTCATGTGTAAGGTGTACAGCGATCCGCAGCCTCACATTCAGTGGCTGAAGCACATCGAGGTGAAC  882

Query  889  GGGAGCAAGATTGGCCCAGACAACCTGCCTTATGTCCAGATCTTGAAGACTGCTGGAGTTAATACCACCGACAA  962
            |||||.|||||.||.|||||||||.||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  883  GGGAGTAAGATCGGGCCAGACAACTTGCCGTATGTCCAGATCCTGAAGACTGCTGGAGTTAATACCACCGACAA  956

Query  963  AGAGATGGAGGTGCTTCACTTAAGAAATGTCTCCTTTGAGGACGCAGGGGAGTATACGTGCTTGGCGGGTAACT  1036
            .||.||||||||||||||..||.|.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  957  GGAAATGGAGGTGCTTCATCTACGGAATGTCTCCTTTGAGGATGCGGGGGAGTATACGTGCTTGGCGGGTAACT  1030

Query 1037  CTATCGGACTCTCCCATCACTCTGCATGGTTGACCGTTCTGGAAGCCCTGGAAGAGAGGCCGGCAGTGATGACC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||
Sbjct 1031  CTATCGGACTCTCCCATCACTCTGCATGGTTGACCGTTCTGGAAGCCCTGGAAGAGAGACCAGCTGTGATGACC  1104

Query 1111  TCGCCCCTGTACCTGGAGATCATCATCTATTGCACAGGGGCCTTCCTCATCTCCTGCATGGTGGGGTCGGTCAT  1184
            ||.||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||.||||.||.|||||
Sbjct 1105  TCACCGCTCTACCTGGAGATCATTATCTACTGCACCGGGGCCTTCCTGATCTCCTGCATGTTGGGCTCTGTCAT  1178

Query 1185  CGTCTACAAGATGAAGAGTGGTACCAAGAAGAGTGACTTCCACAGCCAGATGGCTGTGCACAAGCTGGCCAAGA  1258
            |.||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1179  CATCTATAAGATGAAGAGCGGCACCAAGAAGAGCGACTTCCATAGCCAGATGGCTGTGCACAAGCTGGCCAAGA  1252

Query 1259  GCATCCCTCTGCGCAGACAG------GTGTCTGCTGACTCCAGTGCATCCATGAACTCTGGGGTTCTTCTGGTT  1326
            ||||||||||||||||||||      |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1253  GCATCCCTCTGCGCAGACAGGTAACAGTGTCAGCTGACTCCAGTGCATCCATGAACTCTGGGGTTCTCCTGGTT  1326

Query 1327  CGGCCATCACGGCTCTCCTCCAGTGGGACTCCCATGCTAGCAGGGGTCTCTGAGTATGAGCTTCCCGAAGACCC  1400
            |||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||.|||||.||.||||||||.||.||.||.||
Sbjct 1327  CGGCCCTCACGGCTCTCCTCCAGCGGGACCCCCATGCTGGCTGGAGTCTCCGAATATGAGCTCCCTGAGGATCC  1400

Query 1401  TCGCTGGGAGCTGCCTCGGGACAGACTGGTCTTAGGCAAACCCCTGGGAGAGGGCTGCTTTGGGCAGGTGGTGT  1474
            .||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1401  CCGCTGGGAGCTGCCACGAGACAGACTGGTCTTAGGCAAACCACTTGGCGAGGGCTGCTTCGGGCAGGTGGTGT  1474

Query 1475  TGGCAGAGGCTATCGGGCTGGACAAGGACAAACCCAACCGTGTGACCAAAGTGGCTGTGAAGATGTTGAAGTCG  1548
            ||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1475  TGGCTGAGGCCATCGGGCTGGATAAGGACAAACCCAACCGTGTGACCAAAGTGGCCGTGAAGATGTTGAAGTCC  1548

Query 1549  GACGCAACAGAGAAAGACTTGTCAGACCTGATCTCAGAAATGGAGATGATGAAGATGATCGGGAAGCATAAGAA  1622
            ||||||||.|||||.|||.||||.||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 1549  GACGCAACGGAGAAGGACCTGTCGGATCTGATCTCGGAGATGGAGATGATGAAAATGATTGGGAAGCACAAGAA  1622

Query 1623  TATCATCAACCTGCTGGGGGCCTGCACGCAGGATGGTCC-CTTGTATGTCATCGTGGAGTATGCCTCCAAGGGC  1695
            ||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||| ||| ||||||||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1623  TATCATCAACCTTCTGGGAGCGTGCACACAGGATGGTCCTCTT-TATGTCATTGTGGAGTACGCCTCCAAAGGC  1695

Query 1696  AACCTGCGGGAGTACCTGCAGGCCCGGAGGCCCCCAGGGCTGGAATACTGCTACAACCCCAGCCACAACCCAGA  1769
            ||.||.||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1696  AATCTCCGGGAGTATCTACAGGCCCGGAGGCCTCCTGGGCTGGAGTACTGCTATAACCCCAGCCACAACCCCGA  1769

Query 1770  GGAGCAGCTCTCCTCCAAGGACCTGGTGTCCTGCGCCTACCAGGTGGCCCGAGGCATGGAGTATCTGGCCTCCA  1843
            |||.|||||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1770  GGAACAGCTGTCTTCCAAAGATCTGGTATCCTGTGCCTATCAGGTGGCTCGGGGCATGGAGTATCTTGCCTCTA  1843

Query 1844  AGAAGTGCATACACCGAGACCTGGCAGCCAGGAATGTCCTGGTGACAGAGGACAATGTGATGAAGATAGCAGAC  1917
            |||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||.||||||
Sbjct 1844  AGAAGTGTATACACCGAGACCTGGCTGCTAGGAACGTCCTGGTGACCGAGGATAACGTAATGAAGATCGCAGAC  1917

Query 1918  TTTGGCCTCGCACGGGACATTCACCACATCGACTACTATAAAAAGACAACCAACGGCCGACTGCCTGTGAAGTG  1991
            ||||||.|.||.||.||||||||.||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1918  TTTGGCTTAGCTCGAGACATTCATCATATCGACTACTACAAGAAAACCACCAACGGCCGGCTGCCTGTGAAGTG  1991

Query 1992  GATGGCACCCGAGGCATTATTTGACCGGATCTACACCCACCAGAGTGATGTGTGGTCTTTCGGGGTGCTCCTGT  2065
            ||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||.|||
Sbjct 1992  GATGGCCCCTGAGGCGTTGTTTGACCGGATCTACACACACCAGAGCGATGTGTGGTCTTTTGGAGTGCTCTTGT  2065

Query 2066  GGGAGATCTTCACTCTGGGCGGCTCCCCATACCCCGGTGTGCCTGTGGAGGAACTTTTCAAGCTGCTGAAGGAG  2139
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2066  GGGAGATCTTCACTCTGGGTGGCTCCCCATACCCCGGTGTGCCTGTGGAGGAACTTTTCAAGCTGCTGAAGGAG  2139

Query 2140  GGTCACCGCATGGACAAGCCCAGTAACTGCACCAACGAGCTGTACATGATGATGCGGGACTGCTGGCATGCAGT  2213
            |||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2140  GGTCATCGAATGGACAAGCCCAGTAACTGTACCAATGAGCTGTACATGATGATGCGGGACTGCTGGCATGCAGT  2213

Query 2214  GCCCTCACAGAGACCCACCTTCAAGCAGCTGGTGGAAGACCTGGACCGCATCGTGGCCTTGACCTCCAACCAGG  2287
            ||||||.||||||||.||.|||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 2214  GCCCTCTCAGAGACCTACGTTCAAGCAGTTGGTGGAAGACCTGGACCGCATTGTGGCCTTGACCTCCAACCAGG  2287

Query 2288  AGTACCTGGACCTGTCCATGCCCCTGGACCAGTACTCCCCCAGCTTTCCCGACACCCGGAGCTCTACGTGCTCC  2361
            ||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||
Sbjct 2288  AGTATCTGGACCTGTCCATACCGCTGGACCAGTACTCACCCAGCTTTCCCGACACACGGAGCTCCACCTGCTCC  2361

Query 2362  TCAGGGGAGGATTCCGTCTTCTCTCATGAGCCGCTGCCCGAGGAGCCCTGCCTGCCCCGACACCCAGCCCAGCT  2435
            |||||||||||.||.||||||||||||||||||.|.||.|||||||||||.|||||.||||||||..|||||||
Sbjct 2362  TCAGGGGAGGACTCTGTCTTCTCTCATGAGCCGTTACCTGAGGAGCCCTGTCTGCCTCGACACCCCACCCAGCT  2435

Query 2436  TGCCAATGGCGGACTCAAACGCCGC  2460
            ||||||..|.|||||||||||.|||
Sbjct 2436  TGCCAACAGTGGACTCAAACGGCGC  2460