Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488713
• Subject: XM_011242120.1
• Aligned Length: 2461
• Identities: 2211
• Gaps: 2

Alignment

Query    1  ATGTGGAGCTGGAAGTGCCTCCTCTTCTGGGCTGTGCTGGTCACAGCCACACTCTGCACCGCTAGGCCGTCCCC  74
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||..||||
Sbjct    1  ATGTGGGGCTGGAAGTGCCTCCTCTTCTGGGCTGTGCTGGTCACAGCCACTCTCTGCACTGCCAGGCCAGCCCC  74

Query   75  GACCTTGCCTGAACAAGCCCAGCCCTGGGGAGCCCCTGTGGAAGTGGAGTCCTTCCTGGTCCACCCCGGTGACC  148
            .|||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||..|||||||||||||.||.||||
Sbjct   75  AACCTTGCCTGAACAAGCTCAGCCCTGGGGAGTCCCTGTGGAAGTGGAGTCTCTCCTGGTCCACCCTGGCGACC  148

Query  149  TGCTGCAGCTTCGCTGTCGGCTGCGGGACGATGTGCAGAGCATCAACTGGCTGCGGGACGGGGTGCAGCTGGCG  222
            ||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|
Sbjct  149  TGCTACAGCTTCGCTGTCGGCTTCGCGATGATGTGCAGAGCATCAACTGGCTGCGGGATGGGGTGCAGCTGGTG  222

Query  223  GAAAGCAACCGCACCCGCATCACAGGGGAGGAGGTGGAGGTGCAGGACTCCGTGCCCGCAGACTCCGGCCTCTA  296
            ||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|.|||||.|||||.||||||||
Sbjct  223  GAGAGCAACCGTACCCGCATCACAGGGGAGGAGGTGGAGGTGCGGGACTCCATCCCCGCTGACTCTGGCCTCTA  296

Query  297  TGCTTGCGTAACCAGCAGCCCCTCGGGCAGTGACACCACCTACTTCTCCGTCAATGTTTCAGATGCTCTCCCCT  370
            .||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|
Sbjct  297  CGCTTGCGTGACCAGCAGCCCCTCTGGCAGCGATACCACCTACTTCTCCGTCAATGTCTCAGATGCACTCCCAT  370

Query  371  CCTCGGAGGATGATGATGATGATGATGACTCCTCTTCAGAGGAGAAAGAAACAGATAACACCAAACCAAACCGT  444
            |||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCTCGGAAGATGATGACGACGACGATGACTCCTCCTCGGAGGAGAAAGAGACGGACAACACCAAACCAAACCGT  444

Query  445  ATGCCCGTAGCTCCATATTGGACATCCCCAGAAAAGATGGAAAAGAAATTGCATGCAGTGCCGGCTGCCAAGAC  518
            |.|||.||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.||||||.|||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  445  AGGCCTGTAGCTCCCTACTGGACATCCCCAGAGAAAATGGAGAAGAAACTGCATGCGGTGCCCGCTGCCAAGAC  518

Query  519  AGTGAAGTTCAAATGCCCTTCCAGTGGGACCCCAAACCCCACACTGCGCTGGTTGAAAAATGGCAAAGAATTCA  592
            .|||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct  519  GGTGAAGTTCAAGTGCCCGTCGAGTGGGACACCCAACCCCACTCTGCGCTGGTTGAAAAATGGCAAAGAGTTTA  592

Query  593  AACCTGACCACAGAATTGGAGGCTACAAGGTCCGTTATGCCACCTGGAGCATCATAATGGACTCTGTGGTGCCC  666
            |.|||||||||.|||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct  593  AGCCTGACCACCGAATTGGAGGCTACAAGGTTCGCTATGCCACCTGGAGCATCATAATGGATTCTGTGGTGCCT  666

Query  667  TCTGACAAGGGCAACTACACCTGCATTGTGGAGAATGAGTACGGCAGCATCAACCACACATACCAGCTGGATGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct  667  TCTGACAAGGGCAACTACACCTGCATCGTGGAGAATGAGTATGGGAGCATCAACCACACCTACCAGCTTGACGT  740

Query  741  CGTGGAGCGGTCCCCTCACCGGCCCATCCTGCAAGCAGGGTTGCCCGCCAACAAAACAGTGGCCCTGGGTAGCA  814
            ||||||.||.||.||.|||||.||||||||.||.||||||.||||.||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct  741  CGTGGAACGATCTCCGCACCGACCCATCCTTCAGGCAGGGCTGCCTGCCAACAAGACAGTGGCCCTGGGCAGCA  814

Query  815  ACGTGGAGTTCATGTGTAAGGTGTACAGTGACCCGCAGCCGCACATCCAGTGGCTAAAGCACATCGAGGTGAAT  888
            |.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  815  ATGTGGAGTTCATGTGTAAGGTGTACAGCGATCCGCAGCCTCACATTCAGTGGCTGAAGCACATCGAGGTGAAC  888

Query  889  GGGAGCAAGATTGGCCCAGACAACCTGCCTTATGTCCAGATCTTGAAGACTGCTGGAGTTAATACCACCGACAA  962
            |||||.|||||.||.|||||||||.||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGGAGTAAGATCGGGCCAGACAACTTGCCGTATGTCCAGATCCTGAAGACTGCTGGAGTTAATACCACCGACAA  962

Query  963  AGAGATGGAGGTGCTTCACTTAAGAAATGTCTCCTTTGAGGACGCAGGGGAGTATACGTGCTTGGCGGGTAACT  1036
            .||.||||||||||||||..||.|.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGAAATGGAGGTGCTTCATCTACGGAATGTCTCCTTTGAGGATGCGGGGGAGTATACGTGCTTGGCGGGTAACT  1036

Query 1037  CTATCGGACTCTCCCATCACTCTGCATGGTTGACCGTTCTGGAAGCCCTGGAAGAGAGGCCGGCAGTGATGACC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||
Sbjct 1037  CTATCGGACTCTCCCATCACTCTGCATGGTTGACCGTTCTGGAAGCCCTGGAAGAGAGACCAGCTGTGATGACC  1110

Query 1111  TCGCCCCTGTACCTGGAGATCATCATCTATTGCACAGGGGCCTTCCTCATCTCCTGCATGGTGGGGTCGGTCAT  1184
            ||.||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||.||||.||.|||||
Sbjct 1111  TCACCGCTCTACCTGGAGATCATTATCTACTGCACCGGGGCCTTCCTGATCTCCTGCATGTTGGGCTCTGTCAT  1184

Query 1185  CGTCTACAAGATGAAGAGTGGTACCAAGAAGAGTGACTTCCACAGCCAGATGGCTGTGCACAAGCTGGCCAAGA  1258
            |.||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CATCTATAAGATGAAGAGCGGCACCAAGAAGAGCGACTTCCATAGCCAGATGGCTGTGCACAAGCTGGCCAAGA  1258

Query 1259  GCATCCCTCTGCGCAGACAGGTGTCTGCTGACTCCAGTGCATCCATGAACTCTGGGGTTCTTCTGGTTCGGCCA  1332
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1259  GCATCCCTCTGCGCAGACAGGTGTCAGCTGACTCCAGTGCATCCATGAACTCTGGGGTTCTCCTGGTTCGGCCC  1332

Query 1333  TCACGGCTCTCCTCCAGTGGGACTCCCATGCTAGCAGGGGTCTCTGAGTATGAGCTTCCCGAAGACCCTCGCTG  1406
            |||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||.|||||.||.||||||||.||.||.||.||.|||||
Sbjct 1333  TCACGGCTCTCCTCCAGCGGGACCCCCATGCTGGCTGGAGTCTCCGAATATGAGCTCCCTGAGGATCCCCGCTG  1406

Query 1407  GGAGCTGCCTCGGGACAGACTGGTCTTAGGCAAACCCCTGGGAGAGGGCTGCTTTGGGCAGGTGGTGTTGGCAG  1480
            |||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1407  GGAGCTGCCACGAGACAGACTGGTCTTAGGCAAACCACTTGGCGAGGGCTGCTTCGGGCAGGTGGTGTTGGCTG  1480

Query 1481  AGGCTATCGGGCTGGACAAGGACAAACCCAACCGTGTGACCAAAGTGGCTGTGAAGATGTTGAAGTCGGACGCA  1554
            ||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1481  AGGCCATCGGGCTGGATAAGGACAAACCCAACCGTGTGACCAAAGTGGCCGTGAAGATGTTGAAGTCCGACGCA  1554

Query 1555  ACAGAGAAAGACTTGTCAGACCTGATCTCAGAAATGGAGATGATGAAGATGATCGGGAAGCATAAGAATATCAT  1628
            ||.|||||.|||.||||.||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1555  ACGGAGAAGGACCTGTCGGATCTGATCTCGGAGATGGAGATGATGAAAATGATTGGGAAGCACAAGAATATCAT  1628

Query 1629  CAACCTGCTGGGGGCCTGCACGCAGGATGGTCC-CTTGTATGTCATCGTGGAGTATGCCTCCAAGGGCAACCTG  1701
            ||||||.|||||.||.|||||.||||||||||| ||| ||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.
Sbjct 1629  CAACCTTCTGGGAGCGTGCACACAGGATGGTCCTCTT-TATGTCATTGTGGAGTACGCCTCCAAAGGCAATCTC  1701

Query 1702  CGGGAGTACCTGCAGGCCCGGAGGCCCCCAGGGCTGGAATACTGCTACAACCCCAGCCACAACCCAGAGGAGCA  1775
            ||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1702  CGGGAGTATCTACAGGCCCGGAGGCCTCCTGGGCTGGAGTACTGCTATAACCCCAGCCACAACCCCGAGGAACA  1775

Query 1776  GCTCTCCTCCAAGGACCTGGTGTCCTGCGCCTACCAGGTGGCCCGAGGCATGGAGTATCTGGCCTCCAAGAAGT  1849
            |||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1776  GCTGTCTTCCAAAGATCTGGTATCCTGTGCCTATCAGGTGGCTCGGGGCATGGAGTATCTTGCCTCTAAGAAGT  1849

Query 1850  GCATACACCGAGACCTGGCAGCCAGGAATGTCCTGGTGACAGAGGACAATGTGATGAAGATAGCAGACTTTGGC  1923
            |.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1850  GTATACACCGAGACCTGGCTGCTAGGAACGTCCTGGTGACCGAGGATAACGTAATGAAGATCGCAGACTTTGGC  1923

Query 1924  CTCGCACGGGACATTCACCACATCGACTACTATAAAAAGACAACCAACGGCCGACTGCCTGTGAAGTGGATGGC  1997
            .|.||.||.||||||||.||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1924  TTAGCTCGAGACATTCATCATATCGACTACTACAAGAAAACCACCAACGGCCGGCTGCCTGTGAAGTGGATGGC  1997

Query 1998  ACCCGAGGCATTATTTGACCGGATCTACACCCACCAGAGTGATGTGTGGTCTTTCGGGGTGCTCCTGTGGGAGA  2071
            .||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||.|||||||||
Sbjct 1998  CCCTGAGGCGTTGTTTGACCGGATCTACACACACCAGAGCGATGTGTGGTCTTTTGGAGTGCTCTTGTGGGAGA  2071

Query 2072  TCTTCACTCTGGGCGGCTCCCCATACCCCGGTGTGCCTGTGGAGGAACTTTTCAAGCTGCTGAAGGAGGGTCAC  2145
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 2072  TCTTCACTCTGGGTGGCTCCCCATACCCCGGTGTGCCTGTGGAGGAACTTTTCAAGCTGCTGAAGGAGGGTCAT  2145

Query 2146  CGCATGGACAAGCCCAGTAACTGCACCAACGAGCTGTACATGATGATGCGGGACTGCTGGCATGCAGTGCCCTC  2219
            ||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2146  CGAATGGACAAGCCCAGTAACTGTACCAATGAGCTGTACATGATGATGCGGGACTGCTGGCATGCAGTGCCCTC  2219

Query 2220  ACAGAGACCCACCTTCAAGCAGCTGGTGGAAGACCTGGACCGCATCGTGGCCTTGACCTCCAACCAGGAGTACC  2293
            .||||||||.||.|||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2220  TCAGAGACCTACGTTCAAGCAGTTGGTGGAAGACCTGGACCGCATTGTGGCCTTGACCTCCAACCAGGAGTATC  2293

Query 2294  TGGACCTGTCCATGCCCCTGGACCAGTACTCCCCCAGCTTTCCCGACACCCGGAGCTCTACGTGCTCCTCAGGG  2367
            |||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 2294  TGGACCTGTCCATACCGCTGGACCAGTACTCACCCAGCTTTCCCGACACACGGAGCTCCACCTGCTCCTCAGGG  2367

Query 2368  GAGGATTCCGTCTTCTCTCATGAGCCGCTGCCCGAGGAGCCCTGCCTGCCCCGACACCCAGCCCAGCTTGCCAA  2441
            |||||.||.||||||||||||||||||.|.||.|||||||||||.|||||.||||||||..|||||||||||||
Sbjct 2368  GAGGACTCTGTCTTCTCTCATGAGCCGTTACCTGAGGAGCCCTGTCTGCCTCGACACCCCACCCAGCTTGCCAA  2441

Query 2442  TGGCGGACTCAAACGCCGC  2460
            ..|.|||||||||||.|||
Sbjct 2442  CAGTGGACTCAAACGGCGC  2460