Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488782
• Subject: XM_006506650.3
• Aligned Length: 962
• Identities: 807
• Gaps: 18

Alignment

Query   1  ---------------ATGACCCACCAGGATCTGAGCATCACAGCCAAACTCATCAATGGAGGTGTAGCAGGGCT  59
                          |||.||..||||||.|||||||||.|.||.||||||||||||||||||.|||||||.||
Sbjct   1  ATGATCGCCTGCAGGATGTCCAGCCAGGACCTGAGCATCTCCGCAAAACTCATCAATGGAGGTATAGCAGGTCT  74

Query  60  CGTGGGGGTGACCTGCGTGTTCCCCATCGACTTGGCCAAGACTCGCCTGCAGAACCAGCATGGGAAAGCCATGT  133
           .||||||||||||||||||||.|||||.|||.|.||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||...|||
Sbjct  75  TGTGGGGGTGACCTGCGTGTTTCCCATTGACCTTGCCAAGACCCGACTACAGAACCAGCAGGGGAAAGATGTGT  148

Query 134  ACAAAGGAATGATCGACTGCCTGATGAAGACGGCTCGGGCGGAGGGCTTCTTCGGCATGTACCGAGGGGCTGCA  207
           |||.||||||||..||.||||||||||||||.||.||.||.|||||||||.|.|||||||||||||||||||||
Sbjct 149  ACAGAGGAATGACAGATTGCCTGATGAAGACTGCACGTGCTGAGGGCTTCCTGGGCATGTACCGAGGGGCTGCA  222

Query 208  GTGAACCTCACTCTGGTCACTCCAGAGAAGGCCATCAAGCTGGCGGCCAACGACTTTTTCCGGCGGCTGCTCAT  281
           ||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||||.|||||||||
Sbjct 223  GTAAACCTCACCCTGGTCACTCCAGAGAAGGCAATCAAGCTGGCAGCCAATGACTTCTTGCGGCAGCTGCTCAT  296

Query 282  GGAAGATGGGATGCAGCGGAACCTGAAGATGGAGATGCTTGCCGGGTGTGGGGCTGGGATGTGCCAGGTCGTGG  355
           |.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||.
Sbjct 297  GCAAGATGGGACGCAGCGGAACCTGAAGATGGAGATGCTGGCCGGGTGTGGGGCTGGAATATGCCAGGTGGTGA  370

Query 356  TGACCTGTCCCATGGAAATGCTCAAGATTCAGCTGCAGGATGCTGGACGCCTGGCCGTCCATCATCAGGGCTCG  429
           |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|.||.|||..||||||||..||.
Sbjct 371  TTACCTGTCCCATGGAAATGCTCAAGATTCAGCTGCAGGATGCTGGCCGCTTAGCTGTCTGTCATCAGGCTTCT  444

Query 430  GCCTCAG-CACCCTCCACCTCCAGGTCCTACACAACTGGTTCGGCTTCCACCCACAGGCGCCCCTCTGCCACCC  502
           ||||||| |||.| ||||||||.||.||||||..|||||.|||.|||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 445  GCCTCAGCCACAC-CCACCTCCCGGCCCTACAGCACTGGCTCGACTTCCACCCACAGGCGCCCATCGGCCACCC  517

Query 503  TCATTGCCTGGGAGCTGCTCCGCACTCAGGGCCTGGCTGGGCTCTACAGGGGCCTGGGTGCCACTCTCCTCAGA  576
           ||||||||.|||||||||||||||||||||||||..||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 518  TCATTGCCCGGGAGCTGCTCCGCACTCAGGGCCTCTCTGGTCTCTACAGGGGCCTGGGTGCCACGCTCCTCAGG  591

Query 577  GACATTCCTTTCTCCATCATCTACTTCCCACTGTTTGCCAACCTTAACAACCTGGGGTTCAACGAGCTCGCCGG  650
           ||||||||.||||||||||||||||||||..|||||||.|||||.|||.|.||.||..|||.|||||||.||||
Sbjct 592  GACATTCCCTTCTCCATCATCTACTTCCCTTTGTTTGCAAACCTGAACCAACTCGGAGTCAGCGAGCTCACCGG  665

Query 651  TAAGGCGTCCTTTGCACATTCCTTCGTGTCAGGCTGTGTGGCAGGTTCCATAGCTGCGGTCGCAGTGACGCCTC  724
           .|||||.|||||..||||.|||||.||..|||||||....||||||||..|.||.|||||.||.||.||.||||
Sbjct 666  CAAGGCCTCCTTCACACACTCCTTTGTAGCAGGCTGCACAGCAGGTTCTGTGGCAGCGGTAGCCGTCACCCCTC  739

Query 725  TAGATGTTCTGAAAACTCGAATCCAAACCCTCAAGAAAGGCCTGGGCGAGGACATGTACAGTGGGATCACCGAC  798
           |.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||..|||||.||..||||.|||
Sbjct 740  TGGATGTTCTGAAGACTCGAATTCAGACCCTCAAGAAAGGCCTGGGTGAGGACACCTACAGCGGAGTCACTGAC  813

Query 799  TGTGCCAGGAAACTCTGGATTCAGGAGGGACCATCTGCCTTCATGAAAGGCGCTGGCTGCCGGGCACTGGTCAT  872
           |||||||||||.|||||||..||||||||.|||.|.||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||
Sbjct 814  TGTGCCAGGAAGCTCTGGACACAGGAGGGGCCAGCAGCCTTCATGAAAGGAGCAGGCTGCCGTGCCCTGGTCAT  887

Query 873  AGCACCTCTCTTTGGGATTGCTCAAGGGGTCTATTTTATTGGGATTGGAGAGCGCATCTTAAAGTGTTTTGACG  946
           |||.||.|||||||||||.||.||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||. 
Sbjct 888  AGCCCCCCTCTTTGGGATCGCCCAGGGCGTCTACTTCATTGGCATCGGAGAGCGCATCTTGAAGTGCTTTGAG-  960