Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000488800
Subject:
XM_017010783.1
Aligned Length:
3582
Identities:
3581
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGGTCGGGCTCCTTTTGTTTTTTTTCCCAGCGATCTTTTTGGAGGTGTCCCTTCTCCCCAGAAGCCCCGGCAG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTCGGGCTCCTTTTGTTTTTTTTCCCAGCGATCTTTTTGGAGGTGTCCCTTCTCCCCAGAAGCCCCGGCAG  74

Query   75  GAAAGTGTTGCTGGCAGGAGCGTCGTCTCAGCGCTCGGTGGCCAGAATGGACGGAGATGTCATCATTGGAGCCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAAAGTGTTGCTGGCAGGAGCGTCGTCTCAGCGCTCGGTGGCCAGAATGGACGGAGATGTCATCATTGGAGCCC  148

Query  149  TCTTCTCAGTCCATCACCAGCCTCCGGCCGAGAAAGTGCCCGAGAGGAAGTGTGGGGAGATCAGGGAGCAGTAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCTTCTCAGTCCATCACCAGCCTCCGGCCGAGAAAGTGCCCGAGAGGAAGTGTGGGGAGATCAGGGAGCAGTAT  222

Query  223  GGCATCCAGAGGGTGGAGGCCATGTTCCACACGTTGGATAAGATCAACGCGGACCCGGTCCTCCTGCCCAACAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGCATCCAGAGGGTGGAGGCCATGTTCCACACGTTGGATAAGATCAACGCGGACCCGGTCCTCCTGCCCAACAT  296

Query  297  CACCCTGGGCAGTGAGATCCGGGACTCCTGCTGGCACTCTTCCGTGGCTCTGGAACAGAGCATTGAGTTCATTA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CACCCTGGGCAGTGAGATCCGGGACTCCTGCTGGCACTCTTCCGTGGCTCTGGAACAGAGCATTGAGTTCATTA  370

Query  371  GGGACTCTCTGATTTCCATTCGAGATGAGAAGGATGGGATCAACCGGTGTCTGCCTGACGGCCAGTCCCTCCCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGGACTCTCTGATTTCCATTCGAGATGAGAAGGATGGGATCAACCGGTGTCTGCCTGACGGCCAGTCCCTCCCC  444

Query  445  CCAGGCAGGACTAAGAAGCCCATTGCGGGAGTGATCGGTCCCGGCTCCAGCTCTGTAGCCATTCAAGTGCAGAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCAGGCAGGACTAAGAAGCCCATTGCGGGAGTGATCGGTCCCGGCTCCAGCTCTGTAGCCATTCAAGTGCAGAA  518

Query  519  CCTGCTCCAGCTCTTCGACATCCCCCAGATCGCTTATTCAGCCACAAGCATCGACCTGAGTGACAAAACTTTGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCTGCTCCAGCTCTTCGACATCCCCCAGATCGCTTATTCAGCCACAAGCATCGACCTGAGTGACAAAACTTTGT  592

Query  593  ACAAATACTTCCTGAGGGTTGTCCCTTCTGACACTTTGCAGGCAAGGGCCATGCTTGACATAGTCAAACGTTAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACAAATACTTCCTGAGGGTTGTCCCTTCTGACACTTTGCAGGCAAGGGCCATGCTTGACATAGTCAAACGTTAC  666

Query  667  AATTGGACCTATGTCTCTGCAGTCCACACGGAAGGGAATTATGGGGAGAGCGGAATGGACGCTTTCAAAGAGCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AATTGGACCTATGTCTCTGCAGTCCACACGGAAGGGAATTATGGGGAGAGCGGAATGGACGCTTTCAAAGAGCT  740

Query  741  GGCTGCCCAGGAAGGCCTCTGTATCGCCCATTCTGACAAAATCTACAGCAACGCTGGGGAGAAGAGCTTTGACC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGCTGCCCAGGAAGGCCTCTGTATCGCCCATTCTGACAAAATCTACAGCAACGCTGGGGAGAAGAGCTTTGACC  814

Query  815  GACTCTTGCGCAAACTCCGAGAGAGGCTTCCCAAGGCTAGAGTGGTGGTCTGCTTCTGTGAAGGCATGACAGTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GACTCTTGCGCAAACTCCGAGAGAGGCTTCCCAAGGCTAGAGTGGTGGTCTGCTTCTGTGAAGGCATGACAGTG  888

Query  889  CGAGGACTCCTGAGCGCCATGCGGCGCCTTGGCGTCGTGGGCGAGTTCTCACTCATTGGAAGTGATGGATGGGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CGAGGACTCCTGAGCGCCATGCGGCGCCTTGGCGTCGTGGGCGAGTTCTCACTCATTGGAAGTGATGGATGGGC  962

Query  963  AGACAGAGATGAAGTCATTGAAGGTTATGAGGTGGAAGCCAACGGGGGAATCACGATAAAGCTGCAGTCTCCAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGACAGAGATGAAGTCATTGAAGGTTATGAGGTGGAAGCCAACGGGGGAATCACGATAAAGCTGCAGTCTCCAG  1036

Query 1037  AGGTCAGGTCATTTGATGATTATTTCCTGAAACTGAGGCTGGACACTAACACGAGGAATCCCTGGTTCCCTGAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGGTCAGGTCATTTGATGATTATTTCCTGAAACTGAGGCTGGACACTAACACGAGGAATCCCTGGTTCCCTGAG  1110

Query 1111  TTCTGGCAACATCGGTTCCAGTGCCGCCTTCCAGGACACCTTCTGGAAAATCCCAACTTTAAACGAATCTGCAC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTCTGGCAACATCGGTTCCAGTGCCGCCTTCCAGGACACCTTCTGGAAAATCCCAACTTTAAACGAATCTGCAC  1184

Query 1185  AGGCAATGAAAGCTTAGAAGAAAACTATGTCCAGGACAGTAAGATGGGGTTTGTCATCAATGCCATCTATGCCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGGCAATGAAAGCTTAGAAGAAAACTATGTCCAGGACAGTAAGATGGGGTTTGTCATCAATGCCATCTATGCCA  1258

Query 1259  TGGCACATGGGCTGCAGAACATGCACCATGCCCTCTGCCCTGGCCACGTGGGCCTCTGCGATGCCATGAAGCCC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGGCACATGGGCTGCAGAACATGCACCATGCCCTCTGCCCTGGCCACGTGGGCCTCTGCGATGCCATGAAGCCC  1332

Query 1333  ATCGACGGCAGCAAGCTGCTGGACTTCCTCATCAAGTCCTCATTCATTGGAGTATCTGGAGAGGAGGTGTGGTT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATCGACGGCAGCAAGCTGCTGGACTTCCTCATCAAGTCCTCATTCATTGGAGTATCTGGAGAGGAGGTGTGGTT  1406

Query 1407  TGATGAGAAAGGAGACGCTCCTGGAAGGTATGATATCATGAATCTGCAGTACACTGAAGCTAATCGCTATGACT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGATGAGAAAGGAGACGCTCCTGGAAGGTATGATATCATGAATCTGCAGTACACTGAAGCTAATCGCTATGACT  1480

Query 1481  ATGTGCACGTTGGAACCTGGCATGAAGGAGTGCTGAACATTGATGATTACAAAATCCAGATGAACAAGAGTGGA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ATGTGCACGTTGGAACCTGGCATGAAGGAGTGCTGAACATTGATGATTACAAAATCCAGATGAACAAGAGTGGA  1554

Query 1555  GTGGTGCGGTCTGTGTGCAGTGAGCCTTGCTTAAAGGGCCAGATTAAGGTTATACGGAAAGGAGAAGTGAGCTG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GTGGTGCGGTCTGTGTGCAGTGAGCCTTGCTTAAAGGGCCAGATTAAGGTTATACGGAAAGGAGAAGTGAGCTG  1628

Query 1629  CTGCTGGATTTGCACGGCCTGCAAAGAGAATGAATATGTGCAAGATGAGTTCACCTGCAAAGCTTGTGACTTGG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CTGCTGGATTTGCACGGCCTGCAAAGAGAATGAATATGTGCAAGATGAGTTCACCTGCAAAGCTTGTGACTTGG  1702

Query 1703  GATGGTGGCCCAATGCAGATCTAACAGGCTGTGAGCCCATTCCTGTGCGCTATCTTGAGTGGAGCAACATCGAA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GATGGTGGCCCAATGCAGATCTAACAGGCTGTGAGCCCATTCCTGTGCGCTATCTTGAGTGGAGCAACATCGAA  1776

Query 1777  TCCATTATAGCCATCGCCTTTTCATGCCTGGGAATCCTTGTTACCTTGTTTGTCACCCTAATCTTTGTACTGTA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TCCATTATAGCCATCGCCTTTTCATGCCTGGGAATCCTTGTTACCTTGTTTGTCACCCTAATCTTTGTACTGTA  1850

Query 1851  CCGGGACACACCAGTGGTCAAATCCTCCAGTCGGGAGCTCTGCTACATCATCCTAGCTGGCATCTTCCTTGGTT  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CCGGGACACACCAGTGGTCAAATCCTCCAGTCGGGAGCTCTGCTACATCATCCTAGCTGGCATCTTCCTTGGTT  1924

Query 1925  ATGTGTGCCCATTCACTCTCATTGCCAAACCTACTACCACCTCCTGCTACCTCCAGCGCCTCTTGGTTGGCCTC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  ATGTGTGCCCATTCACTCTCATTGCCAAACCTACTACCACCTCCTGCTACCTCCAGCGCCTCTTGGTTGGCCTC  1998

Query 1999  TCCTCTGCGATGTGCTACTCTGCTTTAGTGACTAAAACCAATCGTATTGCACGCATCCTGGCTGGCAGCAAGAA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TCCTCTGCGATGTGCTACTCTGCTTTAGTGACTAAAACCAATCGTATTGCACGCATCCTGGCTGGCAGCAAGAA  2072

Query 2073  GAAGATCTGCACCCGGAAGCCCAGGTTCATGAGTGCCTGGGCTCAGGTGATCATTGCCTCAATTCTGATTAGTG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GAAGATCTGCACCCGGAAGCCCAGGTTCATGAGTGCCTGGGCTCAGGTGATCATTGCCTCAATTCTGATTAGTG  2146

Query 2147  TGCAACTAACCCTGGTGGTAACCCTGATCATCATGGAACCCCCTATGCCCATTCTGTCCTACCCAAGTATCAAG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TGCAACTAACCCTGGTGGTAACCCTGATCATCATGGAACCCCCTATGCCCATTCTGTCCTACCCAAGTATCAAG  2220

Query 2221  GAAGTCTACCTTATCTGCAATACCAGCAACCTGGGTGTGGTGGCCCCTTTGGGCTACAATGGACTCCTCATCAT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GAAGTCTACCTTATCTGCAATACCAGCAACCTGGGTGTGGTGGCCCCTTTGGGCTACAATGGACTCCTCATCAT  2294

Query 2295  GAGCTGTACCTACTATGCCTTCAAGACCCGCAACGTGCCCGCCAACTTCAACGAGGCCAAATATATCGCGTTCA  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GAGCTGTACCTACTATGCCTTCAAGACCCGCAACGTGCCCGCCAACTTCAACGAGGCCAAATATATCGCGTTCA  2368

Query 2369  CCATGTACACCACCTGTATCATCTGGCTAGCTTTTGTGCCCATTTACTTTGGGAGCAACTACAAGATCATCACA  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  CCATGTACACCACCTGTATCATCTGGCTAGCTTTTGTGCCCATTTACTTTGGGAGCAACTACAAGATCATCACA  2442

Query 2443  ACTTGCTTTGCAGTGAGTCTCAGTGTAACAGTGGCTCTGGGGTGCATGTTCACTCCCAAGATGTACATCATTAT  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  ACTTGCTTTGCAGTGAGTCTCAGTGTAACAGTGGCTCTGGGGTGCATGTTCACTCCCAAGATGTACATCATTAT  2516

Query 2517  TGCCAAGCCTGAGAGGAATGTCCGCAGTGCCTTCACCACCTCTGATGTTGTCCGCATGCATGTTGGCGATGGCA  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  TGCCAAGCCTGAGAGGAATGTCCGCAGTGCCTTCACCACCTCTGATGTTGTCCGCATGCATGTTGGCGATGGCA  2590

Query 2591  AGCTGCCCTGCCGCTCCAACACTTTCCTCAACATCTTCCGAAGAAAGAAGGCAGGGGCAGGGAATGCCAATTCT  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  AGCTGCCCTGCCGCTCCAACACTTTCCTCAACATCTTCCGAAGAAAGAAGGCAGGGGCAGGGAATGCCAATTCT  2664

Query 2665  AATGGCAAGTCTGTGTCATGGTCTGAACCAGGTGGAGGACAGGTGCCCAAGGGACAGCATATGTGGCACCGCCT  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  AATGGCAAGTCTGTGTCATGGTCTGAACCAGGTGGAGGACAGGTGCCCAAGGGACAGCATATGTGGCACCGCCT  2738

Query 2739  CTCTGTGCACGTGAAGACCAATGAGACGGCCTGCAACCAAACAGCCGTCATCAAGCCCCTCACTAAAAGTTACC  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  CTCTGTGCACGTGAAGACCAATGAGACGGCCTGCAACCAAACAGCCGTCATCAAGCCCCTCACTAAAAGTTACC  2812

Query 2813  AAGGCTCTGGCAAGAGCCTGACCTTTTCAGATACCAGCACCAAGACCCTTTACAACGTAGAGGAGGAGGAGGAT  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  AAGGCTCTGGCAAGAGCCTGACCTTTTCAGATACCAGCACCAAGACCCTTTACAACGTAGAGGAGGAGGAGGAT  2886

Query 2887  GCCCAGCCGATTCGCTTTAGCCCGCCTGGTAGCCCTTCCATGGTGGTGCACAGGCGCGTGCCAAGCGCGGCGAC  2960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  GCCCAGCCGATTCGCTTTAGCCCGCCTGGTAGCCCTTCCATGGTGGTGCACAGGCGCGTGCCAAGCGCGGCGAC  2960

Query 2961  CACTCCGCCTCTGCCGTCCCACCTGACCGCAGAGGAGACCCCCCTCTTCCTGGCCGAACCAGCCCTCCCCAAGG  3034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  CACTCCGCCTCTGCCGTCCCACCTGACCGCAGAGGAGACCCCCCTCTTCCTGGCCGAACCAGCCCTCCCCAAGG  3034

Query 3035  GCTTGCCCCCTCCTCTCCAGCAGCAGCAGCAACCCCCTCCACAGCAGAAATCGCTGATGGACCAGCTCCAGGGA  3108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  GCTTGCCCCCTCCTCTCCAGCAGCAGCAGCAACCCCCTCCACAGCAGAAATCGCTGATGGACCAGCTCCAGGGA  3108

Query 3109  GTGGTCAGCAACTTCAGTACCGCGATCCCGGATTTTCACGCGGTGCTGGCAGGCCCCGGGGGTCCCGGGAACGG  3182
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 3109  GTGGTCAGCAACTTCAGTACCGCGATCCCGGATTTTCACGCGGTGCTGGCAGGCCCCGGTGGTCCCGGGAACGG  3182

Query 3183  GCTGCGGTCCCTGTACCCGCCCCCGCCACCTCCGCAGCACCTGCAGATGCTGCCGCTGCAGCTGAGCACCTTTG  3256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  GCTGCGGTCCCTGTACCCGCCCCCGCCACCTCCGCAGCACCTGCAGATGCTGCCGCTGCAGCTGAGCACCTTTG  3256

Query 3257  GGGAGGAGCTGGTCTCCCCGCCCGCGGACGACGACGACGACAGCGAGAGGTTTAAGCTCCTCCAGGAGTACGTG  3330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257  GGGAGGAGCTGGTCTCCCCGCCCGCGGACGACGACGACGACAGCGAGAGGTTTAAGCTCCTCCAGGAGTACGTG  3330

Query 3331  TATGAGCACGAGCGGGAAGGGAACACGGAAGAAGACGAACTGGAAGAGGAGGAGGAGGACCTGCAGGCGGCCAG  3404
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331  TATGAGCACGAGCGGGAAGGGAACACGGAAGAAGACGAACTGGAAGAGGAGGAGGAGGACCTGCAGGCGGCCAG  3404

Query 3405  CAAACTGACCCCGGATGATTCGCCTGCGCTGACGCCTCCGTCGCCTTTCCGCGACTCGGTGGCCTCGGGCAGCT  3478
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405  CAAACTGACCCCGGATGATTCGCCTGCGCTGACGCCTCCGTCGCCTTTCCGCGACTCGGTGGCCTCGGGCAGCT  3478

Query 3479  CGGTGCCCAGCTCCCCCGTGTCCGAGTCGGTGCTCTGCACCCCTCCCAACGTATCCTACGCCTCTGTCATTCTG  3552
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479  CGGTGCCCAGCTCCCCCGTGTCCGAGTCGGTGCTCTGCACCCCTCCCAACGTATCCTACGCCTCTGTCATTCTG  3552

Query 3553  CGGGACTACAAGCAAAGCTCTTCCACCCTG  3582
            ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3553  CGGGACTACAAGCAAAGCTCTTCCACCCTG  3582