Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488840
• Subject: XM_024449936.1
• Aligned Length: 2489
• Identities: 1476
• Gaps: 961

Alignment

Query    1  ATGGATGTCTCTCTTTGCCCAGCCAAGTGTAGTTTCTGGCGGATTTTCTTGCTGGGAAGCGTCTGGCTGGACTA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TGTGGGCTCCGTGCTGGCTTGCCCTGCAAATTGTGTCTGCAGCAAGACTGAGATCAATTGCCGGCGGCCGGACG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ATGGGAACCTCTTCCCCCTCCTGGAAGGGCAGGATTCAGGGAACAGCAATGGGAACGCCAGTATCAACATCACG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GACATCTCAAGGAATATCACTTCCATACACATAGAGAACTGGCGCAGTCTTCACACGCTCAACGCCGTGGACAT  296
                                                                                    ||
Sbjct    1  ------------------------------------------------------------------------AT  2

Query  297  GGAGCTCTACACCGGACTTCAAAAGCTGACCATCAAGAACTCAGGACTTCGGAGCATTCAGCCCAGAGCCTTTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    3  GGAGCTCTACACCGGACTTCAAAAGCTGACCATCAAGAACTCAGGACTTCGGAGCATTCAGCCCAGAGCCTTTG  76

Query  371  CCAAGAACCCCCATTTGCGTTATATAAACCTGTCAAGTAACCGGCTCACCACACTCTCGTGGCAGCTCTTCCAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   77  CCAAGAACCCCCATTTGCGTTATATAAACCTGTCAAGTAACCGGCTCACCACACTCTCGTGGCAGCTCTTCCAG  150

Query  445  ACGCTGAGTCTTCGGGAATTGCAGTTGGAGCAGAACTTTTTCAACTGCAGCTGTGACATCCGCTGGATGCAGCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  151  ACGCTGAGTCTTCGGGAATTGCAGTTGGAGCAGAACTTTTTCAACTGCAGCTGTGACATCCGCTGGATGCAGCT  224

Query  519  CTGGCAGGAGCAGGGGGAGGCCAAGCTCAACAGCCAGAACCTCTACTGCATCAACGCTGATGGCTCCCAGCTTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  225  CTGGCAGGAGCAGGGGGAGGCCAAGCTCAACAGCCAGAACCTCTACTGCATCAACGCTGATGGCTCCCAGCTTC  298

Query  593  CTCTCTTCCGCATGAACATCAGTCAGTGTGACCTTCCTGAGATCAGCGTGAGCCACGTCAACCTGACCGTACGA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  299  CTCTCTTCCGCATGAACATCAGTCAGTGTGACCTTCCTGAGATCAGCGTGAGCCACGTCAACCTGACCGTACGA  372

Query  667  GAGGGTGACAATGCTGTTATCACTTGCAATGGCTCTGGATCACCCCTTCCTGATGTGGACTGGATAGTCACTGG  740
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  373  GAGGGTGACAACGCTGTTATCACTTGCAATGGCTCTGGATCACCCCTTCCTGATGTGGACTGGATAGTCACTGG  446

Query  741  GCTGCAGTCCATCAACACTCACCAGACCAATCTGAACTGGACCAATGTTCATGCCATCAACTTGACGCTGGTGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  447  GCTGCAGTCCATCAACACTCACCAGACCAATCTGAACTGGACCAATGTTCATGCCATCAACTTGACGCTGGTGA  520

Query  815  ATGTGACGAGTGAGGACAATGGCTTCACCCTGACGTGCATTGCAGAGAACGTGGTGGGCATGAGCAATGCCAGT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  521  ATGTGACGAGTGAGGACAATGGCTTCACCCTGACGTGCATTGCAGAGAACGTGGTGGGCATGAGCAATGCCAGT  594

Query  889  GTTGCCCTCACTGTCTACTATCCCCCACGTGTGGTGAGCCTGGAGGAGCCTGAGCTGCGCCTGGAGCACTGCAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  595  GTTGCCCTCACTGTCTACTATCCCCCACGTGTGGTGAGCCTGGAGGAGCCTGAGCTGCGCCTGGAGCACTGCAT  668

Query  963  CGAGTTTGTGGTGCGTGGCAACCCCCCACCAACGCTGCACTGGCTGCACAATGGGCAGCCTCTGCGGGAGTCCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  669  CGAGTTTGTGGTGCGTGGCAACCCCCCACCAACGCTGCACTGGCTGCACAATGGGCAGCCTCTGCGGGAGTCCA  742

Query 1037  AGATCATCCATGTGGAATACTACCAAGAGGGAGAGATTTCCGAGGGCTGCCTGCTCTTCAACAAGCCCACCCAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  743  AGATCATCCATGTGGAATACTACCAAGAGGGAGAGATTTCCGAGGGCTGCCTGCTCTTCAACAAGCCCACCCAC  816

Query 1111  TACAACAATGGCAACTATACCCTCATTGCCAAAAACCCACTGGGCACAGCCAACCAGACCATCAATGGCCACTT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  817  TACAACAATGGCAACTATACCCTCATTGCCAAAAACCCACTGGGCACAGCCAACCAGACCATCAATGGCCACTT  890

Query 1185  CCTCAAGGAGCCCTTTCCAGAGAGCACGGATAACTTTATCTTGTTTGACGAAGTGAGTCCCACACCTCCTATCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  891  CCTCAAGGAGCCCTTTCCAGAGAGCACGGATAACTTTATCTTGTTTGACGAAGTGAGTCCCACACCTCCTATCA  964

Query 1259  CTGTGACCCACAAACCAGAAGAAGACACTTTTGGGGTATCCATAGCAGTTGGACTTGCTGCTTTTGCCTGTGTC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  965  CTGTGACCCACAAACCAGAAGAAGACACTTTTGGGGTATCCATAGCAGTTGGACTTGCTGCTTTTGCCTGTGTC  1038

Query 1333  CTGTTGGTGGTTCTCTTCGTCATGATCAACAAATATGGTCGACGGTCCAAATTTGGAATGAAGGGTCCCGTGGC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1039  CTGTTGGTGGTTCTCTTCGTCATGATCAACAAATATGGTCGACGGTCCAAATTTGGAATGAAGGGTCCCGTGGC  1112

Query 1407  TGTCATCAGTGGTGAGGAGGACTCAGCCAGCCCACTGCACCACATCAACCACGGCATCACCACGCCCTCGTCAC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1113  TGTCATCAGTGGTGAGGAGGACTCAGCCAGCCCACTGCACCACATCAACCACGGCATCACCACGCCCTCGTCAC  1186

Query 1481  TGGATGCCGGGCCCGACACTGTGGTCATTGGCATGACTCGCATCCCTGTCATTGAGAACCCCCAGTACTTCCGT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1187  TGGATGCCGGGCCCGACACTGTGGTCATTGGCATGACTCGCATCCCTGTCATTGAGAACCCCCAGTACTTCCGT  1260

Query 1555  CAGGGACACAACTGCCACAAGCCGGACACGTATGTGCAGCACATTAAGAGGAGAGACATCGTGCTGAAGCGAGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||                                            
Sbjct 1261  CAGGGACACAACTGCCACAAGCCGGACACG--------------------------------------------  1290

Query 1629  ACTGGGTGAGGGAGCCTTTGGAAAGGTCTTCCTGGCCGAGTGCTACAACCTCAGCCCGACCAAGGACAA-GATG  1701
              |||||        ||||..|||                                    ||..||||| .|||
Sbjct 1291  --TGGGT--------CTTTTCAAA------------------------------------CATAGACAATCATG  1318

Query 1702  CTTGTGGCTGTGAAGGCCCTGAAGGATCCCACCCTGGCTGCCCGGAAGGATTTCCAGAGGGAGGCCGAGCTGCT  1775
                 ||.|.|.||  .|.|||||||                           |.|.||.||           |
Sbjct 1319  -----GGATATTAA--ACTTGAAGGA---------------------------CAATAGAGA-----------T  1347

Query 1776  CACCAACCTGCAGCATGAGCACATTGTCAAGTTCTATGGAGTGTGCGGCGATGGGGACCCCCTCA--TCATGGT  1847
            ||                        ||.|||                          |||.|||  |||    
Sbjct 1348  CA------------------------TCTAGT--------------------------CCCATCAACTCA----  1367

Query 1848  CTTTGAATACATGAAGCATGGAGACCTGAATAAGTTCCTCAGGGCCCATGGGCCAGATGCAATGATCCTTGTGG  1921
            ||.|  |||.||||     ||| ||||||                    ||.|||||             ||||
Sbjct 1368  CTAT--ATATATGA-----GGA-ACCTGA--------------------GGTCCAGA-------------GTGG  1400

Query 1922  ATGGACAGCCACGCCAGGCCAAGGGTGAGCTGGGGCTCTCCCAAATGCTCCACAT--TGCCAGTCAGATCGCCT  1993
              ||                |||.||         ||..|||||  |.| |||||  |..|||..|.||     
Sbjct 1401  --GG----------------AAGTGT---------CTTACCCAA--GGT-CACATGGTTTCAGAGAAAT-----  1439

Query 1994  CGGGTATGGTGTACC----TGGCCTCCCAGCACTTTGTGCACCGAGACCTGGCCACCAGGAACTGCCTGGTTGG  2063
                ||||.||.|.|    ..||||.||.|.||.||     ||.|| |||....||||.|              
Sbjct 1440  ----TATGTTGAATCCAATAAGCCTTCCCGGACATT-----CCAAG-CCTCTTAACCATG--------------  1489

Query 2064  AGCGAATCTGCTAGTGAAGATTGGGGACTTCGGCATGTCCAGAGATGTCTACAGCACGGATTATTACAG----G  2133
               |.||||                         ||||..|| |||||      ||..|.|||||.|||    |
Sbjct 1490  ---GCATCT-------------------------ATGTTGAG-GATGT------CAATGTTTATTTCAGCAAAG  1528

Query 2134  GTGGGAGGACACACCAT-GCTCCCCATTCGCTGGATGCCTCCTGAAAGCATCATGTACCGGAAGTTCACTACAG  2206
            |         ||..||| |||     ||                                              
Sbjct 1529  G---------ACGTCATGGCT-----TT----------------------------------------------  1542

Query 2207  AGAGTGATGTATGGAGCTTCGGGGTGATCCTCTGGGAGATCTTCACCTATGGAAAGCAGCCATGGTTCCAACTC  2280
                                                                                      
Sbjct 1543  --------------------------------------------------------------------------  1542

Query 2281  TCAAACACGGAGGTCATTGAGTGCATTACCCAAGGTCGTGTTTTGGAGCGGCCCCGAGTCTGCCCCAAAGAGGT  2354
                                                                                      
Sbjct 1543  --------------------------------------------------------------------------  1542

Query 2355  GTACGATGTCATGCTGGGGTGCTGGCAGAGGGAACCACAGCAGCGGTTGAACATCAAGGAGATCTACAAAATCC  2428
                                                                                      
Sbjct 1543  --------------------------------------------------------------------------  1542

Query 2429  TCCATGCTTTGGGGAAGGCCACCCCAATCTACCTGGACATTCTTGGC  2475
                                                           
Sbjct 1543  -----------------------------------------------  1542