Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488858
• Subject: NM_015529.4
• Aligned Length: 1856
• Identities: 1610
• Gaps: 230

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTGCTGCTGGCCGCTGCTCCTGCTGTGGGGGCTGCTCCCCGGGACGGCGGCGGGGGGCTCGGGCCGAACCTA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TCCGCACCGGACCCTCCTGGACTCGGAGGGCAAGTACTGGCTGGGCTGGAGCCAGCGGGGCAGCCAGATCGCCT  148

Query    1  ---------ATGAATTCTTTTCTCTCTG-----TATTTAGGTATCCTGATTTTT------------CCTT----  44
                     |.|       |.|.|.|||     ||..|.||..||  |..||.|            ||.|    
Sbjct  149  TCCGCCTCCAGG-------TGCGCACTGCAGGCTACGTGGGCTTC--GGCTTCTCGCCCACCGGGGCCATGGCG  213

Query   45  TCC----ATATTTT---------------CCA----------------CAGGATTATTTTACAAATGCAAATAG  83
            |||    |.||..|               |||                ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  214  TCCGCCGACATCGTCGTGGGCGGGGTGGCCCACGGGCGGCCCTACCTCCAGGATTATTTTACAAATGCAAATAG  287

Query   84  AGAGTTGAAAAAAGATGCTCAGCAAGATTACCATCTAGAATATGCCATGGAAAATAGCACACACACAATAATTG  157
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  288  AGAGTTGAAAAAAGATGCTCAGCAAGATTACCATCTAGAATATGCCATGGAAAATAGCACACACACAATAATTG  361

Query  158  AATTTACCAGAGAGCTGCATACATGTGACATAAATGACAAGAGTATAACGGATAGCACTGTGAGAGTGATCTGG  231
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  362  AATTTACCAGAGAGCTGCATACATGTGACATAAATGACAAGAGTATAACGGATAGCACTGTGAGAGTGATCTGG  435

Query  232  GCCTACCACCATGAAGATGCAGGAGAAGCTGGTCCCAAGTACCATGACTCCAATAGGGGCACCAAGAGTTTGCG  305
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  436  GCCTACCACCATGAAGATGCAGGAGAAGCTGGTCCCAAGTACCATGACTCCAATAGGGGCACCAAGAGTTTGCG  509

Query  306  GTTATTGAATCCTGAGAAAACTAGTGTGCTATCTACAGCCTTACCATACTTTGATCTGGTAAATCAGGACGTCC  379
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  510  GTTATTGAATCCTGAGAAAACTAGTGTGCTATCTACAGCCTTACCATACTTTGATCTGGTAAATCAGGACGTCC  583

Query  380  CCATCCCAAACAAAGATACAACATATTGGTGCCAAATGTTTAAGATTCCTGTGTTCCAAGAAAAGCATCATGTA  453
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  584  CCATCCCAAACAAAGATACAACATATTGGTGCCAAATGTTTAAGATTCCTGTGTTCCAAGAAAAGCATCATGTA  657

Query  454  ATAAAGGTTGAGCCAGTGATACAGAGAGGCCATGAGAGTCTGGTGCACCACATCCTGCTCTATCAGTGCAGCAA  527
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  658  ATAAAGGTTGAGCCAGTGATACAGAGAGGCCATGAGAGTCTGGTGCACCACATCCTGCTCTATCAGTGCAGCAA  731

Query  528  CAACTTTAACGACAGCGTTCTGGAGTCCGGCCACGAGTGCTATCACCCCAACATGCCCGATGCATTCCTCACCT  601
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  732  CAACTTTAACGACAGCGTTCTGGAGTCCGGCCACGAGTGCTATCACCCCAACATGCCCGATGCATTCCTCACCT  805

Query  602  GTGAAACTGTGATTTTTGCCTGGGCTATTGGTGGAGAGGGCTTTTCTTATCCACCTCATGTTGGATTATCCCTT  675
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  806  GTGAAACTGTGATTTTTGCCTGGGCTATTGGTGGAGAGGGCTTTTCTTATCCACCTCATGTTGGATTATCCCTT  879

Query  676  GGCACTCCATTAGATCCGCATTATGTGCTCCTAGAAGTCCATTATGATAATCCCACTTATGAGGAAGGCTTAAT  749
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  880  GGCACTCCATTAGATCCGCATTATGTGCTCCTAGAAGTCCATTATGATAATCCCACTTATGAGGAAGGCTTAAT  953

Query  750  AGATAATTCTGGACTGAGGTTATTTTACACAATGGATATAAGGAAATATGATGCTGGGGTGATTGAGGCTGGCC  823
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  954  AGATAATTCTGGACTGAGGTTATTTTACACAATGGATATAAGGAAATATGATGCTGGGGTGATTGAGGCTGGCC  1027

Query  824  TCTGGGTGAGCCTCTTCCATACCATCCCTCCAGGGATGCCTGAGTTCCAGTCTGAGGGTCACTGCACTTTGGAG  897
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1028  TCTGGGTGAGCCTCTTCCATACCATCCCTCCAGGGATGCCTGAGTTCCAGTCTGAGGGTCACTGCACTTTGGAG  1101

Query  898  TGCCTGGAAGAGGCTCTGGAAGCCGAAAAGCCAAGTGGAATTCATGTGTTTGCTGTTCTTCTCCATGCTCACCT  971
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1102  TGCCTGGAAGAGGCTCTGGAAGCCGAAAAGCCAAGTGGAATTCATGTGTTTGCTGTTCTTCTCCATGCTCACCT  1175

Query  972  GGCTGGCAGAGGCATCAGGCTGCGTCATTTTCGAAAAGGGAAGGAAATGAAATTACTTGCCTATGATGATGATT  1045
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1176  GGCTGGCAGAGGCATCAGGCTGCGTCATTTTCGAAAAGGGAAGGAAATGAAATTACTTGCCTATGATGATGATT  1249

Query 1046  TTGACTTCAATTTCCAGGAGTTTCAGTATCTAAAGGAAGAACAAACAATCTTACCAGGAGATAACCTAATTACT  1119
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1250  TTGACTTCAATTTCCAGGAGTTTCAGTATCTAAAGGAAGAACAAACAATCTTACCAGGAGATAACCTAATTACT  1323

Query 1120  GAGTGTCGCTACAACACGAAAGATAGAGCTGAGATGACTTGGGGAGGACTAAGCACCAGGAGTGAAATGTGTCT  1193
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1324  GAGTGTCGCTACAACACGAAAGATAGAGCTGAGATGACTTGGGGAGGACTAAGCACCAGGAGTGAAATGTGTCT  1397

Query 1194  CTCATACCTTCTTTATTACCCAAGAATTAATCTTACTCGATGTGCAAGTATTCCAGACATTATGGAACAACTTC  1267
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1398  CTCATACCTTCTTTATTACCCAAGAATTAATCTTACTCGATGTGCAAGTATTCCAGACATTATGGAACAACTTC  1471

Query 1268  AGTTCATTGGGGTTAAGGAGATCTACAGACCAGTCACGACCTGGCCTTTCATTATCAAAAGTCCCAAGCAATAT  1341
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1472  AGTTCATTGGGGTTAAGGAGATCTACAGACCAGTCACGACCTGGCCTTTCATTATCAAAAGTCCCAAGCAATAT  1545

Query 1342  AAAAACCTTTCTTTCATGGATGCTATGAATAAGTTTAAATGGACTAAAAAGGAAGGTCTCTCCTTCAACAAGCT  1415
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1546  AAAAACCTTTCTTTCATGGATGCTATGAATAAGTTTAAATGGACTAAAAAGGAAGGTCTCTCCTTCAACAAGCT  1619

Query 1416  GGTCCTCAGCCTGCCAGTGAATGTGAGATGTTCCAAGACAGACAATGCTGAGTGGTCGATTCAAGGAATGACAG  1489
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1620  GGTCCTCAGCCTGCCAGTGAATGTGAGATGTTCCAAGACAGACAATGCTGAGTGGTCGATTCAAGGAATGACAG  1693

Query 1490  CATTACCTCCAGATATAGAAAGACCCTATAAAGCAGAACCTTTGGTGTGTGGCACGTCTTCTTCCTCTTCCCTG  1563
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1694  CATTACCTCCAGATATAGAAAGACCCTATAAAGCAGAACCTTTGGTGTGTGGCACGTCTTCTTCCTCTTCCCTG  1767

Query 1564  CACAGAGATTTCTCCATCAACTTGCTTGTTTGCCTTCTGCTACTCAGCTGCACGCTGAGCACCAAGAGCTTGTG  1637
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
Sbjct 1768  CACAGAGATTTCTCCATCAACTTGCTTGTTTGCCTTCTGCTACTCAGCTGCACGCTGAGCACCAAGAGCTTG--  1839

Query 1638  AAAGCT  1643
                  
Sbjct 1840  ------  1839