Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000488866
- Subject:
- XM_011242704.1
- Aligned Length:
- 1408
- Identities:
- 1088
- Gaps:
- 236
Alignment
Query 1 ATGGACCATCCTAGTAGGGAAAAGGATGAAAGACAACGGACAACTAAACCCATGGCACAAAGGAGTGCACACTG 74
|||||||||.|||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||||
Sbjct 1 ATGGACCATTCTAATAGGGAAAAGGATGATAGACAACGGACAACTAAAACCATGGCACAAAGGAATACACACTG 74
Query 75 CTCTCGACCATCTGGCTCCTCATCGTCCTCTGGGGTTCTTATGGTGGGACCCAACTTCAGGGTTGGCAAGAAGA 148
.||..|||||||||||.|.|||.|.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TTCGAGACCATCTGGCACTTCAACATCCTCTGGGGTTCTCATGGTGGGACCCAACTTCAGGGTTGGCAAGAAGA 148
Query 149 TAGGATGTGGGAACTTCGGAGAGCTCAGATTAGGTAAAAATCTCTACACCAATGAATATGTAGCAATCAAACTG 222
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 149 TAGGGTGTGGGAACTTCGGAGAGCTCAGATTAGGTAAAAATCTCTACACCAATGAATATGTAGCCATTAAACTG 222
Query 223 GAACCAATAAAATCACGTGCTCCACAGCTTCATTTAGAGTACAGATTTTATAAACAGCTTGGCAGTGCAGGTGA 296
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAACCAATAAAATCACGTGCTCCACAACTTCATTTAGAGTACAGGTTTTATAAACAGCTTGGCAGTGCAGGTGA 296
Query 297 AGGTCTCCCACAGGTGTATTACTTTGGACCATGTGGGAAATATAATGCCATGGTGCTGGAGCTCCTTGGCCCTA 370
|||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 297 AGGCCTCCCACAGGTTTATTACTTTGGACCATGTGGGAAGTACAATGCCATGGTGCTGGAACTCCTTGGCCCTA 370
Query 371 GCTTGGAGGACTTGTTTGACCTCTGTGACCGAACATTTACTTTGAAGACGGTGTTAATGATAGCCATCCAGCTG 444
|||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 371 GCTTGGAAGACTTGTTTGACCTCTGTGACCGAACGTTTACTTTGAAGACGGTGTTAATGATAGCCATCCAGTTG 444
Query 445 CTTTCTCGAATGGAATACGTGCACTCAAAGAACCTCATTTACCGAGATGTCAAGCCAGAGAACTTCCTGATTGG 518
||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||
Sbjct 445 CTTTCTCGAATGGAGTATGTACACTCAAAGAATCTTATTTACCGAGATGTCAAACCAGAGAACTTCTTGATTGG 518
Query 519 TCGACAAGGCAATAAGAAAGAGCATGTTATACACATTATAGACTTTGGACTGGCCAAGGAATACATTGACCCCG 592
.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||..||||.||.|
Sbjct 519 CCGACAAGGCAATAAGAAAGAGCATGTAATACACATTATAGATTTTGGACTGGCCAAGGAATATGTTGATCCTG 592
Query 593 AAACCAAAAAACACATACCTTATAGGGAACACAAAAGTTTAACTGGAACTGCAAGATATATGTCTATCAACACG 666
||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct 593 AAACCAAAAAACACATACCTTACAGAGAGCACAAAAGTTTGACTGGAACTGCGAGATACATGTCTATCAACACA 666
Query 667 CATCTTGGCAAAGAGCAAAGCCGGAGAGATGATTTGGAAGCCCTAGGCCATATGTTCATGTATTTCCTTCGAGG 740
|||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 667 CATCTAGGCAAAGAGCAAAGCCGGCGAGATGATTTGGAAGCCTTAGGCCATATGTTCATGTACTTCCTCCGAGG 740
Query 741 CAGCCTCCCCTGGCAAGGACTCAAGGCTGACACATTAAAAGAGAGATATCAAAAAATTGGTGACACCAAAAGGA 814
||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 741 CAGCCTACCCTGGCAAGGACTCAAGGCTGATACATTAAAAGAGAGATATCAAAAAATCGGTGATACCAAAAGGA 814
Query 815 ATACTCCCATTGAAGCTCTCTGTGAGAACTTTCCAGAGGAGATGGCAACCTACCTTCGATATGTCAGGCGACTG 888
||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.
Sbjct 815 ATACTCCCATCGAAGCTCTCTGTGAGAACTTTCCAGAGGAGATGGCAACCTACCTTCGATATGTCAGGCGATTA 888
Query 889 GACTTCTTTGAAAAACCTGATTATGAGTATTTACGGACCCTCTTCACAGACCTCTTTGAAAAGAAAGGCTACAC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||..|||||||||.||
Sbjct 889 GACTTCTTTGAAAAACCTGATTATGAGTATTTACGGACCCTCTTCACAGATCTGTTTGAACGGAAAGGCTATAC 962
Query 963 CTTTGACTATGCCTATGATTGGGTTGGGAGACCTATTCCTACTCCAGTAGGGTCAGTTCACGTAGATTCTGGTG 1036
|||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 963 CTTTGACTATGCCTATGATTGGGTTGGAAGGCCTATTCCTACTCCAGTAGGATCAGTTCATGTAGATTCTGGTG 1036
Query 1037 CATCTGCAATAACTCGAGAAAGCCACACACATAGGGATCGGCCATCACAACAGCAGCCTCTTCGAAATCAGA-- 1108
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||
Sbjct 1037 CATCTGCAATAACTCGAGAAAGCCACACACACAGGGATCGGCCATCACAACAACAGCCTCTTAGAAATCAGACT 1110
Query 1109 -------------GCCTTAGGACTGT------TACA---------GCTGAGCATTA---------TGATGTTAA 1145
||| .||||..|| |.|| ||.||.||.|| |||.||
Sbjct 1111 ACATCATCAGAGCGCC-GAGGAGAGTGGGAAATCCAGCCCAGCCGGCAGACCAATACCTCATACCTGACGT--- 1180
Query 1146 CAACTCA--------------GCCATCTG------GCACAGGGG--------AA------GAG-GC-------- 1176
|||| |||||..| |.|||||.| || ||| ||
Sbjct 1181 ---CTCACTTGGCCGCAGACCGCCATGGGGGTTCAGTACAGGTGGTTAGCTCAACCAATGGAGAGCTGAATGTC 1251
Query 1177 ----ACC------------------------------------------------------------------- 1179
|||
Sbjct 1252 GATGACCCCACTGGAGCTCACTCCAATGCACCAATCACAGCTCATGCCGAAGTGGAGGTAGTGGAGGAAGCTAA 1325
Query 1180 -------------------------------------------------------------------------- 1179
Sbjct 1326 CTGCCTGAAAATGCTCAACCTGTGGTGCTGCTGTTTCTTTAAGAGGAAAAGGAAGAAGACAGCCCAGCGACACA 1399
Query 1180 -- 1179
Sbjct 1400 AG 1401