Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488884
• Subject: NM_001243506.2
• Aligned Length: 1305
• Identities: 818
• Gaps: 486

Alignment

Query    1  ATGTCAAACAAAGATCGACACATTGATTCCAGCTGTTCGTCCTTCATCAAGACGGAACCTTCCAGCCCAGCCTC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CCTGACGGACAGCGTCAACCACCACAGCCCTGGTGGCTCTTCAGACGCCAGTGGGAGCTACAGTTCAACCATGA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ATGGCCATCAGAACGGACTTGACTCGCCACCTCTCTACCCTTCTGCTCCTATCCTGGGAGGTAGTGGGCCTGTC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  AGGAAACTGTATGATGACTGCTCCAGCACCATTGTTGAAGATCCCCAGACCAAGTGTGAATACATGCTCAACTC  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GATGCCCAAGAGACTGTGTTTAGTGTGTGGTGACATCGCTTCTGGGTACCACTATGGGGTAGCATCATGTGAAG  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  CCTGCAAGGCATTCTTCAAGAGGACAATTCAAGGCAATATAGAATACAGCTGCCCTGCCACGAATGAATGTGAA  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  ATCACAAAGCGCAGACGTAAATCCTGCCAGGCTTGCCGCTTCATGAAGTGTTTAAAAGTGGGCATGCTGAAAGA  518
                                                      ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------------------------------------------ATGAAGTGTTTAAAAGTGGGCATGCTGAAAGA  32

Query  519  AGGGGTGCGTCTTGACAGAGTACGTGGAGGTCGGCAGAAGTACAAGCGCAGGATAGATGCGGAGAACAGCCCAT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   33  AGGGGTGCGTCTTGACAGAGTACGTGGAGGTCGGCAGAAGTACAAGCGCAGGATAGATGCGGAGAACAGCCCAT  106

Query  593  ACCTGAACCCTCAGCTGGTTCAGCCAGCCAAAAAGCCATATAACAAGATTGTCTCACATTTGTTGGTGGCTGAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  107  ACCTGAACCCTCAGCTGGTTCAGCCAGCCAAAAAGCCATATAACAAGATTGTCTCACATTTGTTGGTGGCTGAA  180

Query  667  CCGGAGAAGATCTATGCCATGCCTGACCCTACTGTCCCCGACAGTGACATCAAAGCCCTCACTACACTGTGTGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  CCGGAGAAGATCTATGCCATGCCTGACCCTACTGTCCCCGACAGTGACATCAAAGCCCTCACTACACTGTGTGA  254

Query  741  CTTGGCCGACCGAGAGTTGGTGGTTATCATTGGATGGGCGAAGCATATTCCAGGCTTCTCCACGCTGTCCCTGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  255  CTTGGCCGACCGAGAGTTGGTGGTTATCATTGGATGGGCGAAGCATATTCCAGGCTTCTCCACGCTGTCCCTGG  328

Query  815  CGGACCAGATGAGCCTTCTGCAGAGTGCTTGGATGGAAATTTTGATCCTTGGTGTCGTATACCGGTCTCTTTCA  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  329  CGGACCAGATGAGCCTTCTGCAGAGTGCTTGGATGGAAATTTTGATCCTTGGTGTCGTATACCGGTCTCTTTCG  402

Query  889  TTTGAGGATGAACTTGTCTATGCAGACGATTATATAATGGACGAAGACCAGTCCAAATTAGCAGGCCTTCTTGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  403  TTTGAGGATGAACTTGTCTATGCAGACGATTATATAATGGACGAAGACCAGTCCAAATTAGCAGGCCTTCTTGA  476

Query  963  TCTAAATAATGCTATCCTGCAGCTGGTAAAGAAATACAAGAGCATGAAGCTGGAAAAAGAAGAATTTGTCACCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  477  TCTAAATAATGCTATCCTGCAGCTGGTAAAGAAATACAAGAGCATGAAGCTGGAAAAAGAAGAATTTGTCACCC  550

Query 1037  TCAAAGCTATAGCTCTTGCTAATTCAGACTCCATGCACATAGAAGATGTTGAAGCCGTTCAGAAGCTTCAGGAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  551  TCAAAGCTATAGCTCTTGCTAATTCAGACTCCATGCACATAGAAGATGTTGAAGCCGTTCAGAAGCTTCAGGAT  624

Query 1111  GTCTTACATGAAGCGCTGCAGGATTATGAAGCTGGCCAGCACATGGAAGACCCTCGTCGAGCTGGCAAGATGCT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  625  GTCTTACATGAAGCGCTGCAGGATTATGAAGCTGGCCAGCACATGGAAGACCCTCGTCGAGCTGGCAAGATGCT  698

Query 1185  GATGACACTGCCACTCCTGAGGCAGACCTCTACCAAGGCCGTGCAGCATTTCTACAACATCAAACTAGAAGGCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  699  GATGACACTGCCACTCCTGAGGCAGACCTCTACCAAGGCCGTGCAGCATTTCTACAACATCAAACTAGAAGGCA  772

Query 1259  AAGTCCCAATGCACAAACTTTTTTTGGAAATGTTGGAGGCCAAGGTC  1305
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  773  AAGTCCCAATGCACAAACTTTTTTTGGAAATGTTGGAGGCCAAGGTC  819