Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488884
• Subject: XM_006497167.3
• Aligned Length: 1305
• Identities: 1215
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGTCAAACAAAGATCGACACATTGATTCCAGCTGTTCGTCCTTCATCAAGACGGAACCTTCCAGCCCAGCCTC  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCAAACAAAGATCGACACATTGATTCCAGCTGTTCGTCCTTCATCAAGACGGAACCCTCCAGCCCAGCCTC  74

Query   75  CCTGACGGACAGCGTCAACCACCACAGCCCTGGTGGCTCTTCAGACGCCAGTGGGAGCTACAGTTCAACCATGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTGACGGACAGCGTCAACCACCACAGCCCTGGTGGGTCTTCCGACGCCAGTGGGAGTTACAGTTCAACCATGA  148

Query  149  ATGGCCATCAGAACGGACTTGACTCGCCACCTCTCTACCCTTCTGCTCCTATCCTGGGAGGTAGTGGGCCTGTC  222
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  149  ATGGCCATCAGAACGGACTGGACTCGCCACCTCTCTACCCCTCTGCTCCGATCCTGGGAGGCAGCGGGCCTGTC  222

Query  223  AGGAAACTGTATGATGACTGCTCCAGCACCATTGTTGAAGATCCCCAGACCAAGTGTGAATACATGCTCAACTC  296
            .|||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  223  CGGAAACTGTATGATGACTGCTCCAGCACCATCGTAGAGGATCCCCAGACCAAGTGTGAATATATGCTCAACTC  296

Query  297  GATGCCCAAGAGACTGTGTTTAGTGTGTGGTGACATCGCTTCTGGGTACCACTATGGGGTAGCATCATGTGAAG  370
            .|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  297  CATGCCCAAGAGACTGTGCTTAGTGTGTGGCGACATCGCCTCTGGGTACCACTATGGGGTTGCATCATGTGAAG  370

Query  371  CCTGCAAGGCATTCTTCAAGAGGACAATTCAAGGCAATATAGAATACAGCTGCCCTGCCACGAATGAATGTGAA  444
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  371  CCTGCAAGGCATTCTTCAAGAGGACGATTCAAGGTAACATAGAGTACAGCTGCCCAGCCACGAATGAATGTGAG  444

Query  445  ATCACAAAGCGCAGACGTAAATCCTGCCAGGCTTGCCGCTTCATGAAGTGTTTAAAAGTGGGCATGCTGAAAGA  518
            |||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATCACAAAGCGCAGACGCAAATCCTGCCAGGCCTGCCGCTTCATGAAGTGTCTCAAAGTGGGCATGCTGAAAGA  518

Query  519  AGGGGTGCGTCTTGACAGAGTACGTGGAGGTCGGCAGAAGTACAAGCGCAGGATAGATGCGGAGAACAGCCCAT  592
            ||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct  519  AGGGGTCCGTCTTGACAGAGTGCGTGGAGGTCGGCAGAAGTACAAGCGCAGAATAGATGCTGAGAACAGCCCAT  592

Query  593  ACCTGAACCCTCAGCTGGTTCAGCCAGCCAAAAAGCCATATAACAAGATTGTCTCACATTTGTTGGTGGCTGAA  666
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACCTGAACCCTCAGCTGGTGCAGCCAGCCAAAAAGCCATATAACAAGATTGTCTCGCATTTGTTGGTGGCTGAA  666

Query  667  CCGGAGAAGATCTATGCCATGCCTGACCCTACTGTCCCCGACAGTGACATCAAAGCCCTCACTACACTGTGTGA  740
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  667  CCAGAGAAGATCTATGCCATGCCTGACCCTACTGTCCCCGACAGTGACATCAAAGCCCTCACCACACTCTGTGA  740

Query  741  CTTGGCCGACCGAGAGTTGGTGGTTATCATTGGATGGGCGAAGCATATTCCAGGCTTCTCCACGCTGTCCCTGG  814
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  741  CTTGGCTGACCGAGAGTTGGTGGTTATCATTGGATGGGCAAAACATATTCCAGGCTTCTCCACACTGTCCCTGG  814

Query  815  CGGACCAGATGAGCCTTCTGCAGAGTGCTTGGATGGAAATTTTGATCCTTGGTGTCGTATACCGGTCTCTTTCA  888
            |.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||.|||||||.||.||.||.|||||.||.|||||.
Sbjct  815  CAGACCAGATGAGCCTCCTCCAGAGTGCATGGATGGAGATTCTGATCCTCGGCGTTGTGTACCGATCGCTTTCG  888

Query  889  TTTGAGGATGAACTTGTCTATGCAGACGATTATATAATGGACGAAGACCAGTCCAAATTAGCAGGCCTTCTTGA  962
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTTGAGGATGAACTTGTCTATGCAGACGATTATATAATGGATGAAGACCAGTCTAAATTAGCAGGCCTTCTTGA  962

Query  963  TCTAAATAATGCTATCCTGCAGCTGGTAAAGAAATACAAGAGCATGAAGCTGGAAAAAGAAGAATTTGTCACCC  1036
            .||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||
Sbjct  963  CCTAAATAATGCTATCCTGCAGCTGGTGAAGAAGTACAAGAGCATGAAGCTAGAGAAGGAAGAATTCGTCACCC  1036

Query 1037  TCAAAGCTATAGCTCTTGCTAATTCAGACTCCATGCACATAGAAGATGTTGAAGCCGTTCAGAAGCTTCAGGAT  1110
            |||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 1037  TCAAAGCAATAGCTCTTGCTAATTCAGATTCCATGCATATAGAAGATGTGGAAGCTGTGCAGAAACTTCAGGAT  1110

Query 1111  GTCTTACATGAAGCGCTGCAGGATTATGAAGCTGGCCAGCACATGGAAGACCCTCGTCGAGCTGGCAAGATGCT  1184
            ||.||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 1111  GTGTTACATGAGGCCCTGCAGGATTACGAGGCTGGCCAGCACATGGAAGACCCTCGCCGTGCAGGCAAGATGCT  1184

Query 1185  GATGACACTGCCACTCCTGAGGCAGACCTCTACCAAGGCCGTGCAGCATTTCTACAACATCAAACTAGAAGGCA  1258
            ||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1185  GATGACGCTGCCGCTGCTGAGGCAGACCTCCACCAAGGCAGTCCAGCACTTCTACAACATCAAACTCGAAGGCA  1258

Query 1259  AAGTCCCAATGCACAAACTTTTTTTGGAAATGTTGGAGGCCAAGGTC  1305
            ||||.||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1259  AAGTGCCCATGCACAAACTTTTTTTGGAAATGCTGGAGGCCAAGGTC  1305