Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488884
• Subject: XM_011238920.2
• Aligned Length: 1341
• Identities: 1215
• Gaps: 36

Alignment

Query    1  ------------------------------------ATGTCAAACAAAGATCGACACATTGATTCCAGCTGTTC  38
                                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTGGACCGTAACCCACAATTGCTTCTCTGCAGAATGTCAAACAAAGATCGACACATTGATTCCAGCTGTTC  74

Query   39  GTCCTTCATCAAGACGGAACCTTCCAGCCCAGCCTCCCTGACGGACAGCGTCAACCACCACAGCCCTGGTGGCT  112
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   75  GTCCTTCATCAAGACGGAACCCTCCAGCCCAGCCTCCCTGACGGACAGCGTCAACCACCACAGCCCTGGTGGGT  148

Query  113  CTTCAGACGCCAGTGGGAGCTACAGTTCAACCATGAATGGCCATCAGAACGGACTTGACTCGCCACCTCTCTAC  186
            ||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTTCCGACGCCAGTGGGAGTTACAGTTCAACCATGAATGGCCATCAGAACGGACTGGACTCGCCACCTCTCTAC  222

Query  187  CCTTCTGCTCCTATCCTGGGAGGTAGTGGGCCTGTCAGGAAACTGTATGATGACTGCTCCAGCACCATTGTTGA  260
            ||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  223  CCCTCTGCTCCGATCCTGGGAGGCAGCGGGCCTGTCCGGAAACTGTATGATGACTGCTCCAGCACCATCGTAGA  296

Query  261  AGATCCCCAGACCAAGTGTGAATACATGCTCAACTCGATGCCCAAGAGACTGTGTTTAGTGTGTGGTGACATCG  334
            .|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  297  GGATCCCCAGACCAAGTGTGAATATATGCTCAACTCCATGCCCAAGAGACTGTGCTTAGTGTGTGGCGACATCG  370

Query  335  CTTCTGGGTACCACTATGGGGTAGCATCATGTGAAGCCTGCAAGGCATTCTTCAAGAGGACAATTCAAGGCAAT  408
            |.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.
Sbjct  371  CCTCTGGGTACCACTATGGGGTTGCATCATGTGAAGCCTGCAAGGCATTCTTCAAGAGGACGATTCAAGGTAAC  444

Query  409  ATAGAATACAGCTGCCCTGCCACGAATGAATGTGAAATCACAAAGCGCAGACGTAAATCCTGCCAGGCTTGCCG  482
            |||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct  445  ATAGAGTACAGCTGCCCAGCCACGAATGAATGTGAGATCACAAAGCGCAGACGCAAATCCTGCCAGGCCTGCCG  518

Query  483  CTTCATGAAGTGTTTAAAAGTGGGCATGCTGAAAGAAGGGGTGCGTCTTGACAGAGTACGTGGAGGTCGGCAGA  556
            |||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  519  CTTCATGAAGTGTCTCAAAGTGGGCATGCTGAAAGAAGGGGTCCGTCTTGACAGAGTGCGTGGAGGTCGGCAGA  592

Query  557  AGTACAAGCGCAGGATAGATGCGGAGAACAGCCCATACCTGAACCCTCAGCTGGTTCAGCCAGCCAAAAAGCCA  630
            |||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGTACAAGCGCAGAATAGATGCTGAGAACAGCCCATACCTGAACCCTCAGCTGGTGCAGCCAGCCAAAAAGCCA  666

Query  631  TATAACAAGATTGTCTCACATTTGTTGGTGGCTGAACCGGAGAAGATCTATGCCATGCCTGACCCTACTGTCCC  704
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TATAACAAGATTGTCTCGCATTTGTTGGTGGCTGAACCAGAGAAGATCTATGCCATGCCTGACCCTACTGTCCC  740

Query  705  CGACAGTGACATCAAAGCCCTCACTACACTGTGTGACTTGGCCGACCGAGAGTTGGTGGTTATCATTGGATGGG  778
            ||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CGACAGTGACATCAAAGCCCTCACCACACTCTGTGACTTGGCTGACCGAGAGTTGGTGGTTATCATTGGATGGG  814

Query  779  CGAAGCATATTCCAGGCTTCTCCACGCTGTCCCTGGCGGACCAGATGAGCCTTCTGCAGAGTGCTTGGATGGAA  852
            |.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.
Sbjct  815  CAAAACATATTCCAGGCTTCTCCACACTGTCCCTGGCAGACCAGATGAGCCTCCTCCAGAGTGCATGGATGGAG  888

Query  853  ATTTTGATCCTTGGTGTCGTATACCGGTCTCTTTCATTTGAGGATGAACTTGTCTATGCAGACGATTATATAAT  926
            |||.|||||||.||.||.||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATTCTGATCCTCGGCGTTGTGTACCGATCGCTTTCGTTTGAGGATGAACTTGTCTATGCAGACGATTATATAAT  962

Query  927  GGACGAAGACCAGTCCAAATTAGCAGGCCTTCTTGATCTAAATAATGCTATCCTGCAGCTGGTAAAGAAATACA  1000
            |||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct  963  GGATGAAGACCAGTCTAAATTAGCAGGCCTTCTTGACCTAAATAATGCTATCCTGCAGCTGGTGAAGAAGTACA  1036

Query 1001  AGAGCATGAAGCTGGAAAAAGAAGAATTTGTCACCCTCAAAGCTATAGCTCTTGCTAATTCAGACTCCATGCAC  1074
            |||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1037  AGAGCATGAAGCTAGAGAAGGAAGAATTCGTCACCCTCAAAGCAATAGCTCTTGCTAATTCAGATTCCATGCAT  1110

Query 1075  ATAGAAGATGTTGAAGCCGTTCAGAAGCTTCAGGATGTCTTACATGAAGCGCTGCAGGATTATGAAGCTGGCCA  1148
            |||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||
Sbjct 1111  ATAGAAGATGTGGAAGCTGTGCAGAAACTTCAGGATGTGTTACATGAGGCCCTGCAGGATTACGAGGCTGGCCA  1184

Query 1149  GCACATGGAAGACCCTCGTCGAGCTGGCAAGATGCTGATGACACTGCCACTCCTGAGGCAGACCTCTACCAAGG  1222
            ||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1185  GCACATGGAAGACCCTCGCCGTGCAGGCAAGATGCTGATGACGCTGCCGCTGCTGAGGCAGACCTCCACCAAGG  1258

Query 1223  CCGTGCAGCATTTCTACAACATCAAACTAGAAGGCAAAGTCCCAATGCACAAACTTTTTTTGGAAATGTTGGAG  1296
            |.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1259  CAGTCCAGCACTTCTACAACATCAAACTCGAAGGCAAAGTGCCCATGCACAAACTTTTTTTGGAAATGCTGGAG  1332

Query 1297  GCCAAGGTC  1305
            |||||||||
Sbjct 1333  GCCAAGGTC  1341