Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488884
• Subject: XM_011509267.1
• Aligned Length: 1410
• Identities: 1304
• Gaps: 105

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTGGCGAGAATGTGATTGGGGTCTTGGAGCAGTCAAGTCTGATCTGGCCTGTGTTCCTTCAGCTAAAAGGCT  74

Query    1  ----------ATGTCAAACAAAGATCGACACATTGATTCCAGCTGTTCGTCCTTCATCAAGACGGAACCTTCCA  64
                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCTCTGCAGAATGTCAAACAAAGATCGACACATTGATTCCAGCTGTTCGTCCTTCATCAAGACGGAACCTTCCA  148

Query   65  GCCCAGCCTCCCTGACGGACAGCGTCAACCACCACAGCCCTGGTGGCTCTTCAGACGCCAGTGGGAGCTACAGT  138
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCCCAGCCTCCCTGACGGACAGCGTCAACCACCACAGCCCTGGTGGCTCTTCAGACGCCAGTGGGAGCTACAGT  222

Query  139  TCAACCATGAATGGCCATCAGAACGGACTTGACTCGCCACCTCTCTACCCTTCTGCTCCTATCCTGGGAGGTAG  212
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCAACCATGAATGGCCATCAGAACGGACTTGACTCGCCACCTCTCTACCCTTCTGCTCCTATCCTGGGAGGTAG  296

Query  213  TGGGCCTGTCAGGAAACTGTATGATGACTGCTCCAGCACCATTGTTGAAGATCCCCAGACCAAGTGTGAATACA  286
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGGGCCTGTCAGGAAACTGTATGATGACTGCTCCAGCACCATTGTTGAAGATCCCCAGACCAAGTGTGAATACA  370

Query  287  TGCTCAACTCGATGCCCAAGAGACTGTGTTTAGTGTGTGGTGACATCGCTTCTGGGTACCACTATGGGGTAGCA  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGCTCAACTCGATGCCCAAGAGACTGTGTTTAGTGTGTGGTGACATCGCTTCTGGGTACCACTATGGGGTAGCA  444

Query  361  TCATGTGAAGCCTGCAAGGCATTCTTCAAGAGGACAATTCAAGGCAATATAGAATACAGCTGCCCTGCCACGAA  434
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCATGTGAAGCCTGCAAGGCATTCTTCAAGAGGACAATTCAAGGCAATATAGAATACAGCTGCCCTGCCACGAA  518

Query  435  TGAATGTGAAATCACAAAGCGCAGACGTAAATCCTGCCAGGCTTGCCGCTTCATGAAGTGTTTAAAAGTGGGCA  508
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGAATGTGAAATCACAAAGCGCAGACGTAAATCCTGCCAGGCTTGCCGCTTCATGAAGTGTTTAAAAGTGGGCA  592

Query  509  TGCTGAAAGAAGGGGTGCGTCTTGACAGAGTACGTGGAGGTCGGCAGAAGTACAAGCGCAGGATAGATGCGGAG  582
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGCTGAAAGAAGGGGTGCGTCTTGACAGAGTACGTGGAGGTCGGCAGAAGTACAAGCGCAGGATAGATGCGGAG  666

Query  583  AACAGCCCATACCTGAACCCTCAGCTGGTTCAGCCAGCCAAAAAGCCAT---------------------ATAA  635
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                     ||||
Sbjct  667  AACAGCCCATACCTGAACCCTCAGCTGGTTCAGCCAGCCAAAAAGCCATTGCTCTGGTCTGATCCTGCAGATAA  740

Query  636  CAAGATTGTCTCACATTTGTTGGTGGCTGAACCGGAGAAGATCTATGCCATGCCTGACCCTACTGTCCCCGACA  709
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAAGATTGTCTCACATTTGTTGGTGGCTGAACCGGAGAAGATCTATGCCATGCCTGACCCTACTGTCCCCGACA  814

Query  710  GTGACATCAAAGCCCTCACTACACTGTGTGACTTGGCCGACCGAGAGTTGGTGGTTATCATTGGATGGGCGAAG  783
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTGACATCAAAGCCCTCACTACACTGTGTGACTTGGCCGACCGAGAGTTGGTGGTTATCATTGGATGGGCGAAG  888

Query  784  CATATTCCAGGCTTCTCCACGCTGTCCCTGGCGGACCAGATGAGCCTTCTGCAGAGTGCTTGGATGGAAATTTT  857
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CATATTCCAGGCTTCTCCACGCTGTCCCTGGCGGACCAGATGAGCCTTCTGCAGAGTGCTTGGATGGAAATTTT  962

Query  858  GATCCTTGGTGTCGTATACCGGTCTCTTTCATTTGAGGATGAACTTGTCTATGCAGACGATTATATAATGGACG  931
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GATCCTTGGTGTCGTATACCGGTCTCTTTCGTTTGAGGATGAACTTGTCTATGCAGACGATTATATAATGGACG  1036

Query  932  AAGACCAGTCCAAATTAGCAGGCCTTCTTGATCTAAATAATGCTATCCTGCAGCTGGTAAAGAAATACAAGAGC  1005
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AAGACCAGTCCAAATTAGCAGGCCTTCTTGATCTAAATAATGCTATCCTGCAGCTGGTAAAGAAATACAAGAGC  1110

Query 1006  ATGAAGCTGGAAAAAGAAGAATTTGTCACCCTCAAAGCTATAGCTCTTGCTAATTCAGACTCCATGCACATAGA  1079
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATGAAGCTGGAAAAAGAAGAATTTGTCACCCTCAAAGCTATAGCTCTTGCTAATTCAGACTCCATGCACATAGA  1184

Query 1080  AGATGTTGAAGCCGTTCAGAAGCTTCAGGATGTCTTACATGAAGCGCTGCAGGATTATGAAGCTGGCCAGCACA  1153
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGATGTTGAAGCCGTTCAGAAGCTTCAGGATGTCTTACATGAAGCGCTGCAGGATTATGAAGCTGGCCAGCACA  1258

Query 1154  TGGAAGACCCTCGTCGAGCTGGCAAGATGCTGATGACACTGCCACTCCTGAGGCAGACCTCTACCAAGGCCGTG  1227
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGGAAGACCCTCGTCGAGCTGGCAAGATGCTGATGACACTGCCACTCCTGAGGCAGACCTCTACCAAGGCCGTG  1332

Query 1228  CAGCATTTCTACAACATCAAACTAGAAGGCAAAGTCCCAATGCACAAACTTTTTTTGGAAATGTTGGAGGCCAA  1301
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CAGCATTTCTACAACATCAAACTAGAAGGCAAAGTCCCAATGCACAAACTTTTTTTGGAAATGTTGGAGGCCAA  1406

Query 1302  GGTC  1305
            ||||
Sbjct 1407  GGTC  1410