Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488884
• Subject: XM_017000625.1
• Aligned Length: 1431
• Identities: 1304
• Gaps: 126

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAGCTGGGGTGGTTCAAAGAACAGGAAAAAAAAAAGGCAACATGACTGGAGCCTAGTGAATGAAGGAGTGTC  74

Query    1  -------------------------------ATGTCAAACAAAGATCGACACATTGATTCCAGCTGTTCGTCCT  43
                                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGGACTTGAGGCTGGCAGGCTTCTCTGCAGAATGTCAAACAAAGATCGACACATTGATTCCAGCTGTTCGTCCT  148

Query   44  TCATCAAGACGGAACCTTCCAGCCCAGCCTCCCTGACGGACAGCGTCAACCACCACAGCCCTGGTGGCTCTTCA  117
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCATCAAGACGGAACCTTCCAGCCCAGCCTCCCTGACGGACAGCGTCAACCACCACAGCCCTGGTGGCTCTTCA  222

Query  118  GACGCCAGTGGGAGCTACAGTTCAACCATGAATGGCCATCAGAACGGACTTGACTCGCCACCTCTCTACCCTTC  191
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACGCCAGTGGGAGCTACAGTTCAACCATGAATGGCCATCAGAACGGACTTGACTCGCCACCTCTCTACCCTTC  296

Query  192  TGCTCCTATCCTGGGAGGTAGTGGGCCTGTCAGGAAACTGTATGATGACTGCTCCAGCACCATTGTTGAAGATC  265
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGCTCCTATCCTGGGAGGTAGTGGGCCTGTCAGGAAACTGTATGATGACTGCTCCAGCACCATTGTTGAAGATC  370

Query  266  CCCAGACCAAGTGTGAATACATGCTCAACTCGATGCCCAAGAGACTGTGTTTAGTGTGTGGTGACATCGCTTCT  339
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCCAGACCAAGTGTGAATACATGCTCAACTCGATGCCCAAGAGACTGTGTTTAGTGTGTGGTGACATCGCTTCT  444

Query  340  GGGTACCACTATGGGGTAGCATCATGTGAAGCCTGCAAGGCATTCTTCAAGAGGACAATTCAAGGCAATATAGA  413
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGGTACCACTATGGGGTAGCATCATGTGAAGCCTGCAAGGCATTCTTCAAGAGGACAATTCAAGGCAATATAGA  518

Query  414  ATACAGCTGCCCTGCCACGAATGAATGTGAAATCACAAAGCGCAGACGTAAATCCTGCCAGGCTTGCCGCTTCA  487
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ATACAGCTGCCCTGCCACGAATGAATGTGAAATCACAAAGCGCAGACGTAAATCCTGCCAGGCTTGCCGCTTCA  592

Query  488  TGAAGTGTTTAAAAGTGGGCATGCTGAAAGAAGGGGTGCGTCTTGACAGAGTACGTGGAGGTCGGCAGAAGTAC  561
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGAAGTGTTTAAAAGTGGGCATGCTGAAAGAAGGGGTGCGTCTTGACAGAGTACGTGGAGGTCGGCAGAAGTAC  666

Query  562  AAGCGCAGGATAGATGCGGAGAACAGCCCATACCTGAACCCTCAGCTGGTTCAGCCAGCCAAAAAGCCAT----  631
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
Sbjct  667  AAGCGCAGGATAGATGCGGAGAACAGCCCATACCTGAACCCTCAGCTGGTTCAGCCAGCCAAAAAGCCATTGCT  740

Query  632  -----------------ATAACAAGATTGTCTCACATTTGTTGGTGGCTGAACCGGAGAAGATCTATGCCATGC  688
                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTGGTCTGATCCTGCAGATAACAAGATTGTCTCACATTTGTTGGTGGCTGAACCGGAGAAGATCTATGCCATGC  814

Query  689  CTGACCCTACTGTCCCCGACAGTGACATCAAAGCCCTCACTACACTGTGTGACTTGGCCGACCGAGAGTTGGTG  762
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTGACCCTACTGTCCCCGACAGTGACATCAAAGCCCTCACTACACTGTGTGACTTGGCCGACCGAGAGTTGGTG  888

Query  763  GTTATCATTGGATGGGCGAAGCATATTCCAGGCTTCTCCACGCTGTCCCTGGCGGACCAGATGAGCCTTCTGCA  836
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTTATCATTGGATGGGCGAAGCATATTCCAGGCTTCTCCACGCTGTCCCTGGCGGACCAGATGAGCCTTCTGCA  962

Query  837  GAGTGCTTGGATGGAAATTTTGATCCTTGGTGTCGTATACCGGTCTCTTTCATTTGAGGATGAACTTGTCTATG  910
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GAGTGCTTGGATGGAAATTTTGATCCTTGGTGTCGTATACCGGTCTCTTTCGTTTGAGGATGAACTTGTCTATG  1036

Query  911  CAGACGATTATATAATGGACGAAGACCAGTCCAAATTAGCAGGCCTTCTTGATCTAAATAATGCTATCCTGCAG  984
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAGACGATTATATAATGGACGAAGACCAGTCCAAATTAGCAGGCCTTCTTGATCTAAATAATGCTATCCTGCAG  1110

Query  985  CTGGTAAAGAAATACAAGAGCATGAAGCTGGAAAAAGAAGAATTTGTCACCCTCAAAGCTATAGCTCTTGCTAA  1058
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTGGTAAAGAAATACAAGAGCATGAAGCTGGAAAAAGAAGAATTTGTCACCCTCAAAGCTATAGCTCTTGCTAA  1184

Query 1059  TTCAGACTCCATGCACATAGAAGATGTTGAAGCCGTTCAGAAGCTTCAGGATGTCTTACATGAAGCGCTGCAGG  1132
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TTCAGACTCCATGCACATAGAAGATGTTGAAGCCGTTCAGAAGCTTCAGGATGTCTTACATGAAGCGCTGCAGG  1258

Query 1133  ATTATGAAGCTGGCCAGCACATGGAAGACCCTCGTCGAGCTGGCAAGATGCTGATGACACTGCCACTCCTGAGG  1206
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATTATGAAGCTGGCCAGCACATGGAAGACCCTCGTCGAGCTGGCAAGATGCTGATGACACTGCCACTCCTGAGG  1332

Query 1207  CAGACCTCTACCAAGGCCGTGCAGCATTTCTACAACATCAAACTAGAAGGCAAAGTCCCAATGCACAAACTTTT  1280
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CAGACCTCTACCAAGGCCGTGCAGCATTTCTACAACATCAAACTAGAAGGCAAAGTCCCAATGCACAAACTTTT  1406

Query 1281  TTTGGAAATGTTGGAGGCCAAGGTC  1305
            |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TTTGGAAATGTTGGAGGCCAAGGTC  1431