Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488884
• Subject: XM_017000628.1
• Aligned Length: 1383
• Identities: 1304
• Gaps: 78

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------------ATGTCAAACAAAGATCG  17
                                                                     |||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCAAACAGAAGGAGCAGCATCTGTGCATAGAGGAACGAAGCAGCTTCTCTGCAGAATGTCAAACAAAGATCG  74

Query   18  ACACATTGATTCCAGCTGTTCGTCCTTCATCAAGACGGAACCTTCCAGCCCAGCCTCCCTGACGGACAGCGTCA  91
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACACATTGATTCCAGCTGTTCGTCCTTCATCAAGACGGAACCTTCCAGCCCAGCCTCCCTGACGGACAGCGTCA  148

Query   92  ACCACCACAGCCCTGGTGGCTCTTCAGACGCCAGTGGGAGCTACAGTTCAACCATGAATGGCCATCAGAACGGA  165
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACCACCACAGCCCTGGTGGCTCTTCAGACGCCAGTGGGAGCTACAGTTCAACCATGAATGGCCATCAGAACGGA  222

Query  166  CTTGACTCGCCACCTCTCTACCCTTCTGCTCCTATCCTGGGAGGTAGTGGGCCTGTCAGGAAACTGTATGATGA  239
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTTGACTCGCCACCTCTCTACCCTTCTGCTCCTATCCTGGGAGGTAGTGGGCCTGTCAGGAAACTGTATGATGA  296

Query  240  CTGCTCCAGCACCATTGTTGAAGATCCCCAGACCAAGTGTGAATACATGCTCAACTCGATGCCCAAGAGACTGT  313
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTGCTCCAGCACCATTGTTGAAGATCCCCAGACCAAGTGTGAATACATGCTCAACTCGATGCCCAAGAGACTGT  370

Query  314  GTTTAGTGTGTGGTGACATCGCTTCTGGGTACCACTATGGGGTAGCATCATGTGAAGCCTGCAAGGCATTCTTC  387
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GTTTAGTGTGTGGTGACATCGCTTCTGGGTACCACTATGGGGTAGCATCATGTGAAGCCTGCAAGGCATTCTTC  444

Query  388  AAGAGGACAATTCAAGGCAATATAGAATACAGCTGCCCTGCCACGAATGAATGTGAAATCACAAAGCGCAGACG  461
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGAGGACAATTCAAGGCAATATAGAATACAGCTGCCCTGCCACGAATGAATGTGAAATCACAAAGCGCAGACG  518

Query  462  TAAATCCTGCCAGGCTTGCCGCTTCATGAAGTGTTTAAAAGTGGGCATGCTGAAAGAAGGGGTGCGTCTTGACA  535
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TAAATCCTGCCAGGCTTGCCGCTTCATGAAGTGTTTAAAAGTGGGCATGCTGAAAGAAGGGGTGCGTCTTGACA  592

Query  536  GAGTACGTGGAGGTCGGCAGAAGTACAAGCGCAGGATAGATGCGGAGAACAGCCCATACCTGAACCCTCAGCTG  609
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GAGTACGTGGAGGTCGGCAGAAGTACAAGCGCAGGATAGATGCGGAGAACAGCCCATACCTGAACCCTCAGCTG  666

Query  610  GTTCAGCCAGCCAAAAAGCCAT---------------------ATAACAAGATTGTCTCACATTTGTTGGTGGC  662
            ||||||||||||||||||||||                     |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTTCAGCCAGCCAAAAAGCCATTGCTCTGGTCTGATCCTGCAGATAACAAGATTGTCTCACATTTGTTGGTGGC  740

Query  663  TGAACCGGAGAAGATCTATGCCATGCCTGACCCTACTGTCCCCGACAGTGACATCAAAGCCCTCACTACACTGT  736
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGAACCGGAGAAGATCTATGCCATGCCTGACCCTACTGTCCCCGACAGTGACATCAAAGCCCTCACTACACTGT  814

Query  737  GTGACTTGGCCGACCGAGAGTTGGTGGTTATCATTGGATGGGCGAAGCATATTCCAGGCTTCTCCACGCTGTCC  810
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTGACTTGGCCGACCGAGAGTTGGTGGTTATCATTGGATGGGCGAAGCATATTCCAGGCTTCTCCACGCTGTCC  888

Query  811  CTGGCGGACCAGATGAGCCTTCTGCAGAGTGCTTGGATGGAAATTTTGATCCTTGGTGTCGTATACCGGTCTCT  884
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGGCGGACCAGATGAGCCTTCTGCAGAGTGCTTGGATGGAAATTTTGATCCTTGGTGTCGTATACCGGTCTCT  962

Query  885  TTCATTTGAGGATGAACTTGTCTATGCAGACGATTATATAATGGACGAAGACCAGTCCAAATTAGCAGGCCTTC  958
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TTCGTTTGAGGATGAACTTGTCTATGCAGACGATTATATAATGGACGAAGACCAGTCCAAATTAGCAGGCCTTC  1036

Query  959  TTGATCTAAATAATGCTATCCTGCAGCTGGTAAAGAAATACAAGAGCATGAAGCTGGAAAAAGAAGAATTTGTC  1032
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTGATCTAAATAATGCTATCCTGCAGCTGGTAAAGAAATACAAGAGCATGAAGCTGGAAAAAGAAGAATTTGTC  1110

Query 1033  ACCCTCAAAGCTATAGCTCTTGCTAATTCAGACTCCATGCACATAGAAGATGTTGAAGCCGTTCAGAAGCTTCA  1106
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACCCTCAAAGCTATAGCTCTTGCTAATTCAGACTCCATGCACATAGAAGATGTTGAAGCCGTTCAGAAGCTTCA  1184

Query 1107  GGATGTCTTACATGAAGCGCTGCAGGATTATGAAGCTGGCCAGCACATGGAAGACCCTCGTCGAGCTGGCAAGA  1180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGATGTCTTACATGAAGCGCTGCAGGATTATGAAGCTGGCCAGCACATGGAAGACCCTCGTCGAGCTGGCAAGA  1258

Query 1181  TGCTGATGACACTGCCACTCCTGAGGCAGACCTCTACCAAGGCCGTGCAGCATTTCTACAACATCAAACTAGAA  1254
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGCTGATGACACTGCCACTCCTGAGGCAGACCTCTACCAAGGCCGTGCAGCATTTCTACAACATCAAACTAGAA  1332

Query 1255  GGCAAAGTCCCAATGCACAAACTTTTTTTGGAAATGTTGGAGGCCAAGGTC  1305
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GGCAAAGTCCCAATGCACAAACTTTTTTTGGAAATGTTGGAGGCCAAGGTC  1383