Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488893
• Subject: NM_001040169.2
• Aligned Length: 1203
• Identities: 1114
• Gaps: 81

Alignment

Query    1  ATGGACAAACTTGATGCTAATGTGAGTTCTGAGGAGGGTTTCGGGTCAGTGGAGAAGGTGGTGCTGCTCACGTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACAAACTTGATGCTAATGTGAGTTCTGAGGAGGGTTTCGGGTCAGTGGAGAAGGTGGTGCTGCTCACGTT  74

Query   75  TCTCTCGACGGTTATCCTGATGGCCATCTTGGGGAACCTGCTGGTGATGGTGGCTGTGTGCTGGGACAGGCAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCTCTCGACGGTTATCCTGATGGCCATCTTGGGGAACCTGCTGGTGATGGTGGCTGTGTGCTGGGACAGGCAGC  148

Query  149  TCAGGAAAATAAAAACAAATTATTTCATTGTATCTCTTGCTTTTGCGGATCTGCTGGTTTCGGTGCTGGTGATG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCAGGAAAATAAAAACAAATTATTTCATTGTATCTCTTGCTTTTGCGGATCTGCTGGTTTCGGTGCTGGTGATG  222

Query  223  CCCTTTGGTGCCATTGAGCTGGTTCAAGACATCTGGATTTATGGGGAGGTGTTTTGTCTTGTTCGGACATCTCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCCTTTGGTGCCATTGAGCTGGTTCAAGACATCTGGATTTATGGGGAGGTGTTTTGTCTTGTTCGGACATCTCT  296

Query  297  GGACGTCCTGCTCACAACGGCATCGATTTTTCACCTGTGCTGCATTTCTCTGGATAGGTATTACGCCATCTGCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGACGTCCTGCTCACAACGGCATCGATTTTTCACCTGTGCTGCATTTCTCTGGATAGGTATTACGCCATCTGCT  370

Query  371  GCCAGCCTTTGGTCTATAGGAACAAGATGACCCCTCTGCGCATCGCATTAATGCTGGGAGGCTGCTGGGTCATC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCCAGCCTTTGGTCTATAGGAACAAGATGACCCCTCTGCGCATCGCATTAATGCTGGGAGGCTGCTGGGTCATC  444

Query  445  CCCACGTTTATTTCTTTTCTCCCTATAATGCAAGGCTGGAATAACATTGGCATAATTGATTTGATAGAAAAGAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCCACGTTTATTTCTTTTCTCCCTATAATGCAAGGCTGGAATAACATTGGCATAATTGATTTGATAGAAAAGAG  518

Query  519  GAAGTTCAACCAGAACTCTAACTCTACGTACTGTGTCTTCATGGTCAACAAGCCCTACGCCATCACCTGCTCTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAAGTTCAACCAGAACTCTAACTCTACGTACTGTGTCTTCATGGTCAACAAGCCCTACGCCATCACCTGCTCTG  592

Query  593  TGGTGGCCTTCTACATCCCATTTCTCCTCATGGTGCTGGCCTATTACCGCATCTATGTCACAGCTAAGGAGCAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGTGGCCTTCTACATCCCATTTCTCCTCATGGTGCTGGCCTATTACCGCATCTATGTCACAGCTAAGGAGCAT  666

Query  667  GCCCATCAGATCCAGATGTTACAACGGGCAGGAGCCTCCTCCGAGAGCAGGCCTCAGTCGGCAGACCAGCATAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCCCATCAGATCCAGATGTTACAACGGGCAGGAGCCTCCTCCGAGAGCAGGCCTCAGTCGGCAGACCAGCATAG  740

Query  741  CACTCATCGCATGAGGACAGAGACCAAAGCAGCCAAGACCCTGTGCATCATCATGGGTTGCTTCTGCCTCTGCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CACTCATCGCATGAGGACAGAGACCAAAGCAGCCAAGACCCTGTGCATCATCATGGGTTGCTTCTGCCTCTGCT  814

Query  815  GGGCACCATTCTTTGTCACCAATATTGTGGATCCTTTCATAGACTACACTGTCCCTGGGCAGGTGTGGACTGCT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGGCACCATTCTTTGTCACCAATATTGTGGATCCTTTCATAGACTACACTGTCCCTGGGCAGGTGTGGACTGCT  888

Query  889  TTCCTCTGGCTCGGCTATATCAATTCCGGGTTGAACCCTTTTCTCTACGCCTTCTTGAATAAGTCTTTTAGACG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTCCTCTGGCTCGGCTATATCAATTCCGGGTTGAACCCTTTTCTCTACGCCTTCTTGAATAAGTCTTTTAGACG  962

Query  963  TGCCTTCCTCATCATCCTCTGCTGTGATGATGAGCGCTACCGAAGACCTTCCATTCTGGGCCAGACTGTCCCTT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGCCTTCCTCATCATCCTCTGCTGTGATGATGAGCGCTACCGAAGACCTTCCATTCTGGGCCAGACTGTCCCTT  1036

Query 1037  GTTCAACCACAACCATTAATGGATCCACACATGTACTAAGGGA--------TGCAGTGGAGTGTGGTGGCCAGT  1102
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|        ||||               ||| 
Sbjct 1037  GTTCAACCACAACCATTAATGGATCCACACATGTACTAAGGTACACCGTTCTGCA---------------CAG-  1094

Query 1103  GGGAGAGTCAGTGTC----ACCCGCCAGCAACTTCTCCTTTGGTGGCTGCTCAGCCCAGTGACACT--------  1164
            ||||.| |||   ||    ||.||  ||.||||                    |||||...|||.|        
Sbjct 1095  GGGACA-TCA---TCAGGAACTCG--AGAAACT--------------------GCCCATACACAATGACCCAGA  1142

Query 1165  -------------------  1164
                               
Sbjct 1143  ATCCCTGGAATCATGCTTC  1161