Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488893
• Subject: NM_001286410.1
• Aligned Length: 1254
• Identities: 1128
• Gaps: 111

Alignment

Query    1  ATGGACAAACTTGATGCTAATGTGAGTTCTGAGGAGGGTTTCGGGTCAGTGGAGAAGGTGGTGCTGCTCACGTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACAAACTTGATGCTAATGTGAGTTCTGAGGAGGGTTTCGGGTCAGTGGAGAAGGTGGTGCTGCTCACGTT  74

Query   75  TCTCTCGACGGTTATCCTGATGGCCATCTTGGGGAACCTGCTGGTGATGGTGGCTGTGTGCTGGGACAGGCAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCTCTCGACGGTTATCCTGATGGCCATCTTGGGGAACCTGCTGGTGATGGTGGCTGTGTGCTGGGACAGGCAGC  148

Query  149  TCAGGAAAATAAAAACAAATTATTTCATTGTATCTCTTGCTTTTGCGGATCTGCTGGTTTCGGTGCTGGTGATG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCAGGAAAATAAAAACAAATTATTTCATTGTATCTCTTGCTTTTGCGGATCTGCTGGTTTCGGTGCTGGTGATG  222

Query  223  CCCTTTGGTGCCATTGAGCTGGTTCAAGACATCTGGATTTATGGGGAGGTGTTTTGTCTTGTTCGGACATCTCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCCTTTGGTGCCATTGAGCTGGTTCAAGACATCTGGATTTATGGGGAGGTGTTTTGTCTTGTTCGGACATCTCT  296

Query  297  GGACGTCCTGCTCACAACGGCATCGATTTTTCACCTGTGCTGCATTTCTCTGGATAGGTATTACGCCATCTGCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGACGTCCTGCTCACAACGGCATCGATTTTTCACCTGTGCTGCATTTCTCTGGATAGGTATTACGCCATCTGCT  370

Query  371  GCCAGCCTTTGGTCTATAGGAACAAGATGACCCCTCTGCGCATCGCATTAATGCTGGGAGGCTGCTGGGTCATC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCCAGCCTTTGGTCTATAGGAACAAGATGACCCCTCTGCGCATCGCATTAATGCTGGGAGGCTGCTGGGTCATC  444

Query  445  CCCACGTTTATTTCTTTTCTCCCTATAATGCAAGGCTGGAATAACATTGGCATAATTGATTTGATAGAAAAGAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCCACGTTTATTTCTTTTCTCCCTATAATGCAAGGCTGGAATAACATTGGCATAATTGATTTGATAGAAAAGAG  518

Query  519  GAAGTTCAACCAGAACTCTAACTCTACGTACTGTGTCTTCATGGTCAACAAGCCCTACGCCATCACCTGCTCTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAAGTTCAACCAGAACTCTAACTCTACGTACTGTGTCTTCATGGTCAACAAGCCCTACGCCATCACCTGCTCTG  592

Query  593  TGGTGGCCTTCTACATCCCATTTCTCCTCATGGTGCTGGCCTATTACCGCATCTATGTCACAGCTAAGGAGCAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGTGGCCTTCTACATCCCATTTCTCCTCATGGTGCTGGCCTATTACCGCATCTATGTCACAGCTAAGGAGCAT  666

Query  667  GCCCATCAGATCCAGATGTTACAACGGGCAGGAGCCTCCTCCGAGAGCAGGCCTCAGTCGGCAGACCAGCATAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCCCATCAGATCCAGATGTTACAACGGGCAGGAGCCTCCTCCGAGAGCAGGCCTCAGTCGGCAGACCAGCATAG  740

Query  741  CACTCATCGCATGAGGACAGAGACCAAAGCAGCCAAGACCCTGTGCATCATCATGGGTTGCTTCTGCCTCTGCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CACTCATCGCATGAGGACAGAGACCAAAGCAGCCAAGACCCTGTGCATCATCATGGGTTGCTTCTGCCTCTGCT  814

Query  815  GGGCACCATTCTTTGTCACCAATATTGTGGATCCTTTCATAGACTACACTGTCCCTGGGCAGGTGTGGACTGCT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGGCACCATTCTTTGTCACCAATATTGTGGATCCTTTCATAGACTACACTGTCCCTGGGCAGGTGTGGACTGCT  888

Query  889  TTCCTCTGGCTCGGCTATATCAATTCCGGGTTGAACCCTTTTCTCTACGCCTTCTTGAATAAGTCTTTTAGACG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTCCTCTGGCTCGGCTATATCAATTCCGGGTTGAACCCTTTTCTCTACGCCTTCTTGAATAAGTCTTTTAGACG  962

Query  963  TGCCTTCCTCATCATCCTCTGCTGTGATGATGAGCGCTACCGAAGACCTTCCATTCTGGGCCAGACTGTCCCTT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGCCTTCCTCATCATCCTCTGCTGTGATGATGAGCGCTACCGAAGACCTTCCATTCTGGGCCAGACTGTCCCTT  1036

Query 1037  GTTCAACCACAACCATTAATGGATCCACACATGTACTAAG----GGA--TG-------CAGTGGAG----TGTG  1093
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||  ||       ||| |.||    |.||
Sbjct 1037  GTTCAACCACAACCATTAATGGATCCACACATGTACTAAGTTCTGGAACTGAAACCGACAG-GAAGAAACTTTG  1109

Query 1094  GTGGCCAGT--GGGAGAGTCAG--TGTC---ACCCGCCAGCAACTTCTCCTTTGGTG-----------------  1143
            |     |.|  ||.|||| .||  ||.|   |||..|||  ||            ||                 
Sbjct 1110  G-----AATAAGGAAGAG-AAGATTGACCAAACCATCCA--AA------------TGCCAAAAAGAAAAAGAAA  1163

Query 1144  -------GCTGCTCAGCCCAGTG-ACACT-----------------------------------------  1164
                   ||..|||.|.||..|| |.|||                                         
Sbjct 1164  AAAAAAAGCCTCTCTGTCCTATGAAGACTTAATTCTGTTGGGGAGAAAGTCATGTTTTAGGGAAGGAAAA  1233