Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488893
• Subject: XM_006525680.3
• Aligned Length: 1192
• Identities: 1021
• Gaps: 59

Alignment

Query    1  ATGGACAAACTTGATGCTAATGTGAGTTCTGAGGAGGGTTTCGGGTCAGTGGAGAAGGTGGTGCTGCTCACGTT  74
            |||||||||||||||||||||||||||||..|.|||||||||.||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACAAACTTGATGCTAATGTGAGTTCCAACGAGGGTTTCAGGTCCGTGGAGAAGGTCGTGCTGCTCACGTT  74

Query   75  TCTCTCGACGGTTATCCTGATGGCCATCTTGGGGAACCTGCTGGTGATGGTGGCTGTGTGCTGGGACAGGCAGC  148
            .||..|...||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct   75  CCTTGCAGTGGTTATCCTGATGGCCATCTTGGGCAACCTGCTGGTGATGGTGGCTGTGTGCAGGGACAGGCAGC  148

Query  149  TCAGGAAAATAAAAACAAATTATTTCATTGTATCTCTTGCTTTTGCGGATCTGCTGGTTTCGGTGCTGGTGATG  222
            ||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCAGGAAAATAAAAACCAACTATTTCATTGTGTCTCTCGCCTTTGCTGACCTGCTGGTTTCGGTGCTGGTGATG  222

Query  223  CCCTTTGGTGCCATTGAGCTGGTTCAAGACATCTGGATTTATGGGGAGGTGTTTTGTCTTGTTCGGACATCTCT  296
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||..||||||||||.||||.||.||.||.|||||.|||||
Sbjct  223  CCCTTTGGTGCCATTGAGCTGGTCCAAGACATCTGGGCTTATGGGGAGATGTTCTGCCTGGTCCGGACCTCTCT  296

Query  297  GGACGTCCTGCTCACAACGGCATCGATTTTTCACCTGTGCTGCATTTCTCTGGATAGGTATTACGCCATCTGCT  370
            |||.|||||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGATGTCCTACTTACCACAGCATCGATCTTTCACCTGTGCTGTATTTCCCTGGACAGGTATTACGCCATCTGCT  370

Query  371  GCCAGCCTTTGGTCTATAGGAACAAGATGACCCCTCTGCGCATCGCATTAATGCTGGGAGGCTGCTGGGTCATC  444
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||.|.
Sbjct  371  GCCAGCCTTTGGTTTATAGGAACAAGATGACCCCTCTACGCATCGCATTAATGTTGGGAGGCTGCTGGGTCCTT  444

Query  445  CCCACGTTTATTTCTTTTCTCCCTATAATGCAAGGCTGGAATAACATTGGCATAATTGATTTGATAGAAAAGAG  518
            ||||.||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||.|||||.|||||||.||.||
Sbjct  445  CCCATGTTTATATCTTTTCTCCCCATAATGCAAGGCTGGAACAACATCGGCATAGTTGATGTGATAGAGAAAAG  518

Query  519  GAAGTTCAACCAGAACTCTAACTCTACGTACTGTGTCTTCATGGTCAACAAGCCCTACGCCATCACCTGCTCTG  592
            |||.||||.|||.|||||||||||.||||..||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct  519  GAAATTCAGCCACAACTCTAACTCCACGTGGTGTGTCTTCATGGTCAACAAGCCCTATGCTATCACCTGCTCTG  592

Query  593  TGGTGGCCTTCTACATCCCATTTCTCCTCATGGTGCTGGCCTATTACCGCATCTATGTCACAGCTAAGGAGCAT  666
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct  593  TGGTGGCCTTCTACATCCCGTTTCTCCTCATGGTGCTGGCCTATTACCGAATCTATGTCACTGCTAAGGAGCAT  666

Query  667  GCCCATCAGATCCAGATGTTACAACGGGCAGGAGCCTCCTCCGAGAGCAGGCCTCAGTCGGCAGACCAGCATAG  740
            |||||.|||||.||||||||||||||||||||||||.||||.||.||||||||.|||.|.||.||||||||.||
Sbjct  667  GCCCAGCAGATACAGATGTTACAACGGGCAGGAGCCACCTCTGAAAGCAGGCCCCAGCCAGCTGACCAGCACAG  740

Query  741  CACTCATCGCATGAGGACAGAGACCAAAGCAGCCAAGACCCTGTGCATCATCATGGGTTGCTTCTGCCTCTGCT  814
            |||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||..|.||..||||||||||.||||||||..||||||
Sbjct  741  CACACATCGCATGAGGACAGAGACCAAGGCAGCCAAGACTTTATGTGTCATCATGGGCTGCTTCTGTTTCTGCT  814

Query  815  GGGCACCATTCTTTGTCACCAATATTGTGGATCCTTTCATAGACTACACTGTCCCTGGGCAGGTGTGGACTGCT  888
            ||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||
Sbjct  815  GGGCCCCCTTCTTTGTCACCAATATTGTGGACCCTTTCATAGACTACACTGTCCCCGAGCAGGTGTGGACTGCT  888

Query  889  TTCCTCTGGCTCGGCTATATCAATTCCGGGTTGAACCCTTTTCTCTACGCCTTCTTGAATAAGTCTTTTAGACG  962
            |||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  889  TTCCTCTGGCTTGGCTATATCAATTCGGGGTTGAACCCTTTTCTCTATGCCTTCTTGAATAAGTCTTTCAGACG  962

Query  963  TGCCTTCCTCATCATCCTCTGCTGTGATGATGAGCGCTACCGAAGACCTTCCATTCTGGGCCAGACTGTCCCTT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||..||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  963  TGCCTTCCTCATCATCCTCTGCTGTGATGATGAGCGCTACAAAAGACCCCCCATTCTGGGCCAGACTGTCCCCT  1036

Query 1037  GTTCAACCACAACCATTAATGGATCCACACATGTACTAAGGGATGCAGTGGAGTGTG----GTGGCCAGTGGGA  1106
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||.||||    |.||    |||||||      
Sbjct 1037  GTTCAACCACAACCATTAATGGATCCACCCATGTACTAAGGTATACAGT----TTTGCACAGTGGCCA------  1100

Query 1107  GAGTCAGTGTCACCCGCCAGCAACTTCTCCTTTGGTG--GCTGCTCA-GCCCAGTGACACT-------------  1164
               |||          ||||.|||        |||.|  ..|||.|| .|.||.||||.|.             
Sbjct 1101  ---TCA----------CCAGGAAC--------TGGAGAAATTGCCCATACACAATGACCCGGAGTCTCTGGAAT  1153

Query 1165  --------  1164
                    
Sbjct 1154  CATGCTTT  1161