Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000488893
- Subject:
- XM_011246848.2
- Aligned Length:
- 1166
- Identities:
- 1000
- Gaps:
- 64
Alignment
Query 1 ATGGACAAACTTGATGCTAATGTGAGTTCTGAGGAGGGTTTCGGGTCAGTGGAGAAGGTGGTGCTGCTCACGTT 74
|||||||||||||||||||||||||||||..|.|||||||||.||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGACAAACTTGATGCTAATGTGAGTTCCAACGAGGGTTTCAGGTCCGTGGAGAAGGTCGTGCTGCTCACGTT 74
Query 75 TCTCTCGACGGTTATCCTGATGGCCATCTTGGGGAACCTGCTGGTGATGGTGGCTGTGTGCTGGGACAGGCAGC 148
.||..|...||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 75 CCTTGCAGTGGTTATCCTGATGGCCATCTTGGGCAACCTGCTGGTGATGGTGGCTGTGTGCAGGGACAGGCAGC 148
Query 149 TCAGGAAAATAAAAACAAATTATTTCATTGTATCTCTTGCTTTTGCGGATCTGCTGGTTTCGGTGCTGGTGATG 222
||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCAGGAAAATAAAAACCAACTATTTCATTGTGTCTCTCGCCTTTGCTGACCTGCTGGTTTCGGTGCTGGTGATG 222
Query 223 CCCTTTGGTGCCATTGAGCTGGTTCAAGACATCTGGATTTATGGGGAGGTGTTTTGTCTTGTTCGGACATCTCT 296
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||..||||||||||.||||.||.||.||.|||||.|||||
Sbjct 223 CCCTTTGGTGCCATTGAGCTGGTCCAAGACATCTGGGCTTATGGGGAGATGTTCTGCCTGGTCCGGACCTCTCT 296
Query 297 GGACGTCCTGCTCACAACGGCATCGATTTTTCACCTGTGCTGCATTTCTCTGGATAGGTATTACGCCATCTGCT 370
|||.|||||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGATGTCCTACTTACCACAGCATCGATCTTTCACCTGTGCTGTATTTCCCTGGACAGGTATTACGCCATCTGCT 370
Query 371 GCCAGCCTTTGGTCTATAGGAACAAGATGACCCCTCTGCGCATCGCATTAATGCTGGGAGGCTGCTGGGTCATC 444
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||.|.
Sbjct 371 GCCAGCCTTTGGTTTATAGGAACAAGATGACCCCTCTACGCATCGCATTAATGTTGGGAGGCTGCTGGGTCCTT 444
Query 445 CCCACGTTTATTTCTTTTCTCCCTATAATGCAAGGCTGGAATAACATTGGCATAATTGATTTGATAGAAAAGAG 518
||||.||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||.|||||.|||||||.||.||
Sbjct 445 CCCATGTTTATATCTTTTCTCCCCATAATGCAAGGCTGGAACAACATCGGCATAGTTGATGTGATAGAGAAAAG 518
Query 519 GAAGTTCAACCAGAACTCTAACTCTACGTACTGTGTCTTCATGGTCAACAAGCCCTACGCCATCACCTGCTCTG 592
|||.||||.|||.|||||||||||.||||..||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 519 GAAATTCAGCCACAACTCTAACTCCACGTGGTGTGTCTTCATGGTCAACAAGCCCTATGCTATCACCTGCTCTG 592
Query 593 TGGTGGCCTTCTACATCCCATTTCTCCTCATGGTGCTGGCCTATTACCGCATCTATGTCACAGCTAAGGAGCAT 666
|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 593 TGGTGGCCTTCTACATCCCGTTTCTCCTCATGGTGCTGGCCTATTACCGAATCTATGTCACTGCTAAGGAGCAT 666
Query 667 GCCCATCAGATCCAGATGTTACAACGGGCAGGAGCCTCCTCCGAGAGCAGGCCTCAGTCGGCAGACCAGCATAG 740
|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||.||||.||.||||||||.|||.|.||.||||||||.||
Sbjct 667 GCCCAGCAGATACAGATGTTACAACGGGCAGGAGCCACCTCTGAAAGCAGGCCCCAGCCAGCTGACCAGCACAG 740
Query 741 CACTCATCGCATGAGGACAGAGACCAAAGCAGCCAAGACCCTGTGCATCATCATGGGTTGCTTCTGCCTCTGCT 814
|||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||..|.||..||||||||||.||||||||..||||||
Sbjct 741 CACACATCGCATGAGGACAGAGACCAAGGCAGCCAAGACTTTATGTGTCATCATGGGCTGCTTCTGTTTCTGCT 814
Query 815 GGGCACCATTCTTTGTCACCAATATTGTGGATCCTTTCATAGACTACACTGTCCCTGGGCAGGTGTGGACTGCT 888
||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||
Sbjct 815 GGGCCCCCTTCTTTGTCACCAATATTGTGGACCCTTTCATAGACTACACTGTCCCCGAGCAGGTGTGGACTGCT 888
Query 889 TTCCTCTGGCTCGGCTATATCAATTCCGGGTTGAACCCTTTTCTCTACGCCTTCTTGAATAAGTCTTTTAGACG 962
|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 889 TTCCTCTGGCTTGGCTATATCAATTCGGGGTTGAACCCTTTTCTCTATGCCTTCTTGAATAAGTCTTTCAGACG 962
Query 963 TGCCTTCCTCATCATCCTCTGCTGTGATGATGAGCGCTACCGAAGACCTTCCATTCTGGGCCAGACTGTCCCTT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||..||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 963 TGCCTTCCTCATCATCCTCTGCTGTGATGATGAGCGCTACAAAAGACCCCCCATTCTGGGCCAGACTGTCCCCT 1036
Query 1037 GTTCAACCACAACCATTAATGGATCCACACATGTACTAAGGGATGCAGTGGAGTGTGGTGGCCAGTGGGAGAGT 1110
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|.|| ||| |||| |
Sbjct 1037 GTTCAACCACAACCATTAATGGATCCACCCATGTACTAAGAGCTG--GTG----------------GGGA---T 1089
Query 1111 CAGT--GTCACCCGCCAGCAACTTCTCCTTTGGTGGCTGCTCAGCCCAGTGACACT 1164
|||| ||.||| |||
Sbjct 1090 CAGTTGGTAACC--CCA--------------------------------------- 1104