Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000488897
- Subject:
- XM_017003582.1
- Aligned Length:
- 3969
- Identities:
- 3302
- Gaps:
- 666
Alignment
Query 1 ATGAAGCCGGCGACAGGACTTTGGGTCTGGGTGAGCCTTCTCGTGGCGGCGGGGACCGTCCAGCCCAGCGATTC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TCAGTCAGTGTGTGCAGGAACGGAGAATAAACTGAGCTCTCTCTCTGACCTGGAACAGCAGTACCGAGCCTTGC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GCAAGTACTATGAAAACTGTGAGGTTGTCATGGGCAACCTGGAGATAACCAGCATTGAGCACAACCGGGACCTC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 TCCTTCCTGCGGTCTGTTCGAGAAGTCACAGGCTACGTGTTAGTGGCTCTTAATCAGTTTCGTTACCTGCCTCT 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 GGAGAATTTACGCATTATTCGTGGGACAAAACTTTATGAGGATCGATATGCCTTGGCAATATTTTTAAACTACA 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 GAAAAGATGGAAACTTTGGACTTCAAGAACTTGGATTAAAGAACTTGACAGAAATCCTAAATGGTGGAGTCTAT 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 GTAGACCAGAACAAATTCCTTTGTTATGCAGACACCATTCATTGGCAAGATATTGTTCGGAACCCATGGCCTTC 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 CAACTTGACTCTTGTGTCAACAAATGGTAGTTCAGGATGTGGACGTTGCCATAAGTCCTGTACTGGCCGTTGCT 592
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 593 GGGGACCCACAGAAAATCATTGCCAGACTTTGACAAGGACGGTGTGTGCAGAACAATGTGACGGCAGATGCTAC 666
.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -----------------------------ATGACAAGGACGGTGTGTGCAGAACAATGTGACGGCAGATGCTAC 45
Query 667 GGACCTTACGTCAGTGACTGCTGCCATCGAGAATGTGCTGGAGGCTGCTCAGGACCTAAGGACACAGACTGCTT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 46 GGACCTTACGTCAGTGACTGCTGCCATCGAGAATGTGCTGGAGGCTGCTCAGGACCTAAGGACACAGACTGCTT 119
Query 741 TGCCTGCATGAATTTCAATGACAGTGGAGCATGTGTTACTCAGTGTCCCCAAACCTTTGTCTACAATCCAACCA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 120 TGCCTGCATGAATTTCAATGACAGTGGAGCATGTGTTACTCAGTGTCCCCAAACCTTTGTCTACAATCCAACCA 193
Query 815 CCTTTCAACTGGAGCACAATTTCAATGCAAAGTACACATATGGAGCATTCTGTGTCAAGAAATGTCCACATAAC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 194 CCTTTCAACTGGAGCACAATTTCAATGCAAAGTACACATATGGAGCATTCTGTGTCAAGAAATGTCCACATAAC 267
Query 889 TTTGTGGTAGATTCCAGTTCTTGTGTGCGTGCCTGCCCTAGTTCCAAGATGGAAGTAGAAGAAAATGGGATTAA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 268 TTTGTGGTAGATTCCAGTTCTTGTGTGCGTGCCTGCCCTAGTTCCAAGATGGAAGTAGAAGAAAATGGGATTAA 341
Query 963 AATGTGTAAACCTTGCACTGACATTTGCCCAAAAGCTTGTGATGGCATTGGCACAGGATCATTGATGTCAGCTC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 342 AATGTGTAAACCTTGCACTGACATTTGCCCAAAAGCTTGTGATGGCATTGGCACAGGATCATTGATGTCAGCTC 415
Query 1037 AGACTGTGGATTCCAGTAACATTGACAAATTCATAAACTGTACCAAGATCAATGGGAATTTGATCTTTCTAGTC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 416 AGACTGTGGATTCCAGTAACATTGACAAATTCATAAACTGTACCAAGATCAATGGGAATTTGATCTTTCTAGTC 489
Query 1111 ACTGGTATTCATGGGGACCCTTACAATGCAATTGAAGCCATAGACCCAGAGAAACTGAACGTCTTTCGGACAGT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 490 ACTGGTATTCATGGGGACCCTTACAATGCAATTGAAGCCATAGACCCAGAGAAACTGAACGTCTTTCGGACAGT 563
Query 1185 CAGAGAGATAACAGGTTTCCTGAACATACAGTCATGGCCACCAAACATGACTGACTTCAGTGTTTTTTCTAACC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 564 CAGAGAGATAACAGGTTTCCTGAACATACAGTCATGGCCACCAAACATGACTGACTTCAGTGTTTTTTCTAACC 637
Query 1259 TGGTGACCATTGGTGGAAGAGTACTCTATAGTGGCCTGTCCTTGCTTATCCTCAAGCAACAGGGCATCACCTCT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 638 TGGTGACCATTGGTGGAAGAGTACTCTATAGTGGCCTGTCCTTGCTTATCCTCAAGCAACAGGGCATCACCTCT 711
Query 1333 CTACAGTTCCAGTCCCTGAAGGAAATCAGCGCAGGAAACATCTATATTACTGACAACAGCAACCTGTGTTATTA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 712 CTACAGTTCCAGTCCCTGAAGGAAATCAGCGCAGGAAACATCTATATTACTGACAACAGCAACCTGTGTTATTA 785
Query 1407 TCATACCATTAACTGGACAACACTCTTCAGCACAATCAACCAGAGAATAGTAATCCGGGACAACAGAAAAGCTG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 786 TCATACCATTAACTGGACAACACTCTTCAGCACAATCAACCAGAGAATAGTAATCCGGGACAACAGAAAAGCTG 859
Query 1481 AAAATTGTACTGCTGAAGGAATGGTGTGCAACCATCTGTGTTCCAGTGATGGCTGTTGGGGACCTGGGCCAGAC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 860 AAAATTGTACTGCTGAAGGAATGGTGTGCAACCATCTGTGTTCCAGTGATGGCTGTTGGGGACCTGGGCCAGAC 933
Query 1555 CAATGTCTGTCGTGTCGCCGCTTCAGTAGAGGAAGGATCTGCATAGAGTCTTGTAACCTCTATGATGGTGAATT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 934 CAATGTCTGTCGTGTCGCCGCTTCAGTAGAGGAAGGATCTGCATAGAGTCTTGTAACCTCTATGATGGTGAATT 1007
Query 1629 TCGGGAGTTTGAGAATGGCTCCATCTGTGTGGAGTGTGACCCCCAGTGTGAGAAGATGGAAGATGGCCTCCTCA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1008 TCGGGAGTTTGAGAATGGCTCCATCTGTGTGGAGTGTGACCCCCAGTGTGAGAAGATGGAAGATGGCCTCCTCA 1081
Query 1703 CATGCCATGGACCGGGTCCTGACAACTGTACAAAGTGCTCTCATTTTAAAGATGGCCCAAACTGTGTGGAAAAA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1082 CATGCCATGGACCGGGTCCTGACAACTGTACAAAGTGCTCTCATTTTAAAGATGGCCCAAACTGTGTGGAAAAA 1155
Query 1777 TGTCCAGATGGCTTACAGGGGGCAAACAGTTTCATTTTCAAGTATGCTGATCCAGATCGGGAGTGCCACCCATG 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1156 TGTCCAGATGGCTTACAGGGGGCAAACAGTTTCATTTTCAAGTATGCTGATCCAGATCGGGAGTGCCACCCATG 1229
Query 1851 CCATCCAAACTGCACCCAAG---------------------------------------------GGTGTAACG 1879
|||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1230 CCATCCAAACTGCACCCAAGGGTGCATAGGCTCAAGTATTGAAGACTGCATCGGCCTGATGGATAGGTGTAACG 1303
Query 1880 GTCCCACTAGTCATGACTGCATTTACTACCCATGGACGGGCCATTCCACTTTACCACAACATGCTAGAACTCCC 1953
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1304 GTCCCACTAGTCATGACTGCATTTACTACCCATGGACGGGCCATTCCACTTTACCACAACATGCTAGAACTCCC 1377
Query 1954 CTGATTGCAGCTGGAGTAATTGGTGGGCTCTTCATTCTGGTCATTGTGGGTCTGACATTTGCTGTTTATGTTAG 2027
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1378 CTGATTGCAGCTGGAGTAATTGGTGGGCTCTTCATTCTGGTCATTGTGGGTCTGACATTTGCTGTTTATGTTAG 1451
Query 2028 AAGGAAGAGCATCAAAAAGAAAAGAGCCTTGAGAAGATTCTTGGAAACAGAGTTGGTGGAACCATTAACTCCCA 2101
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1452 AAGGAAGAGCATCAAAAAGAAAAGAGCCTTGAGAAGATTCTTGGAAACAGAGTTGGTGGAACCATTAACTCCCA 1525
Query 2102 GTGGCACAGCACCCAATCAAGCTCAACTTCGTATTTTGAAAGAAACTGAGCTGAAGAGGGTAAAAGTCCTTGGC 2175
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1526 GTGGCACAGCACCCAATCAAGCTCAACTTCGTATTTTGAAAGAAACTGAGCTGAAGAGGGTAAAAGTCCTTGGC 1599
Query 2176 TCAGGTGCTTTTGGAACGGTTTATAAAGGTATTTGGGTACCTGAAGGAGAAACTGTGAAGATTCCTGTGGCTAT 2249
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1600 TCAGGTGCTTTTGGAACGGTTTATAAAGGTATTTGGGTACCTGAAGGAGAAACTGTGAAGATTCCTGTGGCTAT 1673
Query 2250 TAAGATTCTTAATGAGACAACTGGTCCCAAGGCAAATGTGGAGTTCATGGATGAAGCTCTGATCATGGCAAGTA 2323
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1674 TAAGATTCTTAATGAGACAACTGGTCCCAAGGCAAATGTGGAGTTCATGGATGAAGCTCTGATCATGGCAAGTA 1747
Query 2324 TGGATCATCCACACCTAGTCCGGTTGCTGGGTGTGTGTCTGAGCCCAACCATCCAGCTGGTTACTCAACTTATG 2397
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1748 TGGATCATCCACACCTAGTCCGGTTGCTGGGTGTGTGTCTGAGCCCAACCATCCAGCTGGTTACTCAACTTATG 1821
Query 2398 CCCCATGGCTGCCTGTTGGAGTATGTCCACGAGCACAAGGATAACATTGGATCACAACTGCTGCTTAACTGGTG 2471
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1822 CCCCATGGCTGCCTGTTGGAGTATGTCCACGAGCACAAGGATAACATTGGATCACAACTGCTGCTTAACTGGTG 1895
Query 2472 TGTCCAGATAGCTAAGGGAATGATGTACCTGGAAGAAAGACGACTCGTTCATCGGGATTTGGCAGCCCGTAATG 2545
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1896 TGTCCAGATAGCTAAGGGAATGATGTACCTGGAAGAAAGACGACTCGTTCATCGGGATTTGGCAGCCCGTAATG 1969
Query 2546 TCTTAGTGAAATCTCCAAACCATGTGAAAATCACAGATTTTGGGCTAGCCAGACTCTTGGAAGGAGATGAAAAA 2619
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1970 TCTTAGTGAAATCTCCAAACCATGTGAAAATCACAGATTTTGGGCTAGCCAGACTCTTGGAAGGAGATGAAAAA 2043
Query 2620 GAGTACAATGCTGATGGAGGAAAGATGCCAATTAAATGGATGGCTCTGGAGTGTATACATTACAGGAAATTCAC 2693
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2044 GAGTACAATGCTGATGGAGGAAAGATGCCAATTAAATGGATGGCTCTGGAGTGTATACATTACAGGAAATTCAC 2117
Query 2694 CCATCAGAGTGACGTTTGGAGCTATGGAGTTACTATATGGGAACTGATGACCTTTGGAGGAAAACCCTATGATG 2767
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2118 CCATCAGAGTGACGTTTGGAGCTATGGAGTTACTATATGGGAACTGATGACCTTTGGAGGAAAACCCTATGATG 2191
Query 2768 GAATTCCAACGCGAGAAATCCCTGATTTATTAGAGAAAGGAGAACGTTTGCCTCAGCCTCCCATCTGCACTATT 2841
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2192 GAATTCCAACGCGAGAAATCCCTGATTTATTAGAGAAAGGAGAACGTTTGCCTCAGCCTCCCATCTGCACTATT 2265
Query 2842 GACGTTTACATGGTCATGGTCAAATGTTGGATGATTGATGCTGACAGTAGACCTAAATTTAAGGAACTGGCTGC 2915
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2266 GACGTTTACATGGTCATGGTCAAATGTTGGATGATTGATGCTGACAGTAGACCTAAATTTAAGGAACTGGCTGC 2339
Query 2916 TGAGTTTTCAAGGATGGCTCGAGACCCTCAAAGATACCTAGTTATTCAGGGTGATGATCGTATGAAGCTTCCCA 2989
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2340 TGAGTTTTCAAGGATGGCTCGAGACCCTCAAAGATACCTAGTTATTCAGGGTGATGATCGTATGAAGCTTCCCA 2413
Query 2990 GTCCAAATGACAGCAAGTTCTTTCAGAATCTCTTGGATGAAGAGGATTTGGAAGATATGATGGATGCTGAGGAG 3063
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2414 GTCCAAATGACAGCAAGTTCTTTCAGAATCTCTTGGATGAAGAGGATTTGGAAGATATGATGGATGCTGAGGAG 2487
Query 3064 TACTTGGTCCCTCAGGCTTTCAACATCCCACCTCCCATCTATACTTCCAGAGCAAGAATTGACTCGAATAGGAG 3137
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2488 TACTTGGTCCCTCAGGCTTTCAACATCCCACCTCCCATCTATACTTCCAGAGCAAGAATTGACTCGAATAGGAG 2561
Query 3138 TGAAATTGGACACAGCCCTCCTCCTGCCTACACCCCCATGTCAGGAAACCAGTTTGTATACCGAGATGGAGGTT 3211
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2562 TGAAATTGGACACAGCCCTCCTCCTGCCTACACCCCCATGTCAGGAAACCAGTTTGTATACCGAGATGGAGGTT 2635
Query 3212 TTGCTGCTGAACAAGGAGTGTCTGTGCCCTACAGAGCCCCAACTAGCACAATTCCAGAAGCTCCTGTGGCACAG 3285
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2636 TTGCTGCTGAACAAGGAGTGTCTGTGCCCTACAGAGCCCCAACTAGCACAATTCCAGAAGCTCCTGTGGCACAG 2709
Query 3286 GGTGCTACTGCTGAGATTTTTGATGACTCCTGCTGTAATGGCACCCTACGCAAGCCAGTGGCACCCCATGTCCA 3359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2710 GGTGCTACTGCTGAGATTTTTGATGACTCCTGCTGTAATGGCACCCTACGCAAGCCAGTGGCACCCCATGTCCA 2783
Query 3360 AGAGGACAGTAGCACCCAGAGGTACAGTGCTGACCCCACCGTGTTTGCCCCAGAACGGAGCCCACGAGGAGAGC 3433
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2784 AGAGGACAGTAGCACCCAGAGGTACAGTGCTGACCCCACCGTGTTTGCCCCAGAACGGAGCCCACGAGGAGAGC 2857
Query 3434 TGGATGAGGAAGGTTACATGACTCCTATGCGAGACAAACCCAAACAAGAATACCTGAATCCAGTGGAGGAGAAC 3507
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2858 TGGATGAGGAAGGTTACATGACTCCTATGCGAGACAAACCCAAACAAGAATACCTGAATCCAGTGGAGGAGAAC 2931
Query 3508 CCTTTTGTTTCTCGGAGAAAAAATGGAGACCTTCAAGCATTGGATAATCCCGAATATCACAATGCATCCAATGG 3581
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2932 CCTTTTGTTTCTCGGAGAAAAAATGGAGACCTTCAAGCATTGGATAATCCCGAATATCACAATGCATCCAATGG 3005
Query 3582 TCCACCCAAGGCCGAGGATGAGTATGTGAATGAGCCACTGTACCTCAACACCTTTGCCAACACCTTGGGAAAAG 3655
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3006 TCCACCCAAGGCCGAGGATGAGTATGTGAATGAGCCACTGTACCTCAACACCTTTGCCAACACCTTGGGAAAAG 3079
Query 3656 CTGAGTACCTGAAGAACAACATACTGTCAATGCCAGAGAAGGCCAAGAAAGCGTTTGACAACCCTGACTACTGG 3729
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3080 CTGAGTACCTGAAGAACAACATACTGTCAATGCCAGAGAAGGCCAAGAAAGCGTTTGACAACCCTGACTACTGG 3153
Query 3730 AACCACAGCCTGCCACCTCGGAGCACCCTTCAGCACCCAGACTACCTGCAGGAGTACAGCACAAAATATTTTTA 3803
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3154 AACCACAGCCTGCCACCTCGGAGCACCCTTCAGCACCCAGACTACCTGCAGGAGTACAGCACAAAATATTTTTA 3227
Query 3804 TAAACAGAATGGGCGGATCCGGCCTATTGTGGCAGAGAATCCTGAATACCTCTCTGAGTTCTCCCTGAAGCCAG 3877
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3228 TAAACAGAATGGGCGGATCCGGCCTATTGTGGCAGAGAATCCTGAATACCTCTCTGAGTTCTCCCTGAAGCCAG 3301
Query 3878 GCACTGTGCTGCCGCCTCCACCTTACAGACACCGGAATACTGTGGTG 3924
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3302 GCACTGTGCTGCCGCCTCCACCTTACAGACACCGGAATACTGTGGTG 3348