Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000488899
- Subject:
- XM_011249037.3
- Aligned Length:
- 1878
- Identities:
- 1663
- Gaps:
- 42
Alignment
Query 1 ATGGACGAACAGGAGGCATTGAACTCAATCATGAACGATCTGGTGGCCCTCCAGATGAACCGACGTCACCGGAT 74
|||||.||.|||||||||||||||||||.||||||...||||.|
Sbjct 1 ------------------------------ATGAAGGACCTGGTGGCCCTCCAGATGAGCCGACGAACCCGGTT 44
Query 75 GCCTGGATATGAGACCATGAAGAACAAAGACACAGGTCACTCAAATAGGCAGAGTGACGTCAGAATCAAGTTCG 148
|.||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 45 GTCTGGATATGAGACCATGAAGAATAAGGACACAGGTCACCCAAACAGGCAGAGTGACGTCAGAATCAAGTTTG 118
Query 149 AGCACAACGGGGAGAGGCGAATTATAGCGTTCAGCCGGCCTGTGAAATATGAAGATGTGGAGCACAAGGTGACA 222
|.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 119 AACACAATGGGGAGAGACGAATTATAGCATTCAGCCGGCCTGTGAGATACGAAGATGTGGAGCACAAGGTGACA 192
Query 223 ACAGTATTTGGACAACCTCTTGATCTACATTACATGAACAATGAGCTCTCCATCCTGCTGAAAAACCAAGATGA 296
|||||.|||||.||.|||||||||.|.|||||.|||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 193 ACAGTCTTTGGGCAGCCTCTTGATTTGCATTATATGAATAATGAGCTCTCCATCCTGTTGAAAAACCAAGATGA 266
Query 297 TCTTGATAAAGCAATTGACATTTTAGATAGAAGCTCAAGCATGAAAAGCCTTAGGATATTGCTGTTGTCCCAGG 370
|||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||.|.|||||.|||||.|
Sbjct 267 TCTCGATAAAGCCATTGACATTTTGGATAGAAGCTCAAGTATGAAAAGCCTTAGGATACTACTGTTATCCCAAG 340
Query 371 ACAGAAACCATAACAGTTCCTCTCCCCACTCTGGGGTGTCCAGACAGGTGCGGATCAAGGCTTCCCAGTCCGCA 444
||||||||||||..||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||.||||||||||.|||
Sbjct 341 ACAGAAACCATACTAGTTCCTCTCCCCACTCTGGAGTGTCCAGGCAGGTTCGGATCAAGCCTTCCCAGTCTGCA 414
Query 445 GGGGATATAAATACTATCTACCAGCCCCCCGAGCCCAGAAGCAGGCACCTCTCTGTCAGCTCCCAGAACCCTGG 518
||||||||||||||.||||||||..|.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 415 GGGGATATAAATACCATCTACCAAGCTCCTGAGCCCAGAAGCAGGCACCTGTCTGTCAGCTCCCAGAACCCTGG 488
Query 519 CCGAAGCTCACCTCCCCCTGGCTATGTTCCTGAGCGGCAGCAGCACATTGCCCGGCAGGGGTCCTACACCAGCA 592
|||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.||||
Sbjct 489 CCGAAGCTCTCCTCCCCCGGGATATGTACCTGAGCGACAACAGCACATTGCCCGGCAAGGATCCTATACGAGCA 562
Query 593 TCAACAGTGAGGGGGAGTTCATCCCAGAGACCAGCGAGCAGTGCATGCTGGATCCCCTGAGCAGTGCAGAAAAT 666
|||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 563 TCAACAGCGAAGGTGAATTCATCCCAGAGACCAGCGAACAGTGTATGCTAGATCCCCTCAGCAGTGCCGAAAAT 636
Query 667 TCCTTGTCTGGAAGCTGCCAATCCTTG------------GACAGCCCATCCTTCCGGAAATCACGAATGTCCCG 728
||||||||.|||||||||||||||||| |||||||||||||||.|||||||||.|||||||||
Sbjct 637 TCCTTGTCAGGAAGCTGCCAATCCTTGGACAGGTCAGCAGACAGCCCATCCTTCAGGAAATCACAAATGTCCCG 710
Query 729 TGCCCAGAGCTTCCCTGACAACAGACAGGAATACTCAGATCGGGAAACTCAGCTTTATGACAAAGGGGTCAAAG 802
.||||.|||||||||.|||||||||.||||||.||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct 711 AGCCCGGAGCTTCCCAGACAACAGAAAGGAATGCTCAGATCGGGAGACCCAGCTCTATGATAAAGGTGTCAAAG 784
Query 803 GTGGAACCTACCCCCGGCGCTACCACGTGTCTGTGCACCACAAGGACTACAGTGATGGCAGAAGAACATTTCCC 876
||||||||||.|||.||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 785 GTGGAACCTATCCCAGGCGCTACCATGTGTCTGTGCATCACAAAGACTACAATGATGGCAGAAGAACATTTCCC 858
Query 877 CGAATACGGCGTCATCAAGGCAACTTGTTCACCCTGGTGCCCTCCAGCCGCTCCCTGAGCACAAATGGCGAGAA 950
||||||||.||.||||||||||||.|.|||||.|||||||||||.||.||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 859 CGAATACGACGGCATCAAGGCAACCTATTCACTCTGGTGCCCTCAAGTCGCTCCTTGAGCACAAATGGCGAGAA 932
Query 951 CATGGGTCTGGCTGTGCAATACCTGGACCCCCGTGGGCGCCTGCGGAGTGCGGACAGCGAGAATGCCCTCTCTG 1024
|||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||.|||
Sbjct 933 CATGGGTGTAGCTGTGCAATACCTGGACCCCCGTGGGCGCCTACGGAGTGCAGACAGTGAGAATGCCCTCACTG 1006
Query 1025 TGCAGGAGAGGAATGTGCCAACCAAGTCTCCCAGTGCCCCCATCAACTGGCGCCGGGGAAAGCTCCTGGGCCAG 1098
|||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.
Sbjct 1007 TGCAGGAAAGGAATGTGCCAACCAAATCTCCTAGTGCTCCCATCAATTGGCGTCGGGGGAAGCTCCTGGGTCAA 1080
Query 1099 GGTGCCTTCGGCAGGGTCTATTTGTGCTATGACGTGGACACGGGACGTGAACTTGCTTCCAAGCAGGTCCAATT 1172
||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1081 GGTGCCTTCGGCAGGGTCTACTTGTGCTATGATGTGGACACAGGACGTGAACTTGCTTCTAAGCAGGTCCAGTT 1154
Query 1173 TGATCCAGACAGTCCTGAGACAAGCAAGGAGGTGAGTGCTCTGGAGTGCGAGATCCAGTTGCTAAAGAACTTGC 1246
|||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||.|||
Sbjct 1155 TGACCCAGATAGTCCTGAGACAAGCAAGGAGGTGAGTGCTCTGGAGTGTGAGATCCAGTTGCTGAAGAACCTGC 1228
Query 1247 AGCATGAGCGCATCGTGCAGTACTATGGCTGTCTGCGGGACCGCGCTGAGAAGACCCTGACCATCTTCATGGAG 1320
|||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||.|||.||||||||.||||||
Sbjct 1229 AGCATGAGCGCATTGTGCAGTACTACGGCTGCCTGCGGGACCGTGCTGAGAAGATCCTCACCATCTTTATGGAG 1302
Query 1321 TACATGCCAGGGGGCTCGGTGAAAGACCAGTTGAAGGCTTACGGTGCTCTGACAGAGAGCGTGACCCGAAAGTA 1394
||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 1303 TATATGCCAGGGGGCTCTGTAAAAGACCAGTTGAAGGCCTACGGAGCTCTGACAGAGAGTGTGACCCGCAAGTA 1376
Query 1395 CACGCGGCAGATCCTGGAGGGCATGTCCTACCTGCACAGCAACATGATTGTTCACCGGGACATTAAGGGAGCCA 1468
|||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1377 CACCCGGCAGATTCTGGAGGGCATGTCATACCTGCACAGCAACATGATTGTGCATCGGGACATCAAGGGAGCCA 1450
Query 1469 ACATCCTCCGAGACTCTGCTGGGAATGTAAAGCTGGGGGACTTTGGGGCCAGCAAACGCCTGCAGACGATCTGT 1542
|.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.
Sbjct 1451 ATATCCTCCGAGACTCAGCTGGGAATGTGAAGCTTGGGGATTTTGGGGCCAGCAAACGCCTACAGACCATCTGC 1524
Query 1543 ATGTCGGGGACGGGCATGCGCTCCGTCACTGGCACACCCTACTGGATGAGCCCTGAGGTGATCAGCGGCGAGGG 1616
|||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||
Sbjct 1525 ATGTCAGGGACAGGCATTCGCTCTGTCACTGGCACACCCTACTGGATGAGTCCTGAAGTCATCAGTGGCGAGGG 1598
Query 1617 CTATGGAAGGAAAGCAGACGTGTGGAGCCTGGGCTGCACTGTGGTGGAGATGCTGACAGAGAAACCACCGTGGG 1690
|||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1599 CTATGGAAGAAAGGCAGACGTGTGGAGCCTGGGCTGTACTGTGGTGGAAATGCTGACAGAGAAACCACCTTGGG 1672
Query 1691 CAGAGTATGAAGCTATGGCCGCCATCTTCAAGATTGCCACCCAGCCCACCAATCCTCAGCTGCCCTCCCACATC 1764
|||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1673 CAGAGTATGAAGCTATGGCTGCCATTTTCAAGATTGCCACCCAGCCTACCAATCCTCAGCTGCCCTCTCACATC 1746
Query 1765 TCTGAACATGGCCGGGACTTCCTGAGGCGCATTTTTGTGGAGGCTCGCCAGAGACCTTCAGCTGAGGAGCTGCT 1838
||.|||||.|||.|||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1747 TCAGAACACGGCAGGGACTTCCTGAGGCGCATATTTGTGGAAGCTCGTCAGAGACCCTCAGCTGAGGAGCTGCT 1820
Query 1839 CACACACCACTTTGCACAGCTCATGTAC 1866
|||||||||||||||||||||..|||||
Sbjct 1821 CACACACCACTTTGCACAGCTAGTGTAC 1848