Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488905
• Subject: NM_001013833.3
• Aligned Length: 2093
• Identities: 1795
• Gaps: 115

Alignment

Query    1  ATGGGC-------------ACCTTGCG-GGATTTACAGTACGCGCTC---CAGGAGAAGATCGAGGAGCTGAGG  57
            |||.||             ||.||||| .||||..||     .||||   .||||||.||||.|.||||||..|
Sbjct    1  ATGAGCGAACTGGAGGAAGACTTTGCGAAGATTCTCA-----TGCTCAAGGAGGAGAGGATCAAAGAGCTGGAG  69

Query   58  CAGCGGGATGCTCTCATCGACGAGCTGGAGCTGGAGTTGGATCAGAAGGACGAACTGATCCAGAAGCTGCAGAA  131
            .||||    |||.|||                          .|||||||.|||...||||||.|||||.|||.
Sbjct   70  AAGCG----GCTGTCA--------------------------GAGAAGGAGGAAGAAATCCAGGAGCTGAAGAG  113

Query  132  CGAGCTGGACAAGTACCGCTCGGTGAT-CCG--ACCAGCCACCCAGCAGGCGCAGAAGCAGAGCGCGAGCACCT  202
            ..|.||..||||.|.||..||||||.| |||  .||..|||||||                        ||.| 
Sbjct  114  GAAACTCCACAAATGCCAGTCGGTGCTGCCGGTGCCCTCCACCCA------------------------CATC-  162

Query  203  TGCAGGGCGAGCCGCGCACCAAGCG---GCAGGCGATCTCCGCCGAGCC-CACCG-CCTTCGACA------TCC  265
                 |||   |||||.||||..||   |||||..||||||||.||||| ||  | |||   |||      |||
Sbjct  163  -----GGC---CCGCGGACCACCCGGGCGCAGGGCATCTCCGCGGAGCCGCA--GACCT---ACAGGTCCTTCC  223

Query  266  AGGATCTCAGCCATGTGACCCTGCCCTTCTAC----CCCAAGAGCCCACAGTCCAAGGATCTTATAAAGGAAGC  335
            |.||.||..||||.|.|..||.|...||| ||    .||.||||      |||.||||||||.||||||||.||
Sbjct  224  ACGACCTGCGCCAGGCGTTCCGGAAGTTC-ACTAAATCCGAGAG------GTCGAAGGATCTCATAAAGGAGGC  290

Query  336  TATCCTTGACAATGACTTTATGAAGAACTTGGAGCTGTCGCAGATCCAGGAGATTGTGGATTGTATGTACCCGG  409
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  291  TATCCTTGACAATGACTTCATGAAGAACTTGGAGCTGTCACAGATCCAGGAGATTGTGGACTGTATGTACCCCG  364

Query  410  TGGAGTATGGCAAGGACAGTTGCATCATCAAAGAAGGAGACGTGGGGTCACTGGTGTATGTCATGGAAGATGGT  483
            ||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  365  TGGAATACGGCAAGGACAGCTGCATCATCAAGGAAGGCGATGTGGGGTCACTGGTGTACGTCATGGAAGATGGG  438

Query  484  AAGGTTGAAGTTACAAAAGAAGGTGTGAAGTTGTGTACCATGGGTCCAGGAAAAGTGTTTGGGGAATTGGCTAT  557
            |||||||||||.|||||||||||.||||||.|.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||..|||||||
Sbjct  439  AAGGTTGAAGTCACAAAAGAAGGCGTGAAGCTCTGCACCATGGGTCCTGGAAAAGTGTTCGGGGAGCTGGCTAT  512

Query  558  TCTTTACAACTGTACCCGGACAGCGACCGTCAAGACTCTTGTAAATGTAAAACTCTGGGCCATTGATCGACAAT  631
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  513  ACTTTACAACTGTACCCGGACAGCGACCGTCAAGACTCTTGTAAATGTGAAACTCTGGGCCATCGATCGACAAT  586

Query  632  GTTTTCAAACAATAATGATGAGGACAGGACTCATCAAGCATACCGAGTATATGGAATTTTTAAAAAGCGTTCCA  705
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct  587  GTTTTCAAACAATAATGATGAGGACAGGACTCATCAAGCATACCGAGTACATGGAATTTTTAAAAAGTGTTCCA  660

Query  706  ACATTCCAGAGCCTTCCTGAAGAGATCCTCAGCAAGCTTGCTGATGTCCTTGAAGAGACCCACTATGAAAATGG  779
            ||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  ACATTCCAGAGCCTTCCTGATGAAATCCTCAGCAAGCTGGCTGATGTCCTCGAAGAGACCCACTATGAAAATGG  734

Query  780  AGAATATATTATCAGGCAAGGTGCAAGAGGGGACACCTTCTTTATCATCAGCAAAGGAACGGTAAATGTCACTC  853
            |||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||...|||.|||||.||||
Sbjct  735  AGAATATATCATCAGGCAGGGTGCAAGAGGAGACACCTTCTTCATCATCAGTAAAGGGCAGGTGAATGTTACTC  808

Query  854  GTGAAGACTCACCGAGTGAAGACCCAGTCTTTCTTAGAACTTTAGGAAAAGGAGACTGGTTTGGAGAGAAAGCC  927
            |.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  809  GAGAAGACTCACCAAGTGAAGACCCAGTCTTCCTTAGAACTTTAGGGAAGGGAGATTGGTTTGGAGAGAAAGCG  882

Query  928  TTGCAGGGGGAAGATGTGAGAACAGCAAACGTAATTGCTGCAGAAGCTGTAACCTGCCTTGTGATTGACAGAGA  1001
            |||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  883  TTGCAGGGGGAGGATGTGAGAACAGCAAATGTTATTGCCGCAGAAGCTGTCACCTGCCTTGTGATTGACAGAGA  956

Query 1002  CTCTTTTAAACATTTGATTGGAGGGCTGGATGATGTTTCTAATAAAGCATATGAAGATGCAGAAGCTAAAGCAA  1075
            ||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct  957  CTCTTTCAAGCATTTGATTGGAGGACTGGACGATGTTTCTAACAAAGCATATGAGGACGCAGAAGCAAAAGCAA  1030

Query 1076  AATATGAAGCTGAAGCGGCTTTCTTCGCCAACCTGAAGCTGTCTGATTTCAACATCATTGATACCCTTGGAGTT  1149
            ||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1031  AATATGAAGCCGAAGCTGCCTTCTTCGCCAACCTGAAGCTGTCTGATTTCAACATCATTGACACCCTTGGAGTT  1104

Query 1150  GGAGGTTTCGGACGAGTAGAACTGGTCCAGTTGAAAAGTGAAGAATCCAAAACGTTTGCAATGAAGATTCTCAA  1223
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1105  GGAGGTTTCGGACGAGTAGAGCTGGTCCAGTTGAAAAGTGAAGAATCCAAAACATTTGCAATGAAGATCCTCAA  1178

Query 1224  GAAACGTCACATTGTGGACACAAGACAGCAGGAGCACATCCGCTCAGAGAAGCAGATCATGCAGGGGGCTCATT  1297
            ||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1179  GAAACGCCACATTGTGGACACCAGACAGCAGGAGCACATCCGCTCAGAGAAGCAGATCATGCAGGGGGCTCATT  1252

Query 1298  CCGATTTCATAGTGAGACTGTACAGAACATTTAAGGACAGCAAATATTTGTATATGTTGATGGAAGCTTGTCTA  1371
            |.||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.
Sbjct 1253  CTGACTTCATTGTGAGGCTGTACAGGACATTTAAAGACAGCAAATACTTGTATATGTTGATGGAAGCGTGCCTG  1326

Query 1372  GGTGGAGAGCTCTGGACCATTCTCAGGGATAGAGGTTCGTTTGAAGATTCTACAACCAGATTTTACACAGCATG  1445
            |||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 1327  GGTGGAGAGCTCTGGACTATTCTCAGGGATAGGGGTTCGTTTGAAGACTCAACAACCAGGTTTTACACTGCATG  1400

Query 1446  TGTGGTAGAAGCTTTTGCCTATCTGCATTCCAAAGGAATCATTTACAGGGACCTCAAGCCAGAAAATCTCATCC  1519
            ||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 1401  TGTGGTAGAAGCATTCGCCTATCTGCATTCCAAAGGAATCATTTACAGGGACCTCAAGCCGGAGAATCTCATCC  1474

Query 1520  TAGATCACCGAGGTTATGCCAAACTGGTTGATTTTGGCTTTGCAAAGAAAATAGGATTTGGAAAGAAAACATGG  1593
            |||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1475  TAGATCATCGAGGCTATGCCAAACTGGTTGACTTTGGCTTTGCAAAGAAAATAGGATTTGGAAAGAAAACATGG  1548

Query 1594  ACTTTTTGTGGGACTCCAGAGTATGTAGCCCCAGAGATCATCCTGAACAAAGGCCATGACATTTCAGCCGACTA  1667
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1549  ACTTTTTGTGGGACTCCAGAATATGTAGCCCCAGAGATCATCCTGAACAAAGGCCATGACATTTCAGCTGACTA  1622

Query 1668  CTGGTCACTGGGAATCCTAATGTATGAACTCCTGACTGGCAGCCCACCTTTCTCAGGCCCAGATCCTATGAAAA  1741
            |||||||||.|||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1623  CTGGTCACTAGGAATTCTGATGTATGAGCTTCTGACTGGCAGCCCACCTTTCTCAGGCCCAGATCCAATGAAAA  1696

Query 1742  CCTATAACATCATATTGAGGGGGATTGACATGATAGAATTTCCAAAGAAGATTGCCAAAAATGCTGCTAATTTA  1815
            ||||.||.||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1697  CCTACAATATCATACTGCGGGGGATTGACATGATAGAATTTCCAAAGAAGATTGCAAAAAATGCTGCTAATTTA  1770

Query 1816  ATTAAAAAACTATGCAGGGACAATCCATCAGAAAGATTAGGGAATTTGAAAAATGGAGTAAAAGACATTCAAAA  1889
            |||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||
Sbjct 1771  ATTAAAAAACTATGCAGGGACAACCCATCAGAGAGGTTAGGAAATTTGAAAAACGGAGTCAAAGACATTCAGAA  1844

Query 1890  GCACAAATGGTTTGAGGGCTTTAACTGGGAAGGCTTAAGAAAAGGTACCTTGACACCTCCTATAATACCAAGTG  1963
            .|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1845  ACACAAGTGGTTTGAGGGCTTTAATTGGGAAGGCTTAAGAAAAGGCACCTTGACACCTCCCATAATTCCAAGTG  1918

Query 1964  TTGCATCACCCACAGACACAAGTAATTTTGACAGTTTCCCTGAGGACAACGATGAACCACCACCTGATGACAAC  2037
            ||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1919  TTGCGTCACCCACAGACACAAGCAATTTTGACAGTTTCCCTGAGGACAGCGATGAGCCACCACCTGATGACAAC  1992

Query 2038  TCAGGATGGGATATAGACTTC  2058
            |||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1993  TCAGGCTGGGACATAGACTTC  2013