Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488920
• Subject: NM_001038609.2
• Aligned Length: 1330
• Identities: 1022
• Gaps: 140

Alignment

Query    1  ATGGCTGAGCCCCGCCAGGAGTTCGAAGTGATGGAAGATCACGCTGGGACGTACGGGTTGGGGGACAGGAAAGA  74
            ||||||||.||.|||||||||||.||....||||||||.||.|||||                        |||
Sbjct    1  ATGGCTGACCCTCGCCAGGAGTTTGACACAATGGAAGACCATGCTGG------------------------AGA  50

Query   75  TCAGGGGGGCTACACCATGCACCAAGACCAAGAGGGTGACACGGACGCTGGCCTGAAAGAATCTCCCCTGCAGA  148
            |         |||||..|||.||||||||||||.||.||||.||||..||||.|.|||||.|||||||..|||.
Sbjct   51  T---------TACACTCTGCTCCAAGACCAAGAAGGAGACATGGACCATGGCTTAAAAGAGTCTCCCCCACAGC  115

Query  149  CCCCCACTGAGGACGGATCTGAGGAACCGGGCTCTGAAACCTCTGATGCTAAGAGCACTCCAACAGCGGAAGAT  222
            |||||.|.||.||.|||.|.||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct  116  CCCCCGCCGATGATGGAGCGGAGGAACCAGGGTCGGAGACCTCCGATGCTAAGAGCACTCCAACTGCTGAAGAC  189

Query  223  GTGACAGCACCCTTAGTGGATGAGGGAGCTCCCGGCAAGCAGGCTGCCGCGCAGCCCCACACGGAGATCCCAGA  296
            |||||.||.|||.|||||||||||.|||||||||.|||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  190  GTGACTGCGCCCCTAGTGGATGAGAGAGCTCCCGACAAGCAGGCCGCTGCCCAGCCCCACACGGAGATCCCAGA  263

Query  297  AGGAACCACAGCTGAAGAAGCAGGCATTGGAGACACCCCCAGCCTGGAAGACGAAGCTGCTGGTCACGTGACCC  370
            |||||..|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|.||.|||.|||.||||.|||||.||.|||||.|
Sbjct  264  AGGAATTACAGCCGAAGAAGCAGGCATCGGAGACACCCCGAACCAGGAGGACCAAGCCGCTGGGCATGTGACTC  337

Query  371  AAGCTCGCATGGTCAGTAAAAGCAAAGACGGGACTGGAAGCGATGACAAAAAAGCCAAGGGGGCTGATGGTAAA  444
            |||||||..|||.|      |||||||||.||||.||||..||.||.||.|||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  338  AAGCTCGTGTGGCC------AGCAAAGACAGGACAGGAAATGACGAGAAGAAAGCCAAGGGCGCTGATGGCAAA  405

Query  445  A------CGAAGATCGCCACACCGCGGGGAGCAGCCCCTCCAGGCCAGAAGGGCCAGGCCAACGCCACCAGGAT  512
            |      ||||||||||||||||.||||||||||||.||||.|.||||||||||..|.||||||||||||||||
Sbjct  406  ACCGGGGCGAAGATCGCCACACCTCGGGGAGCAGCCTCTCCGGCCCAGAAGGGCACGTCCAACGCCACCAGGAT  479

Query  513  TCCAGCAAAAACCCCGCCC-GCTCCAAAGACACCACCCAGCTCTGGTGAACCTCCAAAATCAGGGGATCGCAGC  585
            .||.||.||.|||.||||| || ||.|||||.||.||..|.||.||||||||.||||||||.||.||.||.|||
Sbjct  480  CCCGGCCAAGACCACGCCCAGC-CCTAAGACTCCTCCAGGGTCAGGTGAACCACCAAAATCCGGAGAACGAAGC  552

Query  586  GGCTACAGCAGCCCCGGCTCCCCAGGCACTCCCGGCAGCCGCTCCCGCACCCCGTCCCTTCCAACCCCACCCAC  659
            ||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||
Sbjct  553  GGCTACAGCAGCCCCGGCTCTCCCGGAACGCCTGGCAGTCGCTCGCGCACCCCATCCCTACCAACACCGCCCAC  626

Query  660  CCGGGAGCCCAAGAAGGTGGCAGTGGTCCGTACTCCACCCAAGTCGCCGTCTTCCGCCAAGAGCCGCCTGCAGA  733
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||..|....||||||||||||||||
Sbjct  627  CCGGGAGCCCAAGAAGGTGGCAGTGGTCCGCACTCCCCCTAAGTCACCATCAGCTAGTAAGAGCCGCCTGCAGA  700

Query  734  CAGCCCCCGTGCCCATGCCAGACCTGAAGAATGTCAAGTCCAAGATCGGCTCCACTGAGAACCTGAAGCACCAG  807
            |.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||.|||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  701  CTGCCCCTGTGCCCATGCCAGACCTAAAGAATGTCAGGTCGAAGATTGGCTCTACTGAGAACCTGAAGCACCAG  774

Query  808  CCGGGAGGCGGGAAG-----------------------------------------------------------  822
            ||.|||||.||.|||                                                           
Sbjct  775  CCAGGAGGTGGCAAGGTGCAGATAATTAATAAGAAGCTGGATCTTAGCAACGTCCAGTCCAAGTGTGGCTCGAA  848

Query  823  ----------------------------------GTGCAAATAGTCTACAAACCAGTTGACCTGAGCAAGGTGA  862
                                              |||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||
Sbjct  849  GGATAATATCAAACACGTCCCGGGTGGAGGCAGTGTGCAAATAGTCTACAAGCCGGTGGACCTGAGCAAAGTGA  922

Query  863  CCTCCAAGTGTGGCTCATTAGGCAACATCCATCATAAACCAGGAGGTGGCCAGGTGGAAGTAAAATCTGAGAAG  936
            ||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  923  CCTCCAAGTGTGGCTCGTTAGGGAACATCCATCACAAGCCAGGAGGTGGCCAGGTGGAAGTAAAATCAGAGAAG  996

Query  937  CTTGACTTCAAGGACAGAGTCCAGTCGAAGATTGGGTCCCTGGACAATATCACCCACGTCCCTGGCGGAGGAAA  1010
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||.||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct  997  CTGGACTTCAAGGACAGAGTCCAGTCGAAGATTGGCTCCTTGGATAATATCACCCACGTCCCTGGAGGAGGGAA  1070

Query 1011  TAAAAAGATTGAAACCCACAAGCTGACCTTCCGCGAGAACGCCAAAGCCAAGACAGACCACGGGGCGGAGATCG  1084
            |||.|||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|
Sbjct 1071  TAAGAAGATTGAAACCCACAAGCTGACCTTCAGGGAGAATGCCAAAGCCAAGACAGACCATGGAGCAGAAATTG  1144

Query 1085  TGTACAAGTCGCCAGTGGTGTCTGGGGACACGTCTCCACGGCATCTCAGCAATGTCTCCTCCACCGGCAGCATC  1158
            ||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 1145  TGTATAAGTCACCCGTGGTGTCTGGGGACACATCTCCACGGCACCTCAGCAATGTGTCTTCCACGGGCAGCATC  1218

Query 1159  GACATGGTAGACTCGCCCCAGCTCGCCACGCTAGCTGACGAGGTGTCTGCCTCCCTGGCCAAGCAGGGTTTG  1230
            ||||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||.||||||||.|||.|||||||||||||||||
Sbjct 1219  GACATGGTGGACTCACCACAGCTTGCCACACTAGCCGATGAAGTGTCTGCTTCCTTGGCCAAGCAGGGTTTG  1290