Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000488920
- Subject:
- XM_005257371.4
- Aligned Length:
- 1521
- Identities:
- 1056
- Gaps:
- 465
Alignment
Query 1 ATGGCTGAGCCCCGCCAGGAGTTCGAAGTGATGGAAGATCACGCTGGGACGTACGGGTTGGGGGACAGGAAAGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCTGAGCCCCGCCAGGAGTTCGAAGTGATGGAAGATCACGCTGGGACGTACGGGTTGGGGGACAGGAAAGA 74
Query 75 TCAGGGGGGCTACACCATGCACCAAGACCAAGAGGGTGACACGGACGCTGGCCTGAAAGAATCTCCCCTGCAGA 148
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCAGGGGGGCTACACCATGCACCAAGACCAAGAGGGTGACACGGACGCTGGCCTGAA----------------- 131
Query 149 CCCCCACTGAGGACGGATCTGAGGAACCGGGCTCTGAAACCTCTGATGCTAAGAGCACTCCAACAGCGGAAGAT 222
Sbjct 132 -------------------------------------------------------------------------- 131
Query 223 GTGACAGCACCCTTAGTGGATGAGGGAGCTCCCGGCAAGCAGGCTGCCGCGCAGCCCCACACGGAGATCCCAGA 296
Sbjct 132 -------------------------------------------------------------------------- 131
Query 297 AGGAACCACAGCTGAAGAAGCAGGCATTGGAGACACCCCCAGCCTGGAAGACGAAGCTGCTGGTCACGTGACCC 370
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 132 ---------AGCTGAAGAAGCAGGCATTGGAGACACCCCCAGCCTGGAAGACGAAGCTGCTGGTCACGTGACCC 196
Query 371 AAGCTCGCATGGTCAGTAAAAGCAAAGACGGGACTGGAAGCGATGACAAAAAAGC------------------- 425
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 197 AAGCTCGCATGGTCAGTAAAAGCAAAGACGGGACTGGAAGCGATGACAAAAAAGCCAAGACATCCACACGTTCC 270
Query 426 -------------------------------------------------------------------------- 425
Sbjct 271 TCTGCTAAAACCTTGAAAAATAGGCCTTGCCTTAGCCCCAAACACCCCACTCCTGGTAGCTCAGACCCTCTGAT 344
Query 426 -------------------------------------------------------------------------- 425
Sbjct 345 CCAACCCTCCAGCCCTGCTGTGTGCCCAGAGCCACCTTCCTCTCCTAAATACGTCTCTTCTGTCACTTCCCGAA 418
Query 426 -------------------------------CAAGGGGGCTGATGGTAAAACGAAGATCGCCACACCGCGGGGA 468
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 419 CTGGCAGTTCTGGAGCAAAGGAGATGAAACTCAAGGGGGCTGATGGTAAAACGAAGATCGCCACACCGCGGGGA 492
Query 469 GCAGCCCCTCCAGGCCAGAAGGGCCAGGCCAACGCCACCAGGATTCCAGCAAAAACCCCGCCCGCTCCAAAGAC 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 493 GCAGCCCCTCCAGGCCAGAAGGGCCAGGCCAACGCCACCAGGATTCCAGCAAAAACCCCGCCCGCTCCAAAGAC 566
Query 543 ACCACCCAGCTCTGGTGAACCTCCAAAATCAGGGGATCGCAGCGGCTACAGCAGCCCCGGCTCCCCAGGCACTC 616
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 567 ACCACCCAGCTCTGGTGAACCTCCAAAATCAGGGGATCGCAGCGGCTACAGCAGCCCCGGCTCCCCAGGCACTC 640
Query 617 CCGGCAGCCGCTCCCGCACCCCGTCCCTTCCAACCCCACCCACCCGGGAGCCCAAGAAGGTGGCAGTGGTCCGT 690
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 641 CCGGCAGCCGCTCCCGCACCCCGTCCCTTCCAACCCCACCCACCCGGGAGCCCAAGAAGGTGGCAGTGGTCCGT 714
Query 691 ACTCCACCCAAGTCGCCGTCTTCCGCCAAGAGCCGCCTGCAGACAGCCCCCGTGCCCATGCCAGACCTGAAGAA 764
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 715 ACTCCACCCAAGTCGCCGTCTTCCGCCAAGAGCCGCCTGCAGACAGCCCCCGTGCCCATGCCAGACCTGAAGAA 788
Query 765 TGTCAAGTCCAAGATCGGCTCCACTGAGAACCTGAAGCACCAGCCGGGAGGCGGGAAG---------------- 822
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 789 TGTCAAGTCCAAGATCGGCTCCACTGAGAACCTGAAGCACCAGCCGGGAGGCGGGAAGGTGCAGATAATTAATA 862
Query 823 -------------------------------------------------------------------------- 822
Sbjct 863 AGAAGCTGGATCTTAGCAACGTCCAGTCCAAGTGTGGCTCAAAGGATAATATCAAACACGTCCCGGGAGGCGGC 936
Query 823 ---GTGCAAATAGTCTACAAACCAGTTGACCTGAGCAAGGTGACCTCCAAGTGTGGCTCATTAGGCAACATCCA 893
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 937 AGTGTGCAAATAGTCTACAAACCAGTTGACCTGAGCAAGGTGACCTCCAAGTGTGGCTCATTAGGCAACATCCA 1010
Query 894 TCATAAACCAGGAGGTGGCCAGGTGGAAGTAAAATCTGAGAAGCTTGACTTCAAGGACAGAGTCCAGTCGAAGA 967
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1011 TCATAAACCAGGAGGTGGCCAGGTGGAAGTAAAATCTGAGAAGCTTGACTTCAAGGACAGAGTCCAGTCGAAGA 1084
Query 968 TTGGGTCCCTGGACAATATCACCCACGTCCCTGGCGGAGGAAATAAAAAGATTGAAACCCACAAGCTGACCTTC 1041
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1085 TTGGGTCCCTGGACAATATCACCCACGTCCCTGGCGGAGGAAATAAAAAGATTGAAACCCACAAGCTGACCTTC 1158
Query 1042 CGCGAGAACGCCAAAGCCAAGACAGACCACGGGGCGGAGATCGTGTACAAGTCGCCAGTGGTGTCTGGGGACAC 1115
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1159 CGCGAGAACGCCAAAGCCAAGACAGACCACGGGGCGGAGATCGTGTACAAGTCGCCAGTGGTGTCTGGGGACAC 1232
Query 1116 GTCTCCACGGCATCTCAGCAATGTCTCCTCCACCGGCAGCATCGACATGGTAGACTCGCCCCAGCTCGCCACGC 1189
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1233 GTCTCCACGGCATCTCAGCAATGTCTCCTCCACCGGCAGCATCGACATGGTAGACTCGCCCCAGCTCGCCACGC 1306
Query 1190 TAGCTGACGAGGTGTCTGCCTCCCTGGCCAAGCAGGGTTTG 1230
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1307 TAGCTGACGAGGTGTCTGCCTCCCTGGCCAAGCAGGGTTTG 1347
