Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488926
• Subject: XM_011538720.2
• Aligned Length: 1281
• Identities: 1272
• Gaps: 9

Alignment

Query    1  ---------ATGGCGGCCAGCACTTCCCTGCCTGACCCTGGAGACTTTGACCGGAACGTGCCCCGGATCTGTGG  65
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGGCAATGGCGGCCAGCACTTCCCTGCCTGACCCTGGAGACTTTGACCGGAACGTGCCCCGGATCTGTGG  74

Query   66  GGTGTGTGGAGACCGAGCCACTGGCTTTCACTTCAATGCTATGACCTGTGAAGGCTGCAAAGGCTTCTTCAGGC  139
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGTGTGTGGAGACCGAGCCACTGGCTTTCACTTCAATGCTATGACCTGTGAAGGCTGCAAAGGCTTCTTCAGGC  148

Query  140  GAAGCATGAAGCGGAAGGCACTATTCACCTGCCCCTTCAACGGGGACTGCCGCATCACCAAGGACAACCGACGC  213
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GAAGCATGAAGCGGAAGGCACTATTCACCTGCCCCTTCAACGGGGACTGCCGCATCACCAAGGACAACCGACGC  222

Query  214  CACTGCCAGGCCTGCCGGCTCAAACGCTGTGTGGACATCGGCATGATGAAGGAGTTCATTCTGACAGATGAGGA  287
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CACTGCCAGGCCTGCCGGCTCAAACGCTGTGTGGACATCGGCATGATGAAGGAGTTCATTCTGACAGATGAGGA  296

Query  288  AGTGCAGAGGAAGCGGGAGATGATCCTGAAGCGGAAGGAGGAGGAGGCCTTGAAGGACAGTCTGCGGCCCAAGC  361
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGTGCAGAGGAAGCGGGAGATGATCCTGAAGCGGAAGGAGGAGGAGGCCTTGAAGGACAGTCTGCGGCCCAAGC  370

Query  362  TGTCTGAGGAGCAGCAGCGCATCATTGCCATACTGCTGGACGCCCACCATAAGACCTACGACCCCACCTACTCC  435
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGTCTGAGGAGCAGCAGCGCATCATTGCCATACTGCTGGACGCCCACCATAAGACCTACGACCCCACCTACTCC  444

Query  436  GACTTCTGCCAGTTCCGGCCTCCAGTTCGTGTGAATGATGGTGGAGGGAGCCATCCTTCCAGGCCCAACTCCAG  509
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GACTTCTGCCAGTTCCGGCCTCCAGTTCGTGTGAATGATGGTGGAGGGAGCCATCCTTCCAGGCCCAACTCCAG  518

Query  510  ACACACTCCCAGCTTCTCTGGGGACTCCTCCTCCTCCTGCTCAGATCACTGTATCACCTCTTCAGACATGATGG  583
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ACACACTCCCAGCTTCTCTGGGGACTCCTCCTCCTCCTGCTCAGATCACTGTATCACCTCTTCAGACATGATGG  592

Query  584  ACTCGTCCAGCTTCTCCAATCTGGATCTGAGTGAAGAAGATTCAGATGACCCTTCTGTGACCCTAGAGCTGTCC  657
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACTCGTCCAGCTTCTCCAATCTGGATCTGAGTGAAGAAGATTCAGATGACCCTTCTGTGACCCTAGAGCTGTCC  666

Query  658  CAGCTCTCCATGCTGCCCCACCTGGCTGACCTGGTCAGTTACAGCATCCAAAAGGTCATTGGCTTTGCTAAGAT  731
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGCTCTCCATGCTGCCCCACCTGGCTGACCTGGTCAGTTACAGCATCCAAAAGGTCATTGGCTTTGCTAAGAT  740

Query  732  GATACCAGGATTCAGAGACCTCACCTCTGAGGACCAGATCGTACTGCTGAAGTCAAGTGCCATTGAGGTCATCA  805
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GATACCAGGATTCAGAGACCTCACCTCTGAGGACCAGATCGTACTGCTGAAGTCAAGTGCCATTGAGGTCATCA  814

Query  806  TGTTGCGCTCCAATGAGTCCTTCACCATGGACGACATGTCCTGGACCTGTGGCAACCAAGACTACAAGTACCGC  879
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGTTGCGCTCCAATGAGTCCTTCACCATGGACGACATGTCCTGGACCTGTGGCAACCAAGACTACAAGTACCGC  888

Query  880  GTCAGTGACGTGACCAAAGCCGGACACAGCCTGGAGCTGATTGAGCCCCTCATCAAGTTCCAGGTGGGACTGAA  953
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTCAGTGACGTGACCAAAGCCGGACACAGCCTGGAGCTGATTGAGCCCCTCATCAAGTTCCAGGTGGGACTGAA  962

Query  954  GAAGCTGAACTTGCATGAGGAGGAGCATGTCCTGCTCATGGCCATCTGCATCGTCTCCCCAGATCGTCCTGGGG  1027
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GAAGCTGAACTTGCATGAGGAGGAGCATGTCCTGCTCATGGCCATCTGCATCGTCTCCCCAGATCGTCCTGGGG  1036

Query 1028  TGCAGGACGCCGCGCTGATTGAGGCCATCCAGGACCGCCTGTCCAACACACTGCAGACGTACATCCGCTGCCGC  1101
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGCAGGACGCCGCGCTGATTGAGGCCATCCAGGACCGCCTGTCCAACACACTGCAGACGTACATCCGCTGCCGC  1110

Query 1102  CACCCGCCCCCGGGCAGCCACCTGCTCTATGCCAAGATGATCCAGAAGCTAGCCGACCTGCGCAGCCTCAATGA  1175
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CACCCGCCCCCGGGCAGCCACCTGCTCTATGCCAAGATGATCCAGAAGCTAGCCGACCTGCGCAGCCTCAATGA  1184

Query 1176  GGAGCACTCCAAGCAGTACCGCTGCCTCTCCTTCCAGCCTGAGTGCAGCATGAAGCTAACGCCCCTTGTGCTCG  1249
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGAGCACTCCAAGCAGTACCGCTGCCTCTCCTTCCAGCCTGAGTGCAGCATGAAGCTAACGCCCCTTGTGCTCG  1258

Query 1250  AAGTGTTTGGCAATGAGATCTCC  1272
            |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AAGTGTTTGGCAATGAGATCTCC  1281