Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488945
• Subject: NM_001159749.2
• Aligned Length: 1657
• Identities: 1415
• Gaps: 236

Alignment

Query    1  ATGGGGAAAGTGAATGTGGCCAAGTTGCGTTACATGAGCCGAGATGACTTCAGGGTCTTGACCGCGGTTGAAAT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGAAAGTGAATGTGGCCAAGTTGCGTTACATGAGCCGAGATGACTTCAGGGTCTTGACCGCGGTTGAAAT  74

Query   75  GGGCATGAAGAACCATGAAATTGTTCCCGGCAGTTTGATTGCTTCTATAGCCAGCCTTAAACATGGTGGCTGTA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGGCATGAAGAACCATGAAATTGTTCCCGGCAGTTTGATTGCTTCTATAGCCAGCCTTAAACATGGTGGCTGTA  148

Query  149  ATAAAGTTTTAAGAGAATTAGTGAAACATAAACTCATAGCTTGGGAGCGTACCAAAACTGTCCAGGGCTATCGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATAAAGTTTTAAGAGAATTAGTGAAACATAAACTCATAGCTTGGGAGCGTACCAAAACTGTCCAGGGCTATCGG  222

Query  223  TTGACAAATGCAGGATATGATTACCTAGCTTTGAAAACACTTTCTTCTAGGCAAGTAGTTGAGTCTGTTGGAAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTGACAAATGCAGGATATGATTACCTAGCTTTGAAAACACTTTCTTCTAGGCAAGTAGTTGAGTCTGTTGGAAA  296

Query  297  CCAGATGGGTGTTGGCAAAGAATCAGATATTTACATTGTTGCAAATGAAGAAGGACAACAATTTGCATTAAAGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCAGATGGGTGTTGGCAAAGAATCAGATATTTACATTGTTGCAAATGAAGAAGGACAACAATTTGCATTAAAGC  370

Query  371  TTCACAGACTAGGAAGAACCTCGTTTCGAAATTTGAAAAACAAACGCGATTATCATAAATATAGGCACAATGTG  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  371  TTCACAGACTAGGAAGAACCTCGTTTCGAAATTTGAAAAACAAACGCGATTATCATAAACATAGGCACAATGTG  444

Query  445  TCATGGCTATATTTATCTCGTCTCTCTGCCATGAAGGAATTTGCCTATATGAAGGCATTGTATGAGAGGAAATT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCATGGCTATATTTATCTCGTCTCTCTGCCATGAAGGAATTTGCCTATATGAAGGCATTGTATGAGAGGAAATT  518

Query  519  TCCAGTTCCAAAGCCAATTGATTACAATCGTCATGCAGTGGTCATGGAACTCATAAATGGTTATCCACTATGTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCCAGTTCCAAAGCCAATTGATTACAATCGTCATGCAGTGGTCATGGAACTCATAAATGGTTATCCACTATGTC  592

Query  593  AGATACACCATGTTGAAGATCCTGCATCAGTATATGATGAAGCTATGGAACTAATTGTCAAACTTGCAAATCAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGATACACCATGTTGAAGATCCTGCATCAGTATATGATGAAGCTATGGAACTAATTGTCAAACTTGCAAATCAT  666

Query  667  GGGCTGATTCATGGAGATTTTAATGAATTTAATCTCATTTTGGATGAAAGTGACCATATCACCATGATTGATTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGGCTGATTCATGGAGATTTTAATGAATTTAATCTCATTTTGGATGAAAGTGACCATATCACCATGATTGATTT  740

Query  741  TCCACAGATGGTTTCAACTTCTCATCCCAATGCTGAGTGGTATTTTGACAGAGATGTTAAATGCATTAAAGATT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCCACAGATGGTTTCAACTTCTCATCCCAATGCTGAGTGGTATTTTGACAGAGATGTTAAATGCATTAAAGATT  814

Query  815  TCTTTATGAAACGTTTCAGCTACGAAAGTGAGCTTTTTCCAACTTTTAAGGATATCAGGAGAGAAGACACTCTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCTTTATGAAACGTTTCAGCTACGAAAGTGAGCTTTTTCCAACTTTTAAGGATATCAGGAGAGAAGACACTCTT  888

Query  889  GATGTGGAGGTTTCTGCCAGTGGCTACACAAAGGAAATGCAGGCAGATGATGAACTGCTTCATCCATTAGGTCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GATGTGGAGGTTTCTGCCAGTGGCTACACAAAGGAAATGCAGGCAGATGATGAACTGCTTCATCCATTAGGTCC  962

Query  963  AGATGATAAAAATATTGAAACAAAAGAGGGATCTGAATTCTCATTTTCAGATGGAGAAGTGGCAGAAAAAGCAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGATGATAAAAATATTGAAACAAAAGAGGGATCTGAATTCTCATTTTCAGATGGAGAAGTGGCAGAAAAAGCAG  1036

Query 1037  AGGTTTACGGGTCAGAAAATGAAAGTGAACGGAACTGTCTAGAAGAATCAGAGGGCTGCTATTGCAGATCATCT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGGTTTACGGGTCAGAAAATGAAAGTGAACGGAACTGTCTAGAAGAATCAGAGGGCTGCTATTGCAGATCATCT  1110

Query 1111  GGAGACCCTGAACAAATAAAGGAAGACAGTTTATCAGAAGAGAGTGCTGATGCACGGAGTTTTGAAATGACTGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGAGACCCTGAACAAATAAAGGAAGACAGTTTATCAGAAGAGAGTGCTGATGCACGGAGTTTTGAAATGACTGA  1184

Query 1185  ATTCAATCAAGCTTTAGAAGAAATAAAAGGGCAGGTTGTTGAAAACAACTCTGTAACTGAATTTTCTGAGGAGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ATTCAATCAAGCTTTAGAAGAAATAAAAGGGCAGGTTGTTGAAAACAACTCTGTAACTGAATTTTCTGAGGAGA  1258

Query 1259  AAAACAGAACTGAAAATTACAACAGGCAAGATGGTCAGAGAGTTCAAGGAGGAGTCCCTGCTGGCTCTGACGAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AAAACAGAACTGAAAATTACAACAGGCAAGATGGTCAGAGAGTTCAAGGAGGAGTCCCTGCTGGCTCTGACGAG  1332

Query 1333  TATGAAGATGAATGCCCTCATCTAATTGCCTTGTCGTCATTAAATAGAGAATTCAGGCCTTTCAGAGATGAAGA  1406
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
Sbjct 1333  TATGAAGATGAATGCCCTCATCTAATTGCCTTGTCGTCATTAAATAGAGAATTCAGGCCTTTCAG---------  1397

Query 1407  AAATGTGGGAGCTATGAATCAGTATAGAACAAGAACTCTGAGTATCACTTCTTCAGGC-AGTGCTGTAAGCTGT  1479
                                 |||||||                      ||||.|.| |.||||.|.      
Sbjct 1398  ---------------------GTATAGA----------------------CTTCTGTCGATTGCTTTT------  1422

Query 1480  TCAACAATTCCTCCAGAACTGGTGAAACAGAAGGTGAAACGTCAGTTGACAAAACAGCAAAAATCAGCTGTCAG  1553
                                                                                      
Sbjct 1423  --------------------------------------------------------------------------  1422

Query 1554  ACGTCGATTGCAGAAAGGAGAAGCAAATATATTTACCAAGCAACGTAGGGAAAACATGCAAAATATCAAATCAA  1627
                                                                                      
Sbjct 1423  --------------------------------------------------------------------------  1422

Query 1628  GTTTGGAAGCAGCCAGCTTTTGGGGAGAA  1656
                                         
Sbjct 1423  -----------------------------  1422