Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488970
• Subject: XM_005265245.3
• Aligned Length: 2300
• Identities: 2295
• Gaps: 5

Alignment

Query    1  ATGGCAGGATTTAAGCGAGGGTATGATGGAAAGATTGCTGGATTATATGATCTGGATAAAACCTTGGGTCGAGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCAGGATTTAAGCGAGGGTATGATGGAAAGATTGCTGGATTATATGATCTGGATAAAACCTTGGGTCGAGG  74

Query   75  CCATTTTGCCGTGGTTAAACTTGCCAGGCATGTCTTTACGGGTGAAAAGGTGGCAGTAAAAGTTATTGACAAGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCATTTTGCCGTGGTTAAACTTGCCAGGCATGTCTTTACGGGTGAAAAGGTGGCAGTAAAAGTTATTGACAAGA  148

Query  149  CAAAACTGGACACTCTAGCTACTGGTCATCTTTTCCAGGAAGTGAGATGCATGAAACTAGTGCAGCATCCTAAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAAAACTGGACACTCTAGCTACTGGTCATCTTTTCCAGGAAGTGAGATGCATGAAACTAGTGCAGCATCCTAAC  222

Query  223  ATCGTCCGCCTTTATGAAGTTATTGACACCCAGACCAAACTATATCTTATTCTAGAACTTGGGGATGGAGGAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATCGTCCGCCTTTATGAAGTTATTGACACCCAGACCAAACTATATCTTATTCTAGAACTTGGGGATGGAGGAGA  296

Query  297  TATGTTTGATTATATAATGAAACATGAGGAGGGTCTTAATGAAGACTTGGCCAAGAAGTATTTTGCTCAGATAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TATGTTTGATTATATAATGAAACATGAGGAGGGTCTTAATGAAGACTTGGCCAAGAAGTATTTTGCTCAGATAG  370

Query  371  TTCATGCTATATCTTATTGCCATAAACTCCATGTGGTTCACAGAGACTTAAAACCAGAGAATGTAGTCTTCTTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTCATGCTATATCTTATTGCCATAAACTCCATGTGGTTCACAGAGACTTAAAACCAGAGAATGTAGTCTTCTTT  444

Query  445  GAAAAACAAGGTCTTGTAAAGTTGACAGACTTTGGGTTCAGCAACAAATTTCAACCAGGGAAGAAGCTCACTAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAAAAACAAGGTCTTGTAAAGTTGACAGACTTTGGGTTCAGCAACAAATTTCAACCAGGGAAGAAGCTCACTAC  518

Query  519  AAGCTGTGGATCTCTTGCATATTCCGCTCCAGAAATTCTGCTTGGTGATGAGTATGATGCACCTGCAGTAGATA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAGCTGTGGATCTCTTGCATATTCCGCTCCAGAAATTCTGCTTGGTGATGAGTATGATGCACCTGCAGTAGATA  592

Query  593  TTTGGAGTCTGGGAGTGATCCTTTTCATGTTGGTGTGTGGGCAGCCGCCCTTTCAAGAAGCCAATGACAGTGAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTTGGAGTCTGGGAGTGATCCTTTTCATGTTGGTGTGTGGGCAGCCGCCCTTTCAAGAAGCCAATGACAGTGAA  666

Query  667  ACACTGACAATGATCATGGATTGCAAATATACAGTACCATCCCATGTGTCTAAAGAGTGTAAAGACCTAATCAC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACACTGACAATGATCATGGATTGCAAATATACAGTACCATCCCATGTGTCTAAAGAGTGTAAAGACCTAATCAC  740

Query  741  ACGGATGCTACAGAGAGATCCCAAGAGAAGGGCTTCTTTAGAAGAGATTGAAAATCATCCTTGGCTTCAGGGAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACGGATGCTACAGAGAGATCCCAAGAGAAGGGCTTCTTTAGAAGAGATTGAAAATCATCCTTGGCTTCAGGGAG  814

Query  815  TGGACCCTTCACCAGCTACAAAGTATAACATTCCCCTTGTGTCATACAAAAATCTCTCGGAAGAGGAGCACAAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGACCCTTCACCAGCTACAAAGTATAACATTCCCCTTGTGTCATACAAAAATCTCTCGGAAGAGGAGCACAAC  888

Query  889  AGCATCATTCAGCGCATGGTGCTTGGGGACATAGCGGATCGAGACGCCATTGTAGAAGCCCTGGAAACCAACAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGCATCATTCAGCGCATGGTGCTTGGGGACATAGCGGATCGAGACGCCATTGTAGAAGCCCTGGAAACCAACAG  962

Query  963  GTATAACCATATCACAGCCACATACTTCCTGCTGGCTGAAAGGATCCTGAGAGAAAAGCAAGAGAAAGAAATAC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GTATAACCATATCACAGCCACATACTTCCTGCTGGCTGAAAGGATCCTGAGAGAAAAGCAAGAGAAAGAAATAC  1036

Query 1037  AGACCAGATCTGCAAGCCCGAGCAATATCAAGGCCCAGTTTAGGCAGTCATGGCCAACCAAAATTGATGTACCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGACCAGATCTGCAAGCCCGAGCAATATCAAGGCCCAGTTTAGGCAGTCATGGCCAACCAAAATTGATGTACCC  1110

Query 1111  CAGGACCTTGAGGATGACCTCACGGCCACTCCTTTGTCCCACGCGACTGTCCCTCAGTCTCCTGCTCGGGCTGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAGGACCTTGAGGATGACCTCACGGCCACTCCTTTGTCCCACGCGACTGTCCCTCAGTCTCCTGCTCGGGCTGC  1184

Query 1185  TGACAGTGTCCTCAATGGCCACAGGAGCAAAGGCCTGTGTGACTCAGCTAAGAAAGATGACCTCCCTGAGTTGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGACAGTGTCCTCAATGGCCACAGGAGCAAAGGCCTGTGTGACTCAGCTAAGAAAGATGACCTCCCTGAGTTGG  1258

Query 1259  CTGGACCAGCACTCTCTACGGTGCCACCCGCAAGCTTAAAACCCACAGCCAGTGGGCGGAAGTGTCTGTTCAGG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTGGACCAGCACTCTCTACGGTGCCACCCGCAAGCTTAAAACCCACAGCCAGTGGGCGGAAGTGTCTGTTCAGG  1332

Query 1333  GTGGAAGAAGATGAAGAGGAAGATGAGGAGGACAAGAAACCCATGTCCCTCTCAACACAAGTGGTTTTGCGCCG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTGGAAGAAGATGAAGAGGAAGATGAGGAGGACAAGAAACCCATGTCCCTCTCAACACAAGTGGTTTTGCGCCG  1406

Query 1407  GAAGCCATCTGTAACCAACCGCCTGACATCCAGGAAGAGTGCGCCCGTCCTCAACCAGATCTTTGAGGAAGGGG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GAAGCCATCTGTAACCAACCGCCTGACATCCAGGAAGAGTGCGCCCGTCCTCAACCAGATCTTTGAGGAAGGGG  1480

Query 1481  AATCTGACGATGAGTTTGACATGGATGAGAATCTGCCTCCCAAGTTGAGCAGGTTAAAGATGAATATAGCTTCT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AATCTGACGATGAGTTTGACATGGATGAGAATCTGCCTCCCAAGTTGAGCAGGTTAAAGATGAATATAGCTTCT  1554

Query 1555  CCAGGTACAGTTCACAAACGCTACCACCGGAGGAAAAGTCAGGGCCGGGGCTCCAGCTGCAGTAGTTCGGAGAC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CCAGGTACAGTTCACAAACGCTACCACCGGAGGAAAAGTCAGGGCCGGGGCTCCAGCTGCAGTAGTTCGGAGAC  1628

Query 1629  CAGTGATGATGATTCTGAAAGCCGGCGGCGGCTCGATAAAGATAGCGGGTTCACCTACTCCTGGCACCGACGGG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CAGTGATGATGATTCTGAAAGCCGGCGGCGGCTCGATAAAGATAGCGGGTTCACCTACTCCTGGCACCGACGGG  1702

Query 1703  ATAGCAGCGAGGGGCCCCCTGGCAGTGAGGGGGATGGCGGGGGCCAGAGCAAGCCAAGCAATGCCAGTGGAGGG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ATAGCAGCGAGGGGCCCCCTGGCAGTGAGGGGGATGGCGGGGGCCAGAGCAAGCCAAGCAATGCCAGTGGAGGG  1776

Query 1777  GTGGACAAGGCCAGCCCCAGTGAGAACAATGCTGGTGGGGGCAGTCCCTCCAGCGGCTCGGGTGGCAACCCCAC  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GTGGACAAGGCCAGCCCCAGTGAGAACAATGCTGGTGGGGGCAGTCCCTCCAGCGGCTCGGGTGGCAACCCCAC  1850

Query 1851  CAATACATCGGGTACCACACGCCGCTGTGCCGGCCCCAGCAACTCCATGCAGCTGGCCTCTCGCAGTGCTGGGG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CAATACATCGGGTACCACACGCCGCTGTGCCGGCCCCAGCAACTCCATGCAGCTGGCCTCTCGCAGTGCTGGGG  1924

Query 1925  AGCTCGTTGAGAGCCTCAAACTCATGAGCCTCTGCCTCGGCTCCCAGCTTCATGGGAGCACCAAGTACATTATT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AGCTCGTTGAGAGCCTCAAACTCATGAGCCTCTGCCTCGGCTCCCAGCTTCATGGGAGCACCAAGTACATTATT  1998

Query 1999  GATCCACAGAATGGCTTGTCATTTTCCAGTGTGAAAGTCCAAGAGAAATCTACGTGGAAAATGTGCATTAGCTC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GATCCACAGAATGGCTTGTCATTTTCCAGTGTGAAAGTCCAAGAGAAATCTACGTGGAAAATGTGCATTAGCTC  2072

Query 2073  CACAGGGAATGCAGGGCAGGTCCCTGCAGTGGGCGGCATAAAGTTTTTCTCTGACCACATGGCAGATACCACCA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CACAGGGAATGCAGGGCAGGTCCCTGCAGTGGGCGGCATAAAGTTTTTCTCTGACCACATGGCAGATACCACCA  2146

Query 2147  CTGAATTGGAACGGATAAAGAGCAAGAACCTGAAAAATAACGTGCTGCAGCTACCTCTGTGCGAAAAGACCATC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CTGAATTGGAACGGATAAAGAGCAAGAACCTGAAAAATAACGTGCTGCAGCTACCTCTGTGCGAAAAGACCATC  2220

Query 2221  TCTGTGAACATCCAGCGGAACCCTAAGGAGGGGCTGCTGTGCGCATCCAGCCCAGCCAGCTGTTGCCATGTCAT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  TCTGTGAACATCCAGCGGAACCCTAAGGAGGGGCTGCTGTGCGCATCCAGCCCAGCCAGCTGTTGCCATGTCAT  2294

Query 2295  CTGATC  2300
            |     
Sbjct 2295  C-----  2295