Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000488970
- Subject:
- XM_006511998.3
- Aligned Length:
- 2324
- Identities:
- 1913
- Gaps:
- 104
Alignment
Query 1 ATGGCAGGATTTAAGCGAGGGTATGATGGAAAGATTGCTGGATTATATGATCTGGATAAAACCTTGGGTCGAGG 74
||||||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCAGGGTTCAAGCGAGGATATGATGGGAAAATTGCTGGATTATATGATCTGGATAAAACCTTGGGTCGAGG 74
Query 75 CCATTTTGCCGTGGTTAAACTTGCCAGGCATGTCTTTACGGGTGAAAAGGTGGCAGTAAAAGTTATTGACAAGA 148
.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 75 TCATTTTGCAGTGGTCAAACTTGCCAGGCATGTCTTCACAGGTGAGAAGGTGGCAGTGAAAGTCATTGACAAGA 148
Query 149 CAAAACTGGACACTCTAGCTACTGGTCATCTTTTCCAGGAAGTGAGATGCATGAAACTAGTGCAGCATCCTAAC 222
|.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 149 CGAAGCTGGACACTCTAGCCACTGGTCATCTCTTCCAGGAAGTGAGGTGCATGAAACTAGTGCAGCACCCCAAC 222
Query 223 ATCGTCCGCCTTTATGAAGTTATTGACACCCAGACCAAACTATATCTTATTCTAGAACTTGGGGATGGAGGAGA 296
||.||.||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 223 ATTGTGCGTCTCTATGAAGTCATAGACACCCAGACCAAACTTTATCTCATTCTAGAACTTGGAGATGGAGGAGA 296
Query 297 TATGTTTGATTATATAATGAAACATGAGGAGGGTCTTAATGAAGACTTGGCCAAGAAGTATTTTGCTCAGATAG 370
|||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 297 TATGTTTGATTATATAATGAAGCACGAGGAGGGTCTTAATGAAGACTTGGCCAAGAAGTACTTTGCTCAGATAG 370
Query 371 TTCATGCTATATCTTATTGCCATAAACTCCATGTGGTTCACAGAGACTTAAAACCAGAGAATGTAGTCTTCTTT 444
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 371 TTCATGCTATATCTTATTGCCATAAACTCCATGTGGTCCACAGAGACTTGAAACCAGAGAATGTAGTCTTTTTT 444
Query 445 GAAAAACAAGGTCTTGTAAAGTTGACAGACTTTGGGTTCAGCAACAAATTTCAACCAGGGAAGAAGCTCACTAC 518
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||
Sbjct 445 GAAAAACAAGGTCTTGTGAAGTTGACAGACTTTGGCTTCAGCAACAAATTTCAGCCTGGAAAGAAACTCACCAC 518
Query 519 AAGCTGTGGATCTCTTGCATATTCCGCTCCAGAAATTCTGCTTGGTGATGAGTATGATGCACCTGCAGTAGATA 592
.|||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct 519 GAGCTGCGGGTCTCTTGCATACTCTGCTCCAGAAATCCTGCTTGGCGATGAGTACGATGCCCCTGCAGTAGACA 592
Query 593 TTTGGAGTCTGGGAGTGATCCTTTTCATGTTGGTGTGTGGGCAGCCGCCCTTTCAAGAAGCCAATGACAGTGAA 666
|.|||||.|||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.
Sbjct 593 TATGGAGCCTGGGCGTGATCCTTTTCATGCTGGTGTGTGGGCAGCCACCCTTCCAAGAAGCCAACGACAGCGAG 666
Query 667 ACACTGACAATGATCATGGATTGCAAATATACAGTACCATCCCATGTGTCTAAAGAGTGTAAAGACCTAATCAC 740
||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.||.|||.|||..||||||..||.|||.|..|||||.|||||
Sbjct 667 ACACTGACCATGATCATGGACTGCAAGTACACGGTGCCACCCCGCGTGTCTGCAGGGTGCAGGGACCTGATCAC 740
Query 741 ACGGATGCTACAGAGAGATCCCAAGAGAAGGGCTTCTTTAGAAGAGATTGAAAATCATCCTTGGCTTCAGGGAG 814
|||.||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||.|.|||||||||||||..||.||||||||.|||||||
Sbjct 741 ACGAATGCTACAGAGAGACCCCAAAAGGAGAGCCTCTCTGGAAGAGATTGAAAGCCACCCTTGGCTCCAGGGAG 814
Query 815 TGGACCCTTCACCAGCTACAAAGTATAACATTCCCCTTGTGTCATACAAAAATCTCTCGGAAGAGGAGCACAAC 888
|||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||.||.|||||||||
Sbjct 815 TGGACCCATCACCAGCCACCAAGTATAACATTCCCCTCGTGTCCTACAAGAACCTCTCCGAGGAAGAGCACAAC 888
Query 889 AGCATCATTCAGCGCATGGTGCTTGGGGACATAGCGGATCGAGACGCCATTGTAGAAGCCCTGGAAACCAACAG 962
||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AGCATCATCCAGCGCATGGTGCTCGGGGACATCGCGGACCGAGACGCCATCGTAGAAGCCCTGGAAACCAACAG 962
Query 963 GTATAACCATATCACAGCCACATACTTCCTGCTGGCTGAAAGGATCCTGAGAGAAAAGCAAGAGAAAGAAATAC 1036
|||.|||||.||.||.|||||.|||||..|.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GTACAACCACATTACCGCCACTTACTTTTTACTTGCTGAAAGGATCCTGAGAGAAAAGCAAGAGAAAGAAATAC 1036
Query 1037 AGACCAGATCTGCAAGCCCGAGCAATATCAAGGCCCAGTTTAGGCAGTCATGGCCAACCAAAATTGATGTACCC 1110
|||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGACCAGGTCTGCTAGCCCCAGCAACATCAAGGCCCAGTTTAGGCAGTCATGGCCAACCAAAATTGATGTACCC 1110
Query 1111 CAGGACCTTGAGGATGACCTCACGGCCACTCCTTTGTCCCACGCGACTGTCCCTCAGTCTCCTGCTCGGGCTGC 1184
||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|||.||||.||.||.||.|||||.||||||||||||.||||||.
Sbjct 1111 CAAGACCTTGAAGATGATCTCACTGCCACCCCTCTGTCACATGCCACAGTCCCGCAGTCTCCTGCTAGGGCTGG 1184
Query 1185 TGACAGTGTCCTCAATGGCCACAGGAGCAAAGGCCTGTGTGACTCAGCTAAGAAAGATGACCTCCCTGAGTTGG 1258
|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.|||||.|||.|||
Sbjct 1185 TGACAATGTCCTCAATGGCCACAGGAGCAAAGGCCTGTGTGACCCAGCCAAGAAAGATGAGCTCCCGGAGCTGG 1258
Query 1259 CTGGACCAGCACTCTCTACGGTGCCACCCGCAAGCTTAAAACCCACAGCCAGTGGGCGGAAGTGTCTGTTCAGG 1332
||||.||.|||||.||.||.||.|||||.||||||.|.||.|||.|||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 1259 CTGGGCCGGCACTGTCCACTGTTCCACCTGCAAGCATGAAGCCCGCAGCCAGTGGGCGCAAGTGTCTCTTCAGG 1332
Query 1333 GTGGAAGAAGATGAAGAGGAAGATGAGGAGGACAAGAAACCCATGTCCCTCTCAACACAAGTGGTTTTGCGCCG 1406
||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||..|||||||.||.||.||.|||||..|||||||
Sbjct 1333 GTGGAAGAAGATGAGGAGGAGGATGAGGAGGACAAGAAGCCTGTGTCCCTGTCCACGCAGGTGGTGCTGCGCCG 1406
Query 1407 GAAGCCATCTGTAACCAACCGCCTGACATCCAGGAAGAGTGCGCCCGTCCTCAACCAGATCTTTGAGGAAGGGG 1480
|||||||||.||.|||||.||||||||.||..|.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct 1407 GAAGCCATCGGTCACCAATCGCCTGACGTCTCGCAAGAGTGCCCCAGTGCTCAACCAGATCTTCGAGGAGGGCG 1480
Query 1481 AATCTGACGATGAGTTTGACATGGATGAGAATCTGCCTCCCAAGTTGAGCAGGTTAAAGATGAATATAGCTTCT 1554
|.||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||.|||||.||.|.||||||||.||.||.||.
Sbjct 1481 AGTCAGACGACGAGTTTGACATGGACGAGAACCTGCCGCCCAAGCTGAGCCGGCTGAAGATGAACATTGCCTCA 1554
Query 1555 CCAGGTACAGTTCACAAACGCTACCACCGGAGGAAAAGTCAGGGCCGGGGCTCCAGCTGCAGTAGTTCGGAGAC 1628
|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||
Sbjct 1555 CCAGGCACAGTGCACAAGCGCTACCACCGCAGGAAAAGCCAGGGCCGGGGCTCTAGCTGCAGCAGCTCTGAGAC 1628
Query 1629 CAGTGATGATGATTCTGAAAGCCGGCGGCGGCTCGATAAAGATAGCGGGTTCACCTACTCCTGGCACCGACGGG 1702
|||.|||||.||.||.||.|||||||||.||||.||.||.||.|||||.||..|.|||||.||||||||.||.|
Sbjct 1629 CAGCGATGACGACTCCGAGAGCCGGCGGAGGCTGGACAAGGACAGCGGCTTTGCTTACTCGTGGCACCGGCGTG 1702
Query 1703 ATAGCAGCGAGGGGCCCCCTGGCAGTGAGGGGGATGGCGGGGGCCAGAGCAAGCCAAGCAATGCCAGTGGAGGG 1776
|.|||||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.|||| .|.||||.||.
Sbjct 1703 ACAGCAGTGAGGGGCCACCAGGCAGCGAGGGCGATGGTGGCGGCCAGAGCAAGCCTAGCA---GCGGTGGCGGT 1773
Query 1777 GTGGACAAGGCCAGCCCCAGTGAGAA---CAATGCTGGTGGGGGCAGTCCCTCCA--GCGGCTCGGGTGGCAAC 1845
|||||||||||||||||..|||||.| || |.|||||.||||| ||| |.|||||.|||||.|.|
Sbjct 1774 GTGGACAAGGCCAGCCCGGGTGAGCAGGGCA---CGGGTGGTGGCAG-----CCAGGGAGGCTCTGGTGGGACC 1839
Query 1846 CCCACCAATACATC-GGGTACCACACGCCGCTGTGCCGGCCC-----CAGCAACTCCAT-----------GCAG 1902
||..|...||||.| |||| ||.||.|.||||||||.||||| ||.|..|.||.| ||..
Sbjct 1840 CCGTCGGGTACAGCAGGGT-CCTCAAGGCGCTGTGCAGGCCCTGACTCATCCTCACCCTCCCCCGCCTCAGCCT 1912
Query 1903 CTGGCCTCTCGCA-GTGCTGGGGAGCTCGTTGAGAGCCTCAAACTCATGAGCCTCTGCCTCGGCTCCCAGCTTC 1975
|| |||.||| || |||.||..|||||.||..||||||||||||||.|||||||.|||||.|||||.|||||.|
Sbjct 1913 CT-GCCGCTC-CACGTGGTGCAGAGCTTGTGCAGAGCCTCAAACTCGTGAGCCTGTGCCTAGGCTCACAGCTGC 1984
Query 1976 ATGGGAGCACCAAGTACATTATTGATCCACAGAATGGCTTGTCATTTTCCAGTGTGAAAGTCCAAGAGAAATCT 2049
||| ||.|||||||||||.|.||.||.|||||.|.|||| ||.|||||.|||||.||.||.|||||.||.
Sbjct 1985 ATG---GCGCCAAGTACATTCTGGACCCGCAGAAGGCCTTG---TTCTCCAGCGTGAAGGTGCAGGAGAAGTCC 2052
Query 2050 ACGTGGAAAATGTGCATTAGCTCCACAGGGAATGCAGGGCAGGTCCCTGCAGTGGGCGGCATAAAGTTTTTCT- 2122
||||||||.||||||||.|||.||.|||| ||| || ||..| |||
Sbjct 2053 ACGTGGAAGATGTGCATCAGCGCCCCAGG---------------CCC--CA----GCCCC----------TCTG 2095
Query 2123 CTGACCACATGGCAGATACCACCACTGAATTGGAACGGATAAAGAGCAAGAACCTGAAAAATAACGTGCTGCAG 2196
|||||| |.||.|.|.|.|.||.||||||.||||..||.||||.|||.|||
Sbjct 2096 CTGACC------------------------TTGACCCGGTGAGGACCAAGAAGCTGAGGAACAACGCGCTCCAG 2145
Query 2197 CTACCTCTGTGCGAAAAGACCATCTCTGTGAACATCCAGCGGAACCCTAAGGAGGGGCTGCTGTGCGCATCCAG 2270
||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|.||..|||||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct 2146 CTACCTCTGTGCGAAAAGACCATCTCCGTGAACATCCAGCGCAGCCGCAAGGAAGGGCTGCTCTGCGCCTCCAG 2219
Query 2271 CCCAGCCAGCTGTTGCCATGTCATCTGATC 2300
|||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 2220 CCCCGCCAGCTGCTGCCATGTCATC----- 2244