Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488977
• Subject: XM_011509842.2
• Aligned Length: 2746
• Identities: 2331
• Gaps: 415

Alignment

Query    1  ATGGGAAGACCAAGGTTGACACTTGTTTGTCAAGTGTCAATAATCATCTCTGCCCGGGACCTCAGCATGAACAA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CCTCACAGAGCTTCAGCCTGGCCTCTTCCACCACCTGCGCTTCTTGGAGGAGCTGCGTCTCTCTGGGAACCATC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TCTCACACATCCCAGGACAAGCATTCTCTGGTCTCTACAGCCTGAAAATCCTGATGCTGCAGAACAATCAGCTG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GGAGGAATCCCCGCAGAGGCGCTGTGGGAGCTGCCGAGCCTGCAGTCGCTGCGCCTAGATGCCAACCTCATCTC  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CCTGGTCCCGGAGAGGAGCTTTGAGGGGCTGTCCTCCCTCCGCCACCTCTGGCTGGACGACAATGCACTCACGG  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  AGATCCCTGTCAGGGCCCTCAACAACCTCCCTGCCCTGCAGGCCATGACCCTGGCCCTCAACCGCATCAGCCAC  444
                                                        ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --------------------------------------------ATGACCCTGGCCCTCAACCGCATCAGCCAC  30

Query  445  ATCCCCGACTACGCGTTCCAGAATCTCACCAGCCTTGTGGTGCTGCATTTGCATAACAACCGCATCCAGCATCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   31  ATCCCCGACTACGCGTTCCAGAATCTCACCAGCCTTGTGGTGCTGCATTTGCATAACAACCGCATCCAGCATCT  104

Query  519  GGGGACCCACAGCTTCGAGGGGCTGCACAATCTGGAGACACTAGACCTGAATTATAACAAGCTGCAGGAGTTCC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  105  GGGGACCCACAGCTTCGAGGGGCTGCACAATCTGGAGACACTAGACCTGAATTATAACAAGCTGCAGGAGTTCC  178

Query  593  CTGTGGCCATCCGGACCCTGGGCAGACTGCAGGAACTGGGGTTCCATAACAACAACATCAAGGCCATCCCAGAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  179  CTGTGGCCATCCGGACCCTGGGCAGACTGCAGGAACTGGGGTTCCATAACAACAACATCAAGGCCATCCCAGAA  252

Query  667  AAGGCCTTCATGGGGAACCCTCTGCTACAGACGATACACTTTTATGATAACCCAATCCAGTTTGTGGGAAGATC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  253  AAGGCCTTCATGGGGAACCCTCTGCTACAGACGATACACTTTTATGATAACCCAATCCAGTTTGTGGGAAGATC  326

Query  741  GGCATTCCAGTACCTGCCTAAACTCCACACACTATCTCTGAATGGTGCCATGGACATCCAGGAGTTTCCAGATC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  327  GGCATTCCAGTACCTGCCTAAACTCCACACACTATCTCTGAATGGTGCCATGGACATCCAGGAGTTTCCAGATC  400

Query  815  TCAAAGGCACCACCAGCCTGGAGATCCTGACCCTGACCCGCGCAGGCATCCGGCTGCTCCCATCGGGGATGTGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  401  TCAAAGGCACCACCAGCCTGGAGATCCTGACCCTGACCCGCGCAGGCATCCGGCTGCTCCCATCGGGGATGTGC  474

Query  889  CAACAGCTGCCCAGGCTCCGAGTCCTGGAACTGTCTCACAATCAAATTGAGGAGCTGCCCAGCCTGCACAGGTG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  475  CAACAGCTGCCCAGGCTCCGAGTCCTGGAACTGTCTCACAATCAAATTGAGGAGCTGCCCAGCCTGCACAGGTG  548

Query  963  TCAGAAATTGGAGGAAATCGGCCTCCAACACAACCGCATCTGGGAAATTGGAGCTGACACCTTCAGCCAGCTGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  549  TCAGAAATTGGAGGAAATCGGCCTCCAACACAACCGCATCTGGGAAATTGGAGCTGACACCTTCAGCCAGCTGA  622

Query 1037  GCTCCCTGCAAGCCCTGGATCTTAGCTGGAACGCCATCCGGTCCATCCACCCCGAGGCCTTCTCCACCCTGCAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  623  GCTCCCTGCAAGCCCTGGATCTTAGCTGGAACGCCATCCGGTCCATCCACCCCGAGGCCTTCTCCACCCTGCAC  696

Query 1111  TCCCTGGTCAAGCTGGACCTGACAGACAACCAGCTGACCACACTGCCCCTGGCTGGACTTGGGGGCTTGATGCA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  697  TCCCTGGTCAAGCTGGACCTGACAGACAACCAGCTGACCACACTGCCCCTGGCTGGACTTGGGGGCTTGATGCA  770

Query 1185  TCTGAAGCTCAAAGGGAACCTTGCTCTCTCCCAGGCCTTCTCCAAGGACAGTTTCCCAAAACTGAGGATCCTGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  771  TCTGAAGCTCAAAGGGAACCTTGCTCTCTCCCAGGCCTTCTCCAAGGACAGTTTCCCAAAACTGAGGATCCTGG  844

Query 1259  AGGTGCCTTATGCCTACCAGTGCTGTCCCTATGGGATGTGTGCCAGCTTCTTCAAGGCCTCTGGGCAGTGGGAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  845  AGGTGCCTTATGCCTACCAGTGCTGTCCCTATGGGATGTGTGCCAGCTTCTTCAAGGCCTCTGGGCAGTGGGAG  918

Query 1333  GCTGAAGACCTTCACCTTGATGATGAGGAGTCTTCAAAAAGGCCCCTGGGCCTCCTTGCCAGACAAGCAGAGAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  919  GCTGAAGACCTTCACCTTGATGATGAGGAGTCTTCAAAAAGGCCCCTGGGCCTCCTTGCCAGACAAGCAGAGAA  992

Query 1407  CCACTATGACCAGGACCTGGATGAGCTCCAGCTGGAGATGGAGGACTCAAAGCCACACCCCAGTGTCCAGTGTA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  993  CCACTATGACCAGGACCTGGATGAGCTCCAGCTGGAGATGGAGGACTCAAAGCCACACCCCAGTGTCCAGTGTA  1066

Query 1481  GCCCTACTCCAGGCCCCTTCAAGCCCTGTGAGTACCTCTTTGAAAGCTGGGGCATCCGCCTGGCCGTGTGGGCC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1067  GCCCTACTCCAGGCCCCTTCAAGCCCTGTGAGTACCTCTTTGAAAGCTGGGGCATCCGCCTGGCCGTGTGGGCC  1140

Query 1555  ATCGTGTTGCTCTCCGTGCTCTGCAATGGACTGGTGCTGCTGACCGTGTTCGCTGGCGGGCCTGTCCCCCTGCC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141  ATCGTGTTGCTCTCCGTGCTCTGCAATGGACTGGTGCTGCTGACCGTGTTCGCTGGCGGGCCTGTCCCCCTGCC  1214

Query 1629  CCCGGTCAAGTTTGTGGTAGGTGCGATTGCAGGCGCCAACACCTTGACTGGCATTTCCTGTGGCCTTCTAGCCT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1215  CCCGGTCAAGTTTGTGGTAGGTGCGATTGCAGGCGCCAACACCTTGACTGGCATTTCCTGTGGCCTTCTAGCCT  1288

Query 1703  CAGTCGATGCCCTGACCTTTGGTCAGTTCTCTGAGTACGGAGCCCGCTGGGAGACGGGGCTAGGCTGCCGGGCC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1289  CAGTCGATGCCCTGACCTTTGGTCAGTTCTCTGAGTACGGAGCCCGCTGGGAGACGGGGCTAGGCTGCCGGGCC  1362

Query 1777  ACTGGCTTCCTGGCAGTACTTGGGTCGGAGGCATCGGTGCTGCTGCTCACTCTGGCCGCAGTGCAGTGCAGCGT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1363  ACTGGCTTCCTGGCAGTACTTGGGTCGGAGGCATCGGTGCTGCTGCTCACTCTGGCCGCAGTGCAGTGCAGCGT  1436

Query 1851  CTCCGTCTCCTGTGTCCGGGCCTATGGGAAGTCCCCCTCCCTGGGCAGCGTTCGAGCAGGGGTCCTAGGCTGCC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1437  CTCCGTCTCCTGTGTCCGGGCCTATGGGAAGTCCCCCTCCCTGGGCAGCGTTCGAGCAGGGGTCCTAGGCTGCC  1510

Query 1925  TGGCACTGGCAGGGCTGGCCGCCGCGCTGCCCCTGGCCTCAGTGGGAGAATACGGGGCCTCCCCACTCTGCCTG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1511  TGGCACTGGCAGGGCTGGCCGCCGCGCTGCCCCTGGCCTCAGTGGGAGAATACGGGGCCTCCCCACTCTGCCTG  1584

Query 1999  CCCTACGCGCCACCTGAGGGTCAGCCAGCAGCCCTGGGCTTCACCGTGGCCCTGGTGATGATGAACTCCTTCTG  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1585  CCCTACGCGCCACCTGAGGGTCAGCCAGCAGCCCTGGGCTTCACCGTGGCCCTGGTGATGATGAACTCCTTCTG  1658

Query 2073  TTTCCTGGTCGTGGCCGGTGCCTACATCAAACTGTACTGTGACCTGCCGCGGGGCGACTTTGAGGCCGTGTGGG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1659  TTTCCTGGTCGTGGCCGGTGCCTACATCAAACTGTACTGTGACCTGCCGCGGGGCGACTTTGAGGCCGTGTGGG  1732

Query 2147  ACTGCGCCATGGTGAGGCACGTGGCCTGGCTCATCTTCGCAGACGGGCTCCTCTACTGTCCCGTGGCCTTCCTC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1733  ACTGCGCCATGGTGAGGCACGTGGCCTGGCTCATCTTCGCAGACGGGCTCCTCTACTGTCCCGTGGCCTTCCTC  1806

Query 2221  AGCTTTGCCTCCATGCTGGGCCTCTTCCCTGTCACGCCCGAGGCCGTCAAGTCTGTCCTGCTGGTGGTGCTGCC  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1807  AGCTTTGCCTCCATGCTGGGCCTCTTCCCTGTCACGCCCGAGGCCGTCAAGTCTGTCCTGCTGGTGGTGCTGCC  1880

Query 2295  CCTGCCTGCCTGCCTCAACCCACTGCTGTACCTGCTCTTCAACCCCCACTTCCGGGATGACCTTCGGCGGCTTC  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1881  CCTGCCTGCCTGCCTCAACCCACTGCTGTACCTGCTCTTCAACCCCCACTTCCGGGATGACCTTCGGCGGCTTC  1954

Query 2369  GGCCCCGCGCAGGGGACTCAGGGCCCCTAGCCTATGCTGCGGCCGGGGAGCTGGAGAAGAGCTCCTGTGATTCT  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1955  GGCCCCGCGCAGGGGACTCAGGGCCCCTAGCCTATGCTGCGGCCGGGGAGCTGGAGAAGAGCTCCTGTGATTCT  2028

Query 2443  ACCCAGGCCCTGGTAGCCTTCTCTGATGTGGATCTCATTCTGGAAGCTTCTGAAGCTGGGCGGCCCCCTGGGCT  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2029  ACCCAGGCCCTGGTAGCCTTCTCTGATGTGGATCTCATTCTGGAAGCTTCTGAAGCTGGGCGGCCCCCTGGGCT  2102

Query 2517  GGAGACCTATGGCTTCCCCTCAGTGACCCTCATCTCCTGTCAGCAGCCAGGGGCCCCCAGGCTGGAGGGCAGCC  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2103  GGAGACCTATGGCTTCCCCTCAGTGACCCTCATCTCCTGTCAGCAGCCAGGGGCCCCCAGGCTGGAGGGCAGCC  2176

Query 2591  ATTGTGTAGAGCCAGAGGGGAACCACTTTGGGAACCCCCAACCCTCCATGGATGGAGAACTGCTGCTGAGGGCA  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2177  ATTGTGTAGAGCCAGAGGGGAACCACTTTGGGAACCCCCAACCCTCCATGGATGGAGAACTGCTGCTGAGGGCA  2250

Query 2665  GAGGGATCTACGCCAGCAGGTGGAGGCTTGTCAGGGGGTGGCGGCTTTCAGCCCTCTGGCTTGGCCTTTGCTTC  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2251  GAGGGATCTACGCCAGCAGGTGGAGGCTTGTCAGGGGGTGGCGGCTTTCAGCCCTCTGGCTTGGCCTTTGCTTC  2324

Query 2739  ACACGTGG  2746
            ||||||| 
Sbjct 2325  ACACGTG-  2331