Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000489003
- Subject:
- XM_006538655.3
- Aligned Length:
- 1778
- Identities:
- 1294
- Gaps:
- 328
Alignment
Query 1 ATGCCCAGCAGGACCGGCCCCAAGATGGAAGGGAGCGGCGGCCGCGTCCGCCTCAAGGCGCATTACGGGGGGGA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CATCTTCATCACCAGCGTGGACGCCGCCACGACCTTCGAGGAGCTCTGTGAGGAAGTGAGAGACATGTGTCGTC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TGCACCAGCAGCACCCGCTCACCCTCAAGTGGGTGGACAGCGAAGGTGACCCTTGCACGGTGTCCTCCCAGATG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GAGCTGGAAGAGGCTTTCCGCCTGGCCCGTCAGTGCAGGGATGAAGGCCTCATCATTCATGTTTTCCCGAGCAC 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 CCCTGAGCAGCCTGGCCTGCCATGTCCG--GGAGAAGACAAATCTATCTACCGCCGGGGAGCCAGAAGATGGAG 368
||| | |||| |.||.|||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1 ---------------------ATG---GTTGGAG------AGTCCATCTACCGCCGTGGAGCCAGAAGATGGAG 44
Query 369 GAAGCTGTACCGTGCCAACGGCCACCTCTTCCAAGCCAAGCGCTTTAACAGGAGAGCGTACTGCGGTCAGTGCA 442
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||
Sbjct 45 GAAGCTGTACCGAGCCAACGGCCACCTCTTCCAAGCCAAGCGCTTTAACAGGGGAGCGTACTGCGGCCAGTGCA 118
Query 443 GCGAGAGGATATGGGGCCTCGCGAGGCAAGGCTACAGGTGCATCAACTGCAAACTGCTGGTCCATAAGCGCTGC 516
||||.|||||||||||.|||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 119 GCGAAAGGATATGGGGTCTCTCGAGGCAGGGCTACAGGTGCATCAACTGCAAGCTGCTGGTCCATAAACGCTGC 192
Query 517 CACGGCCTCGTCCCGCTGACCTGCAGGAAGCATATGGATTCTGTCATGCCTTCCCAAGAGCCTCCAGTAGACGA 590
||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 193 CACGTCCTCGTCCCGCTGACCTGCAGGAGGCATATGGATTCTGTCATGCCTTCCCAAGAGCCTCCAGTAGATGA 266
Query 591 CAAGAACGAGGACGCCGACCTTCCTTCCGAGGAGACAGATGGAATTGCTTACATTTCCTCATCCCGGAAGCATG 664
|||||||||.|..|..|||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||
Sbjct 267 CAAGAACGATGGTGTAGACCTTCCTTCAGAAGAAACTGATGGAATTGCTTATATTTCTTCATCTCGGAAACATG 340
Query 665 ACAGCATTAAAGACGACTCGGAGGACCTTAAGCCAGTTATCGATGGGATGGATGGAATCAAAATCTCTCAGGGG 738
|.|..||.|||||.||.||.||||||||||||||.||.|||||||||.|||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 341 ATAATATCAAAGATGATTCTGAGGACCTTAAGCCTGTCATCGATGGGGTGGATGGGATCAAAATCTCTCAGGGG 414
Query 739 CTTGGGCTGCAGGACTTTGACCTAATCAGAGTCATCGGGCGCGGGAGCTACGCCAAGGTTCTCCTGGTGCGGTT 812
||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 415 CTGGGGCTGCAAGACTTCGACCTCATCAGAGTCATCGGGCGTGGAAGCTATGCCAAGGTCCTCCTGGTGCGGTT 488
Query 813 GAAGAAGAATGACCAAATTTACGCCATGAAAGTGGTGAAGAAAGAGCTGGTGCATGATGACGAGGATATTGACT 886
||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||||
Sbjct 489 GAAGAAAAACGACCAGATTTACGCCATGAAGGTGGTAAAGAAGGAGCTTGTCCACGACGACGAGGATATCGACT 562
Query 887 GGGTACAGACAGAGAAGCACGTGTTTGAGCAGGCATCCAGCAACCCCTTCCTGGTCGGATTACACTCCTGCTTC 960
||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 563 GGGTGCAGACAGAGAAACATGTGTTTGAGCAGGCGTCCAGCAACCCCTTCCTGGTTGGCTTACACTCCTGCTTC 636
Query 961 CAGACGACAAGTCGGTTGTTCCTGGTCATTGAGTACGTCAACGGCGGGGACCTGATGTTCCACATGCAGAGGCA 1034
|||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 637 CAGACAACGAGCCGGTTGTTCCTGGTCATCGAGTATGTCAATGGCGGGGACCTCATGTTCCACATGCAGAGGCA 710
Query 1035 GAGGAAGCTCCCTGAGGAGCACGCCAGGTTCTACGCGGCCGAGATCTGCATCGCCCTCAACTTCCTGCACGAGA 1108
|||.||.||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||.||||.||||
Sbjct 711 GAGAAAACTTCCAGAGGAGCATGCCAGGTTCTATGCTGCTGAGATCTGTATCGCTCTCAACTTCTTGCATGAGA 784
Query 1109 GGGGGATCATCTACAGGGACCTGAAGCTGGACAACGTCCTCCTGGATGCGGACGGGCACATCAAGCTCACAGAC 1182
||||||||||||||.|||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.|||
Sbjct 785 GGGGGATCATCTACCGGGACCTAAAACTGGACAACGTCCTCCTTGATGCCGACGGACACATTAAGCTGACGGAC 858
Query 1183 TACGGCATGTGCAAGGAAGGCCTGGGCCCTGGTGACACAACGAGCACTTTCTGCGGAACCCCGAATTACATCGC 1256
||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct 859 TACGGCATGTGCAAGGAAGGTCTAGGCCCCGGTGATACAACAAGCACTTTTTGTGGAACCCCGAACTATATCGC 932
Query 1257 CCCCGAAATCCTGCGGGGAGAGGAGTACGGGTTCAGCGTGGACTGGTGGGCGCTGGGAGTCCTCATGTTTGAGA 1330
|||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||
Sbjct 933 CCCCGAAATCCTGCGAGGAGAAGAGTACGGGTTCAGCGTGGACTGGTGGGCACTGGGTGTCCTTATGTTTGAGA 1006
Query 1331 TGATGGCCGGGCGCTCCCCGTTCGACATCATCACCGACAACCCGGACATGAACACAGAGGACTACCTTTTCCAA 1404
|||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1007 TGATGGCTGGGCGCTCCCCCTTTGACATCATCACGGACAACCCTGACATGAACACTGAAGACTACCTTTTCCAA 1080
Query 1405 GTGATCCTGGAGAAGCCCATCCGGATCCCCCGGTTCCTGTCCGTCAAAGCCTCCCATGTTTTAAAAGGATTTTT 1478
||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||.||.||||||||||||||
Sbjct 1081 GTTATCCTGGAAAAGCCAATCCGGATTCCCCGTTTCCTGTCTGTCAAGGCCTCACACGTCTTAAAAGGATTTTT 1154
Query 1479 AAATAAGGACCCCAAAGAGAGGCTCGGCTGCCGGCCACAGACTGGATTTTCTGACATCAAGTCCCACGCGTTCT 1552
|||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||||
Sbjct 1155 AAATAAGGATCCCAAAGAGAGGCTTGGCTGCCGGCCACAGACTGGGTTTTCCGACATCAAGTCTCATGCTTTCT 1228
Query 1553 TCCGCAGCATAGACTGGGACTTGCTGGAGAAGAAGCAGGCGCTCCCTCCATTCCAGCCACAGATCACAGACGAC 1626
||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||.|.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 1229 TCCGCAGCATAGACTGGGACCTGCTGGAAAAGAAGCAGACCCTGCCTCCCTTCCAGCCCCAGATCACAGATGAC 1302
Query 1627 TACGGTCTGGACAACTTTGACACACAGTTCACCAGCGAGCCCGTGCAGCTGACCCCAGACGATGAGGATGCCAT 1700
||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|.|||
Sbjct 1303 TATGGCCTGGACAACTTTGACACGCAGTTCACCAGCGAGCCTGTGCAGCTGACCCCAGATGATGAGGACGTCAT 1376
Query 1701 AAAGAGGATCGACCAGTCAGAGTTCGAAGGCTTTGAGTATATCAACCCATTATTGCTGTCCACCGAGGAGTCGG 1774
||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||.|..|||||||..|.||||||||.|
Sbjct 1377 AAAGAGGATCGACCAGTCCGAATTTGAAGGCTTTGAGTACATCAACCCACTTCTGCTGTCTGCTGAGGAGTCCG 1450
Query 1775 TG 1776
||
Sbjct 1451 TG 1452